MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 14497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896753
2	NC_017362	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896753
3	NC_017362	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896753
4	NC_017362	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896753
5	NC_017362	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896754
6	NC_017362	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896754
7	NC_017362	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896754
8	NC_017362	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896754
9	NC_017362	CCG	3	9	1043	1051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896755
10	NC_017362	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896755
11	NC_017362	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896755
12	NC_017362	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896755
13	NC_017362	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896755
14	NC_017362	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384896755
15	NC_017362	GCC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896755
16	NC_017362	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896755
17	NC_017362	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896755
18	NC_017362	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896756
19	NC_017362	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896756
20	NC_017362	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896756
21	NC_017362	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896756
22	NC_017362	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896756
23	NC_017362	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896757
24	NC_017362	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896757
25	NC_017362	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896757
26	NC_017362	AAG	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896757
27	NC_017362	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896757
28	NC_017362	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896758
29	NC_017362	GAA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896758
30	NC_017362	AGC	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896758
31	NC_017362	GGT	2	6	3577	3582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896758
32	NC_017362	CTA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896758
33	NC_017362	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896758
34	NC_017362	CAG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896758
35	NC_017362	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896758
36	NC_017362	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384896758
37	NC_017362	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
38	NC_017362	TGG	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
39	NC_017362	GTT	2	6	5584	5589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
40	NC_017362	ATA	2	6	5603	5608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896759
41	NC_017362	TAA	2	6	5653	5658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896759
42	NC_017362	TTA	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
43	NC_017362	GTG	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
44	NC_017362	TGT	2	6	5901	5906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
45	NC_017362	GTT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
46	NC_017362	CAG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896759
47	NC_017362	GCG	2	6	6159	6164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384896759
48	NC_017362	CGA	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896759
49	NC_017362	ATG	2	6	6371	6376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896759
50	NC_017362	TTA	3	9	6440	6448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
51	NC_017362	GTG	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
52	NC_017362	GTG	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
53	NC_017362	CTA	3	9	6494	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896759
54	NC_017362	TAC	3	9	6504	6512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896759
55	NC_017362	ATT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
56	NC_017362	TTA	2	6	6542	6547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
57	NC_017362	CCG	2	6	6563	6568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896759
58	NC_017362	TAG	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896759
59	NC_017362	TGT	2	6	6627	6632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
60	NC_017362	TTG	2	6	6667	6672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
61	NC_017362	GAT	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896759
62	NC_017362	TCA	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896759
63	NC_017362	CCG	2	6	6876	6881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896759
64	NC_017362	GCT	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896759
65	NC_017362	GTT	2	6	7021	7026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
66	NC_017362	GAT	2	6	7718	7723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896760
67	NC_017362	CAT	2	6	7745	7750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896760
68	NC_017362	TCT	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896760
69	NC_017362	AAT	2	6	7910	7915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896761
70	NC_017362	CTT	2	6	7918	7923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896761
71	NC_017362	CAT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896761
72	NC_017362	ATG	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896761
73	NC_017362	TCA	2	6	8085	8090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896761
74	NC_017362	CCA	2	6	8142	8147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896761
75	NC_017362	CTT	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896761
76	NC_017362	CCG	2	6	8167	8172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896761
77	NC_017362	CAT	2	6	8362	8367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896761
78	NC_017362	GTG	2	6	8394	8399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896761
79	NC_017362	TTC	2	6	8474	8479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896761
80	NC_017362	CCG	2	6	8493	8498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896761
81	NC_017362	CAC	2	6	8594	8599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896761
82	NC_017362	GAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896761
83	NC_017362	TAG	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896761
84	NC_017362	TCT	2	6	8958	8963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896761
85	NC_017362	TAA	2	6	9001	9006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896761
86	NC_017362	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896761
87	NC_017362	CTT	2	6	9157	9162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896761
88	NC_017362	ACA	2	6	9480	9485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896762
89	NC_017362	TCT	2	6	9514	9519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896762
90	NC_017362	CTT	2	6	9596	9601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896762
91	NC_017362	GAT	3	9	9684	9692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896762
92	NC_017362	TCT	2	6	9712	9717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896762
93	NC_017362	CTA	2	6	9728	9733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896762
94	NC_017362	TTG	2	6	10157	10162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896763
95	NC_017362	GAA	2	6	10173	10178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896763
96	NC_017362	TTA	2	6	10352	10357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896763
97	NC_017362	AGA	2	6	10367	10372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896763
98	NC_017362	AAG	2	6	10408	10413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896763
99	NC_017362	ATT	2	6	10441	10446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896763
100	NC_017362	CAT	2	6	10622	10627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896763
101	NC_017362	GTG	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896763
102	NC_017362	ATG	2	6	10936	10941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896763
103	NC_017362	AAC	2	6	11028	11033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896763
104	NC_017362	GAT	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896763
105	NC_017362	AGA	2	6	11414	11419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896763
106	NC_017362	TTG	2	6	11427	11432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896763
107	NC_017362	GAC	2	6	11514	11519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896763
108	NC_017362	TTA	3	9	11535	11543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896763
109	NC_017362	AAG	2	6	11563	11568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896763
110	NC_017362	TTG	2	6	11592	11597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896763
111	NC_017362	TGT	2	6	11778	11783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896764
112	NC_017362	TGT	2	6	11946	11951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896764
113	NC_017362	AAG	2	6	12105	12110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896764
114	NC_017362	TTG	2	6	12282	12287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896764
115	NC_017362	TAA	2	6	12502	12507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896764
116	NC_017362	TGG	3	9	12516	12524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896764
117	NC_017362	GAA	3	9	12533	12541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896764
118	NC_017362	AGA	2	6	12637	12642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896764
119	NC_017362	TTA	2	6	12946	12951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896765
120	NC_017362	GAA	2	6	12963	12968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896765
121	NC_017362	GTT	2	6	13030	13035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896765
122	NC_017362	ATT	2	6	13053	13058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896765
123	NC_017362	CGC	2	6	13205	13210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896765
124	NC_017362	CAA	2	6	13301	13306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896765
125	NC_017362	ACC	2	6	13429	13434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896765
126	NC_017362	GGT	2	6	13571	13576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896765
127	NC_017362	TTG	2	6	13579	13584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896765
128	NC_017362	AGA	3	9	13631	13639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896765
129	NC_017362	GTG	2	6	14057	14062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896766
130	NC_017362	GAA	2	6	14148	14153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896767
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