MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 35348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017451	GTTT	2	8	323747	323754	0 %	75 %	25 %	0 %	386263557
6002	NC_017451	GCA	2	6	323805	323810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263557
6003	NC_017451	TGA	2	6	323817	323822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263557
6004	NC_017451	GTG	2	6	323830	323835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263557
6005	NC_017451	TCG	2	6	323883	323888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263557
6006	NC_017451	TAT	3	9	323896	323904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263557
6007	NC_017451	CAT	2	6	323915	323920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263557
6008	NC_017451	AT	3	6	324027	324032	50 %	50 %	0 %	0 %	386263557
6009	NC_017451	ATT	2	6	324052	324057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263557
6010	NC_017451	AAT	2	6	324085	324090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263557
6011	NC_017451	GAA	2	6	324133	324138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263557
6012	NC_017451	A	6	6	324144	324149	100 %	0 %	0 %	0 %	386263557
6013	NC_017451	GC	3	6	324202	324207	0 %	0 %	50 %	50 %	386263557
6014	NC_017451	A	6	6	324248	324253	100 %	0 %	0 %	0 %	386263557
6015	NC_017451	T	6	6	324274	324279	0 %	100 %	0 %	0 %	386263557
6016	NC_017451	CTTT	2	8	324286	324293	0 %	75 %	0 %	25 %	386263557
6017	NC_017451	A	6	6	324320	324325	100 %	0 %	0 %	0 %	386263557
6018	NC_017451	TCTTTC	2	12	324381	324392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263557
6019	NC_017451	G	7	7	324415	324421	0 %	0 %	100 %	0 %	386263557
6020	NC_017451	TTG	2	6	324464	324469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263557
6021	NC_017451	ATGT	2	8	324475	324482	25 %	50 %	25 %	0 %	386263557
6022	NC_017451	CTTA	2	8	324528	324535	25 %	50 %	0 %	25 %	386263557
6023	NC_017451	ATT	2	6	324619	324624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263557
6024	NC_017451	A	6	6	324754	324759	100 %	0 %	0 %	0 %	386263557
6025	NC_017451	CGCAC	2	10	324760	324769	20 %	0 %	20 %	60 %	386263557
6026	NC_017451	A	6	6	324778	324783	100 %	0 %	0 %	0 %	386263557
6027	NC_017451	TAA	2	6	324810	324815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263557
6028	NC_017451	A	6	6	324819	324824	100 %	0 %	0 %	0 %	386263557
6029	NC_017451	TTTA	2	8	324849	324856	25 %	75 %	0 %	0 %	386263557
6030	NC_017451	TTA	2	6	324896	324901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263557
6031	NC_017451	ACGC	2	8	325032	325039	25 %	0 %	25 %	50 %	386263557
6032	NC_017451	GCGCGT	2	12	325111	325122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386263557
6033	NC_017451	T	6	6	325212	325217	0 %	100 %	0 %	0 %	386263557
6034	NC_017451	TCA	2	6	325305	325310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263557
6035	NC_017451	GAA	2	6	325330	325335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263557
6036	NC_017451	GC	3	6	325336	325341	0 %	0 %	50 %	50 %	386263557
6037	NC_017451	T	6	6	325345	325350	0 %	100 %	0 %	0 %	386263557
6038	NC_017451	GATG	2	8	325389	325396	25 %	25 %	50 %	0 %	386263557
6039	NC_017451	TCT	2	6	325426	325431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263557
6040	NC_017451	ACA	2	6	325432	325437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263557
6041	NC_017451	TTG	2	6	325652	325657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263557
6042	NC_017451	GAGG	2	8	325669	325676	25 %	0 %	75 %	0 %	386263557
6043	NC_017451	ATT	2	6	325693	325698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263557
6044	NC_017451	CGCT	2	8	325746	325753	0 %	25 %	25 %	50 %	386263557
6045	NC_017451	A	7	7	326104	326110	100 %	0 %	0 %	0 %	386263558
6046	NC_017451	T	6	6	326127	326132	0 %	100 %	0 %	0 %	386263558
6047	NC_017451	GAT	2	6	326316	326321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6048	NC_017451	TGC	2	6	326352	326357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263558
6049	NC_017451	TAG	2	6	326360	326365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6050	NC_017451	CGG	2	6	326397	326402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263558
6051	NC_017451	TAA	2	6	326478	326483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263558
6052	NC_017451	CAT	2	6	326503	326508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263558
6053	NC_017451	ATG	2	6	326510	326515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6054	NC_017451	ACA	2	6	326575	326580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263558
6055	NC_017451	ATGG	2	8	326584	326591	25 %	25 %	50 %	0 %	386263558
6056	NC_017451	GAA	2	6	326674	326679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263558
6057	NC_017451	AGT	2	6	326752	326757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6058	NC_017451	GTAAT	2	10	326786	326795	40 %	40 %	20 %	0 %	386263558
6059	NC_017451	AGG	2	6	326826	326831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386263558
