MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 35348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017451	TCA	2	6	161836	161841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263391
3003	NC_017451	T	6	6	161876	161881	0 %	100 %	0 %	0 %	386263391
3004	NC_017451	CAA	2	6	161903	161908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263391
3005	NC_017451	GGC	2	6	161966	161971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263391
3006	NC_017451	TTCT	2	8	161990	161997	0 %	75 %	0 %	25 %	386263391
3007	NC_017451	TTC	2	6	162048	162053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3008	NC_017451	TTC	2	6	162108	162113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3009	NC_017451	TTTC	2	8	162115	162122	0 %	75 %	0 %	25 %	386263391
3010	NC_017451	GAC	2	6	162146	162151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263391
3011	NC_017451	GAA	2	6	162154	162159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263391
3012	NC_017451	CGA	2	6	162160	162165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263391
3013	NC_017451	GTTT	2	8	162221	162228	0 %	75 %	25 %	0 %	386263391
3014	NC_017451	AAT	2	6	162267	162272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263391
3015	NC_017451	GCT	2	6	162322	162327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263391
3016	NC_017451	ACT	2	6	162346	162351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263391
3017	NC_017451	GTT	2	6	162368	162373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263391
3018	NC_017451	TGT	2	6	162384	162389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263391
3019	NC_017451	TTC	2	6	162414	162419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3020	NC_017451	CTT	2	6	162476	162481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3021	NC_017451	CAA	2	6	162539	162544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263391
3022	NC_017451	AAG	2	6	162600	162605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263391
3023	NC_017451	CTTG	2	8	162641	162648	0 %	50 %	25 %	25 %	386263391
3024	NC_017451	CTT	3	9	162665	162673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3025	NC_017451	AAAG	2	8	162694	162701	75 %	0 %	25 %	0 %	386263391
3026	NC_017451	ATG	2	6	162770	162775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263391
3027	NC_017451	CG	3	6	162961	162966	0 %	0 %	50 %	50 %	386263391
3028	NC_017451	TTC	2	6	163005	163010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3029	NC_017451	CCA	2	6	163018	163023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263391
3030	NC_017451	TGA	2	6	163196	163201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263391
3031	NC_017451	ATCA	2	8	163257	163264	50 %	25 %	0 %	25 %	386263391
3032	NC_017451	ACG	2	6	163281	163286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263391
3033	NC_017451	AAT	2	6	163289	163294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263391
3034	NC_017451	TGA	2	6	163327	163332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263391
3035	NC_017451	GAC	2	6	163349	163354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263391
3036	NC_017451	ATG	2	6	163383	163388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263391
3037	NC_017451	TAA	2	6	163389	163394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263391
3038	NC_017451	TTC	2	6	163416	163421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3039	NC_017451	CAG	2	6	163439	163444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263391
3040	NC_017451	TCC	2	6	163539	163544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386263391
3041	NC_017451	ATT	2	6	163554	163559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263391
3042	NC_017451	AGT	2	6	163599	163604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263391
3043	NC_017451	TCT	2	6	163630	163635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263391
3044	NC_017451	TTA	2	6	163636	163641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263391
3045	NC_017451	GAC	2	6	163691	163696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263391
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3050	NC_017451	A	8	8	164367	164374	100 %	0 %	0 %	0 %	386263392
3051	NC_017451	ACAAA	2	10	164377	164386	80 %	0 %	0 %	20 %	386263392
3052	NC_017451	A	6	6	164390	164395	100 %	0 %	0 %	0 %	386263392
3053	NC_017451	ATT	2	6	164459	164464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263392
3054	NC_017451	TGT	2	6	164580	164585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263392
3055	NC_017451	A	7	7	164612	164618	100 %	0 %	0 %	0 %	386263392
3056	NC_017451	A	6	6	164634	164639	100 %	0 %	0 %	0 %	386263392
3057	NC_017451	GAT	2	6	164683	164688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263392
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3060	NC_017451	TTA	2	6	164839	164844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263392
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3062	NC_017451	AAC	2	6	164882	164887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263392
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3066	NC_017451	TA	3	6	165064	165069	50 %	50 %	0 %	0 %	386263392
3067	NC_017451	GAT	2	6	165160	165165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263392
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3069	NC_017451	GTTT	2	8	165218	165225	0 %	75 %	25 %	0 %	386263392
3070	NC_017451	CAC	2	6	165287	165292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263392
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3074	NC_017451	TA	3	6	165593	165598	50 %	50 %	0 %	0 %	386263393
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3091	NC_017451	T	6	6	166890	166895	0 %	100 %	0 %	0 %	386263395
3092	NC_017451	CACGAA	2	12	166902	166913	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263395
3093	NC_017451	T	6	6	167071	167076	0 %	100 %	0 %	0 %	386263395
3094	NC_017451	AACAT	2	10	167150	167159	60 %	20 %	0 %	20 %	386263395
