MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori F16

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017368	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385216762
2	NC_017368	ATTAA	2	10	2929	2938	60 %	40 %	0 %	0 %	385216764
3	NC_017368	GTTGA	2	10	5662	5671	20 %	40 %	40 %	0 %	385216766
4	NC_017368	TTTCT	2	10	8216	8225	0 %	80 %	0 %	20 %	385216767
5	NC_017368	TTGAA	2	10	11716	11725	40 %	40 %	20 %	0 %	385216770
6	NC_017368	TTTTG	2	10	11732	11741	0 %	80 %	20 %	0 %	385216770
7	NC_017368	TGGTG	2	10	12569	12578	0 %	40 %	60 %	0 %	385216771
8	NC_017368	CAAAA	2	10	18451	18460	80 %	0 %	0 %	20 %	385216776
9	NC_017368	AAGCT	2	10	19354	19363	40 %	20 %	20 %	20 %	385216777
10	NC_017368	CATCA	2	10	19827	19836	40 %	20 %	0 %	40 %	385216777
11	NC_017368	TGAAA	2	10	20795	20804	60 %	20 %	20 %	0 %	385216778
12	NC_017368	CCATG	2	10	23039	23048	20 %	20 %	20 %	40 %	385216780
13	NC_017368	TTTAC	2	10	25923	25932	20 %	60 %	0 %	20 %	385216782
14	NC_017368	ATTTT	2	10	27379	27388	20 %	80 %	0 %	0 %	385216783
15	NC_017368	GATTT	2	10	28639	28648	20 %	60 %	20 %	0 %	385216783
16	NC_017368	ATTTG	2	10	29487	29496	20 %	60 %	20 %	0 %	385216784
17	NC_017368	TTTTA	2	10	32163	32172	20 %	80 %	0 %	0 %	385216787
18	NC_017368	GGCGT	2	10	32185	32194	0 %	20 %	60 %	20 %	385216787
19	NC_017368	GATTT	2	10	33362	33371	20 %	60 %	20 %	0 %	385216788
20	NC_017368	AGGGC	2	10	33712	33721	20 %	0 %	60 %	20 %	385216789
21	NC_017368	ATTGA	2	10	34376	34385	40 %	40 %	20 %	0 %	385216789
22	NC_017368	TTTTA	2	10	34682	34691	20 %	80 %	0 %	0 %	385216790
23	NC_017368	GCGCT	2	10	35134	35143	0 %	20 %	40 %	40 %	385216790
24	NC_017368	ATCTT	2	10	35626	35635	20 %	60 %	0 %	20 %	385216791
25	NC_017368	TAAAA	2	10	36360	36369	80 %	20 %	0 %	0 %	385216791
26	NC_017368	AAAAT	2	10	36794	36803	80 %	20 %	0 %	0 %	385216791
27	NC_017368	GTCTT	2	10	41963	41972	0 %	60 %	20 %	20 %	385216794
28	NC_017368	ATTTC	2	10	42216	42225	20 %	60 %	0 %	20 %	385216794
29	NC_017368	AAGAT	2	10	42342	42351	60 %	20 %	20 %	0 %	385216794
30	NC_017368	ATTTA	2	10	42585	42594	40 %	60 %	0 %	0 %	385216795
31	NC_017368	TGAAA	2	10	42762	42771	60 %	20 %	20 %	0 %	385216795
32	NC_017368	ATGCG	2	10	42867	42876	20 %	20 %	40 %	20 %	385216795
33	NC_017368	TGGCT	2	10	44269	44278	0 %	40 %	40 %	20 %	385216796
34	NC_017368	TTTAG	2	10	44624	44633	20 %	60 %	20 %	0 %	385216796
35	NC_017368	ATCAA	2	10	46755	46764	60 %	20 %	0 %	20 %	385216798
36	NC_017368	TTTGT	2	10	47421	47430	0 %	80 %	20 %	0 %	385216798
37	NC_017368	AATTG	2	10	51696	51705	40 %	40 %	20 %	0 %	385216804
38	NC_017368	CTTAT	2	10	54595	54604	20 %	60 %	0 %	20 %	385216805
39	NC_017368	GCCAA	2	10	54608	54617	40 %	0 %	20 %	40 %	385216805
40	NC_017368	GCAAG	2	10	55534	55543	40 %	0 %	40 %	20 %	385216806
41	NC_017368	AAACC	2	10	55782	55791	60 %	0 %	0 %	40 %	385216806
42	NC_017368	AAAAC	2	10	56185	56194	80 %	0 %	0 %	20 %	385216807
43	NC_017368	AAATG	2	10	59754	59763	60 %	20 %	20 %	0 %	385216809
44	NC_017368	TTGGC	2	10	60586	60595	0 %	40 %	40 %	20 %	385216811
45	NC_017368	AAAGA	2	10	61413	61422	80 %	0 %	20 %	0 %	385216812
