MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 1220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	TCTGG	2	10	3368	3377	0 %	40 %	40 %	20 %	386263237
2	NC_017451	TTGAT	2	10	3704	3713	20 %	60 %	20 %	0 %	386263237
3	NC_017451	TCGTA	2	10	4233	4242	20 %	40 %	20 %	20 %	386263237
4	NC_017451	CACAC	2	10	6220	6229	40 %	0 %	0 %	60 %	386263238
5	NC_017451	AGTTA	2	10	7396	7405	40 %	40 %	20 %	0 %	386263241
6	NC_017451	TTGAT	2	10	8703	8712	20 %	60 %	20 %	0 %	386263243
7	NC_017451	TGAAA	2	10	9289	9298	60 %	20 %	20 %	0 %	386263244
8	NC_017451	CCATT	2	10	12670	12679	20 %	40 %	0 %	40 %	386263249
9	NC_017451	AAACC	2	10	13994	14003	60 %	0 %	0 %	40 %	386263249
10	NC_017451	GCATT	2	10	14713	14722	20 %	40 %	20 %	20 %	386263249
11	NC_017451	ATTTT	2	10	15739	15748	20 %	80 %	0 %	0 %	386263250
12	NC_017451	CTTAT	2	10	17585	17594	20 %	60 %	0 %	20 %	386263251
13	NC_017451	AATCC	2	10	18917	18926	40 %	20 %	0 %	40 %	386263252
14	NC_017451	CTTGC	2	10	21879	21888	0 %	40 %	20 %	40 %	386263256
15	NC_017451	TCATT	2	10	23558	23567	20 %	60 %	0 %	20 %	386263257
16	NC_017451	TTGAA	2	10	23844	23853	40 %	40 %	20 %	0 %	386263258
17	NC_017451	TATCG	2	10	25157	25166	20 %	40 %	20 %	20 %	386263259
18	NC_017451	AAAGC	2	10	26770	26779	60 %	0 %	20 %	20 %	386263260
19	NC_017451	ACTGG	2	10	29724	29733	20 %	20 %	40 %	20 %	386263263
20	NC_017451	ACGAA	2	10	31204	31213	60 %	0 %	20 %	20 %	386263265
21	NC_017451	GCATC	2	10	32936	32945	20 %	20 %	20 %	40 %	386263267
22	NC_017451	TGTTC	2	10	35601	35610	0 %	60 %	20 %	20 %	386263273
23	NC_017451	TTTCA	2	10	35885	35894	20 %	60 %	0 %	20 %	386263273
24	NC_017451	ATTAC	2	10	36939	36948	40 %	40 %	0 %	20 %	386263273
25	NC_017451	TTTTC	2	10	37054	37063	0 %	80 %	0 %	20 %	386263273
26	NC_017451	AAAAT	2	10	37447	37456	80 %	20 %	0 %	0 %	386263275
27	NC_017451	AAGAA	2	10	39656	39665	80 %	0 %	20 %	0 %	386263277
28	NC_017451	TGGTA	2	10	39788	39797	20 %	40 %	40 %	0 %	386263277
29	NC_017451	AATGA	2	10	43727	43736	60 %	20 %	20 %	0 %	386263279
30	NC_017451	CAGTA	2	10	44599	44608	40 %	20 %	20 %	20 %	386263279
31	NC_017451	GTTTG	2	10	44760	44769	0 %	60 %	40 %	0 %	386263279
32	NC_017451	GCGTT	2	10	45276	45285	0 %	40 %	40 %	20 %	386263280
33	NC_017451	GATTA	2	10	46209	46218	40 %	40 %	20 %	0 %	386263281
34	NC_017451	TTTTG	2	10	47181	47190	0 %	80 %	20 %	0 %	386263282
35	NC_017451	TGGAA	2	10	47688	47697	40 %	20 %	40 %	0 %	386263283
36	NC_017451	GGTTG	2	10	49461	49470	0 %	40 %	60 %	0 %	386263285
37	NC_017451	GAAAA	2	10	50294	50303	80 %	0 %	20 %	0 %	386263286
38	NC_017451	CTTCA	2	10	54236	54245	20 %	40 %	0 %	40 %	386263290
39	NC_017451	ACGCA	2	10	55383	55392	40 %	0 %	20 %	40 %	386263290
40	NC_017451	ATGAT	2	10	58670	58679	40 %	40 %	20 %	0 %	386263293
41	NC_017451	ATTCC	2	10	62403	62412	20 %	40 %	0 %	40 %	386263296
