MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 70623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017668	TAT	2	6	310763	310768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712641
5002	NC_017668	CAG	2	6	310787	310792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712641
5003	NC_017668	GGTGC	2	10	310891	310900	0 %	20 %	60 %	20 %	386712641
5004	NC_017668	GAA	2	6	310981	310986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712641
5005	NC_017668	ATTG	2	8	311061	311068	25 %	50 %	25 %	0 %	386712641
5006	NC_017668	AGC	2	6	311163	311168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712641
5007	NC_017668	GAA	2	6	311209	311214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712641
5008	NC_017668	GTG	2	6	311255	311260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712641
5009	NC_017668	CA	3	6	311262	311267	50 %	0 %	0 %	50 %	386712641
5010	NC_017668	TCA	2	6	311286	311291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712641
5011	NC_017668	TGAA	2	8	311309	311316	50 %	25 %	25 %	0 %	386712641
5012	NC_017668	AGG	2	6	311393	311398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712641
5013	NC_017668	ATC	2	6	311402	311407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712641
5014	NC_017668	TTC	2	6	311414	311419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712641
5015	NC_017668	AG	3	6	311548	311553	50 %	0 %	50 %	0 %	386712641
5016	NC_017668	GCT	2	6	311614	311619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712641
5017	NC_017668	CGC	2	6	311633	311638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712641
5018	NC_017668	CTT	2	6	311659	311664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712641
5019	NC_017668	TCT	2	6	311718	311723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712641
5020	NC_017668	ATT	2	6	311729	311734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712641
5021	NC_017668	CTC	2	6	311813	311818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712641
5022	NC_017668	GAG	2	6	311830	311835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712641
5023	NC_017668	AC	3	6	311957	311962	50 %	0 %	0 %	50 %	386712641
5024	NC_017668	CCTG	2	8	311979	311986	0 %	25 %	25 %	50 %	386712641
5025	NC_017668	CAGGTA	2	12	312020	312031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712641
5026	NC_017668	CTT	2	6	312138	312143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712641
5027	NC_017668	GCA	2	6	312166	312171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712641
5028	NC_017668	TTA	2	6	312182	312187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712641
5029	NC_017668	GCT	2	6	312293	312298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712641
5030	NC_017668	A	6	6	312344	312349	100 %	0 %	0 %	0 %	386712641
5031	NC_017668	GAC	2	6	312378	312383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712641
5032	NC_017668	TAA	2	6	312460	312465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712641
5033	NC_017668	A	6	6	312744	312749	100 %	0 %	0 %	0 %	386712642
5034	NC_017668	AAT	2	6	312772	312777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712642
5035	NC_017668	TGGA	2	8	312822	312829	25 %	25 %	50 %	0 %	386712642
5036	NC_017668	TGTTTT	2	12	312832	312843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386712642
5037	NC_017668	TATCA	2	10	312899	312908	40 %	40 %	0 %	20 %	386712642
5038	NC_017668	TAA	2	6	312919	312924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712642
5039	NC_017668	T	7	7	313386	313392	0 %	100 %	0 %	0 %	386712643
5040	NC_017668	TTC	2	6	313444	313449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712643
5041	NC_017668	CCTTAT	2	12	313483	313494	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386712643
5042	NC_017668	ATG	2	6	313526	313531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712643
5043	NC_017668	TGG	2	6	313571	313576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712643
5044	NC_017668	CTT	2	6	313586	313591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712643
5045	NC_017668	TA	3	6	313592	313597	50 %	50 %	0 %	0 %	386712643
5046	NC_017668	ATT	2	6	313625	313630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712643
5047	NC_017668	AAAG	2	8	313666	313673	75 %	0 %	25 %	0 %	386712643
5048	NC_017668	TA	3	6	313722	313727	50 %	50 %	0 %	0 %	386712643
5049	NC_017668	ATC	2	6	313742	313747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712643
5050	NC_017668	TGG	2	6	313795	313800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712643
5051	NC_017668	TAC	2	6	313818	313823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712643
5052	NC_017668	GAA	2	6	313838	313843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712643
5053	NC_017668	GA	3	6	313866	313871	50 %	0 %	50 %	0 %	386712643
5054	NC_017668	GTTT	2	8	313912	313919	0 %	75 %	25 %	0 %	386712643
5055	NC_017668	GTC	2	6	313963	313968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712644
5056	NC_017668	TGG	2	6	313980	313985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712644
5057	NC_017668	AATT	2	8	314030	314037	50 %	50 %	0 %	0 %	386712644
5058	NC_017668	TGG	2	6	314055	314060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712644
5059	NC_017668	ATT	2	6	314142	314147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712644
