MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 3890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	GAGC	2	8	72	79	25 %	0 %	50 %	25 %	385223049
2	NC_017374	CATT	2	8	158	165	25 %	50 %	0 %	25 %	385223049
3	NC_017374	TTCT	2	8	303	310	0 %	75 %	0 %	25 %	385223049
4	NC_017374	AAAT	2	8	956	963	75 %	25 %	0 %	0 %	385223051
5	NC_017374	CCTG	2	8	1854	1861	0 %	25 %	25 %	50 %	385223052
6	NC_017374	GCCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	25 %	50 %	385223052
7	NC_017374	TGAA	2	8	1918	1925	50 %	25 %	25 %	0 %	385223052
8	NC_017374	AATG	2	8	2108	2115	50 %	25 %	25 %	0 %	385223052
9	NC_017374	ATTC	2	8	2393	2400	25 %	50 %	0 %	25 %	385223052
10	NC_017374	CTTT	2	8	2603	2610	0 %	75 %	0 %	25 %	385223053
11	NC_017374	GAAA	2	8	3292	3299	75 %	0 %	25 %	0 %	385223054
12	NC_017374	GAAA	2	8	3367	3374	75 %	0 %	25 %	0 %	385223054
13	NC_017374	AGAA	2	8	3823	3830	75 %	0 %	25 %	0 %	385223054
14	NC_017374	ACTA	2	8	5112	5119	50 %	25 %	0 %	25 %	385223057
15	NC_017374	TTCA	2	8	5774	5781	25 %	50 %	0 %	25 %	385223059
16	NC_017374	CGTT	2	8	6550	6557	0 %	50 %	25 %	25 %	385223059
17	NC_017374	TCAA	2	8	7983	7990	50 %	25 %	0 %	25 %	385223061
18	NC_017374	ATTG	2	8	8338	8345	25 %	50 %	25 %	0 %	385223061
19	NC_017374	TTTG	2	8	8803	8810	0 %	75 %	25 %	0 %	385223061
20	NC_017374	AGCA	2	8	10710	10717	50 %	0 %	25 %	25 %	385223062
21	NC_017374	GTTT	2	8	11068	11075	0 %	75 %	25 %	0 %	385223062
22	NC_017374	TCTT	2	8	11455	11462	0 %	75 %	0 %	25 %	385223062
23	NC_017374	AGCG	2	8	11926	11933	25 %	0 %	50 %	25 %	385223064
24	NC_017374	GATT	2	8	12034	12041	25 %	50 %	25 %	0 %	385223064
25	NC_017374	TTTA	2	8	13205	13212	25 %	75 %	0 %	0 %	385223065
26	NC_017374	CAGG	2	8	14363	14370	25 %	0 %	50 %	25 %	385223065
27	NC_017374	TGAT	2	8	14407	14414	25 %	50 %	25 %	0 %	385223065
28	NC_017374	AGTT	2	8	14535	14542	25 %	50 %	25 %	0 %	385223065
29	NC_017374	CGTG	2	8	15099	15106	0 %	25 %	50 %	25 %	385223067
30	NC_017374	AACG	2	8	15214	15221	50 %	0 %	25 %	25 %	385223067
31	NC_017374	GCTT	2	8	15386	15393	0 %	50 %	25 %	25 %	385223067
32	NC_017374	TGAT	2	8	15620	15627	25 %	50 %	25 %	0 %	385223067
33	NC_017374	GTTT	2	8	16161	16168	0 %	75 %	25 %	0 %	385223067
34	NC_017374	TTGA	2	8	16514	16521	25 %	50 %	25 %	0 %	385223068
35	NC_017374	AGCG	2	8	17062	17069	25 %	0 %	50 %	25 %	385223068
36	NC_017374	TAAA	2	8	18581	18588	75 %	25 %	0 %	0 %	385223070
37	NC_017374	GCGA	2	8	18590	18597	25 %	0 %	50 %	25 %	385223070
38	NC_017374	TAAA	2	8	19341	19348	75 %	25 %	0 %	0 %	385223071
39	NC_017374	CTTT	2	8	19447	19454	0 %	75 %	0 %	25 %	385223071
40	NC_017374	AAGT	2	8	19759	19766	50 %	25 %	25 %	0 %	385223071
41	NC_017374	CTTT	2	8	20524	20531	0 %	75 %	0 %	25 %	385223071
42	NC_017374	GTTT	2	8	21612	21619	0 %	75 %	25 %	0 %	385223072
43	NC_017374	CATT	2	8	21660	21667	25 %	50 %	0 %	25 %	385223072
44	NC_017374	ATTG	2	8	22582	22589	25 %	50 %	25 %	0 %	385223072
45	NC_017374	TTTG	2	8	23584	23591	0 %	75 %	25 %	0 %	385223073
46	NC_017374	GCTC	2	8	26058	26065	0 %	25 %	25 %	50 %	385223075
