MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 2175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017455	TTATT	2	10	2967	2976	20 %	80 %	0 %	0 %	385798919
2	NC_017455	AATTA	2	10	3237	3246	60 %	40 %	0 %	0 %	385798920
3	NC_017455	AATGA	2	10	4255	4264	60 %	20 %	20 %	0 %	385798921
4	NC_017455	ACTTT	2	10	6358	6367	20 %	60 %	0 %	20 %	385798923
5	NC_017455	AAAAT	2	10	9328	9337	80 %	20 %	0 %	0 %	385798924
6	NC_017455	TAATT	2	10	18561	18570	40 %	60 %	0 %	0 %	385798928
7	NC_017455	TAATT	2	10	21824	21833	40 %	60 %	0 %	0 %	385798931
8	NC_017455	TTTAA	2	10	23427	23436	40 %	60 %	0 %	0 %	385798931
9	NC_017455	TTTAG	2	10	24357	24366	20 %	60 %	20 %	0 %	385798932
10	NC_017455	GCTTG	2	10	27309	27318	0 %	40 %	40 %	20 %	385798936
11	NC_017455	TAAAT	2	10	27365	27374	60 %	40 %	0 %	0 %	385798936
12	NC_017455	TTTTA	2	10	28421	28430	20 %	80 %	0 %	0 %	385798937
13	NC_017455	CTGCA	2	10	32149	32158	20 %	20 %	20 %	40 %	385798940
14	NC_017455	AAAAG	2	10	32545	32554	80 %	0 %	20 %	0 %	385798940
15	NC_017455	AAGCC	2	10	32805	32814	40 %	0 %	20 %	40 %	385798940
16	NC_017455	GCAAT	2	10	34716	34725	40 %	20 %	20 %	20 %	385798941
17	NC_017455	TTTTA	2	10	35317	35326	20 %	80 %	0 %	0 %	385798942
18	NC_017455	ATTTA	2	10	35776	35785	40 %	60 %	0 %	0 %	385798942
19	NC_017455	TTTAG	2	10	38096	38105	20 %	60 %	20 %	0 %	385798944
20	NC_017455	AAGAA	2	10	38438	38447	80 %	0 %	20 %	0 %	385798944
21	NC_017455	TTAAT	2	10	38622	38631	40 %	60 %	0 %	0 %	385798944
22	NC_017455	GCTTA	2	10	38889	38898	20 %	40 %	20 %	20 %	385798945
23	NC_017455	AAATA	2	10	40508	40517	80 %	20 %	0 %	0 %	385798946
24	NC_017455	TTCAA	2	10	40559	40568	40 %	40 %	0 %	20 %	385798946
25	NC_017455	TAATT	2	10	41993	42002	40 %	60 %	0 %	0 %	385798948
26	NC_017455	CTAAA	2	10	42907	42916	60 %	20 %	0 %	20 %	385798949
27	NC_017455	ATCTT	2	10	43734	43743	20 %	60 %	0 %	20 %	385798950
28	NC_017455	TTGTT	2	10	44551	44560	0 %	80 %	20 %	0 %	385798951
29	NC_017455	TTTAT	2	10	44927	44936	20 %	80 %	0 %	0 %	385798952
30	NC_017455	GATTT	2	10	45020	45029	20 %	60 %	20 %	0 %	385798952
31	NC_017455	TTTTA	2	10	46099	46108	20 %	80 %	0 %	0 %	385798952
32	NC_017455	ATTTC	2	10	47370	47379	20 %	60 %	0 %	20 %	385798954
33	NC_017455	TTTTA	2	10	47852	47861	20 %	80 %	0 %	0 %	385798954
34	NC_017455	TTAAT	2	10	47995	48004	40 %	60 %	0 %	0 %	385798954
35	NC_017455	TGGTT	2	10	48465	48474	0 %	60 %	40 %	0 %	385798954
36	NC_017455	AAACA	2	10	49355	49364	80 %	0 %	0 %	20 %	385798955
37	NC_017455	TAAAA	2	10	52450	52459	80 %	20 %	0 %	0 %	385798959
38	NC_017455	ATTTA	2	10	54766	54775	40 %	60 %	0 %	0 %	385798962
39	NC_017455	AATTA	2	10	55738	55747	60 %	40 %	0 %	0 %	385798962
40	NC_017455	AGAGC	2	10	62353	62362	40 %	0 %	40 %	20 %	385798966
41	NC_017455	ATAAA	2	10	62626	62635	80 %	20 %	0 %	0 %	385798967
42	NC_017455	ATTAG	2	10	64956	64965	40 %	40 %	20 %	0 %	385798969
43	NC_017455	ATATT	2	10	65059	65068	40 %	60 %	0 %	0 %	385798969
44	NC_017455	TAATT	2	10	65277	65286	40 %	60 %	0 %	0 %	385798969
45	NC_017455	AAAAG	2	10	66062	66071	80 %	0 %	20 %	0 %	385798970