46	NC_017368	ATTCA	2	10	61642	61651	40 %	40 %	0 %	20 %	385216812
47	NC_017368	AAAAT	2	10	64338	64347	80 %	20 %	0 %	0 %	385216814
48	NC_017368	TCTTT	2	10	64965	64974	0 %	80 %	0 %	20 %	385216815
49	NC_017368	AGAAA	2	10	65245	65254	80 %	0 %	20 %	0 %	385216815
50	NC_017368	AGGCT	2	10	65760	65769	20 %	20 %	40 %	20 %	385216816
51	NC_017368	TGCCT	2	10	66135	66144	0 %	40 %	20 %	40 %	385216816
52	NC_017368	TGAAA	2	10	67531	67540	60 %	20 %	20 %	0 %	385216819
53	NC_017368	TCGCC	2	10	70528	70537	0 %	20 %	20 %	60 %	385216820
54	NC_017368	TAAAA	2	10	70824	70833	80 %	20 %	0 %	0 %	385216820
55	NC_017368	TCAAA	2	10	71540	71549	60 %	20 %	0 %	20 %	385216820
56	NC_017368	TATCC	2	10	75058	75067	20 %	40 %	0 %	40 %	385216826
57	NC_017368	TCATA	2	10	75613	75622	40 %	40 %	0 %	20 %	385216827
58	NC_017368	CAATA	2	10	77795	77804	60 %	20 %	0 %	20 %	385216831
59	NC_017368	TGAGT	2	10	78667	78676	20 %	40 %	40 %	0 %	385216831
60	NC_017368	GGTGG	2	10	80689	80698	0 %	20 %	80 %	0 %	385216836
61	NC_017368	GTCAG	2	10	81323	81332	20 %	20 %	40 %	20 %	385216836
62	NC_017368	TCAAT	2	10	83869	83878	40 %	40 %	0 %	20 %	385216840
63	NC_017368	CTTCT	2	10	84717	84726	0 %	60 %	0 %	40 %	385216841
64	NC_017368	TGCCT	2	10	84794	84803	0 %	40 %	20 %	40 %	385216841
65	NC_017368	TCCAA	2	10	85206	85215	40 %	20 %	0 %	40 %	385216842
66	NC_017368	TTTTG	2	10	88524	88533	0 %	80 %	20 %	0 %	385216845
67	NC_017368	ACGCC	2	10	88830	88839	20 %	0 %	20 %	60 %	385216845
68	NC_017368	AAAGC	2	10	89596	89605	60 %	0 %	20 %	20 %	385216846
69	NC_017368	CAAGC	2	10	93642	93651	40 %	0 %	20 %	40 %	385216850
70	NC_017368	ATCTT	2	10	97975	97984	20 %	60 %	0 %	20 %	385216854
71	NC_017368	TGGCT	2	10	98516	98525	0 %	40 %	40 %	20 %	385216854
72	NC_017368	ATGCC	2	10	98925	98934	20 %	20 %	20 %	40 %	385216855
73	NC_017368	TTGAT	2	10	99843	99852	20 %	60 %	20 %	0 %	385216857
74	NC_017368	GGCGT	2	10	101657	101666	0 %	20 %	60 %	20 %	385216859
75	NC_017368	CTTTC	2	10	105194	105203	0 %	60 %	0 %	40 %	385216861
76	NC_017368	GAAAT	2	10	107141	107150	60 %	20 %	20 %	0 %	385216863
77	NC_017368	TTTGA	2	10	107982	107991	20 %	60 %	20 %	0 %	385216864
78	NC_017368	GGCTT	2	10	109306	109315	0 %	40 %	40 %	20 %	385216866
79	NC_017368	CGGCA	2	10	111964	111973	20 %	0 %	40 %	40 %	385216869
80	NC_017368	ACGAT	2	10	114445	114454	40 %	20 %	20 %	20 %	385216871
81	NC_017368	TTTTC	2	10	114640	114649	0 %	80 %	0 %	20 %	385216871
82	NC_017368	AATTG	2	10	116287	116296	40 %	40 %	20 %	0 %	385216872
83	NC_017368	TCGTT	2	10	118098	118107	0 %	60 %	20 %	20 %	385216873
84	NC_017368	TCTTT	2	10	121406	121415	0 %	80 %	0 %	20 %	385216876
85	NC_017368	CCACC	2	10	123348	123357	20 %	0 %	0 %	80 %	385216878
86	NC_017368	AAAGC	2	10	124163	124172	60 %	0 %	20 %	20 %	385216878
87	NC_017368	GAATG	2	10	125385	125394	40 %	20 %	40 %	0 %	385216880
88	NC_017368	TTTTG	2	10	126196	126205	0 %	80 %	20 %	0 %	385216881
89	NC_017368	CAAAT	2	10	126592	126601	60 %	20 %	0 %	20 %	385216881
90	NC_017368	ACCCT	2	10	128021	128030	20 %	20 %	0 %	60 %	385216882
91	NC_017368	TGATT	2	10	130157	130166	20 %	60 %	20 %	0 %	385216884
