MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 6326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	GTCA	2	8	1164	1171	25 %	25 %	25 %	25 %	385802383
2	NC_017459	TCAA	2	8	1337	1344	50 %	25 %	0 %	25 %	385802383
3	NC_017459	TTCA	2	8	1871	1878	25 %	50 %	0 %	25 %	385802383
4	NC_017459	ACTT	2	8	1963	1970	25 %	50 %	0 %	25 %	385802383
5	NC_017459	AATT	2	8	2421	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
6	NC_017459	ATAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	385802384
7	NC_017459	TCAC	2	8	2909	2916	25 %	25 %	0 %	50 %	385802384
8	NC_017459	GTTA	2	8	4162	4169	25 %	50 %	25 %	0 %	385802385
9	NC_017459	TCGA	2	8	4177	4184	25 %	25 %	25 %	25 %	385802385
10	NC_017459	GGCA	2	8	5070	5077	25 %	0 %	50 %	25 %	385802385
11	NC_017459	CGGT	2	8	5093	5100	0 %	25 %	50 %	25 %	385802385
12	NC_017459	CTCA	2	8	5435	5442	25 %	25 %	0 %	50 %	385802386
13	NC_017459	GTTT	2	8	5596	5603	0 %	75 %	25 %	0 %	385802386
14	NC_017459	ATAA	2	8	7172	7179	75 %	25 %	0 %	0 %	385802387
15	NC_017459	AATA	2	8	7300	7307	75 %	25 %	0 %	0 %	385802387
16	NC_017459	AAGT	2	8	7390	7397	50 %	25 %	25 %	0 %	385802387
17	NC_017459	ATAC	2	8	9234	9241	50 %	25 %	0 %	25 %	385802388
18	NC_017459	AAAC	2	8	10085	10092	75 %	0 %	0 %	25 %	385802389
19	NC_017459	CGTC	2	8	10739	10746	0 %	25 %	25 %	50 %	385802390
20	NC_017459	CATA	2	8	10819	10826	50 %	25 %	0 %	25 %	385802390
21	NC_017459	ACAA	2	8	10838	10845	75 %	0 %	0 %	25 %	385802390
22	NC_017459	GCTG	2	8	10935	10942	0 %	25 %	50 %	25 %	385802390
23	NC_017459	AGCA	2	8	11378	11385	50 %	0 %	25 %	25 %	385802390
24	NC_017459	ATTG	2	8	12172	12179	25 %	50 %	25 %	0 %	385802390
25	NC_017459	GTTT	2	8	12330	12337	0 %	75 %	25 %	0 %	385802390
26	NC_017459	CTTC	2	8	13560	13567	0 %	50 %	0 %	50 %	385802392
27	NC_017459	CATA	2	8	13696	13703	50 %	25 %	0 %	25 %	385802393
28	NC_017459	TCGT	2	8	13799	13806	0 %	50 %	25 %	25 %	385802393
29	NC_017459	ACAG	2	8	14037	14044	50 %	0 %	25 %	25 %	385802393
30	NC_017459	TCGT	2	8	14072	14079	0 %	50 %	25 %	25 %	385802393
31	NC_017459	TGGA	2	8	14105	14112	25 %	25 %	50 %	0 %	385802393
32	NC_017459	GATT	2	8	14676	14683	25 %	50 %	25 %	0 %	385802393
33	NC_017459	AATA	2	8	15244	15251	75 %	25 %	0 %	0 %	385802393
34	NC_017459	CGAC	2	8	15583	15590	25 %	0 %	25 %	50 %	385802393
35	NC_017459	CACT	2	8	16929	16936	25 %	25 %	0 %	50 %	385802394
36	NC_017459	GGAA	2	8	17136	17143	50 %	0 %	50 %	0 %	385802394
37	NC_017459	TTCT	2	8	17713	17720	0 %	75 %	0 %	25 %	385802395
38	NC_017459	GATA	2	8	18634	18641	50 %	25 %	25 %	0 %	385802396
39	NC_017459	GACA	2	8	19092	19099	50 %	0 %	25 %	25 %	385802397
40	NC_017459	AATG	2	8	20002	20009	50 %	25 %	25 %	0 %	385802398
41	NC_017459	TCGT	2	8	20442	20449	0 %	50 %	25 %	25 %	385802399
42	NC_017459	TTCT	2	8	22592	22599	0 %	75 %	0 %	25 %	385802400
43	NC_017459	GAGC	2	8	23119	23126	25 %	0 %	50 %	25 %	385802401
44	NC_017459	CACT	2	8	23458	23465	25 %	25 %	0 %	50 %	385802401
45	NC_017459	TTCG	2	8	23551	23558	0 %	50 %	25 %	25 %	385802401
