MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori F57

Total Repeats: 708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017367	ATTATA	2	12	1797	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	385248500
2	NC_017367	TTGCGC	2	12	6283	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385248503
3	NC_017367	GTTGTG	2	12	6680	6691	0 %	50 %	50 %	0 %	385248503
4	NC_017367	GAAACC	2	12	7829	7840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385248504
5	NC_017367	AGAAAA	2	12	18760	18771	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385248513
6	NC_017367	GATAAA	2	12	22322	22333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385248516
7	NC_017367	TTATTG	2	12	24639	24650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385248517
8	NC_017367	ATGCAA	2	12	27363	27374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385248520
9	NC_017367	CCAAAA	2	12	31489	31500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385248524
10	NC_017367	ACCTTA	2	12	37411	37422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385248529
11	NC_017367	CATGGA	2	12	41968	41979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385248532
12	NC_017367	TTTTAT	2	12	45579	45590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385248534
13	NC_017367	TTTTTA	2	12	46768	46779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385248535
14	NC_017367	TGTTGG	2	12	48661	48672	0 %	50 %	50 %	0 %	385248538
15	NC_017367	ACAAAA	2	12	49587	49598	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385248539
16	NC_017367	ATTGAA	2	12	51470	51481	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385248541
17	NC_017367	CGCTAA	2	12	52236	52247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385248542
18	NC_017367	GGCACA	2	12	56138	56149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385248544
19	NC_017367	TTAGAA	2	12	56273	56284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385248544
20	NC_017367	TGAGCA	2	12	58307	58318	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385248547
21	NC_017367	GAAAAT	2	12	58975	58986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385248547
22	NC_017367	TAGAAA	2	12	61184	61195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385248550
23	NC_017367	GTGCCT	2	12	61450	61461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385248550
24	NC_017367	GATTTT	2	12	61786	61797	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385248550
25	NC_017367	GTTTTT	2	12	65701	65712	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385248554
26	NC_017367	TAAAAA	2	12	67602	67613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385248556
27	NC_017367	TAAAAA	2	12	69176	69187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385248557
28	NC_017367	AGAAAA	2	12	73866	73877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385248560
29	NC_017367	AAAAGA	2	12	74677	74688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385248561
30	NC_017367	CCAACA	2	12	75508	75519	50 %	0 %	0 %	50 %	385248564
31	NC_017367	TTTTGT	2	12	75841	75852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385248565
32	NC_017367	AAAGAG	2	12	76120	76131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385248565
33	NC_017367	AGAAAA	2	12	77518	77529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385248568
34	NC_017367	TAAGGG	2	12	90162	90173	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385248583
35	NC_017367	CGCTAA	2	12	90525	90536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385248583
36	NC_017367	CGCCCA	2	12	90699	90710	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385248583
37	NC_017367	GCAACG	2	12	94955	94966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385248588
38	NC_017367	ATATTG	2	12	95625	95636	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385248589
39	NC_017367	AACAGG	2	12	103438	103449	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385248596
40	NC_017367	AAAAGA	2	12	107997	108008	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385248602
41	NC_017367	GAAAAA	2	12	108708	108719	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385248602
42	NC_017367	TTTAAA	2	12	110167	110178	50 %	50 %	0 %	0 %	385248604
43	NC_017367	AAACCA	2	12	112146	112157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385248606
44	NC_017367	TTTGCT	2	12	113670	113681	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385248609
45	NC_017367	AAAGCA	2	12	114163	114174	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385248610
46	NC_017367	ATTGAA	2	12	117016	117027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385248612
47	NC_017367	ATTCAA	2	12	117177	117188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385248612
48	NC_017367	CCTTAG	2	12	117710	117721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385248612
49	NC_017367	TAGAAC	2	12	119028	119039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385248613
50	NC_017367	GGTTAT	2	12	119861	119872	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385248613
51	NC_017367	CGAGCG	2	12	124242	124253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385248616
52	NC_017367	GCTTGC	2	12	128867	128878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385248621
53	NC_017367	TTTGCT	2	12	132663	132674	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385248624
54	NC_017367	AATATT	2	12	140895	140906	50 %	50 %	0 %	0 %	385248631
55	NC_017367	TTGATT	2	12	142474	142485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385248631
56	NC_017367	AATTAA	2	12	143577	143588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385248632
57	NC_017367	CACCGC	2	12	144112	144123	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385248632
58	NC_017367	TTTTGA	2	12	144810	144821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385248633
59	NC_017367	TGAGTT	2	12	146298	146309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385248634
60	NC_017367	TCTAAT	2	12	148174	148185	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385248637
61	NC_017367	TTTGAA	2	12	152897	152908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385248642
62	NC_017367	GCTCCA	2	12	154580	154591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385248644
63	NC_017367	AAAAAT	2	12	161511	161522	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385248650
64	NC_017367	ATCCTT	2	12	162204	162215	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385248651
65	NC_017367	ATTCAA	2	12	162596	162607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385248652
66	NC_017367	TTGGCT	2	12	162804	162815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385248652
67	NC_017367	TAGCGA	2	12	163652	163663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385248653
68	NC_017367	TATCGC	2	12	166756	166767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385248655
69	NC_017367	ATCGCT	2	12	168464	168475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385248656
