MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori F32

Total Repeats: 693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017366	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385215270
2	NC_017366	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385215273
3	NC_017366	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215275
4	NC_017366	GCTTGC	2	12	6032	6043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215276
5	NC_017366	GAAACC	2	12	7576	7587	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385215277
6	NC_017366	AGAAAA	2	12	18507	18518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385215286
7	NC_017366	CCAAAA	2	12	31352	31363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385215296
8	NC_017366	CGCTTT	2	12	36707	36718	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385215301
9	NC_017366	AGCGGG	2	12	37658	37669	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385215302
10	NC_017366	CCCTAA	2	12	38252	38263	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385215303
11	NC_017366	CATGGA	2	12	40681	40692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215306
12	NC_017366	TTCTTT	2	12	44964	44975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215309
13	NC_017366	TTGGTG	2	12	47379	47390	0 %	50 %	50 %	0 %	385215312
14	NC_017366	ACAAAA	2	12	48303	48314	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385215313
15	NC_017366	ATTGAA	2	12	50186	50197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385215315
16	NC_017366	AGATGA	2	12	52614	52625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385215316
17	NC_017366	GGCACA	2	12	54871	54882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385215317
18	NC_017366	TGAGCA	2	12	56991	57002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215319
19	NC_017366	GAAAAT	2	12	57659	57670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215319
20	NC_017366	TAGAAA	2	12	59856	59867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215322
21	NC_017366	GTGCCT	2	12	60122	60133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215322
22	NC_017366	GATTTT	2	12	60458	60469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215322
23	NC_017366	GTTTTT	2	12	64373	64384	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385215326
24	NC_017366	TAAAAA	2	12	67842	67853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385215329
25	NC_017366	AAAAGA	2	12	73290	73301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385215333
26	NC_017366	CCAACA	2	12	74141	74152	50 %	0 %	0 %	50 %	385215333
27	NC_017366	TTTTGT	2	12	74479	74490	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385215334
28	NC_017366	AAAGAG	2	12	74758	74769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385215334
29	NC_017366	AGAAAA	2	12	76157	76168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385215337
30	NC_017366	AGCGGG	2	12	78251	78262	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385215343
31	NC_017366	ACGCCC	2	12	86014	86025	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385215352
32	NC_017366	AAGGGC	2	12	88732	88743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385215355
33	NC_017366	CGCCCA	2	12	89268	89279	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385215355
34	NC_017366	AGGATA	2	12	90111	90122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385215357
35	NC_017366	GGCATG	2	12	92137	92148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215360
36	NC_017366	ATATTG	2	12	93944	93955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215361
37	NC_017366	AACAGG	2	12	101748	101759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385215367
38	NC_017366	AAAAAT	2	12	104224	104235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385215370
39	NC_017366	ATTAGA	2	12	105729	105740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385215372
40	NC_017366	GATTTT	2	12	107487	107498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215376
41	NC_017366	AAACTC	2	12	107604	107615	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215376
42	NC_017366	TCAAAA	2	12	109093	109104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385215377
43	NC_017366	GCGGTG	2	12	109792	109803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385215378
44	NC_017366	TTAATT	2	12	110327	110338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215378
45	NC_017366	CAATAT	2	12	112999	113010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215379
46	NC_017366	CATATT	2	12	118753	118764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215384
47	NC_017366	TTTTCT	2	12	124631	124642	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215389
48	NC_017366	GCAAGC	2	12	125038	125049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385215389
49	NC_017366	CGCTCG	2	12	129661	129672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385215394
50	NC_017366	TAGGCA	2	12	132198	132209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215395
51	NC_017366	TTCTAT	2	12	134477	134488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215397
52	NC_017366	GTTCTA	2	12	134872	134883	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215397
53	NC_017366	TGAATT	2	12	136730	136741	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215398
54	NC_017366	TTTCAA	2	12	136889	136900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215398
55	NC_017366	AGCAAA	2	12	140235	140246	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385215401
56	NC_017366	TGGTTT	2	12	141760	141771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215404
57	NC_017366	TCATGA	2	12	143009	143020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385215405
58	NC_017366	AAAAAT	2	12	149539	149550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385215411
59	NC_017366	ATCCTT	2	12	150233	150244	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385215412
60	NC_017366	ATTCAA	2	12	150625	150636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215413
