MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 1335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017457	CCT	3	9	38155	38163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802332
502	NC_017457	TGG	2	6	38177	38182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802332
503	NC_017457	CTG	2	6	38207	38212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802332
504	NC_017457	ATA	2	6	38239	38244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802332
505	NC_017457	ATG	2	6	38561	38566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802333
506	NC_017457	GAT	2	6	38593	38598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802333
507	NC_017457	ATG	2	6	38603	38608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802333
508	NC_017457	AAG	2	6	38623	38628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802333
509	NC_017457	TTCA	2	8	38648	38655	25 %	50 %	0 %	25 %	385802333
510	NC_017457	GGGAAG	4	24	38687	38710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802333
511	NC_017457	GAT	3	9	38716	38724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802333
512	NC_017457	ATT	2	6	38966	38971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802334
513	NC_017457	ATCA	2	8	38977	38984	50 %	25 %	0 %	25 %	385802334
514	NC_017457	TCC	2	6	39003	39008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802334
515	NC_017457	TCA	2	6	39024	39029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802334
516	NC_017457	TCA	2	6	39125	39130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802334
517	NC_017457	TCC	2	6	39238	39243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802335
518	NC_017457	GAC	2	6	39284	39289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802335
519	NC_017457	AAGT	2	8	39297	39304	50 %	25 %	25 %	0 %	385802335
520	NC_017457	CATT	2	8	39322	39329	25 %	50 %	0 %	25 %	385802335
521	NC_017457	CAT	2	6	39330	39335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802335
522	NC_017457	ATC	2	6	39369	39374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802335
523	NC_017457	GTC	2	6	39375	39380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802335
524	NC_017457	T	6	6	39385	39390	0 %	100 %	0 %	0 %	385802335
525	NC_017457	CAG	2	6	39401	39406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802335
526	NC_017457	GAA	2	6	39416	39421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802335
527	NC_017457	GAAT	2	8	39471	39478	50 %	25 %	25 %	0 %	385802335
528	NC_017457	GGT	2	6	39496	39501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802335
529	NC_017457	CTG	2	6	39530	39535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802335
530	NC_017457	A	6	6	40694	40699	100 %	0 %	0 %	0 %	385802336
531	NC_017457	GAT	2	6	40711	40716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802336
532	NC_017457	GAC	2	6	40725	40730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802336
533	NC_017457	CT	3	6	40735	40740	0 %	50 %	0 %	50 %	385802336
534	NC_017457	GA	3	6	40786	40791	50 %	0 %	50 %	0 %	385802336
535	NC_017457	ACT	2	6	40812	40817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802336
536	NC_017457	AAC	2	6	40935	40940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802336
537	NC_017457	AAG	2	6	40991	40996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802336
538	NC_017457	AGAA	2	8	41000	41007	75 %	0 %	25 %	0 %	385802336
539	NC_017457	TGGAC	2	10	41020	41029	20 %	20 %	40 %	20 %	385802336
540	NC_017457	GTCA	2	8	41071	41078	25 %	25 %	25 %	25 %	385802336
541	NC_017457	GGGT	2	8	41134	41141	0 %	25 %	75 %	0 %	385802336
542	NC_017457	GA	3	6	41158	41163	50 %	0 %	50 %	0 %	385802336
543	NC_017457	CGC	2	6	41178	41183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802336
544	NC_017457	TAT	2	6	41216	41221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802336
545	NC_017457	ATGGA	2	10	41237	41246	40 %	20 %	40 %	0 %	385802336
546	NC_017457	ATT	2	6	41311	41316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802336
547	NC_017457	GAG	2	6	41332	41337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802336
548	NC_017457	CGT	2	6	41350	41355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802336
549	NC_017457	TCA	2	6	41383	41388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802336
550	NC_017457	ACT	2	6	41403	41408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802336
551	NC_017457	CT	3	6	41425	41430	0 %	50 %	0 %	50 %	385802336
552	NC_017457	TGA	2	6	41436	41441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802336
553	NC_017457	GACCCC	2	12	41473	41484	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385802336
554	NC_017457	GAAG	2	8	41592	41599	50 %	0 %	50 %	0 %	385802336
555	NC_017457	TGT	2	6	41600	41605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802336
556	NC_017457	ACTC	2	8	41633	41640	25 %	25 %	0 %	50 %	385802336
557	NC_017457	AGGT	2	8	41708	41715	25 %	25 %	50 %	0 %	385802336
558	NC_017457	ACT	2	6	41984	41989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802337
559	NC_017457	GGC	2	6	42035	42040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802337
560	NC_017457	GAA	2	6	42126	42131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802337
561	NC_017457	TCCTG	2	10	42236	42245	0 %	40 %	20 %	40 %	385802337
562	NC_017457	GA	3	6	42249	42254	50 %	0 %	50 %	0 %	385802337
563	NC_017457	GATG	2	8	42678	42685	25 %	25 %	50 %	0 %	385802338
564	NC_017457	AGTGAG	2	12	42736	42747	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385802338
565	NC_017457	AG	3	6	42746	42751	50 %	0 %	50 %	0 %	385802338