70	NC_017367	CCTAAA	2	12	170687	170698	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385248658
71	NC_017367	TTCTAT	2	12	171842	171853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385248659
72	NC_017367	CTTGGG	2	12	175491	175502	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385248665
73	NC_017367	ATTGGA	2	12	176864	176875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385248666
74	NC_017367	GATTTT	2	12	180781	180792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385248671
75	NC_017367	GATGGC	2	12	184012	184023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385248675
76	NC_017367	CTTTCT	2	12	184264	184275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385248675
77	NC_017367	CCGCTC	2	12	186263	186274	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385248677
78	NC_017367	GCTCTC	2	12	188693	188704	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385248679
79	NC_017367	TTCTAA	2	12	191016	191027	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385248682
80	NC_017367	TCAATA	2	12	192698	192709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385248684
81	NC_017367	ATCGTT	2	12	193120	193131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385248684
82	NC_017367	AATTTC	2	12	193466	193477	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385248685
83	NC_017367	TAAAAT	2	12	194251	194262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385248687
84	NC_017367	TTCTTT	2	12	194661	194672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385248687
85	NC_017367	ATTTTG	2	12	196087	196098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385248689
86	NC_017367	CGCTTT	2	12	196565	196576	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385248689
87	NC_017367	GTTTAA	2	12	197349	197360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385248690
88	NC_017367	CCGCTC	2	12	200403	200414	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385248693
89	NC_017367	GGTTTG	2	12	202010	202021	0 %	50 %	50 %	0 %	385248695
90	NC_017367	AGGCAT	2	12	204151	204162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385248696
91	NC_017367	GCATTT	2	12	205864	205875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385248698
92	NC_017367	TCAAAC	2	12	206431	206442	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385248699
93	NC_017367	ATAAAG	2	12	206598	206609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385248699
94	NC_017367	GGTATT	2	12	210318	210329	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385248703
95	NC_017367	TCTAAA	2	12	210548	210559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385248703
96	NC_017367	TGGGCA	2	12	211617	211628	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385248704
97	NC_017367	TTCTAA	2	12	212096	212107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385248705
98	NC_017367	ATTTTC	2	12	214041	214052	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385248705
99	NC_017367	TGGGGC	2	12	221458	221469	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385248715
100	NC_017367	AATTCA	2	12	224540	224551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385248718
101	NC_017367	CTGTAT	2	12	224900	224911	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385248718
102	NC_017367	AATTTT	2	12	225583	225594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385248719
103	NC_017367	ATTCTA	2	12	233568	233579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385248726
104	NC_017367	CATAGC	2	12	235339	235350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385248727
105	NC_017367	GTTTTG	2	12	235844	235855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385248727
106	NC_017367	TTATTT	2	12	237476	237487	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385248728
107	NC_017367	TAATTA	2	12	240355	240366	50 %	50 %	0 %	0 %	385248731
108	NC_017367	GCTAAA	2	12	243865	243876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385248736
109	NC_017367	AATGCC	2	12	248545	248556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385248740
110	NC_017367	GGATTG	2	12	250793	250804	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385248741
111	NC_017367	GTTGTA	2	12	251070	251081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385248741
112	NC_017367	AGGGCC	2	12	251142	251153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385248741
113	NC_017367	GGTGAT	2	12	252769	252780	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385248742
114	NC_017367	CACGCC	2	12	253672	253683	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385248743
115	NC_017367	GCTTTG	2	12	254906	254917	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385248744
116	NC_017367	GCTAGG	2	12	256288	256299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385248745
117	NC_017367	TCTTTA	2	12	262672	262683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385248752
118	NC_017367	GTTTTT	2	12	268305	268316	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385248759
119	NC_017367	ATTGTC	2	12	271465	271476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385248762
120	NC_017367	TCCCGC	2	12	273639	273650	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385248764
121	NC_017367	ATACCA	2	12	277406	277417	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385248767
122	NC_017367	TTTAGC	2	12	277674	277685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385248767
123	NC_017367	TGAGCG	2	12	282303	282314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385248772
124	NC_017367	AGCCTG	2	12	286647	286658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385248775
125	NC_017367	CTATTG	2	12	287281	287292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385248776
126	NC_017367	CAATCT	2	12	290496	290507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385248779
127	NC_017367	AAAGCT	2	12	291484	291495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385248779
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149	NC_017367	GTTAGC	2	12	341131	341142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385248827
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345	NC_017367	TATTGA	2	12	733870	733881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385249190
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462	NC_017367	TCTTTA	2	12	993684	993695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385249427
463	NC_017367	TTGATA	2	12	995021	995032	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385249428
464	NC_017367	AGTGAG	2	12	995387	995398	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385249429
465	NC_017367	GCAAAA	2	12	998272	998283	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385249432
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484	NC_017367	TCCAAA	2	12	1045161	1045172	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385249480
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