42	NC_017451	TAATT	2	10	62654	62663	40 %	60 %	0 %	0 %	386263296
43	NC_017451	ATCAA	2	10	63778	63787	60 %	20 %	0 %	20 %	386263296
44	NC_017451	GTGAA	2	10	64783	64792	40 %	20 %	40 %	0 %	386263297
45	NC_017451	TTGGA	2	10	69444	69453	20 %	40 %	40 %	0 %	386263298
46	NC_017451	GTTTA	2	10	71780	71789	20 %	60 %	20 %	0 %	386263300
47	NC_017451	TTCAG	2	10	74011	74020	20 %	40 %	20 %	20 %	386263303
48	NC_017451	TTTTC	2	10	79922	79931	0 %	80 %	0 %	20 %	386263309
49	NC_017451	TTTGA	2	10	80117	80126	20 %	60 %	20 %	0 %	386263309
50	NC_017451	CCAGC	2	10	81018	81027	20 %	0 %	20 %	60 %	386263310
51	NC_017451	ACGCA	2	10	84550	84559	40 %	0 %	20 %	40 %	386263312
52	NC_017451	ATCAA	2	10	85551	85560	60 %	20 %	0 %	20 %	386263314
53	NC_017451	TTTCC	2	10	86351	86360	0 %	60 %	0 %	40 %	386263315
54	NC_017451	TGAAT	2	10	90114	90123	40 %	40 %	20 %	0 %	386263320
55	NC_017451	AATGC	2	10	90917	90926	40 %	20 %	20 %	20 %	386263322
56	NC_017451	ACGTA	2	10	90986	90995	40 %	20 %	20 %	20 %	386263322
57	NC_017451	GCTTA	2	10	92363	92372	20 %	40 %	20 %	20 %	386263325
58	NC_017451	AAATT	2	10	92783	92792	60 %	40 %	0 %	0 %	386263325
59	NC_017451	TAATT	2	10	95245	95254	40 %	60 %	0 %	0 %	386263327
60	NC_017451	TGAAT	2	10	95305	95314	40 %	40 %	20 %	0 %	386263327
61	NC_017451	ATGAA	2	10	95926	95935	60 %	20 %	20 %	0 %	386263328
62	NC_017451	ATTTA	2	10	96772	96781	40 %	60 %	0 %	0 %	386263329
63	NC_017451	GCAGA	2	10	96794	96803	40 %	0 %	40 %	20 %	386263329
64	NC_017451	ATGGA	2	10	97419	97428	40 %	20 %	40 %	0 %	386263330
65	NC_017451	TAAAA	2	10	97588	97597	80 %	20 %	0 %	0 %	386263330
66	NC_017451	TGGAA	2	10	97993	98002	40 %	20 %	40 %	0 %	386263330
67	NC_017451	TAAAG	2	10	98473	98482	60 %	20 %	20 %	0 %	386263330
68	NC_017451	TCTTT	2	10	99113	99122	0 %	80 %	0 %	20 %	386263331
69	NC_017451	GATTT	2	10	101536	101545	20 %	60 %	20 %	0 %	386263334
70	NC_017451	CATTT	2	10	101741	101750	20 %	60 %	0 %	20 %	386263335
71	NC_017451	GGATA	2	10	103249	103258	40 %	20 %	40 %	0 %	386263336
72	NC_017451	TCAAT	2	10	103714	103723	40 %	40 %	0 %	20 %	386263336
73	NC_017451	CTAGA	2	10	104244	104253	40 %	20 %	20 %	20 %	386263337
74	NC_017451	TGGAC	2	10	105305	105314	20 %	20 %	40 %	20 %	386263337
75	NC_017451	GAATT	2	10	107052	107061	40 %	40 %	20 %	0 %	386263339
76	NC_017451	AGTAC	2	10	108584	108593	40 %	20 %	20 %	20 %	386263341
77	NC_017451	TACCG	2	10	111461	111470	20 %	20 %	20 %	40 %	386263343
78	NC_017451	ACATC	2	10	112913	112922	40 %	20 %	0 %	40 %	386263344
79	NC_017451	ATTTT	2	10	114523	114532	20 %	80 %	0 %	0 %	386263345
80	NC_017451	AAAGT	2	10	115979	115988	60 %	20 %	20 %	0 %	386263346
81	NC_017451	ATGAA	2	10	116960	116969	60 %	20 %	20 %	0 %	386263348
82	NC_017451	TATGG	2	10	118741	118750	20 %	40 %	40 %	0 %	386263349
83	NC_017451	TGGAT	2	10	122741	122750	20 %	40 %	40 %	0 %	386263351
84	NC_017451	GAAAA	2	10	123698	123707	80 %	0 %	20 %	0 %	386263352
