MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 15255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017372	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219874
2	NC_017372	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219874
3	NC_017372	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219874
4	NC_017372	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219874
5	NC_017372	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219875
6	NC_017372	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219875
7	NC_017372	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219875
8	NC_017372	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219875
9	NC_017372	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219875
10	NC_017372	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219876
11	NC_017372	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219876
12	NC_017372	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219876
13	NC_017372	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385219876
14	NC_017372	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219876
15	NC_017372	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385219876
16	NC_017372	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219876
17	NC_017372	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219876
18	NC_017372	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219876
19	NC_017372	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219877
20	NC_017372	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219877
21	NC_017372	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219877
22	NC_017372	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219877
23	NC_017372	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219877
24	NC_017372	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219877
25	NC_017372	ATA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219877
26	NC_017372	TGA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219878
27	NC_017372	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219878
28	NC_017372	AAC	2	6	2798	2803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219878
29	NC_017372	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219878
30	NC_017372	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219878
31	NC_017372	AAG	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219878
32	NC_017372	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219878
33	NC_017372	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219878
34	NC_017372	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219879
35	NC_017372	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219879
36	NC_017372	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219879
37	NC_017372	TAG	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219879
38	NC_017372	ATT	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219880
39	NC_017372	GTT	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
40	NC_017372	TAA	2	6	5790	5795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219880
41	NC_017372	TTA	2	6	5848	5853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219880
42	NC_017372	GTG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219880
43	NC_017372	GTT	2	6	5937	5942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
44	NC_017372	GTT	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
45	NC_017372	AGT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219880
46	NC_017372	AGA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219880
47	NC_017372	GCG	2	6	6296	6301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385219880
48	NC_017372	CGA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219880
49	NC_017372	TGT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
50	NC_017372	ATT	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219880
51	NC_017372	CAG	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219880
52	NC_017372	TGT	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
53	NC_017372	TTG	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
54	NC_017372	CCG	2	6	6971	6976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219880
55	NC_017372	GCT	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219880
56	NC_017372	GTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219880
57	NC_017372	CAT	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219881
58	NC_017372	GCC	2	6	7633	7638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219881
59	NC_017372	TCT	2	6	7694	7699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
60	NC_017372	AAT	2	6	7792	7797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219881
61	NC_017372	CTT	2	6	7800	7805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
62	NC_017372	CAT	2	6	7890	7895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219881
63	NC_017372	ATG	2	6	7943	7948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219881
64	NC_017372	TCA	2	6	7967	7972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219881
65	NC_017372	CCG	2	6	8021	8026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219881
66	NC_017372	CTT	2	6	8040	8045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
67	NC_017372	TCA	2	6	8075	8080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219881
68	NC_017372	CAT	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219881
69	NC_017372	GTG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219881
70	NC_017372	TTC	2	6	8356	8361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
71	NC_017372	CCG	2	6	8375	8380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219881
72	NC_017372	CAC	2	6	8476	8481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385219881
73	NC_017372	GAT	2	6	8518	8523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219881
74	NC_017372	TAG	2	6	8557	8562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219881
75	NC_017372	CTT	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
76	NC_017372	TCT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
77	NC_017372	TAA	2	6	8883	8888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219881
78	NC_017372	CTT	2	6	8961	8966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
79	NC_017372	GGT	2	6	8995	9000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219881
80	NC_017372	GCA	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219881
81	NC_017372	CTT	2	6	9039	9044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219881
82	NC_017372	TCT	2	6	9396	9401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219882
83	NC_017372	CTT	2	6	9478	9483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219882
84	NC_017372	GAT	3	9	9566	9574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219882
85	NC_017372	TCT	2	6	9594	9599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219882
86	NC_017372	CTA	2	6	9610	9615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219882
87	NC_017372	TTG	2	6	10045	10050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219883
88	NC_017372	GAA	2	6	10061	10066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219883
89	NC_017372	TTA	2	6	10240	10245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219883
90	NC_017372	AGA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219883
91	NC_017372	ACC	2	6	10263	10268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385219883
92	NC_017372	AAG	2	6	10296	10301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219883
93	NC_017372	CAT	2	6	10510	10515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219883
94	NC_017372	GTG	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219883
95	NC_017372	ATG	2	6	10824	10829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219883
96	NC_017372	AGG	2	6	10889	10894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385219883
97	NC_017372	GGT	2	6	10900	10905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219883
98	NC_017372	GAT	2	6	10936	10941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219883
99	NC_017372	AGA	2	6	11302	11307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219883
100	NC_017372	TTG	2	6	11315	11320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219883
101	NC_017372	GAC	2	6	11402	11407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219883
102	NC_017372	TTA	3	9	11423	11431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219883
103	NC_017372	TTG	2	6	11480	11485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219883
104	NC_017372	TGT	2	6	11666	11671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219884
105	NC_017372	TGT	2	6	11834	11839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219884
106	NC_017372	AAG	2	6	11993	11998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219884
107	NC_017372	TAA	2	6	12303	12308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219884
108	NC_017372	TGG	2	6	12404	12409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219884
109	NC_017372	GAA	3	9	12421	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219884
110	NC_017372	ATT	2	6	12474	12479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219884
111	NC_017372	AGA	2	6	12525	12530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219884
112	NC_017372	TTA	2	6	12839	12844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219885
113	NC_017372	GAA	2	6	12856	12861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219885
114	NC_017372	GTT	2	6	12923	12928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385219885
115	NC_017372	ATT	2	6	12946	12951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219885
116	NC_017372	CGC	2	6	13098	13103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385219885
117	NC_017372	AAT	2	6	13228	13233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219885
118	NC_017372	ACC	2	6	13322	13327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385219885
119	NC_017372	CTA	2	6	13385	13390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219885
120	NC_017372	GGT	2	6	13464	13469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219885
121	NC_017372	AGA	3	9	13524	13532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219885
122	NC_017372	TAG	2	6	13588	13593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219885
123	NC_017372	GTG	2	6	13948	13953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219886
124	NC_017372	GAA	2	6	14039	14044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219887
125	NC_017372	ATT	2	6	14226	14231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219887
126	NC_017372	GAA	2	6	14365	14370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219888
127	NC_017372	AAC	2	6	14371	14376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219888
128	NC_017372	ATG	2	6	14390	14395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219888
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130	NC_017372	TGG	2	6	14546	14551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385219888
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