46	NC_017459	ATGG	2	8	23709	23716	25 %	25 %	50 %	0 %	385802401
47	NC_017459	GCAG	2	8	23724	23731	25 %	0 %	50 %	25 %	385802401
48	NC_017459	AAGG	2	8	24459	24466	50 %	0 %	50 %	0 %	385802402
49	NC_017459	ACGC	2	8	24774	24781	25 %	0 %	25 %	50 %	385802402
50	NC_017459	TCAG	2	8	24824	24831	25 %	25 %	25 %	25 %	385802402
51	NC_017459	TCAA	2	8	24932	24939	50 %	25 %	0 %	25 %	385802402
52	NC_017459	CAAA	2	8	25604	25611	75 %	0 %	0 %	25 %	385802402
53	NC_017459	CTAT	2	8	26743	26750	25 %	50 %	0 %	25 %	385802403
54	NC_017459	AATT	2	8	27005	27012	50 %	50 %	0 %	0 %	385802403
55	NC_017459	TCAT	2	8	27293	27300	25 %	50 %	0 %	25 %	385802403
56	NC_017459	AGAA	2	8	27305	27312	75 %	0 %	25 %	0 %	385802403
57	NC_017459	CGAC	2	8	27482	27489	25 %	0 %	25 %	50 %	385802403
58	NC_017459	TTCA	2	8	29252	29259	25 %	50 %	0 %	25 %	385802405
59	NC_017459	GCTG	2	8	30268	30275	0 %	25 %	50 %	25 %	385802406
60	NC_017459	AACC	2	8	30324	30331	50 %	0 %	0 %	50 %	385802406
61	NC_017459	GACT	2	8	31195	31202	25 %	25 %	25 %	25 %	385802406
62	NC_017459	GAAT	2	8	31777	31784	50 %	25 %	25 %	0 %	385802407
63	NC_017459	TCAA	2	8	32129	32136	50 %	25 %	0 %	25 %	385802407
64	NC_017459	ATTC	2	8	32946	32953	25 %	50 %	0 %	25 %	385802408
65	NC_017459	CCGA	2	8	33665	33672	25 %	0 %	25 %	50 %	385802409
66	NC_017459	GACC	2	8	34338	34345	25 %	0 %	25 %	50 %	385802410
67	NC_017459	CCAA	2	8	34942	34949	50 %	0 %	0 %	50 %	385802410
68	NC_017459	ACTT	2	8	35937	35944	25 %	50 %	0 %	25 %	385802411
69	NC_017459	GATT	2	8	37090	37097	25 %	50 %	25 %	0 %	385802414
70	NC_017459	CGTC	2	8	37521	37528	0 %	25 %	25 %	50 %	385802415
71	NC_017459	GCTC	2	8	37948	37955	0 %	25 %	25 %	50 %	385802415
72	NC_017459	GATT	2	8	37979	37986	25 %	50 %	25 %	0 %	385802415
73	NC_017459	TTAT	2	8	38107	38114	25 %	75 %	0 %	0 %	385802415
74	NC_017459	GCAC	2	8	39202	39209	25 %	0 %	25 %	50 %	385802417
75	NC_017459	GGAT	2	8	39589	39596	25 %	25 %	50 %	0 %	385802417
76	NC_017459	ATGG	2	8	39679	39686	25 %	25 %	50 %	0 %	385802417
77	NC_017459	GGGT	2	8	40439	40446	0 %	25 %	75 %	0 %	385802418
78	NC_017459	AACC	2	8	41084	41091	50 %	0 %	0 %	50 %	385802418
79	NC_017459	TCAC	2	8	41197	41204	25 %	25 %	0 %	50 %	385802418
80	NC_017459	CTTC	2	8	41458	41465	0 %	50 %	0 %	50 %	385802418
81	NC_017459	TGGT	2	8	41757	41764	0 %	50 %	50 %	0 %	385802418
82	NC_017459	GCTT	2	8	41788	41795	0 %	50 %	25 %	25 %	385802418
83	NC_017459	ATGG	2	8	41833	41840	25 %	25 %	50 %	0 %	385802418
84	NC_017459	ATCT	2	8	41903	41910	25 %	50 %	0 %	25 %	385802418
85	NC_017459	CTGT	2	8	42953	42960	0 %	50 %	25 %	25 %	385802419
86	NC_017459	AGAC	2	8	43715	43722	50 %	0 %	25 %	25 %	385802421
87	NC_017459	CGAC	2	8	43784	43791	25 %	0 %	25 %	50 %	385802421
88	NC_017459	GAAT	2	8	44144	44151	50 %	25 %	25 %	0 %	385802422
89	NC_017459	AGCG	2	8	44210	44217	25 %	0 %	50 %	25 %	385802422
90	NC_017459	ATGG	2	8	46278	46285	25 %	25 %	50 %	0 %	385802424
91	NC_017459	ATCA	2	8	47020	47027	50 %	25 %	0 %	25 %	385802425
92	NC_017459	ATCC	2	8	48085	48092	25 %	25 %	0 %	50 %	385802425