85	NC_017451	TTATT	2	10	124782	124791	20 %	80 %	0 %	0 %	386263354
86	NC_017451	GGTTG	2	10	133444	133453	0 %	40 %	60 %	0 %	386263362
87	NC_017451	GCATT	2	10	137506	137515	20 %	40 %	20 %	20 %	386263366
88	NC_017451	CCTTT	2	10	138923	138932	0 %	60 %	0 %	40 %	386263367
89	NC_017451	TTAAT	2	10	139634	139643	40 %	60 %	0 %	0 %	386263368
90	NC_017451	ATTAT	2	10	140582	140591	40 %	60 %	0 %	0 %	386263370
91	NC_017451	GCGGA	2	10	140721	140730	20 %	0 %	60 %	20 %	386263370
92	NC_017451	TGAAA	2	10	143275	143284	60 %	20 %	20 %	0 %	386263373
93	NC_017451	GCAAT	2	10	147016	147025	40 %	20 %	20 %	20 %	386263377
94	NC_017451	GAAAT	2	10	147855	147864	60 %	20 %	20 %	0 %	386263378
95	NC_017451	TAATT	2	10	148780	148789	40 %	60 %	0 %	0 %	386263379
96	NC_017451	AATTA	2	10	149158	149167	60 %	40 %	0 %	0 %	386263379
97	NC_017451	GCAAG	2	10	151878	151887	40 %	0 %	40 %	20 %	386263381
98	NC_017451	AAAAG	2	10	152369	152378	80 %	0 %	20 %	0 %	386263382
99	NC_017451	GGAAC	2	10	152616	152625	40 %	0 %	40 %	20 %	386263382
100	NC_017451	TCAAT	2	10	153201	153210	40 %	40 %	0 %	20 %	386263383
101	NC_017451	CAAAA	2	10	153397	153406	80 %	0 %	0 %	20 %	386263383
102	NC_017451	GTGGC	2	10	154277	154286	0 %	20 %	60 %	20 %	386263384
103	NC_017451	CCGTT	2	10	154386	154395	0 %	40 %	20 %	40 %	386263384
104	NC_017451	GTGAA	2	10	155108	155117	40 %	20 %	40 %	0 %	386263384
105	NC_017451	GAAGA	2	10	155161	155170	60 %	0 %	40 %	0 %	386263384
106	NC_017451	AATAG	2	10	155590	155599	60 %	20 %	20 %	0 %	386263385
107	NC_017451	TACCA	2	10	157698	157707	40 %	20 %	0 %	40 %	386263386
108	NC_017451	CGCCT	2	10	160027	160036	0 %	20 %	20 %	60 %	386263389
109	NC_017451	ACAAA	2	10	164377	164386	80 %	0 %	0 %	20 %	386263392
110	NC_017451	AACAT	2	10	167150	167159	60 %	20 %	0 %	20 %	386263395
111	NC_017451	CTTTT	2	10	167663	167672	0 %	80 %	0 %	20 %	386263395
112	NC_017451	AAATT	2	10	169012	169021	60 %	40 %	0 %	0 %	386263396
113	NC_017451	ATTTA	2	10	169657	169666	40 %	60 %	0 %	0 %	386263397
114	NC_017451	AAAAG	2	10	170273	170282	80 %	0 %	20 %	0 %	386263398
115	NC_017451	CAATC	2	10	171191	171200	40 %	20 %	0 %	40 %	386263399
116	NC_017451	TCAAT	2	10	171813	171822	40 %	40 %	0 %	20 %	386263399
117	NC_017451	TTCTT	2	10	173389	173398	0 %	80 %	0 %	20 %	386263401
118	NC_017451	GAAAA	2	10	176178	176187	80 %	0 %	20 %	0 %	386263404
119	NC_017451	CCATT	2	10	176759	176768	20 %	40 %	0 %	40 %	386263405
120	NC_017451	TAATT	2	10	177440	177449	40 %	60 %	0 %	0 %	386263406
121	NC_017451	CAATC	2	10	177460	177469	40 %	20 %	0 %	40 %	386263406
122	NC_017451	AAAAG	2	10	180072	180081	80 %	0 %	20 %	0 %	386263408
123	NC_017451	TAATT	2	10	190092	190101	40 %	60 %	0 %	0 %	386263416
124	NC_017451	TACTT	2	10	190668	190677	20 %	60 %	0 %	20 %	386263416
125	NC_017451	CTTTT	2	10	191424	191433	0 %	80 %	0 %	20 %	386263417