46	NC_017455	AAATA	2	10	66467	66476	80 %	20 %	0 %	0 %	385798970
47	NC_017455	TACTT	2	10	66581	66590	20 %	60 %	0 %	20 %	385798970
48	NC_017455	TTCAA	2	10	67589	67598	40 %	40 %	0 %	20 %	385798970
49	NC_017455	ATAGA	2	10	67849	67858	60 %	20 %	20 %	0 %	385798971
50	NC_017455	ATTAA	2	10	68187	68196	60 %	40 %	0 %	0 %	385798971
51	NC_017455	TAAGT	2	10	68681	68690	40 %	40 %	20 %	0 %	385798971
52	NC_017455	GATGG	2	10	69034	69043	20 %	20 %	60 %	0 %	385798971
53	NC_017455	TTAAG	2	10	69834	69843	40 %	40 %	20 %	0 %	385798972
54	NC_017455	AGAAA	2	10	70016	70025	80 %	0 %	20 %	0 %	385798972
55	NC_017455	TAAGT	2	10	71119	71128	40 %	40 %	20 %	0 %	385798974
56	NC_017455	TGAGT	2	10	72112	72121	20 %	40 %	40 %	0 %	385798974
57	NC_017455	ATTTA	2	10	72244	72253	40 %	60 %	0 %	0 %	385798974
58	NC_017455	CAAAA	2	10	72531	72540	80 %	0 %	0 %	20 %	385798974
59	NC_017455	TTTAA	2	10	75520	75529	40 %	60 %	0 %	0 %	385798975
60	NC_017455	GAAAA	2	10	75883	75892	80 %	0 %	20 %	0 %	385798975
61	NC_017455	TAATT	2	10	75978	75987	40 %	60 %	0 %	0 %	385798975
62	NC_017455	ACTTT	2	10	80282	80291	20 %	60 %	0 %	20 %	385798978
63	NC_017455	TAAAA	2	10	80430	80439	80 %	20 %	0 %	0 %	385798978
64	NC_017455	AAAAT	2	10	81464	81473	80 %	20 %	0 %	0 %	385798979
65	NC_017455	ATTTT	2	10	81495	81504	20 %	80 %	0 %	0 %	385798979
66	NC_017455	ATTAA	2	10	82769	82778	60 %	40 %	0 %	0 %	385798980
67	NC_017455	ATGCA	2	10	83619	83628	40 %	20 %	20 %	20 %	385798981
68	NC_017455	GCTTG	2	10	83936	83945	0 %	40 %	40 %	20 %	385798981
69	NC_017455	AGATA	2	10	84836	84845	60 %	20 %	20 %	0 %	385798982
70	NC_017455	TTTTA	2	10	85509	85518	20 %	80 %	0 %	0 %	385798982
71	NC_017455	TTTTA	2	10	87163	87172	20 %	80 %	0 %	0 %	385798984
72	NC_017455	AGCTT	2	10	87572	87581	20 %	40 %	20 %	20 %	385798984
73	NC_017455	CTTCA	2	10	89870	89879	20 %	40 %	0 %	40 %	385798986
74	NC_017455	TAAAT	2	10	90751	90760	60 %	40 %	0 %	0 %	385798987
75	NC_017455	AGAAA	2	10	91078	91087	80 %	0 %	20 %	0 %	385798988
76	NC_017455	ATTAA	2	10	92088	92097	60 %	40 %	0 %	0 %	385798988
77	NC_017455	CAGAT	2	10	92942	92951	40 %	20 %	20 %	20 %	385798990
78	NC_017455	TAATT	2	10	94244	94253	40 %	60 %	0 %	0 %	385798992
79	NC_017455	ATCAA	2	10	96306	96315	60 %	20 %	0 %	20 %	385798994
80	NC_017455	TATTT	2	10	97534	97543	20 %	80 %	0 %	0 %	385798995
81	NC_017455	TTATT	2	10	100366	100375	20 %	80 %	0 %	0 %	385798997
82	NC_017455	ATTAG	2	10	101803	101812	40 %	40 %	20 %	0 %	385798998
83	NC_017455	ACTAG	2	10	103360	103369	40 %	20 %	20 %	20 %	385799000
84	NC_017455	AGTTT	2	10	104191	104200	20 %	60 %	20 %	0 %	385799000
85	NC_017455	AATTG	2	10	105121	105130	40 %	40 %	20 %	0 %	385799001
86	NC_017455	AAATT	2	10	105578	105587	60 %	40 %	0 %	0 %	385799002
87	NC_017455	ACAGG	2	10	105934	105943	40 %	0 %	40 %	20 %	385799002
88	NC_017455	CAGAC	2	10	106393	106402	40 %	0 %	20 %	40 %	385799002
89	NC_017455	AAAAT	2	10	106541	106550	80 %	20 %	0 %	0 %	385799002
90	NC_017455	TCATG	2	10	106579	106588	20 %	40 %	20 %	20 %	385799002
91	NC_017455	GTAAT	2	10	107222	107231	40 %	40 %	20 %	0 %	385799002
