MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	TC	4	8	1802	1809	0 %	50 %	0 %	50 %	385802307
2	NC_017457	AT	3	6	2495	2500	50 %	50 %	0 %	0 %	385802308
3	NC_017457	GA	3	6	3356	3361	50 %	0 %	50 %	0 %	385802309
4	NC_017457	AT	3	6	4955	4960	50 %	50 %	0 %	0 %	385802312
5	NC_017457	TA	3	6	5092	5097	50 %	50 %	0 %	0 %	385802312
6	NC_017457	TC	3	6	7013	7018	0 %	50 %	0 %	50 %	385802313
7	NC_017457	AC	3	6	7373	7378	50 %	0 %	0 %	50 %	385802313
8	NC_017457	CA	3	6	7703	7708	50 %	0 %	0 %	50 %	385802313
9	NC_017457	GA	3	6	7945	7950	50 %	0 %	50 %	0 %	385802313
10	NC_017457	CA	3	6	8774	8779	50 %	0 %	0 %	50 %	385802313
11	NC_017457	AC	3	6	9417	9422	50 %	0 %	0 %	50 %	385802314
12	NC_017457	TA	3	6	12733	12738	50 %	50 %	0 %	0 %	385802317
13	NC_017457	AT	3	6	13032	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	385802317
14	NC_017457	CT	3	6	13072	13077	0 %	50 %	0 %	50 %	385802317
15	NC_017457	GA	3	6	14013	14018	50 %	0 %	50 %	0 %	385802317
16	NC_017457	AC	3	6	14412	14417	50 %	0 %	0 %	50 %	385802317
17	NC_017457	AT	3	6	14658	14663	50 %	50 %	0 %	0 %	385802317
18	NC_017457	TC	3	6	14682	14687	0 %	50 %	0 %	50 %	385802317
19	NC_017457	CT	3	6	14967	14972	0 %	50 %	0 %	50 %	385802317
20	NC_017457	AT	3	6	14981	14986	50 %	50 %	0 %	0 %	385802317
21	NC_017457	AG	3	6	15528	15533	50 %	0 %	50 %	0 %	385802317
22	NC_017457	TG	3	6	15815	15820	0 %	50 %	50 %	0 %	385802317
23	NC_017457	GA	3	6	16142	16147	50 %	0 %	50 %	0 %	385802317
24	NC_017457	AG	3	6	17188	17193	50 %	0 %	50 %	0 %	385802318
25	NC_017457	GA	3	6	19329	19334	50 %	0 %	50 %	0 %	385802319
26	NC_017457	TC	3	6	19754	19759	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
27	NC_017457	CT	3	6	19965	19970	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
28	NC_017457	CT	5	10	20036	20045	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
29	NC_017457	TG	3	6	20052	20057	0 %	50 %	50 %	0 %	385802320
30	NC_017457	TC	3	6	20147	20152	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
31	NC_017457	CA	3	6	20210	20215	50 %	0 %	0 %	50 %	385802320
32	NC_017457	TC	3	6	20222	20227	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
33	NC_017457	TC	3	6	20267	20272	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
34	NC_017457	TC	3	6	20402	20407	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
35	NC_017457	TC	3	6	20486	20491	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
36	NC_017457	CT	3	6	20607	20612	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
37	NC_017457	TC	3	6	20825	20830	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
38	NC_017457	TC	3	6	20930	20935	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
39	NC_017457	CA	4	8	21008	21015	50 %	0 %	0 %	50 %	385802320
40	NC_017457	TC	3	6	21035	21040	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
41	NC_017457	CT	3	6	21051	21056	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
42	NC_017457	TC	3	6	21065	21070	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
43	NC_017457	TC	3	6	21095	21100	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
44	NC_017457	TC	3	6	21110	21115	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
