MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	384890377
2	NC_017357	TTGAT	2	10	5737	5746	20 %	60 %	20 %	0 %	384890382
3	NC_017357	TTGCT	2	10	5854	5863	0 %	60 %	20 %	20 %	384890382
4	NC_017357	TTTTA	2	10	7007	7016	20 %	80 %	0 %	0 %	384890383
5	NC_017357	TTTCT	2	10	7934	7943	0 %	80 %	0 %	20 %	384890385
6	NC_017357	AATTT	2	10	8773	8782	40 %	60 %	0 %	0 %	384890385
7	NC_017357	AAAGG	2	10	10408	10417	60 %	0 %	40 %	0 %	384890387
8	NC_017357	TTTTG	2	10	11464	11473	0 %	80 %	20 %	0 %	384890388
9	NC_017357	TGGTG	2	10	12303	12312	0 %	40 %	60 %	0 %	384890389
10	NC_017357	TTGAT	2	10	23687	23696	20 %	60 %	20 %	0 %	384890400
11	NC_017357	CAAGC	2	10	26888	26897	40 %	0 %	20 %	40 %	384890403
12	NC_017357	TTTTA	2	10	27817	27826	20 %	80 %	0 %	0 %	384890404
13	NC_017357	TAGCG	2	10	28479	28488	20 %	20 %	40 %	20 %	384890405
14	NC_017357	TGATT	2	10	30836	30845	20 %	60 %	20 %	0 %	384890407
15	NC_017357	GTGGG	2	10	32719	32728	0 %	20 %	80 %	0 %	384890409
16	NC_017357	ATCAA	2	10	34851	34860	60 %	20 %	0 %	20 %	384890412
17	NC_017357	TTTTG	2	10	37347	37356	0 %	80 %	20 %	0 %	384890416
18	NC_017357	TGAGT	2	10	39367	39376	20 %	40 %	40 %	0 %	384890418
19	NC_017357	CAAAA	2	10	39470	39479	80 %	0 %	0 %	20 %	384890418
20	NC_017357	AAGCC	2	10	39752	39761	40 %	0 %	20 %	40 %	384890418
21	NC_017357	CAAAC	2	10	40393	40402	60 %	0 %	0 %	40 %	384890418
22	NC_017357	AGAAA	2	10	41078	41087	80 %	0 %	20 %	0 %	384890419
23	NC_017357	TAAAA	2	10	44341	44350	80 %	20 %	0 %	0 %	384890424
24	NC_017357	GCGAT	2	10	44872	44881	20 %	20 %	40 %	20 %	384890425
25	NC_017357	GCTCC	2	10	45674	45683	0 %	20 %	20 %	60 %	384890425
26	NC_017357	ATGAA	2	10	45856	45865	60 %	20 %	20 %	0 %	384890425
27	NC_017357	TCGCA	2	10	46211	46220	20 %	20 %	20 %	40 %	384890425
28	NC_017357	CAATA	2	10	47779	47788	60 %	20 %	0 %	20 %	384890426
29	NC_017357	AGGCT	2	10	48091	48100	20 %	20 %	40 %	20 %	384890427
30	NC_017357	TGCCT	2	10	48466	48475	0 %	40 %	20 %	40 %	384890427
31	NC_017357	GATTG	2	10	48950	48959	20 %	40 %	40 %	0 %	384890428
32	NC_017357	GCTTT	2	10	49006	49015	0 %	60 %	20 %	20 %	384890428
33	NC_017357	AAATA	2	10	50252	50261	80 %	20 %	0 %	0 %	384890429
34	NC_017357	ATATT	2	10	50418	50427	40 %	60 %	0 %	0 %	384890429
35	NC_017357	CCAAA	2	10	50585	50594	60 %	0 %	0 %	40 %	384890430
36	NC_017357	TAAAA	2	10	52636	52645	80 %	20 %	0 %	0 %	384890430
37	NC_017357	ATCAA	2	10	52667	52676	60 %	20 %	0 %	20 %	384890430
38	NC_017357	TGAAA	2	10	53398	53407	60 %	20 %	20 %	0 %	384890431
39	NC_017357	TCAAA	2	10	53652	53661	60 %	20 %	0 %	20 %	384890431
40	NC_017357	TCGTT	2	10	54462	54471	0 %	60 %	20 %	20 %	384890431
41	NC_017357	TAAAA	2	10	56691	56700	80 %	20 %	0 %	0 %	384890432
42	NC_017357	TCAAA	2	10	57407	57416	60 %	20 %	0 %	20 %	384890432
43	NC_017357	GGTGG	2	10	66245	66254	0 %	20 %	80 %	0 %	384890446
44	NC_017357	CTTGG	2	10	70238	70247	0 %	40 %	40 %	20 %	384890450
45	NC_017357	TGCCT	2	10	70369	70378	0 %	40 %	20 %	40 %	384890450
46	NC_017357	TCCAA	2	10	70781	70790	40 %	20 %	0 %	40 %	384890451
47	NC_017357	TTTTG	2	10	74109	74118	0 %	80 %	20 %	0 %	384890454
48	NC_017357	ACGCC	2	10	74415	74424	20 %	0 %	20 %	60 %	384890454
49	NC_017357	AAAGC	2	10	75181	75190	60 %	0 %	20 %	20 %	384890455
50	NC_017357	TTTTG	2	10	79923	79932	0 %	80 %	20 %	0 %	384890462
51	NC_017357	GATTT	2	10	79934	79943	20 %	60 %	20 %	0 %	384890462
52	NC_017357	TTTTC	2	10	83411	83420	0 %	80 %	0 %	20 %	384890464
