MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori SNT49 chromosome

Total Repeats: 1063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017376	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385226255
2	NC_017376	TTTGA	2	10	6236	6245	20 %	60 %	20 %	0 %	385226259
3	NC_017376	TTTCT	2	10	8436	8445	0 %	80 %	0 %	20 %	385226260
4	NC_017376	TTTTG	2	10	11953	11962	0 %	80 %	20 %	0 %	385226263
5	NC_017376	GGGTT	2	10	12175	12184	0 %	40 %	60 %	0 %	385226263
6	NC_017376	TGGTG	2	10	12791	12800	0 %	40 %	60 %	0 %	385226264
7	NC_017376	CCATG	2	10	23253	23262	20 %	20 %	20 %	40 %	385226274
8	NC_017376	CTCTT	2	10	23283	23292	0 %	60 %	0 %	40 %	385226274
9	NC_017376	CAAGC	2	10	27899	27908	40 %	0 %	20 %	40 %	385226276
10	NC_017376	TTTTA	2	10	28829	28838	20 %	80 %	0 %	0 %	385226277
11	NC_017376	GTGGG	2	10	33634	33643	0 %	20 %	80 %	0 %	385226281
12	NC_017376	AAGCC	2	10	40643	40652	40 %	0 %	20 %	40 %	385226290
13	NC_017376	AGAAA	2	10	41958	41967	80 %	0 %	20 %	0 %	385226291
14	NC_017376	TACTC	2	10	42811	42820	20 %	40 %	0 %	40 %	385226292
15	NC_017376	TAAAA	2	10	44938	44947	80 %	20 %	0 %	0 %	385226293
16	NC_017376	TCCCA	2	10	45959	45968	20 %	20 %	0 %	60 %	385226294
17	NC_017376	TGCCT	2	10	49072	49081	0 %	40 %	20 %	40 %	385226296
18	NC_017376	TGAAA	2	10	50148	50157	60 %	20 %	20 %	0 %	385226298
19	NC_017376	TCAAA	2	10	50402	50411	60 %	20 %	0 %	20 %	385226298
20	NC_017376	TAAAA	2	10	53441	53450	80 %	20 %	0 %	0 %	385226299
21	NC_017376	TCAAA	2	10	54157	54166	60 %	20 %	0 %	20 %	385226299
22	NC_017376	ATCGC	2	10	56119	56128	20 %	20 %	20 %	40 %	385226303
23	NC_017376	AAGAA	2	10	63089	63098	80 %	0 %	20 %	0 %	385226310
24	NC_017376	CAAAG	2	10	63528	63537	60 %	0 %	20 %	20 %	385226310
25	NC_017376	CATCC	2	10	63853	63862	20 %	20 %	0 %	60 %	385226311
26	NC_017376	TTTTG	2	10	64601	64610	0 %	80 %	20 %	0 %	385226311
27	NC_017376	CTTTT	2	10	64727	64736	0 %	80 %	0 %	20 %	385226311
28	NC_017376	TGCTT	2	10	67567	67576	0 %	60 %	20 %	20 %	385226312
29	NC_017376	ATTAT	2	10	67806	67815	40 %	60 %	0 %	0 %	385226312
30	NC_017376	GTTTT	2	10	68915	68924	0 %	80 %	20 %	0 %	385226313
31	NC_017376	TTTTA	2	10	70958	70967	20 %	80 %	0 %	0 %	385226314
32	NC_017376	AATTG	2	10	71063	71072	40 %	40 %	20 %	0 %	385226314
33	NC_017376	GAAAA	2	10	74780	74789	80 %	0 %	20 %	0 %	385226314
34	NC_017376	AGCAA	2	10	75247	75256	60 %	0 %	20 %	20 %	385226314
35	NC_017376	TGGCG	2	10	76499	76508	0 %	20 %	60 %	20 %	385226314
36	NC_017376	AACAA	2	10	77815	77824	80 %	0 %	0 %	20 %	385226314
37	NC_017376	GCCAA	2	10	79078	79087	40 %	0 %	20 %	40 %	385226315
38	NC_017376	AAAAT	2	10	79405	79414	80 %	20 %	0 %	0 %	385226315
39	NC_017376	TTTCA	2	10	81492	81501	20 %	60 %	0 %	20 %	385226318
40	NC_017376	TTTAG	2	10	81718	81727	20 %	60 %	20 %	0 %	385226318
41	NC_017376	AGTTG	2	10	82777	82786	20 %	40 %	40 %	0 %	385226318
42	NC_017376	GTATC	2	10	82836	82845	20 %	40 %	20 %	20 %	385226318
43	NC_017376	ATTTT	2	10	85464	85473	20 %	80 %	0 %	0 %	385226321
44	NC_017376	TCAAA	2	10	85501	85510	60 %	20 %	0 %	20 %	385226321
45	NC_017376	AAAAT	2	10	86080	86089	80 %	20 %	0 %	0 %	385226322
