MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 50447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017459	CAA	2	6	30479	30484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802406
502	NC_017459	GCA	2	6	30505	30510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802406
503	NC_017459	GCA	2	6	30550	30555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802406
504	NC_017459	TCA	2	6	30589	30594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802406
505	NC_017459	A	6	6	30768	30773	100 %	0 %	0 %	0 %	385802406
506	NC_017459	AT	3	6	30889	30894	50 %	50 %	0 %	0 %	385802406
507	NC_017459	TAT	2	6	30932	30937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802406
508	NC_017459	ATG	2	6	30941	30946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802406
509	NC_017459	GACT	2	8	31195	31202	25 %	25 %	25 %	25 %	385802406
510	NC_017459	GAT	2	6	31224	31229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802406
511	NC_017459	GCC	2	6	31258	31263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802406
512	NC_017459	GTA	2	6	31274	31279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802406
513	NC_017459	TCCCC	2	10	31295	31304	0 %	20 %	0 %	80 %	385802406
514	NC_017459	AAC	2	6	31305	31310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802406
515	NC_017459	CGAAC	2	10	31326	31335	40 %	0 %	20 %	40 %	385802406
516	NC_017459	TGT	2	6	31640	31645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802407
517	NC_017459	TGT	2	6	31694	31699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802407
518	NC_017459	GCA	2	6	31701	31706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802407
519	NC_017459	GAAT	2	8	31777	31784	50 %	25 %	25 %	0 %	385802407
520	NC_017459	CTG	2	6	31789	31794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802407
521	NC_017459	ATG	2	6	31858	31863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802407
522	NC_017459	ACT	2	6	31871	31876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802407
523	NC_017459	TGC	2	6	31985	31990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802407
524	NC_017459	GTT	2	6	32001	32006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802407
525	NC_017459	TCAA	2	8	32129	32136	50 %	25 %	0 %	25 %	385802407
526	NC_017459	TGA	2	6	32204	32209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802407
527	NC_017459	GCA	2	6	32238	32243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802407
528	NC_017459	GT	3	6	32301	32306	0 %	50 %	50 %	0 %	385802407
529	NC_017459	CAT	2	6	32505	32510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802408
530	NC_017459	GGTGCA	2	12	32516	32527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385802408
531	NC_017459	GAT	2	6	32528	32533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802408
532	NC_017459	CCG	2	6	32559	32564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802408
533	NC_017459	TTC	2	6	32633	32638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802408
534	NC_017459	TGA	2	6	32713	32718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802408
535	NC_017459	TAA	2	6	32764	32769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802408
536	NC_017459	TGA	2	6	32824	32829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802408
537	NC_017459	CGG	2	6	32908	32913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802408
538	NC_017459	ATTC	2	8	32946	32953	25 %	50 %	0 %	25 %	385802408
539	NC_017459	CAT	2	6	33005	33010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802408
540	NC_017459	ATT	2	6	33022	33027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802408
541	NC_017459	CG	3	6	33037	33042	0 %	0 %	50 %	50 %	385802408
542	NC_017459	TGA	2	6	33321	33326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802409
543	NC_017459	GAA	2	6	33343	33348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802409
544	NC_017459	CAG	2	6	33358	33363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802409
545	NC_017459	CTT	2	6	33379	33384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802409
546	NC_017459	ATG	2	6	33404	33409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802409
547	NC_017459	GTT	2	6	33418	33423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802409
548	NC_017459	TGG	2	6	33426	33431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802409
549	NC_017459	ATG	3	9	33515	33523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802409
550	NC_017459	TGC	2	6	33642	33647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802409
551	NC_017459	CCGA	2	8	33665	33672	25 %	0 %	25 %	50 %	385802409
552	NC_017459	TGA	2	6	33717	33722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802409
553	NC_017459	TA	3	6	33731	33736	50 %	50 %	0 %	0 %	385802409
554	NC_017459	GAT	2	6	33745	33750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802409
555	NC_017459	GACC	2	8	34338	34345	25 %	0 %	25 %	50 %	385802410
556	NC_017459	ATG	2	6	34364	34369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802410
557	NC_017459	GGT	2	6	34443	34448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802410
558	NC_017459	GCTGAA	2	12	34468	34479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385802410
559	NC_017459	AAG	2	6	34499	34504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802410
560	NC_017459	TAC	2	6	34560	34565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802410
561	NC_017459	AAC	2	6	34566	34571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802410
562	NC_017459	CAG	2	6	34637	34642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802410