45	NC_017457	TC	3	6	21200	21205	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
46	NC_017457	TC	3	6	21215	21220	0 %	50 %	0 %	50 %	385802320
47	NC_017457	AT	4	8	21588	21595	50 %	50 %	0 %	0 %	385802321
48	NC_017457	GA	3	6	22489	22494	50 %	0 %	50 %	0 %	385802322
49	NC_017457	TA	3	6	22729	22734	50 %	50 %	0 %	0 %	385802322
50	NC_017457	GA	3	6	23335	23340	50 %	0 %	50 %	0 %	385802322
51	NC_017457	AT	3	6	23501	23506	50 %	50 %	0 %	0 %	385802322
52	NC_017457	TG	3	6	23530	23535	0 %	50 %	50 %	0 %	385802322
53	NC_017457	GA	3	6	25384	25389	50 %	0 %	50 %	0 %	385802323
54	NC_017457	GA	3	6	26195	26200	50 %	0 %	50 %	0 %	385802324
55	NC_017457	GA	4	8	26609	26616	50 %	0 %	50 %	0 %	385802324
56	NC_017457	AG	3	6	26740	26745	50 %	0 %	50 %	0 %	385802324
57	NC_017457	AT	3	6	27063	27068	50 %	50 %	0 %	0 %	385802324
58	NC_017457	TG	3	6	27326	27331	0 %	50 %	50 %	0 %	385802324
59	NC_017457	AC	3	6	28020	28025	50 %	0 %	0 %	50 %	385802324
60	NC_017457	CT	4	8	28157	28164	0 %	50 %	0 %	50 %	385802324
61	NC_017457	GA	3	6	28259	28264	50 %	0 %	50 %	0 %	385802325
62	NC_017457	TC	3	6	28392	28397	0 %	50 %	0 %	50 %	385802325
63	NC_017457	GA	3	6	29782	29787	50 %	0 %	50 %	0 %	385802326
64	NC_017457	TA	3	6	32161	32166	50 %	50 %	0 %	0 %	385802328
65	NC_017457	TC	3	6	35498	35503	0 %	50 %	0 %	50 %	385802330
66	NC_017457	AT	3	6	37786	37791	50 %	50 %	0 %	0 %	385802332
67	NC_017457	CT	3	6	40735	40740	0 %	50 %	0 %	50 %	385802336
68	NC_017457	GA	3	6	40786	40791	50 %	0 %	50 %	0 %	385802336
69	NC_017457	GA	3	6	41158	41163	50 %	0 %	50 %	0 %	385802336
70	NC_017457	CT	3	6	41425	41430	0 %	50 %	0 %	50 %	385802336
71	NC_017457	GA	3	6	42249	42254	50 %	0 %	50 %	0 %	385802337
72	NC_017457	AG	3	6	42746	42751	50 %	0 %	50 %	0 %	385802338
73	NC_017457	CA	3	6	42824	42829	50 %	0 %	0 %	50 %	385802338
74	NC_017457	AT	3	6	45081	45086	50 %	50 %	0 %	0 %	385802339
75	NC_017457	AT	3	6	45513	45518	50 %	50 %	0 %	0 %	385802339
76	NC_017457	AT	3	6	48509	48514	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
77	NC_017457	AT	4	8	48619	48626	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
78	NC_017457	AT	3	6	48777	48782	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
79	NC_017457	AG	3	6	49050	49055	50 %	0 %	50 %	0 %	385802342
80	NC_017457	TA	3	6	49285	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
81	NC_017457	TA	3	6	50585	50590	50 %	50 %	0 %	0 %	385802344
82	NC_017457	TC	3	6	50699	50704	0 %	50 %	0 %	50 %	385802344
83	NC_017457	GA	3	6	50992	50997	50 %	0 %	50 %	0 %	385802344
84	NC_017457	TG	3	6	51271	51276	0 %	50 %	50 %	0 %	385802345
85	NC_017457	AT	3	6	52936	52941	50 %	50 %	0 %	0 %	385802346
86	NC_017457	AC	3	6	53555	53560	50 %	0 %	0 %	50 %	385802346
87	NC_017457	GA	3	6	54080	54085	50 %	0 %	50 %	0 %	385802346
88	NC_017457	AC	3	6	54290	54295	50 %	0 %	0 %	50 %	385802346
89	NC_017457	AG	3	6	54373	54378	50 %	0 %	50 %	0 %	385802346
90	NC_017457	AG	3	6	55065	55070	50 %	0 %	50 %	0 %	385802346
91	NC_017457	CT	3	6	55836	55841	0 %	50 %	0 %	50 %	385802347
92	NC_017457	CA	3	6	55887	55892	50 %	0 %	0 %	50 %	385802347
