MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 56077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017455	TGA	2	6	26724	26729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798935
503	NC_017455	A	6	6	26794	26799	100 %	0 %	0 %	0 %	385798935
504	NC_017455	CTG	2	6	26816	26821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798935
505	NC_017455	GA	3	6	26857	26862	50 %	0 %	50 %	0 %	385798935
506	NC_017455	TTAA	2	8	26953	26960	50 %	50 %	0 %	0 %	385798935
507	NC_017455	GAA	2	6	26998	27003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798935
508	NC_017455	A	6	6	27030	27035	100 %	0 %	0 %	0 %	385798935
509	NC_017455	TTG	2	6	27065	27070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798935
510	NC_017455	GCTTG	2	10	27309	27318	0 %	40 %	40 %	20 %	385798936
511	NC_017455	A	6	6	27341	27346	100 %	0 %	0 %	0 %	385798936
512	NC_017455	TAAAT	2	10	27365	27374	60 %	40 %	0 %	0 %	385798936
513	NC_017455	A	7	7	27375	27381	100 %	0 %	0 %	0 %	385798936
514	NC_017455	TGT	2	6	27395	27400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798936
515	NC_017455	AGTT	2	8	27445	27452	25 %	50 %	25 %	0 %	385798936
516	NC_017455	AGA	2	6	27488	27493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798936
517	NC_017455	CTG	2	6	27598	27603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798936
518	NC_017455	TAAA	2	8	27628	27635	75 %	25 %	0 %	0 %	385798936
519	NC_017455	TGC	2	6	27638	27643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798936
520	NC_017455	ATA	2	6	27649	27654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798936
521	NC_017455	A	7	7	27654	27660	100 %	0 %	0 %	0 %	385798936
522	NC_017455	ATT	2	6	27719	27724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798936
523	NC_017455	TAAA	2	8	27853	27860	75 %	25 %	0 %	0 %	385798936
524	NC_017455	TGC	2	6	27908	27913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798936
525	NC_017455	ATTTAG	2	12	27937	27948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385798936
526	NC_017455	TAT	2	6	27959	27964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798936
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530	NC_017455	GA	3	6	28052	28057	50 %	0 %	50 %	0 %	385798936
531	NC_017455	ATT	2	6	28160	28165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798936
532	NC_017455	AG	3	6	28198	28203	50 %	0 %	50 %	0 %	385798936
533	NC_017455	AGA	2	6	28250	28255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798936
534	NC_017455	GCA	2	6	28266	28271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798936
535	NC_017455	CAG	2	6	28309	28314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798936
536	NC_017455	CTG	3	9	28321	28329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798936
537	NC_017455	GCTT	2	8	28340	28347	0 %	50 %	25 %	25 %	385798936
538	NC_017455	ATTT	2	8	28398	28405	25 %	75 %	0 %	0 %	385798936
539	NC_017455	AGA	2	6	28406	28411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798936
540	NC_017455	TTTTA	2	10	28421	28430	20 %	80 %	0 %	0 %	385798937
541	NC_017455	TAT	2	6	28482	28487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798937
542	NC_017455	TAG	2	6	28509	28514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798937
543	NC_017455	TAGC	2	8	28584	28591	25 %	25 %	25 %	25 %	385798937
544	NC_017455	T	6	6	28593	28598	0 %	100 %	0 %	0 %	385798937
545	NC_017455	T	6	6	28642	28647	0 %	100 %	0 %	0 %	385798937
546	NC_017455	TCA	2	6	28652	28657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798937
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549	NC_017455	TA	3	6	28710	28715	50 %	50 %	0 %	0 %	385798937
550	NC_017455	TCT	2	6	28739	28744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798937
551	NC_017455	TCT	2	6	28757	28762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798937
552	NC_017455	TA	3	6	28831	28836	50 %	50 %	0 %	0 %	385798937
553	NC_017455	TTA	2	6	28847	28852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798937
554	NC_017455	T	6	6	28909	28914	0 %	100 %	0 %	0 %	385798937
555	NC_017455	T	8	8	28927	28934	0 %	100 %	0 %	0 %	385798937
556	NC_017455	TTGATC	2	12	28960	28971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385798937
557	NC_017455	T	6	6	29023	29028	0 %	100 %	0 %	0 %	385798937
558	NC_017455	CAA	2	6	29037	29042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385798937
559	NC_017455	AGC	2	6	29098	29103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798937
560	NC_017455	ATT	2	6	29105	29110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798937
561	NC_017455	ATA	2	6	29128	29133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798937
562	NC_017455	AGT	2	6	29638	29643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798938
563	NC_017455	A	6	6	29658	29663	100 %	0 %	0 %	0 %	385798938
564	NC_017455	TGA	2	6	29701	29706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798938
565	NC_017455	GCG	2	6	29710	29715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385798938
566	NC_017455	TTA	2	6	29720	29725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798938
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569	NC_017455	TGA	2	6	29947	29952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798938
570	NC_017455	A	6	6	29972	29977	100 %	0 %	0 %	0 %	385798938
571	NC_017455	AGG	2	6	30061	30066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385798938
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587	NC_017455	TAAA	2	8	30869	30876	75 %	25 %	0 %	0 %	385798938
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591	NC_017455	GAA	2	6	31286	31291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798939
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594	NC_017455	A	6	6	31376	31381	100 %	0 %	0 %	0 %	385798939
595	NC_017455	ATT	2	6	31399	31404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798939
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597	NC_017455	ATTT	2	8	31468	31475	25 %	75 %	0 %	0 %	385798939
598	NC_017455	GGT	2	6	31494	31499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798939
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601	NC_017455	CAA	3	9	31575	31583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385798939
602	NC_017455	A	7	7	31582	31588	100 %	0 %	0 %	0 %	385798939
603	NC_017455	ATC	2	6	31669	31674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798939
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607	NC_017455	GATTTT	2	12	32303	32314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385798940
608	NC_017455	GAT	2	6	32321	32326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798940
609	NC_017455	GTA	2	6	32327	32332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798940
610	NC_017455	AAG	2	6	32355	32360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798940
611	NC_017455	TGG	2	6	32482	32487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798940
612	NC_017455	TCA	2	6	32500	32505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798940
613	NC_017455	ATT	2	6	32539	32544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798940
614	NC_017455	AAAAG	2	10	32545	32554	80 %	0 %	20 %	0 %	385798940
615	NC_017455	TGT	2	6	32638	32643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798940
616	NC_017455	TGG	2	6	32647	32652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798940
617	NC_017455	TTC	2	6	32662	32667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798940
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619	NC_017455	AAT	2	6	32717	32722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798940
620	NC_017455	AAT	2	6	32738	32743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798940
621	NC_017455	TAA	2	6	32755	32760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798940
622	NC_017455	AAT	2	6	32786	32791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798940
623	NC_017455	T	6	6	32796	32801	0 %	100 %	0 %	0 %	385798940
624	NC_017455	AAGCC	2	10	32805	32814	40 %	0 %	20 %	40 %	385798940
625	NC_017455	AGC	2	6	32823	32828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798940
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627	NC_017455	TTA	2	6	32874	32879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798940
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