MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 14791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892009
2	NC_017358	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892009
3	NC_017358	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892009
4	NC_017358	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892009
5	NC_017358	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892009
6	NC_017358	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892010
7	NC_017358	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892010
8	NC_017358	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892010
9	NC_017358	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892010
10	NC_017358	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892010
11	NC_017358	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892011
12	NC_017358	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892011
13	NC_017358	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892011
14	NC_017358	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892011
15	NC_017358	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384892011
16	NC_017358	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892011
17	NC_017358	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892011
18	NC_017358	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384892011
19	NC_017358	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892011
20	NC_017358	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892011
21	NC_017358	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892011
22	NC_017358	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892012
23	NC_017358	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892012
24	NC_017358	ACT	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892012
25	NC_017358	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892012
26	NC_017358	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892012
27	NC_017358	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892012
28	NC_017358	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892012
29	NC_017358	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892012
30	NC_017358	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892012
31	NC_017358	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384892012
32	NC_017358	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384892013
33	NC_017358	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892013
34	NC_017358	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892013
35	NC_017358	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892013
36	NC_017358	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892013
37	NC_017358	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892014
38	NC_017358	TTG	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892014
39	NC_017358	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892014
40	NC_017358	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892014
41	NC_017358	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384892014
42	NC_017358	TGT	2	6	4749	4754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892015
43	NC_017358	CAT	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
44	NC_017358	GCC	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892016
45	NC_017358	TCT	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
46	NC_017358	AAT	2	6	5609	5614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892016
47	NC_017358	CTT	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
48	NC_017358	CAT	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
49	NC_017358	ATG	2	6	5760	5765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892016
50	NC_017358	TCA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
51	NC_017358	CCA	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892016
52	NC_017358	CTT	2	6	5857	5862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
53	NC_017358	TCA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
54	NC_017358	TTG	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892016
55	NC_017358	CAT	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892016
56	NC_017358	GTG	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892016
57	NC_017358	TTC	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
58	NC_017358	TAA	2	6	6181	6186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892016
59	NC_017358	CCG	2	6	6192	6197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384892016
60	NC_017358	TCT	2	6	6230	6235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
61	NC_017358	CAC	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892016
62	NC_017358	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892016
63	NC_017358	TAG	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892016
64	NC_017358	CTT	2	6	6547	6552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
65	NC_017358	TCT	2	6	6657	6662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
66	NC_017358	TAA	2	6	6700	6705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892016
67	NC_017358	GCA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384892016
68	NC_017358	CTT	2	6	6856	6861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892016
69	NC_017358	ACA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892017
70	NC_017358	TCT	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892017
71	NC_017358	CTT	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892017
72	NC_017358	GAT	3	9	7383	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892017
73	NC_017358	TCT	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892017
74	NC_017358	CTA	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892017
75	NC_017358	TTG	2	6	7842	7847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892018
76	NC_017358	GAA	2	6	7858	7863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892018
77	NC_017358	TTA	2	6	8037	8042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892018
78	NC_017358	AGA	2	6	8052	8057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892018
79	NC_017358	ACC	2	6	8060	8065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892018
80	NC_017358	AAG	2	6	8093	8098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892018
81	NC_017358	ATT	2	6	8126	8131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892018
82	NC_017358	CAT	2	6	8307	8312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892018
83	NC_017358	GTG	2	6	8341	8346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892018
84	NC_017358	ATG	2	6	8621	8626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892018
85	NC_017358	AGG	2	6	8686	8691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384892018
86	NC_017358	AAC	2	6	8713	8718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892018
87	NC_017358	AGA	2	6	9099	9104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892018
88	NC_017358	TTG	2	6	9112	9117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892018
89	NC_017358	GAC	2	6	9199	9204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384892018
90	NC_017358	TTA	3	9	9220	9228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892018
91	NC_017358	TTG	2	6	9277	9282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892018
92	NC_017358	TGT	2	6	9463	9468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892019
93	NC_017358	TGT	2	6	9631	9636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892019
94	NC_017358	AAG	2	6	9790	9795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892019
95	NC_017358	GTT	2	6	9905	9910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892019
96	NC_017358	TGG	3	9	10201	10209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892019
97	NC_017358	GAA	3	9	10218	10226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892019
98	NC_017358	TGG	2	6	10300	10305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892019
99	NC_017358	AGA	2	6	10322	10327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892019
100	NC_017358	TTA	2	6	10634	10639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892020
101	NC_017358	GAA	2	6	10651	10656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892020
102	NC_017358	GTT	2	6	10718	10723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892020
103	NC_017358	ATT	2	6	10741	10746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892020
104	NC_017358	GAA	2	6	10947	10952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892020
105	NC_017358	AAT	2	6	11023	11028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892020
106	NC_017358	CAA	2	6	11122	11127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892020
107	NC_017358	TTG	2	6	11267	11272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892020
108	NC_017358	AGA	2	6	11319	11324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892020
109	NC_017358	GTG	2	6	11746	11751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384892021
110	NC_017358	GAA	2	6	11837	11842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892022
111	NC_017358	ATT	3	9	12024	12032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892022
112	NC_017358	GAA	2	6	12163	12168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892023
113	NC_017358	AAC	2	6	12169	12174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892023
114	NC_017358	ATG	2	6	12188	12193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892023
115	NC_017358	TCC	2	6	12233	12238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384892023
116	NC_017358	CAA	2	6	12373	12378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892023
117	NC_017358	AAG	2	6	12434	12439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892023
118	NC_017358	TAG	2	6	12701	12706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892023
119	NC_017358	ATT	2	6	12758	12763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892023
120	NC_017358	GCT	2	6	12981	12986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384892023
121	NC_017358	ACC	2	6	13196	13201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384892023
122	NC_017358	ATT	2	6	13319	13324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892023
123	NC_017358	AAG	2	6	13352	13357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892023
124	NC_017358	CAA	2	6	13365	13370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384892023
125	NC_017358	ATG	2	6	13456	13461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892023
126	NC_017358	CTT	2	6	13626	13631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892023
127	NC_017358	AAG	2	6	13667	13672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892023
128	NC_017358	AGA	2	6	13677	13682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892023
129	NC_017358	TAT	2	6	13930	13935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892023
130	NC_017358	AGA	2	6	13953	13958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892023
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132	NC_017358	TAT	2	6	14790	14795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892024
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