5060	NC_017668	T	6	6	314214	314219	0 %	100 %	0 %	0 %	386712644
5061	NC_017668	CTTT	2	8	314316	314323	0 %	75 %	0 %	25 %	386712644
5062	NC_017668	TATG	2	8	314348	314355	25 %	50 %	25 %	0 %	386712644
5063	NC_017668	AGTAT	2	10	314369	314378	40 %	40 %	20 %	0 %	386712644
5064	NC_017668	CAT	2	6	314404	314409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712644
5065	NC_017668	TGAG	2	8	314414	314421	25 %	25 %	50 %	0 %	386712644
5066	NC_017668	ATA	2	6	314477	314482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712644
5067	NC_017668	ATGT	2	8	314515	314522	25 %	50 %	25 %	0 %	386712644
5068	NC_017668	GGA	2	6	314605	314610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712644
5069	NC_017668	AGT	2	6	314712	314717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712644
5070	NC_017668	TCG	2	6	314793	314798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712644
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5073	NC_017668	CTT	2	6	314884	314889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712644
5074	NC_017668	TCT	2	6	314930	314935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712644
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5076	NC_017668	TGA	2	6	315030	315035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712644
5077	NC_017668	CTGA	2	8	315091	315098	25 %	25 %	25 %	25 %	386712644
5078	NC_017668	GA	3	6	315180	315185	50 %	0 %	50 %	0 %	386712644
5079	NC_017668	TTGAAT	2	12	315191	315202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712644
5080	NC_017668	TGC	2	6	315267	315272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712644
5081	NC_017668	TGG	2	6	315288	315293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712644
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5084	NC_017668	GGA	2	6	315361	315366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712644
5085	NC_017668	TTAA	2	8	315409	315416	50 %	50 %	0 %	0 %	386712644
5086	NC_017668	AGA	2	6	315417	315422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712644
5087	NC_017668	A	7	7	315425	315431	100 %	0 %	0 %	0 %	386712644
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5089	NC_017668	T	6	6	315636	315641	0 %	100 %	0 %	0 %	386712645
5090	NC_017668	A	6	6	315682	315687	100 %	0 %	0 %	0 %	386712645
5091	NC_017668	CTT	2	6	315694	315699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712645
5092	NC_017668	TAT	2	6	315716	315721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712645
5093	NC_017668	ATT	2	6	315771	315776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712645
5094	NC_017668	TGGC	2	8	315908	315915	0 %	25 %	50 %	25 %	386712645
5095	NC_017668	TATCA	2	10	315978	315987	40 %	40 %	0 %	20 %	386712645
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5098	NC_017668	AG	4	8	316075	316082	50 %	0 %	50 %	0 %	386712645
5099	NC_017668	A	6	6	316092	316097	100 %	0 %	0 %	0 %	386712645
5100	NC_017668	TAT	2	6	316123	316128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712645
5101	NC_017668	CGG	2	6	316186	316191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386712645
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5103	NC_017668	TC	3	6	316326	316331	0 %	50 %	0 %	50 %	386712645
5104	NC_017668	TTTAA	2	10	316347	316356	40 %	60 %	0 %	0 %	386712645
5105	NC_017668	TCT	2	6	316397	316402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712645
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5107	NC_017668	CTAT	2	8	316505	316512	25 %	50 %	0 %	25 %	386712645
5108	NC_017668	CTT	2	6	316516	316521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712645
5109	NC_017668	ATAAA	2	10	316569	316578	80 %	20 %	0 %	0 %	386712645
5110	NC_017668	A	6	6	316576	316581	100 %	0 %	0 %	0 %	386712645
5111	NC_017668	GCT	2	6	316707	316712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712646
5112	NC_017668	CCA	2	6	316722	316727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712646
5113	NC_017668	GCAATA	2	12	316801	316812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712646
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5117	NC_017668	TCG	2	6	316928	316933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712646
5118	NC_017668	TAT	2	6	316940	316945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712646
5119	NC_017668	CTT	2	6	317081	317086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712646
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5122	NC_017668	ATC	2	6	317179	317184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712646
5123	NC_017668	GAT	2	6	317187	317192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712646
5124	NC_017668	CAT	2	6	317286	317291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712646
5125	NC_017668	GAA	2	6	317344	317349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712646
5126	NC_017668	GCT	2	6	317353	317358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712646
5127	NC_017668	GCT	2	6	317423	317428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712646
5128	NC_017668	GAT	2	6	317455	317460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712646
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5130	NC_017668	TTG	2	6	317486	317491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712646
