MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno135 chromosome

Total Repeats: 15082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017379	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229316
2	NC_017379	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229316
3	NC_017379	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229316
4	NC_017379	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229317
5	NC_017379	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229317
6	NC_017379	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229317
7	NC_017379	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229317
8	NC_017379	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229317
9	NC_017379	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229318
10	NC_017379	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229318
11	NC_017379	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229318
12	NC_017379	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229318
13	NC_017379	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229318
14	NC_017379	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385229318
15	NC_017379	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229318
16	NC_017379	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229318
17	NC_017379	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229318
18	NC_017379	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229319
19	NC_017379	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229319
20	NC_017379	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229319
21	NC_017379	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229319
22	NC_017379	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229319
23	NC_017379	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229319
24	NC_017379	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229319
25	NC_017379	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229319
26	NC_017379	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385229319
27	NC_017379	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229320
28	NC_017379	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229320
29	NC_017379	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229320
30	NC_017379	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229320
31	NC_017379	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229320
32	NC_017379	TTG	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229321
33	NC_017379	AGC	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229321
34	NC_017379	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229321
35	NC_017379	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229321
36	NC_017379	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229321
37	NC_017379	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385229321
38	NC_017379	ATT	2	6	5301	5306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229322
39	NC_017379	GTT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
40	NC_017379	TAA	2	6	5670	5675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229322
41	NC_017379	TTA	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229322
42	NC_017379	GTG	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229322
43	NC_017379	AGA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229322
44	NC_017379	GCG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385229322
45	NC_017379	CTT	2	6	6395	6400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229322
46	NC_017379	GTT	2	6	6417	6422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
47	NC_017379	AGT	5	15	6423	6437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229322
48	NC_017379	TGT	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
49	NC_017379	TTG	2	6	6531	6536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
50	NC_017379	CAT	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229322
51	NC_017379	GTT	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
52	NC_017379	TGA	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229322
53	NC_017379	CCG	2	6	6734	6739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229322
54	NC_017379	GCT	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229322
55	NC_017379	GTT	2	6	6879	6884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
56	NC_017379	TGT	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229323
57	NC_017379	TGT	2	6	7272	7277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229323
58	NC_017379	CAT	2	6	7361	7366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229324
59	NC_017379	TTG	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229324
60	NC_017379	TCT	2	6	7428	7433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
61	NC_017379	AAT	2	6	7526	7531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229324
62	NC_017379	CTT	2	6	7534	7539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
63	NC_017379	CAT	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229324
64	NC_017379	ATG	2	6	7677	7682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229324
65	NC_017379	TCA	2	6	7701	7706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229324
66	NC_017379	CCG	2	6	7755	7760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229324
67	NC_017379	CTT	2	6	7774	7779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
68	NC_017379	CAT	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229324
69	NC_017379	CAT	2	6	7978	7983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229324
70	NC_017379	GTG	2	6	8010	8015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229324
71	NC_017379	TTC	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
72	NC_017379	TAA	2	6	8098	8103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229324
73	NC_017379	CCG	2	6	8109	8114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229324
74	NC_017379	TCT	2	6	8147	8152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
75	NC_017379	CAC	2	6	8210	8215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229324
76	NC_017379	GAT	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229324
77	NC_017379	TAG	2	6	8291	8296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229324
78	NC_017379	CTT	2	6	8464	8469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
79	NC_017379	TCT	2	6	8574	8579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
80	NC_017379	TAA	2	6	8617	8622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229324
81	NC_017379	GCA	2	6	8748	8753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229324
82	NC_017379	CTT	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229324
83	NC_017379	ACA	2	6	9095	9100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229325
84	NC_017379	TCT	2	6	9129	9134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229325
85	NC_017379	CTT	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229325
86	NC_017379	GAT	3	9	9299	9307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229325
87	NC_017379	TCT	2	6	9327	9332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229325
88	NC_017379	CTA	2	6	9343	9348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229325
89	NC_017379	TTG	2	6	9769	9774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229326
90	NC_017379	GAA	2	6	9785	9790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229326
91	NC_017379	TTA	2	6	9964	9969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229326
92	NC_017379	AGA	2	6	9979	9984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229326
93	NC_017379	ACC	2	6	9987	9992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229326
94	NC_017379	AAG	2	6	10020	10025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229326
95	NC_017379	ATT	2	6	10053	10058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229326
96	NC_017379	CAT	2	6	10234	10239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229326
97	NC_017379	GTG	2	6	10268	10273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229326
98	NC_017379	ATG	2	6	10548	10553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229326
99	NC_017379	AGG	2	6	10613	10618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385229326
100	NC_017379	AAC	2	6	10640	10645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229326
101	NC_017379	AGA	2	6	11026	11031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229326
102	NC_017379	TTG	2	6	11039	11044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229326
103	NC_017379	GAC	2	6	11126	11131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229326
104	NC_017379	TTA	3	9	11147	11155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229326
105	NC_017379	TTG	2	6	11204	11209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229326
106	NC_017379	TGT	2	6	11390	11395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229327
107	NC_017379	TGT	2	6	11558	11563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229327
108	NC_017379	AAG	2	6	11717	11722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229327
109	NC_017379	TAA	2	6	12027	12032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229327
110	NC_017379	TGG	3	9	12128	12136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229327
111	NC_017379	GAA	3	9	12145	12153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229327
112	NC_017379	TGG	2	6	12227	12232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229327
113	NC_017379	AGA	2	6	12249	12254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229327
114	NC_017379	AGG	2	6	12474	12479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385229328
115	NC_017379	TTA	2	6	12561	12566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229329
116	NC_017379	GAA	2	6	12578	12583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229329
117	NC_017379	GTT	2	6	12645	12650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229329
118	NC_017379	ATT	2	6	12668	12673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229329
119	NC_017379	GAA	2	6	12874	12879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229329
120	NC_017379	AAT	2	6	12950	12955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229329
121	NC_017379	CAA	2	6	13049	13054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229329
122	NC_017379	CCA	2	6	13107	13112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229329
123	NC_017379	TTG	2	6	13194	13199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229329
124	NC_017379	AGA	2	6	13246	13251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229329
125	NC_017379	GTG	2	6	13671	13676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229330
126	NC_017379	GAA	2	6	13762	13767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229331
127	NC_017379	ATT	3	9	13949	13957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229331
128	NC_017379	GAA	2	6	14088	14093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229332
129	NC_017379	ATG	2	6	14113	14118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229332
130	NC_017379	TGG	2	6	14149	14154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229332
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