92	NC_017455	CAGGT	2	10	107495	107504	20 %	20 %	40 %	20 %	385799002
93	NC_017455	AATGA	2	10	108174	108183	60 %	20 %	20 %	0 %	385799003
94	NC_017455	TAAAA	2	10	109240	109249	80 %	20 %	0 %	0 %	385799005
95	NC_017455	TTATC	2	10	110357	110366	20 %	60 %	0 %	20 %	385799005
96	NC_017455	TTTAT	2	10	110562	110571	20 %	80 %	0 %	0 %	385799006
97	NC_017455	ATTTT	2	10	111206	111215	20 %	80 %	0 %	0 %	385799006
98	NC_017455	TAATT	2	10	112182	112191	40 %	60 %	0 %	0 %	385799006
99	NC_017455	CGAAT	2	10	112587	112596	40 %	20 %	20 %	20 %	385799006
100	NC_017455	AATCT	2	10	113846	113855	40 %	40 %	0 %	20 %	385799007
101	NC_017455	GTAGA	2	10	115293	115302	40 %	20 %	40 %	0 %	385799008
102	NC_017455	TTTGG	2	10	118527	118536	0 %	60 %	40 %	0 %	385799010
103	NC_017455	CTTAG	2	10	119699	119708	20 %	40 %	20 %	20 %	385799011
104	NC_017455	ATAGA	2	10	120781	120790	60 %	20 %	20 %	0 %	385799012
105	NC_017455	TATTT	2	10	123489	123498	20 %	80 %	0 %	0 %	385799014
106	NC_017455	AAAAT	2	10	127043	127052	80 %	20 %	0 %	0 %	385799017
107	NC_017455	ATTAT	2	10	128316	128325	40 %	60 %	0 %	0 %	385799017
108	NC_017455	ATTTA	2	10	130958	130967	40 %	60 %	0 %	0 %	385799019
109	NC_017455	TAATT	2	10	133687	133696	40 %	60 %	0 %	0 %	385799021
110	NC_017455	AAGTA	2	10	133915	133924	60 %	20 %	20 %	0 %	385799021
111	NC_017455	AAAAT	2	10	133950	133959	80 %	20 %	0 %	0 %	385799021
112	NC_017455	CCTTT	2	10	134106	134115	0 %	60 %	0 %	40 %	385799021
113	NC_017455	TAAAA	2	10	134431	134440	80 %	20 %	0 %	0 %	385799021
114	NC_017455	TGAAA	2	10	136836	136845	60 %	20 %	20 %	0 %	385799025
115	NC_017455	TTTAA	2	10	137510	137519	40 %	60 %	0 %	0 %	385799026
116	NC_017455	ATTAA	2	10	138634	138643	60 %	40 %	0 %	0 %	385799026
117	NC_017455	ACAGA	2	10	139898	139907	60 %	0 %	20 %	20 %	385799028
118	NC_017455	TAATT	2	10	140610	140619	40 %	60 %	0 %	0 %	385799028
119	NC_017455	ATTTT	2	10	144648	144657	20 %	80 %	0 %	0 %	385799031
120	NC_017455	GAAAT	2	10	146535	146544	60 %	20 %	20 %	0 %	385799032
121	NC_017455	AAGAA	2	10	147487	147496	80 %	0 %	20 %	0 %	385799032
122	NC_017455	AAATA	2	10	147906	147915	80 %	20 %	0 %	0 %	385799033
123	NC_017455	TTAAT	2	10	149108	149117	40 %	60 %	0 %	0 %	385799033
124	NC_017455	TTGAT	2	10	150211	150220	20 %	60 %	20 %	0 %	385799034
125	NC_017455	TTAAA	2	10	153592	153601	60 %	40 %	0 %	0 %	385799037
126	NC_017455	AAAAC	2	10	154998	155007	80 %	0 %	0 %	20 %	385799039
127	NC_017455	CAAAA	2	10	156488	156497	80 %	0 %	0 %	20 %	385799041
128	NC_017455	TAATT	2	10	158780	158789	40 %	60 %	0 %	0 %	385799044
129	NC_017455	AAAAT	2	10	158956	158965	80 %	20 %	0 %	0 %	385799044
130	NC_017455	ATCAA	2	10	160327	160336	60 %	20 %	0 %	20 %	385799046
131	NC_017455	TAAAA	2	10	160700	160709	80 %	20 %	0 %	0 %	385799046
132	NC_017455	AATTA	2	10	160713	160722	60 %	40 %	0 %	0 %	385799046
133	NC_017455	AAACT	2	10	161419	161428	60 %	20 %	0 %	20 %	385799048
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135	NC_017455	TTTTG	2	10	165504	165513	0 %	80 %	20 %	0 %	385799052
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