93	NC_017457	GA	3	6	57204	57209	50 %	0 %	50 %	0 %	385802349
94	NC_017457	AT	3	6	57573	57578	50 %	50 %	0 %	0 %	385802349
95	NC_017457	AG	3	6	58898	58903	50 %	0 %	50 %	0 %	385802350
96	NC_017457	CT	3	6	59165	59170	0 %	50 %	0 %	50 %	385802350
97	NC_017457	AT	3	6	60674	60679	50 %	50 %	0 %	0 %	385802352
98	NC_017457	CT	3	6	61004	61009	0 %	50 %	0 %	50 %	385802353
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100	NC_017457	TG	3	6	61377	61382	0 %	50 %	50 %	0 %	385802353
101	NC_017457	GA	3	6	61594	61599	50 %	0 %	50 %	0 %	385802353
102	NC_017457	AT	3	6	62012	62017	50 %	50 %	0 %	0 %	385802354
103	NC_017457	AT	3	6	62752	62757	50 %	50 %	0 %	0 %	385802355
104	NC_017457	TA	3	6	65163	65168	50 %	50 %	0 %	0 %	385802357
105	NC_017457	AT	3	6	66543	66548	50 %	50 %	0 %	0 %	385802358
106	NC_017457	TC	3	6	66711	66716	0 %	50 %	0 %	50 %	385802358
107	NC_017457	CA	3	6	66886	66891	50 %	0 %	0 %	50 %	385802358
108	NC_017457	CA	3	6	67563	67568	50 %	0 %	0 %	50 %	385802358
109	NC_017457	CA	3	6	68060	68065	50 %	0 %	0 %	50 %	385802359
110	NC_017457	TC	3	6	68579	68584	0 %	50 %	0 %	50 %	385802359
111	NC_017457	AC	3	6	68679	68684	50 %	0 %	0 %	50 %	385802359
112	NC_017457	AT	4	8	70109	70116	50 %	50 %	0 %	0 %	385802360
113	NC_017457	TC	3	6	70454	70459	0 %	50 %	0 %	50 %	385802360
114	NC_017457	TC	3	6	70641	70646	0 %	50 %	0 %	50 %	385802360
115	NC_017457	TC	3	6	70744	70749	0 %	50 %	0 %	50 %	385802361
116	NC_017457	TC	3	6	71722	71727	0 %	50 %	0 %	50 %	385802361
117	NC_017457	AG	3	6	71749	71754	50 %	0 %	50 %	0 %	385802361
118	NC_017457	AC	3	6	72857	72862	50 %	0 %	0 %	50 %	385802361
119	NC_017457	GA	3	6	73041	73046	50 %	0 %	50 %	0 %	385802361
120	NC_017457	GA	3	6	73053	73058	50 %	0 %	50 %	0 %	385802361
121	NC_017457	GA	3	6	73917	73922	50 %	0 %	50 %	0 %	385802362
122	NC_017457	GA	3	6	74005	74010	50 %	0 %	50 %	0 %	385802362
123	NC_017457	AG	3	6	78813	78818	50 %	0 %	50 %	0 %	385802365
124	NC_017457	AG	3	6	79017	79022	50 %	0 %	50 %	0 %	385802365
125	NC_017457	TC	3	6	80031	80036	0 %	50 %	0 %	50 %	385802366
126	NC_017457	CA	3	6	80842	80847	50 %	0 %	0 %	50 %	385802367
127	NC_017457	TA	4	8	81277	81284	50 %	50 %	0 %	0 %	385802367
128	NC_017457	AG	3	6	81416	81421	50 %	0 %	50 %	0 %	385802367
129	NC_017457	TC	3	6	82055	82060	0 %	50 %	0 %	50 %	385802368
130	NC_017457	AC	3	6	82291	82296	50 %	0 %	0 %	50 %	385802368
131	NC_017457	GA	3	6	82325	82330	50 %	0 %	50 %	0 %	385802368
132	NC_017457	TC	3	6	83984	83989	0 %	50 %	0 %	50 %	385802369
133	NC_017457	CT	3	6	84015	84020	0 %	50 %	0 %	50 %	385802369
134	NC_017457	TC	3	6	84209	84214	0 %	50 %	0 %	50 %	385802369
135	NC_017457	CA	3	6	85500	85505	50 %	0 %	0 %	50 %	385802370
136	NC_017457	TG	3	6	85679	85684	0 %	50 %	50 %	0 %	385802370
137	NC_017457	GT	3	6	86022	86027	0 %	50 %	50 %	0 %	385802370
138	NC_017457	TG	3	6	86081	86086	0 %	50 %	50 %	0 %	385802370
139	NC_017457	AG	3	6	87407	87412	50 %	0 %	50 %	0 %	385802372
140	NC_017457	CT	3	6	90520	90525	0 %	50 %	0 %	50 %	385802373
141	NC_017457	AT	3	6	90800	90805	50 %	50 %	0 %	0 %	385802373
142	NC_017457	AG	3	6	92748	92753	50 %	0 %	50 %	0 %	385802373
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.