47	NC_017374	GATG	2	8	26505	26512	25 %	25 %	50 %	0 %	385223075
48	NC_017374	TTTA	2	8	27141	27148	25 %	75 %	0 %	0 %	385223076
49	NC_017374	GAGT	2	8	27994	28001	25 %	25 %	50 %	0 %	385223077
50	NC_017374	TGCT	2	8	28048	28055	0 %	50 %	25 %	25 %	385223077
51	NC_017374	AGCA	2	8	28159	28166	50 %	0 %	25 %	25 %	385223077
52	NC_017374	CAAT	2	8	28173	28180	50 %	25 %	0 %	25 %	385223077
53	NC_017374	GCTT	2	8	28249	28256	0 %	50 %	25 %	25 %	385223077
54	NC_017374	TTGA	2	8	28669	28676	25 %	50 %	25 %	0 %	385223077
55	NC_017374	CCTA	2	8	28978	28985	25 %	25 %	0 %	50 %	385223077
56	NC_017374	AAAG	2	8	29492	29499	75 %	0 %	25 %	0 %	385223077
57	NC_017374	TTTA	2	8	29787	29794	25 %	75 %	0 %	0 %	385223078
58	NC_017374	GCGA	2	8	29985	29992	25 %	0 %	50 %	25 %	385223078
59	NC_017374	ACCC	2	8	30096	30103	25 %	0 %	0 %	75 %	385223079
60	NC_017374	CATC	2	8	30222	30229	25 %	25 %	0 %	50 %	385223079
61	NC_017374	TGAA	2	8	30376	30383	50 %	25 %	25 %	0 %	385223080
62	NC_017374	CCAA	2	8	30576	30583	50 %	0 %	0 %	50 %	385223080
63	NC_017374	TCGT	2	8	30734	30741	0 %	50 %	25 %	25 %	385223080
64	NC_017374	TATT	2	8	31171	31178	25 %	75 %	0 %	0 %	385223080
65	NC_017374	CATG	2	8	31490	31497	25 %	25 %	25 %	25 %	385223080
66	NC_017374	CGCT	2	8	31606	31613	0 %	25 %	25 %	50 %	385223080
67	NC_017374	GCTT	2	8	32505	32512	0 %	50 %	25 %	25 %	385223080
68	NC_017374	GCAC	2	8	32549	32556	25 %	0 %	25 %	50 %	385223080
69	NC_017374	GAAA	2	8	32564	32571	75 %	0 %	25 %	0 %	385223080
70	NC_017374	GAAA	2	8	32896	32903	75 %	0 %	25 %	0 %	385223081
71	NC_017374	TTCT	2	8	34267	34274	0 %	75 %	0 %	25 %	385223084
72	NC_017374	CTTT	2	8	34596	34603	0 %	75 %	0 %	25 %	385223084
73	NC_017374	CTCA	2	8	35085	35092	25 %	25 %	0 %	50 %	385223084
74	NC_017374	TAAA	2	8	35295	35302	75 %	25 %	0 %	0 %	385223084
75	NC_017374	GAAA	2	8	35425	35432	75 %	0 %	25 %	0 %	385223085
76	NC_017374	TGAA	2	8	36003	36010	50 %	25 %	25 %	0 %	385223086
77	NC_017374	TTTG	2	8	36055	36062	0 %	75 %	25 %	0 %	385223086
78	NC_017374	TGAT	2	8	36160	36167	25 %	50 %	25 %	0 %	385223086
79	NC_017374	CGAA	2	8	36245	36252	50 %	0 %	25 %	25 %	385223087
80	NC_017374	TGAT	2	8	36545	36552	25 %	50 %	25 %	0 %	385223087
81	NC_017374	AACC	2	8	37247	37254	50 %	0 %	0 %	50 %	385223088
82	NC_017374	CAAA	2	8	37531	37538	75 %	0 %	0 %	25 %	385223088
83	NC_017374	ATTG	2	8	37945	37952	25 %	50 %	25 %	0 %	385223088
84	NC_017374	ATTG	2	8	38011	38018	25 %	50 %	25 %	0 %	385223088
85	NC_017374	TGTT	2	8	38907	38914	0 %	75 %	25 %	0 %	385223089
86	NC_017374	CTTT	2	8	39500	39507	0 %	75 %	0 %	25 %	385223089
87	NC_017374	GAAA	2	8	39800	39807	75 %	0 %	25 %	0 %	385223090
88	NC_017374	GATC	2	8	39929	39936	25 %	25 %	25 %	25 %	385223090
89	NC_017374	ATGA	2	8	40936	40943	50 %	25 %	25 %	0 %	385223090
90	NC_017374	AACG	2	8	41328	41335	50 %	0 %	25 %	25 %	385223091
91	NC_017374	CAAA	2	8	41775	41782	75 %	0 %	0 %	25 %	385223091
92	NC_017374	GATT	2	8	42407	42414	25 %	50 %	25 %	0 %	385223093
93	NC_017374	TTGA	2	8	42890	42897	25 %	50 %	25 %	0 %	385223095
