MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384896753
2	NC_017362	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384896754
3	NC_017362	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384896756
4	NC_017362	GCTTGC	2	12	6086	6097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896759
5	NC_017362	CCATTC	2	12	6824	6835	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384896759
6	NC_017362	GAAACC	2	12	7860	7871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384896761
7	NC_017362	GCCACG	2	12	10854	10865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384896763
8	NC_017362	AGAAAA	2	12	18789	18800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384896770
9	NC_017362	AGCTTT	2	12	20490	20501	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896771
10	NC_017362	TTTCTT	2	12	23083	23094	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896774
11	NC_017362	TATCAA	2	12	30281	30292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896780
12	NC_017362	AAGACC	2	12	30822	30833	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384896780
13	NC_017362	TCTTAT	2	12	30989	31000	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896780
14	NC_017362	GCGTGG	2	12	33039	33050	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384896783
15	NC_017362	TTGGAT	2	12	33149	33160	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384896783
16	NC_017362	TAATGA	2	12	33184	33195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384896783
17	NC_017362	TAAGGA	2	12	34534	34545	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384896783
18	NC_017362	TAGGGG	2	12	36050	36061	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384896786
19	NC_017362	AAAGAA	2	12	39133	39144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384896789
20	NC_017362	CAAAAT	2	12	41479	41490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384896791
21	NC_017362	TAAACT	2	12	43047	43058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896792
22	NC_017362	CGCAAA	2	12	45315	45326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384896795
23	NC_017362	ATTTGC	2	12	50397	50408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896798
24	NC_017362	TAAAAA	2	12	52001	52012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384896799
25	NC_017362	ACGCCC	2	12	72354	72365	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384896813
26	NC_017362	AAGGGC	2	12	75081	75092	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384896816
27	NC_017362	GGCATG	2	12	77659	77670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896819
28	NC_017362	GCAACG	2	12	78707	78718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896819
29	NC_017362	GATATT	2	12	79488	79499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384896822
30	NC_017362	GATTTT	2	12	93356	93367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384896835
31	NC_017362	AAACTC	2	12	93473	93484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896835
32	NC_017362	TCAAAA	2	12	94986	94997	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384896837
33	NC_017362	GCGGTG	2	12	95680	95691	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384896838
34	NC_017362	TTAAGG	2	12	97226	97237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896839
35	NC_017362	AAATCA	2	12	97316	97327	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384896839
36	NC_017362	CAATAT	2	12	98886	98897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896839
37	NC_017362	CATATT	2	12	104643	104654	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896844
38	NC_017362	AGCGTT	2	12	105506	105517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384896844
39	NC_017362	AAGCAA	2	12	107108	107119	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384896846
40	NC_017362	GGAGCG	2	12	109696	109707	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384896849
41	NC_017362	TTTTCT	2	12	111196	111207	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896850
42	NC_017362	TGCAAG	2	12	111602	111613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896850
43	NC_017362	CGCTCG	2	12	116199	116210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384896855
44	NC_017362	TAGGCA	2	12	118736	118747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896856
45	NC_017362	CTTCTA	2	12	121043	121054	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384896858
46	NC_017362	GTTCTA	2	12	121175	121186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896858
47	NC_017362	GTTCTA	2	12	122831	122842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896859
48	NC_017362	TGAATT	2	12	124686	124697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384896860
49	NC_017362	TTTCAA	2	12	124845	124856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896860
50	NC_017362	AGCAAA	2	12	128217	128228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384896863
51	NC_017362	TAGCGA	2	12	139936	139947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896877
52	NC_017362	TTAGCG	2	12	142826	142837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384896879
53	NC_017362	ATCGCT	2	12	143039	143050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384896879
54	NC_017362	ATCGCT	2	12	144754	144765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384896880
55	NC_017362	CCTAAA	2	12	146977	146988	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896882
56	NC_017362	TTCTAT	2	12	148137	148148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896883
57	NC_017362	TTGTTT	2	12	151125	151136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384896888
58	NC_017362	CTTGGG	2	12	151786	151797	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384896890
59	NC_017362	TTGGGT	2	12	156560	156571	0 %	50 %	50 %	0 %	384896895
60	NC_017362	GATTTT	2	12	157074	157085	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384896896
61	NC_017362	AATTGA	2	12	157333	157344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384896896
62	NC_017362	GATGGC	2	12	160299	160310	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896900
63	NC_017362	GATGGC	2	12	160407	160418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896900
64	NC_017362	CTTTCT	2	12	160551	160562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896900
65	NC_017362	CCGCTC	2	12	162319	162330	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896904
66	NC_017362	AACCCA	2	12	163472	163483	50 %	0 %	0 %	50 %	384896905
67	NC_017362	GCTCTC	2	12	164747	164758	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384896906
68	NC_017362	TTCTAA	2	12	167081	167092	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896909
69	NC_017362	ATCGTT	2	12	169192	169203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896911
70	NC_017362	AATTTC	2	12	169543	169554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896912
71	NC_017362	TAAAAT	2	12	171067	171078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896913
72	NC_017362	TTCTTT	2	12	171477	171488	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896913
73	NC_017362	TTCTTT	2	12	172457	172468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896915
74	NC_017362	ATTTTG	2	12	172879	172890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384896916
75	NC_017362	CGCTTT	2	12	173357	173368	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384896916
76	NC_017362	ACTTAT	2	12	173454	173465	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896916
77	NC_017362	GTTTAA	2	12	174142	174153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384896917
78	NC_017362	CCGCTC	2	12	177189	177200	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896920