566	NC_017457	AGA	2	6	42766	42771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802338
567	NC_017457	AGG	2	6	42818	42823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802338
568	NC_017457	CA	3	6	42824	42829	50 %	0 %	0 %	50 %	385802338
569	NC_017457	AGTA	2	8	42853	42860	50 %	25 %	25 %	0 %	385802338
570	NC_017457	TCAT	2	8	45065	45072	25 %	50 %	0 %	25 %	385802339
571	NC_017457	AT	3	6	45081	45086	50 %	50 %	0 %	0 %	385802339
572	NC_017457	CCG	2	6	45122	45127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802339
573	NC_017457	ATG	2	6	45152	45157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802339
574	NC_017457	CTG	2	6	45167	45172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802339
575	NC_017457	TAT	2	6	45206	45211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802339
576	NC_017457	GACCAC	2	12	45220	45231	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385802339
577	NC_017457	TCA	2	6	45234	45239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802339
578	NC_017457	GTT	2	6	45298	45303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802339
579	NC_017457	TTG	2	6	45402	45407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802339
580	NC_017457	CCA	2	6	45417	45422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802339
581	NC_017457	AT	3	6	45513	45518	50 %	50 %	0 %	0 %	385802339
582	NC_017457	TCT	2	6	45568	45573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802339
583	NC_017457	GAA	2	6	46002	46007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802340
584	NC_017457	AGA	2	6	46013	46018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802340
585	NC_017457	CAA	2	6	46032	46037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802340
586	NC_017457	TAG	2	6	46038	46043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802340
587	NC_017457	ACCA	2	8	46045	46052	50 %	0 %	0 %	50 %	385802340
588	NC_017457	CAA	2	6	46113	46118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802340
589	NC_017457	TAT	2	6	46135	46140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802340
590	NC_017457	CCCTT	2	10	46186	46195	0 %	40 %	0 %	60 %	385802340
591	NC_017457	ACG	2	6	46201	46206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802340
592	NC_017457	TCA	2	6	46226	46231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802340
593	NC_017457	ACTC	2	8	46233	46240	25 %	25 %	0 %	50 %	385802340
594	NC_017457	GAC	2	6	46399	46404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802341
595	NC_017457	AATC	2	8	46449	46456	50 %	25 %	0 %	25 %	385802341
596	NC_017457	AGA	2	6	46519	46524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802341
597	NC_017457	TGA	2	6	46561	46566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802341
598	NC_017457	TGA	2	6	46603	46608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802341
599	NC_017457	AT	3	6	48509	48514	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
600	NC_017457	GTT	2	6	48552	48557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802342
601	NC_017457	TTG	2	6	48607	48612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802342
602	NC_017457	AT	4	8	48619	48626	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
603	NC_017457	TGA	2	6	48662	48667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802342
604	NC_017457	A	8	8	48675	48682	100 %	0 %	0 %	0 %	385802342
605	NC_017457	GAA	2	6	48693	48698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802342
606	NC_017457	ATT	2	6	48751	48756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802342
607	NC_017457	GAA	2	6	48764	48769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802342
608	NC_017457	AT	3	6	48777	48782	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
609	NC_017457	GAAG	2	8	48809	48816	50 %	0 %	50 %	0 %	385802342
610	NC_017457	TCA	2	6	48860	48865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802342
611	NC_017457	TCA	2	6	48922	48927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802342
612	NC_017457	ATA	2	6	48949	48954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802342
613	NC_017457	GTT	2	6	48980	48985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802342
614	NC_017457	GAT	2	6	48996	49001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802342
615	NC_017457	AG	3	6	49050	49055	50 %	0 %	50 %	0 %	385802342
616	NC_017457	AGA	2	6	49070	49075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802342
617	NC_017457	AAAG	2	8	49193	49200	75 %	0 %	25 %	0 %	385802342
618	NC_017457	TA	3	6	49285	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
619	NC_017457	GAT	2	6	49401	49406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802342
620	NC_017457	ATT	2	6	49510	49515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802342
621	NC_017457	GAGT	2	8	50244	50251	25 %	25 %	50 %	0 %	385802343
622	NC_017457	TCT	2	6	50261	50266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802343
623	NC_017457	TTC	2	6	50282	50287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802343
624	NC_017457	ATG	2	6	50470	50475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802344
625	NC_017457	TA	3	6	50585	50590	50 %	50 %	0 %	0 %	385802344
626	NC_017457	TCT	2	6	50602	50607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802344
627	NC_017457	TCA	2	6	50638	50643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802344
628	NC_017457	AGG	2	6	50687	50692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802344
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