MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 28550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_017360	TTTATC	2	12	1558058	1558069	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896644
28502	NC_017360	TGT	2	6	1558078	1558083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896644
28503	NC_017360	T	6	6	1558187	1558192	0 %	100 %	0 %	0 %	384896644
28504	NC_017360	A	7	7	1558203	1558209	100 %	0 %	0 %	0 %	384896644
28505	NC_017360	GAA	2	6	1558233	1558238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896644
28506	NC_017360	T	6	6	1558264	1558269	0 %	100 %	0 %	0 %	384896644
28507	NC_017360	TGG	2	6	1558402	1558407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896644
28508	NC_017360	T	6	6	1558410	1558415	0 %	100 %	0 %	0 %	384896644
28509	NC_017360	T	6	6	1558434	1558439	0 %	100 %	0 %	0 %	384896644
28510	NC_017360	TTG	2	6	1558458	1558463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896644
28511	NC_017360	T	8	8	1558494	1558501	0 %	100 %	0 %	0 %	384896644
28512	NC_017360	ATT	2	6	1558540	1558545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896644
28513	NC_017360	T	6	6	1558566	1558571	0 %	100 %	0 %	0 %	384896644
28514	NC_017360	TTA	2	6	1558610	1558615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896644
28515	NC_017360	TGT	2	6	1558618	1558623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896644
28516	NC_017360	TGA	2	6	1558675	1558680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896644
28517	NC_017360	AAG	2	6	1558756	1558761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896644
28518	NC_017360	T	6	6	1558782	1558787	0 %	100 %	0 %	0 %	384896644
28519	NC_017360	A	6	6	1558788	1558793	100 %	0 %	0 %	0 %	384896644
28520	NC_017360	TGA	2	6	1558800	1558805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896644
28521	NC_017360	A	6	6	1559551	1559556	100 %	0 %	0 %	0 %	384896645
28522	NC_017360	CAA	2	6	1559569	1559574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896645
28523	NC_017360	AAC	2	6	1559575	1559580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896645
28524	NC_017360	ACC	2	6	1559594	1559599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896645
28525	NC_017360	AAAC	2	8	1559600	1559607	75 %	0 %	0 %	25 %	384896645
28526	NC_017360	AAT	2	6	1559621	1559626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896645
28527	NC_017360	TAAA	2	8	1559632	1559639	75 %	25 %	0 %	0 %	384896645
28528	NC_017360	A	6	6	1559650	1559655	100 %	0 %	0 %	0 %	384896645
28529	NC_017360	CTT	2	6	1559756	1559761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896646
28530	NC_017360	ACC	2	6	1559774	1559779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896646
28531	NC_017360	AAT	2	6	1559781	1559786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896646
28532	NC_017360	ATCCA	2	10	1559911	1559920	40 %	20 %	0 %	40 %	384896646
28533	NC_017360	TCT	3	9	1559929	1559937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896646
28534	NC_017360	CCG	2	6	1559980	1559985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896646
28535	NC_017360	GTT	2	6	1560008	1560013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896646
28536	NC_017360	A	6	6	1560058	1560063	100 %	0 %	0 %	0 %	384896646
28537	NC_017360	TTC	2	6	1560117	1560122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896646
28538	NC_017360	CAT	2	6	1560137	1560142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896646
28539	NC_017360	AAAAT	2	10	1564194	1564203	80 %	20 %	0 %	0 %	384896647
28540	NC_017360	CAT	2	6	1564205	1564210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896647
28541	NC_017360	AAAT	2	8	1564212	1564219	75 %	25 %	0 %	0 %	384896647
28542	NC_017360	CAT	2	6	1564221	1564226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896647
28543	NC_017360	ACA	2	6	1564253	1564258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896647
28544	NC_017360	T	8	8	1564271	1564278	0 %	100 %	0 %	0 %	384896647
28545	NC_017360	AGA	2	6	1564533	1564538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896648
28546	NC_017360	TGT	3	9	1564565	1564573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896648
28547	NC_017360	ACG	2	6	1564665	1564670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896648
28548	NC_017360	CAT	2	6	1564722	1564727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896648
28549	NC_017360	CAA	2	6	1564748	1564753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896648
28550	NC_017360	TGA	2	6	1564818	1564823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896648

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.