79	NC_017362	GAAAAA	2	12	180818	180829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384896923
80	NC_017362	AGGCAT	2	12	180907	180918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896923
81	NC_017362	AGAAAT	2	12	182455	182466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384896925
82	NC_017362	CATTTG	2	12	182621	182632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896925
83	NC_017362	GGGCGA	2	12	182659	182670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384896925
84	NC_017362	TCAAAC	2	12	183187	183198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896926
85	NC_017362	TAAAGA	2	12	183331	183342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384896926
86	NC_017362	GGTATT	2	12	187105	187116	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384896928
87	NC_017362	TCTAAA	2	12	187335	187346	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896928
88	NC_017362	TGGGCA	2	12	188404	188415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896929
89	NC_017362	ATTTTC	2	12	190828	190839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896930
90	NC_017362	TGGGGC	2	12	198237	198248	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384896940
91	NC_017362	CTATGG	2	12	198626	198637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384896940
92	NC_017362	AAATCC	2	12	200004	200015	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896942
93	NC_017362	AATTTT	2	12	202766	202777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896943
94	NC_017362	CAAAAA	2	12	210397	210408	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384896950
95	NC_017362	CATAGC	2	12	212624	212635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384896952
96	NC_017362	GTTTTG	2	12	213129	213140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896952
97	NC_017362	TAATTA	2	12	217631	217642	50 %	50 %	0 %	0 %	384896956
98	NC_017362	ACTTTA	2	12	217681	217692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896957
99	NC_017362	AATGCC	2	12	225529	225540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384896965
100	NC_017362	AGGGCC	2	12	228164	228175	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384896966
101	NC_017362	GGTGAT	2	12	229759	229770	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384896967
102	NC_017362	CACGCC	2	12	230667	230678	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384896968
103	NC_017362	GCTTTG	2	12	231922	231933	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384896969
104	NC_017362	GCTAGG	2	12	233303	233314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896970
105	NC_017362	TCTTTA	2	12	239980	239991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896977
106	NC_017362	GTTTTT	2	12	245618	245629	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384896984
107	NC_017362	TCCCGC	2	12	250977	250988	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896989
108	NC_017362	TCCCGC	2	12	251790	251801	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896989
109	NC_017362	GAAAAG	2	12	257795	257806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896995
110	NC_017362	AAAAAG	2	12	258106	258117	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384896996
111	NC_017362	TGAGCG	2	12	259641	259652	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896998
112	NC_017362	GGGGCT	2	12	263535	263546	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384897001
113	NC_017362	ATGGAA	2	12	264111	264122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384897001
114	NC_017362	GATTTT	2	12	264827	264838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384897001
115	NC_017362	TGAGCG	2	12	268086	268097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384897004
116	NC_017362	AGCTTT	2	12	268234	268245	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384897004
117	NC_017362	AATTAG	2	12	272889	272900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384897011
118	NC_017362	AAATAC	2	12	275312	275323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897014
119	NC_017362	AAATCA	2	12	275673	275684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897015
120	NC_017362	AACTCA	2	12	285143	285154	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384897022
121	NC_017362	AGCGAG	2	12	286661	286672	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384897023
122	NC_017362	ATCAAA	2	12	288059	288070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897026
123	NC_017362	AGTAAT	2	12	290002	290013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384897026
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132	NC_017362	GTTGGA	2	12	311583	311594	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384897039
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143	NC_017362	TCATTT	2	12	327415	327426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384897057
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230	NC_017362	GAAAAA	2	12	508208	508219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384897233
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232	NC_017362	AAATCA	2	12	510044	510055	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897235
233	NC_017362	ATAGTA	2	12	511281	511292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384897235
234	NC_017362	TTTAAT	2	12	512540	512551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384897237
235	NC_017362	TTTTTC	2	12	514955	514966	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384897238
236	NC_017362	TCAGTT	2	12	516270	516281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384897238
237	NC_017362	TCAGTT	2	12	516822	516833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384897238
238	NC_017362	ATAGAA	2	12	523608	523619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384897242
239	NC_017362	AAAACT	2	12	523835	523846	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897242
240	NC_017362	CAAAAA	2	12	528656	528667	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384897245
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251	NC_017362	CAATGT	2	12	560664	560675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384897279
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332	NC_017362	TATCGC	2	12	748291	748302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384897443
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338	NC_017362	TGGCTA	2	12	759846	759857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384897453
339	NC_017362	CATGCT	2	12	760694	760705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384897454
340	NC_017362	GGGATT	2	12	762171	762182	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384897456
341	NC_017362	CAAAGA	2	12	764433	764444	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384897457
342	NC_017362	AGAAAA	2	12	765164	765175	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384897459
343	NC_017362	GTGTTG	2	12	765517	765528	0 %	50 %	50 %	0 %	384897460
344	NC_017362	ATGACG	2	12	766053	766064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384897461
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453	NC_017362	GATAAA	2	12	1043902	1043913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384897723
454	NC_017362	AAATCA	2	12	1051054	1051065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897730
455	NC_017362	CCATGC	2	12	1055679	1055690	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384897734
456	NC_017362	TGAGCG	2	12	1063372	1063383	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384897742
457	NC_017362	CATAGC	2	12	1064256	1064267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384897743
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