MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017459	ACGAG	2	10	157359	157368	40 %	0 %	40 %	20 %	385802492
2502	NC_017459	GCA	2	6	157373	157378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802492
2503	NC_017459	ACA	2	6	157448	157453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802492
2504	NC_017459	CTT	2	6	157484	157489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802492
2505	NC_017459	CCA	3	9	157515	157523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802492
2506	NC_017459	CGATAT	2	12	157550	157561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802492
2507	NC_017459	TGCA	2	8	157581	157588	25 %	25 %	25 %	25 %	385802492
2508	NC_017459	TGC	2	6	157699	157704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802492
2509	NC_017459	TGGA	2	8	157747	157754	25 %	25 %	50 %	0 %	385802492
2510	NC_017459	ATTT	2	8	157816	157823	25 %	75 %	0 %	0 %	385802492
2511	NC_017459	CTA	2	6	157842	157847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802492
2512	NC_017459	CGG	2	6	157870	157875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802492
2513	NC_017459	GCT	2	6	157916	157921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802492
2514	NC_017459	TGG	3	9	158005	158013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802492
2515	NC_017459	GTG	2	6	158034	158039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802492
2516	NC_017459	ATG	2	6	158273	158278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802493
2517	NC_017459	CGG	2	6	158282	158287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802493
2518	NC_017459	CCGA	2	8	158309	158316	25 %	0 %	25 %	50 %	385802493
2519	NC_017459	TGC	2	6	158415	158420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802493
2520	NC_017459	ATT	2	6	158424	158429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802493
2521	NC_017459	ATC	2	6	158465	158470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802493
2522	NC_017459	GGT	2	6	158485	158490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802493
2523	NC_017459	ACA	2	6	158536	158541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802493
2524	NC_017459	CAT	2	6	158553	158558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802493
2525	NC_017459	CAA	2	6	158572	158577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802493
2526	NC_017459	GCT	2	6	158659	158664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802493
2527	NC_017459	TGA	2	6	158818	158823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802494
2528	NC_017459	CAG	2	6	158840	158845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802494
2529	NC_017459	GGA	2	6	158851	158856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802494
2530	NC_017459	ATA	2	6	158898	158903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802494
2531	NC_017459	CTG	2	6	158904	158909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802494
2532	NC_017459	AGG	2	6	158916	158921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802494
2533	NC_017459	GCA	2	6	158944	158949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802494
2534	NC_017459	A	6	6	159040	159045	100 %	0 %	0 %	0 %	385802494
2535	NC_017459	CGA	2	6	159091	159096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802494
2536	NC_017459	TCG	3	9	159154	159162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802494
2537	NC_017459	CTC	2	6	159209	159214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802495
2538	NC_017459	GCA	2	6	159219	159224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802495
2539	NC_017459	CTT	2	6	159228	159233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802495
2540	NC_017459	GAC	2	6	159282	159287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802495
2541	NC_017459	TGC	2	6	159296	159301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802495
2542	NC_017459	AGC	2	6	159365	159370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802495
2543	NC_017459	ACG	2	6	159375	159380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802495
2544	NC_017459	CAC	2	6	159562	159567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802495
2545	NC_017459	TGA	2	6	159593	159598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802495
2546	NC_017459	ATCT	2	8	159716	159723	25 %	50 %	0 %	25 %	385802495
2547	NC_017459	ATC	2	6	159751	159756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802495
2548	NC_017459	ATG	2	6	159766	159771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802495
2549	NC_017459	ACATA	2	10	159774	159783	60 %	20 %	0 %	20 %	385802495
2550	NC_017459	GTAT	2	8	159919	159926	25 %	50 %	25 %	0 %	385802496
2551	NC_017459	C	7	7	159956	159962	0 %	0 %	0 %	100 %	385802496
2552	NC_017459	GAC	2	6	160001	160006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802496
2553	NC_017459	ATGT	2	8	160062	160069	25 %	50 %	25 %	0 %	385802496
2554	NC_017459	GAA	2	6	160092	160097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802496
2555	NC_017459	GAT	2	6	160116	160121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802496
2556	NC_017459	GTT	2	6	160176	160181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802496
2557	NC_017459	ACAA	2	8	160183	160190	75 %	0 %	0 %	25 %	385802496
2558	NC_017459	TGC	2	6	160343	160348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802496
2559	NC_017459	GACT	2	8	160369	160376	25 %	25 %	25 %	25 %	385802496
2560	NC_017459	ATG	3	9	160444	160452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802496
2561	NC_017459	ACT	2	6	160526	160531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802496
2562	NC_017459	TGA	2	6	160571	160576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802496
2563	NC_017459	TCT	2	6	160577	160582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802496
2564	NC_017459	AAC	2	6	160583	160588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802496
2565	NC_017459	TGA	2	6	160673	160678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802496
2566	NC_017459	AAC	2	6	160712	160717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802496
2567	NC_017459	ATT	2	6	160732	160737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802496