92	NC_017368	CTAAA	2	10	130642	130651	60 %	20 %	0 %	20 %	385216886
93	NC_017368	GAATT	2	10	130791	130800	40 %	40 %	20 %	0 %	385216886
94	NC_017368	GGATC	2	10	134667	134676	20 %	20 %	40 %	20 %	385216888
95	NC_017368	AGCTC	2	10	134687	134696	20 %	20 %	20 %	40 %	385216888
96	NC_017368	AAGCC	2	10	136575	136584	40 %	0 %	20 %	40 %	385216889
97	NC_017368	GGTTT	2	10	137936	137945	0 %	60 %	40 %	0 %	385216890
98	NC_017368	TTGAT	2	10	138465	138474	20 %	60 %	20 %	0 %	385216890
99	NC_017368	TTTGA	2	10	139711	139720	20 %	60 %	20 %	0 %	385216891
100	NC_017368	GACTT	2	10	140245	140254	20 %	40 %	20 %	20 %	385216891
101	NC_017368	ATCTC	2	10	140996	141005	20 %	40 %	0 %	40 %	385216891
102	NC_017368	CGCTT	2	10	141154	141163	0 %	40 %	20 %	40 %	385216891
103	NC_017368	TGCGT	2	10	143542	143551	0 %	40 %	40 %	20 %	385216894
104	NC_017368	GAAAA	2	10	143703	143712	80 %	0 %	20 %	0 %	385216894
105	NC_017368	GAAAA	2	10	144021	144030	80 %	0 %	20 %	0 %	385216894
106	NC_017368	ATTTT	2	10	146995	147004	20 %	80 %	0 %	0 %	385216899
107	NC_017368	ATGTT	2	10	147077	147086	20 %	60 %	20 %	0 %	385216899
108	NC_017368	AAAAG	2	10	147489	147498	80 %	0 %	20 %	0 %	385216899
109	NC_017368	CGCTG	2	10	149104	149113	0 %	20 %	40 %	40 %	385216900
110	NC_017368	AAATC	2	10	149733	149742	60 %	20 %	0 %	20 %	385216900
111	NC_017368	AAAAT	2	10	151205	151214	80 %	20 %	0 %	0 %	385216901
112	NC_017368	GTAAA	2	10	154108	154117	60 %	20 %	20 %	0 %	385216905
113	NC_017368	TTCTT	2	10	155512	155521	0 %	80 %	0 %	20 %	385216906
114	NC_017368	TCTTT	2	10	156006	156015	0 %	80 %	0 %	20 %	385216907
115	NC_017368	TTTTG	2	10	157169	157178	0 %	80 %	20 %	0 %	385216908
116	NC_017368	GCGAT	2	10	157962	157971	20 %	20 %	40 %	20 %	385216908
117	NC_017368	GCTTG	2	10	158218	158227	0 %	40 %	40 %	20 %	385216908
118	NC_017368	TTTTG	2	10	158870	158879	0 %	80 %	20 %	0 %	385216909
119	NC_017368	CCAAA	2	10	160710	160719	60 %	0 %	0 %	40 %	385216910
120	NC_017368	ACGCC	2	10	164232	164241	20 %	0 %	20 %	60 %	385216912
121	NC_017368	TTATT	2	10	166128	166137	20 %	80 %	0 %	0 %	385216916
122	NC_017368	GCGTT	2	10	166486	166495	0 %	40 %	40 %	20 %	385216917
123	NC_017368	ATTTG	2	10	167461	167470	20 %	60 %	20 %	0 %	385216918
124	NC_017368	AAAAC	2	10	170085	170094	80 %	0 %	0 %	20 %	385216921
125	NC_017368	GGGGA	2	10	170185	170194	20 %	0 %	80 %	0 %	385216921
126	NC_017368	ATTTT	2	10	175379	175388	20 %	80 %	0 %	0 %	385216928
127	NC_017368	GGGTG	2	10	175735	175744	0 %	20 %	80 %	0 %	385216928
128	NC_017368	ATTCA	2	10	177123	177132	40 %	40 %	0 %	20 %	385216929
129	NC_017368	AAAAC	2	10	179458	179467	80 %	0 %	0 %	20 %	385216931
130	NC_017368	GAGAA	2	10	180297	180306	60 %	0 %	40 %	0 %	385216932
131	NC_017368	ATCTT	2	10	180523	180532	20 %	60 %	0 %	20 %	385216932
132	NC_017368	AGGCT	2	10	185479	185488	20 %	20 %	40 %	20 %	385216940
133	NC_017368	AAAAC	2	10	186930	186939	80 %	0 %	0 %	20 %	385216941
134	NC_017368	CGCAC	2	10	187680	187689	20 %	0 %	20 %	60 %	385216942
135	NC_017368	ATTTG	2	10	189165	189174	20 %	60 %	20 %	0 %	385216943
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