93	NC_017459	TTCA	2	8	48412	48419	25 %	50 %	0 %	25 %	385802425
94	NC_017459	AATG	2	8	48883	48890	50 %	25 %	25 %	0 %	385802426
95	NC_017459	GTCC	2	8	49328	49335	0 %	25 %	25 %	50 %	385802426
96	NC_017459	CATG	2	8	49372	49379	25 %	25 %	25 %	25 %	385802426
97	NC_017459	CCCG	2	8	50518	50525	0 %	0 %	25 %	75 %	385802427
98	NC_017459	ACCC	2	8	50540	50547	25 %	0 %	0 %	75 %	385802427
99	NC_017459	TCAG	2	8	51179	51186	25 %	25 %	25 %	25 %	385802428
100	NC_017459	GCTC	2	8	52868	52875	0 %	25 %	25 %	50 %	385802428
101	NC_017459	TTGA	2	8	53131	53138	25 %	50 %	25 %	0 %	385802428
102	NC_017459	CTTG	2	8	54139	54146	0 %	50 %	25 %	25 %	385802429
103	NC_017459	ACTC	2	8	55050	55057	25 %	25 %	0 %	50 %	385802429
104	NC_017459	AGTT	2	8	55682	55689	25 %	50 %	25 %	0 %	385802430
105	NC_017459	GGTT	2	8	57392	57399	0 %	50 %	50 %	0 %	385802431
106	NC_017459	AATT	2	8	57699	57706	50 %	50 %	0 %	0 %	385802431
107	NC_017459	ACAG	2	8	57822	57829	50 %	0 %	25 %	25 %	385802431
108	NC_017459	CAGA	2	8	58020	58027	50 %	0 %	25 %	25 %	385802431
109	NC_017459	ATGG	2	8	58075	58082	25 %	25 %	50 %	0 %	385802431
110	NC_017459	CCAG	2	8	58141	58148	25 %	0 %	25 %	50 %	385802431
111	NC_017459	TCAC	2	8	58266	58273	25 %	25 %	0 %	50 %	385802431
112	NC_017459	GACT	2	8	59366	59373	25 %	25 %	25 %	25 %	385802432
113	NC_017459	TACA	2	8	59390	59397	50 %	25 %	0 %	25 %	385802432
114	NC_017459	CTAT	2	8	59533	59540	25 %	50 %	0 %	25 %	385802432
115	NC_017459	TCCA	2	8	59977	59984	25 %	25 %	0 %	50 %	385802432
116	NC_017459	GTCG	2	8	60003	60010	0 %	25 %	50 %	25 %	385802432
117	NC_017459	TTCA	2	8	60548	60555	25 %	50 %	0 %	25 %	385802432
118	NC_017459	GGAC	2	8	60561	60568	25 %	0 %	50 %	25 %	385802432
119	NC_017459	ATGC	2	8	62301	62308	25 %	25 %	25 %	25 %	385802433
120	NC_017459	CATT	2	8	62403	62410	25 %	50 %	0 %	25 %	385802433
121	NC_017459	CGGT	2	8	62763	62770	0 %	25 %	50 %	25 %	385802433
122	NC_017459	GACG	2	8	63211	63218	25 %	0 %	50 %	25 %	385802433
123	NC_017459	CATC	2	8	63235	63242	25 %	25 %	0 %	50 %	385802433
124	NC_017459	GTCA	2	8	63243	63250	25 %	25 %	25 %	25 %	385802433
125	NC_017459	GTCG	2	8	63304	63311	0 %	25 %	50 %	25 %	385802433
126	NC_017459	AGTG	2	8	63448	63455	25 %	25 %	50 %	0 %	385802433
127	NC_017459	AACT	2	8	64109	64116	50 %	25 %	0 %	25 %	385802434
128	NC_017459	AGTG	2	8	64325	64332	25 %	25 %	50 %	0 %	385802434
129	NC_017459	TCCA	2	8	65891	65898	25 %	25 %	0 %	50 %	385802436
130	NC_017459	CCAT	2	8	65925	65932	25 %	25 %	0 %	50 %	385802436
131	NC_017459	CATG	2	8	65936	65943	25 %	25 %	25 %	25 %	385802436
132	NC_017459	CTGC	2	8	66063	66070	0 %	25 %	25 %	50 %	385802436
133	NC_017459	TTGT	2	8	75359	75366	0 %	75 %	25 %	0 %	385802438
134	NC_017459	TATT	2	8	75894	75901	25 %	75 %	0 %	0 %	385802439
135	NC_017459	TCGA	2	8	75934	75941	25 %	25 %	25 %	25 %	385802439
136	NC_017459	GTAT	2	8	76417	76424	25 %	50 %	25 %	0 %	385802439
137	NC_017459	CGTT	2	8	77454	77461	0 %	50 %	25 %	25 %	385802440
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