2568	NC_017459	TGG	2	6	160796	160801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802496
2569	NC_017459	TGG	2	6	160832	160837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802496
2570	NC_017459	CAAC	2	8	160839	160846	50 %	0 %	0 %	50 %	385802496
2571	NC_017459	GAG	2	6	160920	160925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802496
2572	NC_017459	ACA	2	6	160929	160934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802496
2573	NC_017459	TCA	2	6	161089	161094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802496
2574	NC_017459	ATG	2	6	161119	161124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802496
2575	NC_017459	AAC	2	6	161159	161164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802496
2576	NC_017459	ATG	2	6	161194	161199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802496
2577	NC_017459	AATC	2	8	161224	161231	50 %	25 %	0 %	25 %	385802496
2578	NC_017459	GCA	3	9	161458	161466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802497
2579	NC_017459	ATG	2	6	161618	161623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802497
2580	NC_017459	ACATAT	2	12	161635	161646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385802497
2581	NC_017459	CTG	2	6	161687	161692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802497
2582	NC_017459	GAT	3	9	161737	161745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802497
2583	NC_017459	TGA	2	6	161781	161786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802497
2584	NC_017459	CTG	2	6	161810	161815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802497
2585	NC_017459	TCG	2	6	161838	161843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802497
2586	NC_017459	CT	3	6	162027	162032	0 %	50 %	0 %	50 %	385802497
2587	NC_017459	GATCA	2	10	162110	162119	40 %	20 %	20 %	20 %	385802497
2588	NC_017459	GAA	2	6	162427	162432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802498
2589	NC_017459	GAT	2	6	162463	162468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802498
2590	NC_017459	TA	4	8	162963	162970	50 %	50 %	0 %	0 %	385802499
2591	NC_017459	CGAA	2	8	162984	162991	50 %	0 %	25 %	25 %	385802499
2592	NC_017459	AGC	2	6	163151	163156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802499
2593	NC_017459	GAG	2	6	163159	163164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802499
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2597	NC_017459	GACAT	2	10	163507	163516	40 %	20 %	20 %	20 %	385802499
2598	NC_017459	ATC	2	6	163529	163534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802499
2599	NC_017459	ATG	2	6	163637	163642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802499
2600	NC_017459	AAAG	2	8	163692	163699	75 %	0 %	25 %	0 %	385802499
2601	NC_017459	CGA	2	6	163720	163725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802499
2602	NC_017459	TGC	2	6	163740	163745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802499
2603	NC_017459	AGC	2	6	163848	163853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802499
2604	NC_017459	TCTTAA	2	12	163854	163865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385802499
2605	NC_017459	TCAC	2	8	163894	163901	25 %	25 %	0 %	50 %	385802499
2606	NC_017459	TGA	2	6	163905	163910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802499
2607	NC_017459	CAA	2	6	163937	163942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802499
2608	NC_017459	AT	3	6	163944	163949	50 %	50 %	0 %	0 %	385802499
2609	NC_017459	TGA	2	6	164096	164101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802499
2610	NC_017459	GAT	2	6	164110	164115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802499
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2612	NC_017459	TTG	2	6	164216	164221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802499
2613	NC_017459	TTA	2	6	164251	164256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802499
2614	NC_017459	TGA	2	6	164310	164315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802499
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2616	NC_017459	GAG	2	6	164395	164400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802499
2617	NC_017459	TGA	2	6	164427	164432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802499
2618	NC_017459	AT	3	6	164434	164439	50 %	50 %	0 %	0 %	385802499
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2620	NC_017459	TGA	2	6	164478	164483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802499
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2982	NC_017459	ATGG	2	8	185884	185891	25 %	25 %	50 %	0 %	385802518
2983	NC_017459	CGA	2	6	185896	185901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802518
2984	NC_017459	TTA	2	6	185925	185930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802518
2985	NC_017459	CT	3	6	185963	185968	0 %	50 %	0 %	50 %	385802518
2986	NC_017459	ATCG	2	8	186089	186096	25 %	25 %	25 %	25 %	385802518
2987	NC_017459	GAAT	2	8	186103	186110	50 %	25 %	25 %	0 %	385802518
2988	NC_017459	CGA	2	6	186165	186170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802518
2989	NC_017459	ATC	2	6	186380	186385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802518
2990	NC_017459	ACA	2	6	186398	186403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802518
2991	NC_017459	ACT	2	6	186434	186439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802518
2992	NC_017459	GCC	2	6	186452	186457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802518
2993	NC_017459	GGT	2	6	186476	186481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802518
2994	NC_017459	CT	3	6	186563	186568	0 %	50 %	0 %	50 %	385802518
2995	NC_017459	GTTGT	2	10	186576	186585	0 %	60 %	40 %	0 %	385802518
2996	NC_017459	GAGC	2	8	186599	186606	25 %	0 %	50 %	25 %	385802518
2997	NC_017459	TGC	2	6	186613	186618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802518
2998	NC_017459	AGA	2	6	186619	186624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802518
2999	NC_017459	ACA	2	6	186659	186664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802518
3000	NC_017459	TGA	2	6	186721	186726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802518

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