563	NC_017459	CGG	2	6	34722	34727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802410
564	NC_017459	GTC	2	6	34801	34806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802410
565	NC_017459	A	7	7	34808	34814	100 %	0 %	0 %	0 %	385802410
566	NC_017459	AT	3	6	34824	34829	50 %	50 %	0 %	0 %	385802410
567	NC_017459	TCG	2	6	34866	34871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802410
568	NC_017459	GAG	2	6	34878	34883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802410
569	NC_017459	CAT	2	6	34904	34909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802410
570	NC_017459	TGT	2	6	34917	34922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802410
571	NC_017459	CCAA	2	8	34942	34949	50 %	0 %	0 %	50 %	385802410
572	NC_017459	CAA	2	6	34985	34990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802410
573	NC_017459	AT	3	6	35527	35532	50 %	50 %	0 %	0 %	385802411
574	NC_017459	TCA	3	9	35536	35544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802411
575	NC_017459	ATC	2	6	35550	35555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802411
576	NC_017459	CAG	2	6	35568	35573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802411
577	NC_017459	CTG	2	6	35627	35632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802411
578	NC_017459	CAT	2	6	35669	35674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802411
579	NC_017459	CA	3	6	35693	35698	50 %	0 %	0 %	50 %	385802411
580	NC_017459	TCA	2	6	35821	35826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802411
581	NC_017459	CG	4	8	35853	35860	0 %	0 %	50 %	50 %	385802411
582	NC_017459	CAA	2	6	35882	35887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802411
583	NC_017459	ACAATA	2	12	35914	35925	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385802411
584	NC_017459	ACTT	2	8	35937	35944	25 %	50 %	0 %	25 %	385802411
585	NC_017459	CTGTT	2	10	36066	36075	0 %	60 %	20 %	20 %	385802411
586	NC_017459	TG	3	6	36118	36123	0 %	50 %	50 %	0 %	385802411
587	NC_017459	ATG	2	6	36328	36333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802412
588	NC_017459	AG	3	6	36420	36425	50 %	0 %	50 %	0 %	385802412
589	NC_017459	TCA	2	6	36657	36662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802413
590	NC_017459	TTA	2	6	36725	36730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802413
591	NC_017459	CTG	2	6	36882	36887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802413
592	NC_017459	TGG	2	6	36913	36918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802413
593	NC_017459	TTA	2	6	36939	36944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802413
594	NC_017459	GCT	2	6	36959	36964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802413
595	NC_017459	TGA	2	6	36966	36971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802413
596	NC_017459	TGA	2	6	36977	36982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802413
597	NC_017459	GATT	2	8	37090	37097	25 %	50 %	25 %	0 %	385802414
598	NC_017459	TGA	2	6	37217	37222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802414
599	NC_017459	AATGA	2	10	37254	37263	60 %	20 %	20 %	0 %	385802414
600	NC_017459	TTG	2	6	37358	37363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802415
601	NC_017459	AGTGAG	2	12	37368	37379	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385802415
602	NC_017459	TTC	2	6	37380	37385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802415
603	NC_017459	CA	3	6	37415	37420	50 %	0 %	0 %	50 %	385802415
604	NC_017459	ATT	2	6	37425	37430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802415
605	NC_017459	TCA	2	6	37462	37467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802415
606	NC_017459	CGTC	2	8	37521	37528	0 %	25 %	25 %	50 %	385802415
607	NC_017459	ACTCAA	2	12	37550	37561	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385802415
608	NC_017459	ATT	2	6	37572	37577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802415
609	NC_017459	GCTGT	2	10	37670	37679	0 %	40 %	40 %	20 %	385802415
610	NC_017459	CTG	2	6	37814	37819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802415
611	NC_017459	TCATGA	2	12	37843	37854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802415
612	NC_017459	GT	3	6	37917	37922	0 %	50 %	50 %	0 %	385802415
613	NC_017459	GCTC	2	8	37948	37955	0 %	25 %	25 %	50 %	385802415
614	NC_017459	GATT	2	8	37979	37986	25 %	50 %	25 %	0 %	385802415
615	NC_017459	TAT	2	6	37992	37997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802415
616	NC_017459	GTT	2	6	38020	38025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802415
617	NC_017459	CTG	2	6	38079	38084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802415
618	NC_017459	TTAT	2	8	38107	38114	25 %	75 %	0 %	0 %	385802415
619	NC_017459	ATC	2	6	38175	38180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802415
620	NC_017459	CAT	3	9	38183	38191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802415
621	NC_017459	TCA	2	6	38212	38217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802415
622	NC_017459	TCA	2	6	38233	38238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802415
623	NC_017459	CAA	2	6	38264	38269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802415
624	NC_017459	CAA	2	6	38273	38278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802415
625	NC_017459	GCC	2	6	38302	38307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802415
626	NC_017459	ACA	2	6	38407	38412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802415
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