46	NC_017376	TTTCA	2	10	86144	86153	20 %	60 %	0 %	20 %	385226322
47	NC_017376	CTAAG	2	10	87695	87704	40 %	20 %	20 %	20 %	385226325
48	NC_017376	TAGAT	2	10	88315	88324	40 %	40 %	20 %	0 %	385226326
49	NC_017376	CTTCA	2	10	90040	90049	20 %	40 %	0 %	40 %	385226329
50	NC_017376	TTTTG	2	10	90289	90298	0 %	80 %	20 %	0 %	385226330
51	NC_017376	GTATT	2	10	95772	95781	20 %	60 %	20 %	0 %	385226333
52	NC_017376	TCATT	2	10	98078	98087	20 %	60 %	0 %	20 %	385226336
53	NC_017376	CAATA	2	10	99889	99898	60 %	20 %	0 %	20 %	385226337
54	NC_017376	TTAAA	2	10	100851	100860	60 %	40 %	0 %	0 %	385226338
55	NC_017376	TCAAT	2	10	105079	105088	40 %	40 %	0 %	20 %	385226341
56	NC_017376	CTTCT	2	10	105922	105931	0 %	60 %	0 %	40 %	385226342
57	NC_017376	TGCCT	2	10	105999	106008	0 %	40 %	20 %	40 %	385226342
58	NC_017376	TCCAA	2	10	106411	106420	40 %	20 %	0 %	40 %	385226343
59	NC_017376	CAATG	2	10	107247	107256	40 %	20 %	20 %	20 %	385226344
60	NC_017376	TTTTG	2	10	109693	109702	0 %	80 %	20 %	0 %	385226346
61	NC_017376	ACGCC	2	10	109999	110008	20 %	0 %	20 %	60 %	385226346
62	NC_017376	AAAGC	2	10	110765	110774	60 %	0 %	20 %	20 %	385226347
63	NC_017376	ATCTT	2	10	118763	118772	20 %	60 %	0 %	20 %	385226353
64	NC_017376	TGGCT	2	10	119304	119313	0 %	40 %	40 %	20 %	385226353
65	NC_017376	ATTTC	2	10	119421	119430	20 %	60 %	0 %	20 %	385226353
66	NC_017376	ATGCC	2	10	119823	119832	20 %	20 %	20 %	40 %	385226354
67	NC_017376	TTGAT	2	10	120752	120761	20 %	60 %	20 %	0 %	385226356
68	NC_017376	GGCGT	2	10	122566	122575	0 %	20 %	60 %	20 %	385226358
69	NC_017376	CTTTC	2	10	126100	126109	0 %	60 %	0 %	40 %	385226360
70	NC_017376	TTTGA	2	10	129102	129111	20 %	60 %	20 %	0 %	385226363
71	NC_017376	TCTTT	2	10	129313	129322	0 %	80 %	0 %	20 %	385226363
72	NC_017376	CGGCA	2	10	132899	132908	20 %	0 %	40 %	40 %	385226366
73	NC_017376	ACGAT	2	10	135384	135393	40 %	20 %	20 %	20 %	385226368
74	NC_017376	GAATT	2	10	137225	137234	40 %	40 %	20 %	0 %	385226369
75	NC_017376	TCGTT	2	10	139029	139038	0 %	60 %	20 %	20 %	385226370
76	NC_017376	CAATC	2	10	139805	139814	40 %	20 %	0 %	40 %	385226371
77	NC_017376	TCTTT	2	10	142346	142355	0 %	80 %	0 %	20 %	385226373
78	NC_017376	AAAGC	2	10	145119	145128	60 %	0 %	20 %	20 %	385226375
79	NC_017376	CAAAT	2	10	147555	147564	60 %	20 %	0 %	20 %	385226378
80	NC_017376	ACCCT	2	10	148985	148994	20 %	20 %	0 %	60 %	385226379
81	NC_017376	ATGCC	2	10	149117	149126	20 %	20 %	20 %	40 %	385226379
82	NC_017376	TGATT	2	10	151112	151121	20 %	60 %	20 %	0 %	385226381
83	NC_017376	CTAAA	2	10	151581	151590	60 %	20 %	0 %	20 %	385226383
84	NC_017376	GAATT	2	10	151730	151739	40 %	40 %	20 %	0 %	385226383
85	NC_017376	GATCG	2	10	155608	155617	20 %	20 %	40 %	20 %	385226385
86	NC_017376	AGCTC	2	10	155627	155636	20 %	20 %	20 %	40 %	385226385
87	NC_017376	AGCCA	2	10	157516	157525	40 %	0 %	20 %	40 %	385226386
88	NC_017376	CGCTG	2	10	160459	160468	0 %	20 %	40 %	40 %	385226388
89	NC_017376	TTTGA	2	10	160606	160615	20 %	60 %	20 %	0 %	385226388
90	NC_017376	GACTT	2	10	161140	161149	20 %	40 %	20 %	20 %	385226388
