MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori F32

Total Repeats: 29771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017366	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	385215270
2	NC_017366	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215270
3	NC_017366	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	385215270
4	NC_017366	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	385215270
5	NC_017366	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385215270
6	NC_017366	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215270
7	NC_017366	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	385215270
8	NC_017366	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	385215270
9	NC_017366	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215270
10	NC_017366	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385215270
11	NC_017366	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	385215270
12	NC_017366	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385215271
13	NC_017366	TTA	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215271
14	NC_017366	CTGC	2	8	508	515	0 %	25 %	25 %	50 %	385215271
15	NC_017366	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	385215271
16	NC_017366	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385215271
17	NC_017366	CA	3	6	670	675	50 %	0 %	0 %	50 %	385215271
18	NC_017366	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385215271
19	NC_017366	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	385215271
20	NC_017366	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215271
21	NC_017366	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215271
22	NC_017366	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385215272
23	NC_017366	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385215272
24	NC_017366	CCG	2	6	1043	1048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385215272
25	NC_017366	TGC	2	6	1050	1055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215272
26	NC_017366	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385215272
27	NC_017366	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215272
28	NC_017366	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	385215272
29	NC_017366	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	385215272
30	NC_017366	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215272
31	NC_017366	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	385215272
32	NC_017366	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	385215272
33	NC_017366	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385215272
34	NC_017366	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	385215272
35	NC_017366	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	385215272
36	NC_017366	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385215272
37	NC_017366	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215272
38	NC_017366	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215272
39	NC_017366	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215272
40	NC_017366	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215273
41	NC_017366	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	385215273
42	NC_017366	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385215273
43	NC_017366	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	385215273
44	NC_017366	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215273
45	NC_017366	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385215273
46	NC_017366	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	385215273
47	NC_017366	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215273
48	NC_017366	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	385215273
49	NC_017366	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215273
50	NC_017366	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385215273
51	NC_017366	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215273
52	NC_017366	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	385215273
53	NC_017366	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385215273
54	NC_017366	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215273
55	NC_017366	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	385215273
56	NC_017366	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	385215274
57	NC_017366	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385215274
58	NC_017366	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	385215274
59	NC_017366	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	385215274
60	NC_017366	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385215274
61	NC_017366	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	385215274
62	NC_017366	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	385215274
63	NC_017366	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	385215274
64	NC_017366	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385215274
65	NC_017366	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385215274
66	NC_017366	AG	3	6	3074	3079	50 %	0 %	50 %	0 %	385215274
67	NC_017366	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	385215274
68	NC_017366	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385215274
69	NC_017366	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385215274
70	NC_017366	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	385215275
71	NC_017366	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	385215275
72	NC_017366	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	385215275
73	NC_017366	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	385215275
74	NC_017366	AGC	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385215275
75	NC_017366	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215275
76	NC_017366	CTA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215275
77	NC_017366	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215275
78	NC_017366	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215275
79	NC_017366	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	385215275
80	NC_017366	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	385215275
81	NC_017366	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215275
82	NC_017366	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385215275
83	NC_017366	CCATG	2	10	5112	5121	20 %	20 %	20 %	40 %	385215276
84	NC_017366	GCTT	2	8	5137	5144	0 %	50 %	25 %	25 %	385215276
85	NC_017366	T	6	6	5143	5148	0 %	100 %	0 %	0 %	385215276
86	NC_017366	CATT	2	8	5208	5215	25 %	50 %	0 %	25 %	385215276
87	NC_017366	ATT	2	6	5230	5235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215276
88	NC_017366	C	6	6	5293	5298	0 %	0 %	0 %	100 %	385215276
89	NC_017366	TGG	2	6	5328	5333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385215276
90	NC_017366	A	6	6	5440	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	385215276
91	NC_017366	GTT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215276
92	NC_017366	TAA	2	6	5599	5604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385215276
93	NC_017366	TTA	2	6	5657	5662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215276
94	NC_017366	GTG	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385215276
95	NC_017366	GTT	2	6	5746	5751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215276
96	NC_017366	CGTG	2	8	5785	5792	0 %	25 %	50 %	25 %	385215276
97	NC_017366	GTC	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215276
98	NC_017366	TCT	2	6	5870	5875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215276
99	NC_017366	C	6	6	5892	5897	0 %	0 %	0 %	100 %	385215276
100	NC_017366	AGT	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215276
101	NC_017366	T	6	6	5998	6003	0 %	100 %	0 %	0 %	385215276
102	NC_017366	GCTTGC	2	12	6032	6043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215276
103	NC_017366	GC	3	6	6042	6047	0 %	0 %	50 %	50 %	385215276
104	NC_017366	AGA	2	6	6079	6084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385215276
105	NC_017366	TCA	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215276
106	NC_017366	TGC	2	6	6331	6336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215276
107	NC_017366	TGG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385215276
108	NC_017366	TAT	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215276
109	NC_017366	GTG	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385215276
110	NC_017366	CTA	3	9	6440	6448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215276
111	NC_017366	ACT	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215276
112	NC_017366	CTA	2	6	6458	6463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215276
113	NC_017366	CCG	2	6	6503	6508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385215276
114	NC_017366	T	7	7	6521	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	385215276
115	NC_017366	TG	3	6	6560	6565	0 %	50 %	50 %	0 %	385215276
116	NC_017366	TTG	2	6	6610	6615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215276
117	NC_017366	GAT	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215276
118	NC_017366	TCA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215276
119	NC_017366	TGGT	2	8	6724	6731	0 %	50 %	50 %	0 %	385215276
120	NC_017366	CA	3	6	6780	6785	50 %	0 %	0 %	50 %	385215276
121	NC_017366	T	6	6	6867	6872	0 %	100 %	0 %	0 %	385215276
122	NC_017366	ATCG	2	8	6907	6914	25 %	25 %	25 %	25 %	385215276
123	NC_017366	ATTG	2	8	6919	6926	25 %	50 %	25 %	0 %	385215276
124	NC_017366	CGTT	2	8	6942	6949	0 %	50 %	25 %	25 %	385215276
125	NC_017366	A	6	6	7081	7086	100 %	0 %	0 %	0 %	385215276
126	NC_017366	GA	7	14	7120	7133	50 %	0 %	50 %	0 %	385215276
127	NC_017366	T	7	7	7143	7149	0 %	100 %	0 %	0 %	385215276
128	NC_017366	CAT	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215277
129	NC_017366	TCT	2	6	7528	7533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215277
130	NC_017366	GAAACC	2	12	7576	7587	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385215277
131	NC_017366	AAT	2	6	7626	7631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385215277
132	NC_017366	CTT	2	6	7634	7639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215277
133	NC_017366	TTCA	2	8	7704	7711	25 %	50 %	0 %	25 %	385215277
134	NC_017366	CAT	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215277
135	NC_017366	ATG	2	6	7777	7782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215277
136	NC_017366	TCA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215277
137	NC_017366	CCG	2	6	7855	7860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385215277
138	NC_017366	CTT	2	6	7874	7879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215277
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