94	NC_017374	CGCT	2	8	43045	43052	0 %	25 %	25 %	50 %	385223095
95	NC_017374	GTTT	2	8	43667	43674	0 %	75 %	25 %	0 %	385223095
96	NC_017374	CAAA	2	8	44163	44170	75 %	0 %	0 %	25 %	385223096
97	NC_017374	TCGC	2	8	44978	44985	0 %	25 %	25 %	50 %	385223096
98	NC_017374	AGGG	2	8	44989	44996	25 %	0 %	75 %	0 %	385223096
99	NC_017374	GCAA	2	8	45642	45649	50 %	0 %	25 %	25 %	385223096
100	NC_017374	TTTA	2	8	46323	46330	25 %	75 %	0 %	0 %	385223097
101	NC_017374	CGAG	2	8	46336	46343	25 %	0 %	50 %	25 %	385223097
102	NC_017374	CTTT	2	8	47300	47307	0 %	75 %	0 %	25 %	385223098
103	NC_017374	GATT	2	8	47486	47493	25 %	50 %	25 %	0 %	385223098
104	NC_017374	TTGC	2	8	47776	47783	0 %	50 %	25 %	25 %	385223099
105	NC_017374	ATCA	2	8	48657	48664	50 %	25 %	0 %	25 %	385223100
106	NC_017374	TAAA	2	8	48691	48698	75 %	25 %	0 %	0 %	385223100
107	NC_017374	GAGT	2	8	48710	48717	25 %	25 %	50 %	0 %	385223100
108	NC_017374	AATC	2	8	49205	49212	50 %	25 %	0 %	25 %	385223100
109	NC_017374	GTTT	2	8	49263	49270	0 %	75 %	25 %	0 %	385223100
110	NC_017374	CATG	2	8	49403	49410	25 %	25 %	25 %	25 %	385223100
111	NC_017374	TGTC	2	8	50064	50071	0 %	50 %	25 %	25 %	385223101
112	NC_017374	GATA	2	8	50134	50141	50 %	25 %	25 %	0 %	385223101
113	NC_017374	TTGT	2	8	50156	50163	0 %	75 %	25 %	0 %	385223101
114	NC_017374	AACG	2	8	50208	50215	50 %	0 %	25 %	25 %	385223101
115	NC_017374	TGAG	2	8	50436	50443	25 %	25 %	50 %	0 %	385223101
116	NC_017374	TAAA	2	8	50636	50643	75 %	25 %	0 %	0 %	385223101
117	NC_017374	AAAT	2	8	50872	50879	75 %	25 %	0 %	0 %	385223101
118	NC_017374	TTTG	2	8	51046	51053	0 %	75 %	25 %	0 %	385223101
119	NC_017374	AAGT	2	8	51448	51455	50 %	25 %	25 %	0 %	385223101
120	NC_017374	TTTG	2	8	51751	51758	0 %	75 %	25 %	0 %	385223101
121	NC_017374	AAAC	2	8	52238	52245	75 %	0 %	0 %	25 %	385223102
122	NC_017374	AGCC	2	8	52438	52445	25 %	0 %	25 %	50 %	385223102
123	NC_017374	AAGA	2	8	52959	52966	75 %	0 %	25 %	0 %	385223102
124	NC_017374	CACT	2	8	53206	53213	25 %	25 %	0 %	50 %	385223102
125	NC_017374	TCGC	2	8	53484	53491	0 %	25 %	25 %	50 %	385223102
126	NC_017374	TTGT	2	8	53564	53571	0 %	75 %	25 %	0 %	385223102
127	NC_017374	ATTT	2	8	53681	53688	25 %	75 %	0 %	0 %	385223103
128	NC_017374	GCTT	3	12	53854	53865	0 %	50 %	25 %	25 %	385223103
129	NC_017374	TCGT	2	8	54016	54023	0 %	50 %	25 %	25 %	385223103
130	NC_017374	GATA	2	8	54342	54349	50 %	25 %	25 %	0 %	385223103
131	NC_017374	TCTG	2	8	54976	54983	0 %	50 %	25 %	25 %	385223103
132	NC_017374	GTTT	2	8	55844	55851	0 %	75 %	25 %	0 %	385223103
133	NC_017374	CTTT	2	8	56420	56427	0 %	75 %	0 %	25 %	385223103
134	NC_017374	AAAG	2	8	56923	56930	75 %	0 %	25 %	0 %	385223103
135	NC_017374	GCTC	2	8	57165	57172	0 %	25 %	25 %	50 %	385223103
136	NC_017374	AGCT	2	8	58906	58913	25 %	25 %	25 %	25 %	385223107
137	NC_017374	ACTG	2	8	58928	58935	25 %	25 %	25 %	25 %	385223107
138	NC_017374	AGCG	2	8	59023	59030	25 %	0 %	50 %	25 %	385223107
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