91	NC_017376	ATCTC	2	10	161891	161900	20 %	40 %	0 %	40 %	385226388
92	NC_017376	CGCTT	2	10	162049	162058	0 %	40 %	20 %	40 %	385226388
93	NC_017376	TGCGT	2	10	164435	164444	0 %	40 %	40 %	20 %	385226390
94	NC_017376	GAAAA	2	10	164596	164605	80 %	0 %	20 %	0 %	385226390
95	NC_017376	CGTTT	2	10	164863	164872	0 %	60 %	20 %	20 %	385226390
96	NC_017376	GAAAA	2	10	164914	164923	80 %	0 %	20 %	0 %	385226390
97	NC_017376	ATTTT	2	10	167883	167892	20 %	80 %	0 %	0 %	385226395
98	NC_017376	ATGTT	2	10	167965	167974	20 %	60 %	20 %	0 %	385226395
99	NC_017376	AAATC	2	10	170385	170394	60 %	20 %	0 %	20 %	385226397
100	NC_017376	AAAAT	2	10	171857	171866	80 %	20 %	0 %	0 %	385226398
101	NC_017376	TTTTC	2	10	174206	174215	0 %	80 %	0 %	20 %	385226402
102	NC_017376	GTAAA	2	10	174758	174767	60 %	20 %	20 %	0 %	385226403
103	NC_017376	TTCTT	2	10	176162	176171	0 %	80 %	0 %	20 %	385226404
104	NC_017376	TCTTT	2	10	176656	176665	0 %	80 %	0 %	20 %	385226405
105	NC_017376	ACTTG	2	10	176869	176878	20 %	40 %	20 %	20 %	385226405
106	NC_017376	TTTTG	2	10	177834	177843	0 %	80 %	20 %	0 %	385226406
107	NC_017376	GCGAT	2	10	178627	178636	20 %	20 %	40 %	20 %	385226406
108	NC_017376	GCTTG	2	10	178883	178892	0 %	40 %	40 %	20 %	385226406
109	NC_017376	GTCCA	2	10	179487	179496	20 %	20 %	20 %	40 %	385226407
110	NC_017376	TTTTG	2	10	179535	179544	0 %	80 %	20 %	0 %	385226407
111	NC_017376	CCAAA	2	10	181375	181384	60 %	0 %	0 %	40 %	385226408
112	NC_017376	ACGCC	2	10	184897	184906	20 %	0 %	20 %	60 %	385226410
113	NC_017376	GCGTT	2	10	187151	187160	0 %	40 %	40 %	20 %	385226416
114	NC_017376	ATTTG	2	10	188126	188135	20 %	60 %	20 %	0 %	385226417
115	NC_017376	AAAAC	2	10	190747	190756	80 %	0 %	0 %	20 %	385226420
116	NC_017376	GGGGA	2	10	190847	190856	20 %	0 %	80 %	0 %	385226420
117	NC_017376	AGATT	2	10	192646	192655	40 %	40 %	20 %	0 %	385226422
118	NC_017376	AAGCC	2	10	193983	193992	40 %	0 %	20 %	40 %	385226425
119	NC_017376	GGCAT	2	10	195798	195807	20 %	20 %	40 %	20 %	385226426
120	NC_017376	ATTTT	2	10	196035	196044	20 %	80 %	0 %	0 %	385226427
121	NC_017376	GGGTG	2	10	196397	196406	0 %	20 %	80 %	0 %	385226427
122	NC_017376	ATTCA	2	10	197531	197540	40 %	40 %	0 %	20 %	385226428
123	NC_017376	ATCTT	2	10	200930	200939	20 %	60 %	0 %	20 %	385226431
124	NC_017376	ATTTG	2	10	210310	210319	20 %	60 %	20 %	0 %	385226442
125	NC_017376	AAATC	2	10	210549	210558	60 %	20 %	0 %	20 %	385226443
126	NC_017376	AAAGT	2	10	212120	212129	60 %	20 %	20 %	0 %	385226446
127	NC_017376	GGTTA	2	10	212570	212579	20 %	40 %	40 %	0 %	385226447
128	NC_017376	AAATG	2	10	213153	213162	60 %	20 %	20 %	0 %	385226449
129	NC_017376	ATTTT	2	10	213833	213842	20 %	80 %	0 %	0 %	385226449
130	NC_017376	TGTAA	2	10	213941	213950	40 %	40 %	20 %	0 %	385226450
131	NC_017376	ATAAA	2	10	215437	215446	80 %	20 %	0 %	0 %	385226451
132	NC_017376	AATAA	2	10	215735	215744	80 %	20 %	0 %	0 %	385226451
133	NC_017376	AAAAG	2	10	216575	216584	80 %	0 %	20 %	0 %	385226452
134	NC_017376	ACCCC	2	10	216640	216649	20 %	0 %	0 %	80 %	385226452
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