3095	NC_017451	CTG	2	6	167208	167213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263395
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3099	NC_017451	ATA	2	6	167413	167418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263395
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3101	NC_017451	T	7	7	167521	167527	0 %	100 %	0 %	0 %	386263395
3102	NC_017451	ACT	2	6	167608	167613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263395
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3104	NC_017451	CTTTT	2	10	167663	167672	0 %	80 %	0 %	20 %	386263395
3105	NC_017451	TTC	2	6	167722	167727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263395
3106	NC_017451	CAAT	2	8	167832	167839	50 %	25 %	0 %	25 %	386263395
3107	NC_017451	TGA	2	6	167848	167853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263395
3108	NC_017451	ATC	2	6	167854	167859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263395
3109	NC_017451	TAA	2	6	167956	167961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263395
3110	NC_017451	ATC	2	6	168004	168009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263395
3111	NC_017451	TCA	2	6	168026	168031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263395
3112	NC_017451	TCA	3	9	168056	168064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263395
3113	NC_017451	TCA	2	6	168080	168085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263395
3114	NC_017451	TTC	2	6	168169	168174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263395
3115	NC_017451	CAA	2	6	168225	168230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263395
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3117	NC_017451	TA	3	6	168247	168252	50 %	50 %	0 %	0 %	386263395
3118	NC_017451	T	7	7	168259	168265	0 %	100 %	0 %	0 %	386263395
3119	NC_017451	CAA	2	6	168508	168513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263396
3120	NC_017451	A	6	6	168528	168533	100 %	0 %	0 %	0 %	386263396
3121	NC_017451	A	6	6	168554	168559	100 %	0 %	0 %	0 %	386263396
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3123	NC_017451	TGG	3	9	168624	168632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263396
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3365	NC_017451	GAC	2	6	180847	180852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263409
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3369	NC_017451	TTG	2	6	181227	181232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263410
3370	NC_017451	CGT	2	6	181307	181312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263410
3371	NC_017451	AAAT	2	8	181336	181343	75 %	25 %	0 %	0 %	386263410
3372	NC_017451	AAG	2	6	181380	181385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263410
3373	NC_017451	CAA	2	6	181401	181406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263410
3374	NC_017451	GAA	2	6	181469	181474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263410
3375	NC_017451	CTG	2	6	181506	181511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263410
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3377	NC_017451	GTATTG	2	12	181611	181622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263410
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3379	NC_017451	TG	3	6	181724	181729	0 %	50 %	50 %	0 %	386263410
3380	NC_017451	CACT	2	8	181901	181908	25 %	25 %	0 %	50 %	386263411
3381	NC_017451	GTA	2	6	181966	181971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263411
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3387	NC_017451	TCC	2	6	182342	182347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386263411
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3390	NC_017451	CTT	2	6	182424	182429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263411
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3400	NC_017451	AAG	2	6	182702	182707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263411
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3405	NC_017451	CTG	2	6	185087	185092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263412
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3471	NC_017451	AT	3	6	188554	188559	50 %	50 %	0 %	0 %	386263415
3472	NC_017451	T	7	7	188596	188602	0 %	100 %	0 %	0 %	386263415
3473	NC_017451	AGC	2	6	188619	188624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263415
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3478	NC_017451	TAAACC	2	12	188982	188993	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386263415
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3483	NC_017451	A	6	6	189232	189237	100 %	0 %	0 %	0 %	386263416
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3485	NC_017451	CAA	2	6	189414	189419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263416
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3487	NC_017451	AAAG	2	8	189463	189470	75 %	0 %	25 %	0 %	386263416
3488	NC_017451	CGC	2	6	189476	189481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263416
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3490	NC_017451	TAA	2	6	189582	189587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263416
3491	NC_017451	T	6	6	189602	189607	0 %	100 %	0 %	0 %	386263416
3492	NC_017451	CAT	2	6	189633	189638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263416
3493	NC_017451	AAG	2	6	189644	189649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263416
3494	NC_017451	TTTG	2	8	189672	189679	0 %	75 %	25 %	0 %	386263416
3495	NC_017451	TAA	2	6	189693	189698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263416
3496	NC_017451	CA	3	6	189756	189761	50 %	0 %	0 %	50 %	386263416
3497	NC_017451	AAT	2	6	189779	189784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263416
3498	NC_017451	TA	3	6	189794	189799	50 %	50 %	0 %	0 %	386263416
3499	NC_017451	T	6	6	189803	189808	0 %	100 %	0 %	0 %	386263416
3500	NC_017451	C	6	6	189856	189861	0 %	0 %	0 %	100 %	386263416

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