6060	NC_017451	TTTA	2	8	326860	326867	25 %	75 %	0 %	0 %	386263558
6061	NC_017451	GAA	2	6	326959	326964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263558
6062	NC_017451	ATT	2	6	327038	327043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263558
6063	NC_017451	ATG	2	6	327059	327064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6064	NC_017451	TTAACT	2	12	327076	327087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386263558
6065	NC_017451	CAT	2	6	327149	327154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263558
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6068	NC_017451	A	6	6	327228	327233	100 %	0 %	0 %	0 %	386263558
6069	NC_017451	AGGAAC	2	12	327252	327263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386263558
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6071	NC_017451	TGG	2	6	327297	327302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263558
6072	NC_017451	ATA	2	6	327344	327349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263558
6073	NC_017451	CAA	2	6	327523	327528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263558
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6076	NC_017451	CATT	2	8	327673	327680	25 %	50 %	0 %	25 %	386263558
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6078	NC_017451	TGGT	2	8	327828	327835	0 %	50 %	50 %	0 %	386263558
6079	NC_017451	GAT	2	6	327847	327852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6080	NC_017451	TTAC	2	8	327878	327885	25 %	50 %	0 %	25 %	386263558
6081	NC_017451	CTTC	2	8	327909	327916	0 %	50 %	0 %	50 %	386263558
6082	NC_017451	TGA	2	6	328056	328061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
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6086	NC_017451	TTA	2	6	328283	328288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263558
6087	NC_017451	ACA	2	6	328300	328305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263558
6088	NC_017451	CAA	2	6	328416	328421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263558
6089	NC_017451	A	6	6	328530	328535	100 %	0 %	0 %	0 %	386263558
6090	NC_017451	TAC	2	6	328617	328622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263558
6091	NC_017451	AGCT	2	8	328677	328684	25 %	25 %	25 %	25 %	386263558
6092	NC_017451	ACGCC	2	10	328693	328702	20 %	0 %	20 %	60 %	386263558
6093	NC_017451	GTC	2	6	328703	328708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263558
6094	NC_017451	CGTT	2	8	328711	328718	0 %	50 %	25 %	25 %	386263558
6095	NC_017451	ACG	2	6	328729	328734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263558
6096	NC_017451	CGG	2	6	328742	328747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263558
6097	NC_017451	ATG	2	6	328856	328861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6098	NC_017451	GAA	2	6	329028	329033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263558
6099	NC_017451	AGAGC	2	10	329095	329104	40 %	0 %	40 %	20 %	386263558
6100	NC_017451	GAAC	2	8	329110	329117	50 %	0 %	25 %	25 %	386263558
6101	NC_017451	AAG	2	6	329181	329186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263558
6102	NC_017451	AGC	2	6	329187	329192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263558
6103	NC_017451	AGC	2	6	329196	329201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263558
6104	NC_017451	CCTG	2	8	329214	329221	0 %	25 %	25 %	50 %	386263558
6105	NC_017451	CTG	2	6	329264	329269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263558
6106	NC_017451	A	6	6	329276	329281	100 %	0 %	0 %	0 %	386263558
6107	NC_017451	A	7	7	329289	329295	100 %	0 %	0 %	0 %	386263558
6108	NC_017451	CAAA	2	8	329445	329452	75 %	0 %	0 %	25 %	386263558
6109	NC_017451	CAG	2	6	329632	329637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263558
6110	NC_017451	ATA	2	6	329720	329725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263558
6111	NC_017451	TGA	2	6	329730	329735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6112	NC_017451	GAT	2	6	329763	329768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263558
6113	NC_017451	GAA	2	6	329851	329856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263558
6114	NC_017451	AAGTGA	2	12	329996	330007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386263558
6115	NC_017451	ATA	2	6	330077	330082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263558
6116	NC_017451	CAA	2	6	330166	330171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263558
6117	NC_017451	AAG	2	6	330194	330199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263558
6118	NC_017451	TAA	2	6	330454	330459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263559
6119	NC_017451	TGC	3	9	330488	330496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263559
6120	NC_017451	TAT	2	6	330502	330507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263559
6121	NC_017451	ATC	2	6	330542	330547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263559
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