MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori SNT49 plasmid pHPSNT

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017380	CTA	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227769
2	NC_017380	CTT	2	6	967	972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
3	NC_017380	CTT	2	6	989	994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
4	NC_017380	CTT	2	6	1011	1016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
5	NC_017380	AACGA	2	10	1020	1029	60 %	0 %	20 %	20 %	385227770
6	NC_017380	CTT	2	6	1038	1043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
7	NC_017380	CTT	2	6	1064	1069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
8	NC_017380	AACGA	2	10	1073	1082	60 %	0 %	20 %	20 %	385227770
9	NC_017380	CTT	2	6	1091	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
10	NC_017380	AACGA	2	10	1100	1109	60 %	0 %	20 %	20 %	385227770
11	NC_017380	CTT	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
12	NC_017380	AACGA	2	10	1127	1136	60 %	0 %	20 %	20 %	385227770
13	NC_017380	CTT	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
14	NC_017380	GAA	2	6	1567	1572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771
15	NC_017380	A	6	6	1594	1599	100 %	0 %	0 %	0 %	385227771
16	NC_017380	GAA	2	6	1600	1605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771
17	NC_017380	ACC	2	6	1654	1659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227771
18	NC_017380	TAG	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227771
19	NC_017380	ACC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227771
20	NC_017380	CAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
21	NC_017380	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227771
22	NC_017380	GAAACT	2	12	1945	1956	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385227771
23	NC_017380	ATTGA	2	10	1999	2008	40 %	40 %	20 %	0 %	385227771
24	NC_017380	CAA	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
25	NC_017380	CTT	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227771
26	NC_017380	CAA	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
27	NC_017380	A	6	6	2264	2269	100 %	0 %	0 %	0 %	385227771
28	NC_017380	A	7	7	2296	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	385227771
29	NC_017380	A	6	6	2329	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	385227771
30	NC_017380	AAACAA	2	12	2413	2424	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385227771
31	NC_017380	AAC	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
32	NC_017380	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
33	NC_017380	ACA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
34	NC_017380	A	6	6	2725	2730	100 %	0 %	0 %	0 %	385227771
35	NC_017380	AGA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771
36	NC_017380	CCA	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227771
37	NC_017380	ACGA	2	8	2776	2783	50 %	0 %	25 %	25 %	385227771
38	NC_017380	GAA	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.