5131	NC_017668	CCAT	2	8	317576	317583	25 %	25 %	0 %	50 %	386712646
5132	NC_017668	ATG	2	6	317602	317607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712646
5133	NC_017668	CT	3	6	317617	317622	0 %	50 %	0 %	50 %	386712646
5134	NC_017668	AGC	2	6	317658	317663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712646
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5137	NC_017668	ATT	2	6	317740	317745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712646
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5141	NC_017668	ATG	2	6	318022	318027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712646
5142	NC_017668	CTG	2	6	318035	318040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712646
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5144	NC_017668	TTC	2	6	318087	318092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712646
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5153	NC_017668	TCT	2	6	318418	318423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712646
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5155	NC_017668	GCT	2	6	318436	318441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712646
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5234	NC_017668	ATC	2	6	323459	323464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712650
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5240	NC_017668	AT	3	6	323745	323750	50 %	50 %	0 %	0 %	386712651
5241	NC_017668	TCTT	2	8	323865	323872	0 %	75 %	0 %	25 %	386712651
5242	NC_017668	TCC	2	6	323874	323879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712651
5243	NC_017668	GCT	2	6	324111	324116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712651
5244	NC_017668	GCT	2	6	324122	324127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712651
5245	NC_017668	CTT	2	6	324163	324168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712651
5246	NC_017668	AGCA	2	8	324215	324222	50 %	0 %	25 %	25 %	386712651
5247	NC_017668	TGGT	2	8	324267	324274	0 %	50 %	50 %	0 %	386712651
5248	NC_017668	TCA	2	6	324306	324311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712651
5249	NC_017668	GA	3	6	324396	324401	50 %	0 %	50 %	0 %	386712651
5250	NC_017668	TAC	2	6	324407	324412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712651
5251	NC_017668	CTT	2	6	324448	324453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712651
5252	NC_017668	TTC	2	6	324464	324469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712651
5253	NC_017668	TGC	2	6	324514	324519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712651
5254	NC_017668	CCA	2	6	324607	324612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712651
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5256	NC_017668	TTTC	2	8	324646	324653	0 %	75 %	0 %	25 %	386712651
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5258	NC_017668	TCA	2	6	324717	324722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712651
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5260	NC_017668	TAAA	2	8	324838	324845	75 %	25 %	0 %	0 %	386712651
5261	NC_017668	TCGT	2	8	324860	324867	0 %	50 %	25 %	25 %	386712651
5262	NC_017668	GTT	2	6	324872	324877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712651
5263	NC_017668	AT	3	6	324916	324921	50 %	50 %	0 %	0 %	386712651
5264	NC_017668	ACTG	2	8	324968	324975	25 %	25 %	25 %	25 %	386712651
5265	NC_017668	TAT	2	6	324979	324984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712651
5266	NC_017668	GAA	2	6	325014	325019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712651
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5270	NC_017668	AGCA	2	8	325475	325482	50 %	0 %	25 %	25 %	386712651
5271	NC_017668	TTC	2	6	325499	325504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712651
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5276	NC_017668	T	6	6	326514	326519	0 %	100 %	0 %	0 %	386712652
5277	NC_017668	AAGG	2	8	326596	326603	50 %	0 %	50 %	0 %	386712652
5278	NC_017668	CT	3	6	326751	326756	0 %	50 %	0 %	50 %	386712652
5279	NC_017668	TCA	2	6	326775	326780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712652
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5282	NC_017668	TGA	2	6	326994	326999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712652
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5353	NC_017668	TGCT	2	8	331489	331496	0 %	50 %	25 %	25 %	386712656
5354	NC_017668	TTG	2	6	331532	331537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712656
5355	NC_017668	ATC	2	6	331538	331543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712656
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5358	NC_017668	GTAC	2	8	331719	331726	25 %	25 %	25 %	25 %	386712656
5359	NC_017668	AT	3	6	332004	332009	50 %	50 %	0 %	0 %	386712656
5360	NC_017668	TTGA	2	8	332034	332041	25 %	50 %	25 %	0 %	386712656
5361	NC_017668	CTT	2	6	332043	332048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712656
5362	NC_017668	GCT	2	6	332055	332060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712656
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5364	NC_017668	A	6	6	332282	332287	100 %	0 %	0 %	0 %	386712657
5365	NC_017668	TGA	2	6	332391	332396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712657
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