MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno120 plasmid pHPPN120

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017377	GAAC	2	8	1152	1159	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
2	NC_017377	CCAA	2	8	1334	1341	50 %	0 %	0 %	50 %	385229300
3	NC_017377	CAAG	2	8	1494	1501	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
4	NC_017377	TCCA	2	8	2197	2204	25 %	25 %	0 %	50 %	385229302
5	NC_017377	CTTG	2	8	2381	2388	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
6	NC_017377	TTGC	2	8	2780	2787	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
7	NC_017377	CTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	0 %	25 %	385229302
8	NC_017377	AAGA	2	8	4818	4825	75 %	0 %	25 %	0 %	385229304
9	NC_017377	ATCA	2	8	6308	6315	50 %	25 %	0 %	25 %	385229307
10	NC_017377	AAGA	2	8	7144	7151	75 %	0 %	25 %	0 %	385229307
11	NC_017377	CCTG	2	8	8168	8175	0 %	25 %	25 %	50 %	385229308
12	NC_017377	CATG	2	8	8474	8481	25 %	25 %	25 %	25 %	385229308
13	NC_017377	GAAA	2	8	8576	8583	75 %	0 %	25 %	0 %	385229308
14	NC_017377	GAAA	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	385229309
15	NC_017377	GAAG	2	8	8783	8790	50 %	0 %	50 %	0 %	385229309
16	NC_017377	ATCA	2	8	8888	8895	50 %	25 %	0 %	25 %	385229309
17	NC_017377	CTTG	2	8	8914	8921	0 %	50 %	25 %	25 %	385229309
18	NC_017377	CAAT	2	8	9503	9510	50 %	25 %	0 %	25 %	385229310
19	NC_017377	TTAG	2	8	9773	9780	25 %	50 %	25 %	0 %	385229310
20	NC_017377	TTTC	2	8	9970	9977	0 %	75 %	0 %	25 %	385229310
21	NC_017377	GATT	2	8	10202	10209	25 %	50 %	25 %	0 %	385229310
22	NC_017377	AAAT	2	8	10315	10322	75 %	25 %	0 %	0 %	385229310
23	NC_017377	GGTC	2	8	10381	10388	0 %	25 %	50 %	25 %	385229310
24	NC_017377	TTAT	2	8	10715	10722	25 %	75 %	0 %	0 %	385229310
25	NC_017377	AAGA	2	8	11926	11933	75 %	0 %	25 %	0 %	385229313

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.