126	NC_017451	GAATT	2	10	191846	191855	40 %	40 %	20 %	0 %	386263418
127	NC_017451	CTTAT	2	10	197384	197393	20 %	60 %	0 %	20 %	386263424
128	NC_017451	GCTTA	2	10	199610	199619	20 %	40 %	20 %	20 %	386263427
129	NC_017451	ATTTG	2	10	201071	201080	20 %	60 %	20 %	0 %	386263429
130	NC_017451	GAAGA	2	10	201300	201309	60 %	0 %	40 %	0 %	386263430
131	NC_017451	TGGAT	2	10	201695	201704	20 %	40 %	40 %	0 %	386263430
132	NC_017451	TTAAA	2	10	204229	204238	60 %	40 %	0 %	0 %	386263434
133	NC_017451	CGATA	2	10	206339	206348	40 %	20 %	20 %	20 %	386263435
134	NC_017451	AATTA	2	10	208487	208496	60 %	40 %	0 %	0 %	386263438
135	NC_017451	ATATT	2	10	208653	208662	40 %	60 %	0 %	0 %	386263438
136	NC_017451	GCCAA	2	10	211700	211709	40 %	0 %	20 %	40 %	386263440
137	NC_017451	TGCAA	2	10	212236	212245	40 %	20 %	20 %	20 %	386263441
138	NC_017451	ATTTT	2	10	214525	214534	20 %	80 %	0 %	0 %	386263443
139	NC_017451	CAAAG	2	10	216233	216242	60 %	0 %	20 %	20 %	386263445
140	NC_017451	AAATC	2	10	218392	218401	60 %	20 %	0 %	20 %	386263448
141	NC_017451	ATACT	2	10	219480	219489	40 %	40 %	0 %	20 %	386263449
142	NC_017451	GATAA	2	10	224202	224211	60 %	20 %	20 %	0 %	386263453
143	NC_017451	CAAAA	2	10	225541	225550	80 %	0 %	0 %	20 %	386263455
144	NC_017451	GCAAA	2	10	226273	226282	60 %	0 %	20 %	20 %	386263456
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149	NC_017451	AATGT	2	10	237503	237512	40 %	40 %	20 %	0 %	386263467
150	NC_017451	GTAAC	2	10	238951	238960	40 %	20 %	20 %	20 %	386263468
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152	NC_017451	TGAAA	2	10	239222	239231	60 %	20 %	20 %	0 %	386263468
153	NC_017451	CAAAA	2	10	240267	240276	80 %	0 %	0 %	20 %	386263469
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156	NC_017451	CATTT	2	10	241312	241321	20 %	60 %	0 %	20 %	386263471
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174	NC_017451	AATAG	2	10	266640	266649	60 %	20 %	20 %	0 %	386263503
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252	NC_017451	AATTT	2	10	418163	418172	40 %	60 %	0 %	0 %	386263632
253	NC_017451	ATTTT	2	10	418619	418628	20 %	80 %	0 %	0 %	386263632
254	NC_017451	AAGCG	2	10	422335	422344	40 %	0 %	40 %	20 %	386263637
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256	NC_017451	AAACT	2	10	423248	423257	60 %	20 %	0 %	20 %	386263638
257	NC_017451	ATACC	2	10	423528	423537	40 %	20 %	0 %	40 %	386263639
258	NC_017451	ATTAA	2	10	426803	426812	60 %	40 %	0 %	0 %	386263642
259	NC_017451	GCGTA	2	10	429284	429293	20 %	20 %	40 %	20 %	386263644
260	NC_017451	TAAAT	2	10	430445	430454	60 %	40 %	0 %	0 %	386263645
261	NC_017451	TAACT	2	10	433675	433684	40 %	40 %	0 %	20 %	386263649
262	NC_017451	CATCA	2	10	435195	435204	40 %	20 %	0 %	40 %	386263651
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