61	NC_017366	TAGCGA	2	12	151681	151692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215414
62	NC_017366	ATCGCT	2	12	154785	154796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385215416
63	NC_017366	TTCAAA	2	12	155094	155105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215417
64	NC_017366	GGCTTA	2	12	155433	155444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385215417
65	NC_017366	ATCGCT	2	12	156492	156503	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385215417
66	NC_017366	TTTGGG	2	12	157073	157084	0 %	50 %	50 %	0 %	385215418
67	NC_017366	CCTAAA	2	12	158713	158724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215420
68	NC_017366	TTCTAT	2	12	159868	159879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215421
69	NC_017366	CTTGGG	2	12	163517	163528	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385215427
70	NC_017366	ATTGGA	2	12	164890	164901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215428
71	NC_017366	GATTTT	2	12	168807	168818	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215433
72	NC_017366	GATGGC	2	12	172025	172036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215437
73	NC_017366	GATGGC	2	12	172133	172144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215437
74	NC_017366	CTTTCT	2	12	172277	172288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215437
75	NC_017366	GCTCTC	2	12	176629	176640	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385215441
76	NC_017366	TTCTAA	2	12	178945	178956	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215444
77	NC_017366	TCAATA	2	12	180627	180638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215446
78	NC_017366	CATTTT	2	12	180736	180747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215446
79	NC_017366	ATCGTT	2	12	181049	181060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215446
80	NC_017366	AATTTC	2	12	181395	181406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215447
81	NC_017366	TTCTTT	2	12	182592	182603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215449
82	NC_017366	ATTTTG	2	12	184007	184018	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215451
83	NC_017366	CGCTTT	2	12	184485	184496	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385215451
84	NC_017366	GTTTAA	2	12	185269	185280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215452
85	NC_017366	AATGAA	2	12	188612	188623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215455
86	NC_017366	CCGCTC	2	12	191020	191031	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385215457
87	NC_017366	GGTTTG	2	12	192627	192638	0 %	50 %	50 %	0 %	385215459
88	NC_017366	AGGCAT	2	12	194732	194743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215460
89	NC_017366	GCATTT	2	12	196445	196456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215462
90	NC_017366	TCAAAC	2	12	197012	197023	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215463
91	NC_017366	TAAAGA	2	12	197174	197185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215463
92	NC_017366	GGTATT	2	12	200972	200983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385215466
93	NC_017366	TCTAAA	2	12	201202	201213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215466
94	NC_017366	TGGGCA	2	12	202271	202282	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215467
95	NC_017366	TTCTAA	2	12	202750	202761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215468
96	NC_017366	ATTTTC	2	12	204695	204706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215468
97	NC_017366	TGGGGC	2	12	212107	212118	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385215478
98	NC_017366	CTGTAT	2	12	215550	215561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215482
99	NC_017366	AATTTT	2	12	216234	216245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215482
100	NC_017366	ATTCTA	2	12	224229	224240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215489
101	NC_017366	CATAGC	2	12	225986	225997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385215490
102	NC_017366	GTTTTG	2	12	226491	226502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215490
103	NC_017366	TTATTT	2	12	228123	228134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385215491
104	NC_017366	TAATTA	2	12	231000	231011	50 %	50 %	0 %	0 %	385215494
105	NC_017366	GCTAAA	2	12	234513	234524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385215499
106	NC_017366	AATGCC	2	12	239257	239268	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385215503
107	NC_017366	AGGGCC	2	12	241897	241908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385215504
108	NC_017366	GGTGAT	2	12	243514	243525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385215505
109	NC_017366	CACGCC	2	12	244417	244428	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385215506
110	NC_017366	ATAACT	2	12	244543	244554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215506
111	NC_017366	TGGTTT	2	12	244727	244738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215506
112	NC_017366	TATTTT	2	12	244986	244997	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385215506
113	NC_017366	GCTAGG	2	12	247058	247069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215508
114	NC_017366	TCTTTA	2	12	253625	253636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215516
115	NC_017366	GTTTTT	2	12	259214	259225	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385215523
116	NC_017366	ATTGTC	2	12	262374	262385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215526
117	NC_017366	TCCCGC	2	12	264564	264575	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385215528
118	NC_017366	TCCCGC	2	12	265377	265388	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385215528
119	NC_017366	ATACCA	2	12	268352	268363	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215531
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462	NC_017366	GCTTTT	2	12	1017111	1017122	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385216215
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