53	NC_017357	CCATA	2	10	83739	83748	40 %	20 %	0 %	40 %	384890464
54	NC_017357	TGGCT	2	10	84105	84114	0 %	40 %	40 %	20 %	384890464
55	NC_017357	ATGCC	2	10	84547	84556	20 %	20 %	20 %	40 %	384890465
56	NC_017357	TTGAT	2	10	85633	85642	20 %	60 %	20 %	0 %	384890467
57	NC_017357	GGCGT	2	10	87447	87456	0 %	20 %	60 %	20 %	384890469
58	NC_017357	CTTTC	2	10	91039	91048	0 %	60 %	0 %	40 %	384890471
59	NC_017357	CGAGA	2	10	93059	93068	40 %	0 %	40 %	20 %	384890473
60	NC_017357	TGATT	2	10	94003	94012	20 %	60 %	20 %	0 %	384890474
61	NC_017357	GGCTT	2	10	95328	95337	0 %	40 %	40 %	20 %	384890475
62	NC_017357	ACGAT	2	10	100289	100298	40 %	20 %	20 %	20 %	384890480
63	NC_017357	TTTTC	2	10	100484	100493	0 %	80 %	0 %	20 %	384890480
64	NC_017357	AATTG	2	10	102116	102125	40 %	40 %	20 %	0 %	384890481
65	NC_017357	TCGTT	2	10	104018	104027	0 %	60 %	20 %	20 %	384890482
66	NC_017357	GTGGG	2	10	104340	104349	0 %	20 %	80 %	0 %	384890483
67	NC_017357	TTAGA	2	10	105031	105040	40 %	40 %	20 %	0 %	384890484
68	NC_017357	CAAGC	2	10	106136	106145	40 %	0 %	20 %	40 %	384890484
69	NC_017357	AAAGC	2	10	110141	110150	60 %	0 %	20 %	20 %	384890488
70	NC_017357	GAATG	2	10	111373	111382	40 %	20 %	40 %	0 %	384890490
71	NC_017357	CAAAT	2	10	112698	112707	60 %	20 %	0 %	20 %	384890492
72	NC_017357	CGTTT	2	10	113331	113340	0 %	60 %	20 %	20 %	384890492
73	NC_017357	ACCCT	2	10	114126	114135	20 %	20 %	0 %	60 %	384890493
74	NC_017357	ATGCC	2	10	114258	114267	20 %	20 %	20 %	40 %	384890493
75	NC_017357	TGATT	2	10	116253	116262	20 %	60 %	20 %	0 %	384890495
76	NC_017357	GATCG	2	10	120768	120777	20 %	20 %	40 %	20 %	384890499
77	NC_017357	AGCTC	2	10	120787	120796	20 %	20 %	20 %	40 %	384890499
78	NC_017357	AAGCC	2	10	122675	122684	40 %	0 %	20 %	40 %	384890500
79	NC_017357	TTGAT	2	10	123740	123749	20 %	60 %	20 %	0 %	384890501
80	NC_017357	TTTGA	2	10	124978	124987	20 %	60 %	20 %	0 %	384890502
81	NC_017357	ATCTC	2	10	126263	126272	20 %	40 %	0 %	40 %	384890502
82	NC_017357	TTTGT	2	10	126773	126782	0 %	80 %	20 %	0 %	384890503
83	NC_017357	TGCGT	2	10	128805	128814	0 %	40 %	40 %	20 %	384890505
84	NC_017357	ATTTT	2	10	132333	132342	20 %	80 %	0 %	0 %	384890511
85	NC_017357	ATGTT	2	10	132415	132424	20 %	60 %	20 %	0 %	384890512
86	NC_017357	AAAAG	2	10	132827	132836	80 %	0 %	20 %	0 %	384890512
87	NC_017357	AAATC	2	10	134842	134851	60 %	20 %	0 %	20 %	384890513
88	NC_017357	AAAAT	2	10	136314	136323	80 %	20 %	0 %	0 %	384890514
89	NC_017357	TTTTC	2	10	138870	138879	0 %	80 %	0 %	20 %	384890517
90	NC_017357	TTCTT	2	10	140826	140835	0 %	80 %	0 %	20 %	384890519
91	NC_017357	TCTTT	2	10	141320	141329	0 %	80 %	0 %	20 %	384890520
92	NC_017357	GTTTT	2	10	142482	142491	0 %	80 %	20 %	0 %	384890521
93	NC_017357	AATTC	2	10	143054	143063	40 %	40 %	0 %	20 %	384890521
94	NC_017357	GCGAT	2	10	143213	143222	20 %	20 %	40 %	20 %	384890521
95	NC_017357	GCTTG	2	10	143451	143460	0 %	40 %	40 %	20 %	384890521
96	NC_017357	TTTTG	2	10	144103	144112	0 %	80 %	20 %	0 %	384890522
97	NC_017357	ACGCC	2	10	149462	149471	20 %	0 %	20 %	60 %	384890525
98	NC_017357	GCGTT	2	10	151725	151734	0 %	40 %	40 %	20 %	384890530
99	NC_017357	ATTTG	2	10	152702	152711	20 %	60 %	20 %	0 %	384890531
100	NC_017357	GGATT	2	10	155284	155293	20 %	40 %	40 %	0 %	384890534
101	NC_017357	AGATT	2	10	157743	157752	40 %	40 %	20 %	0 %	384890536
102	NC_017357	AAGCC	2	10	159080	159089	40 %	0 %	20 %	40 %	384890539
103	NC_017357	TGGCG	2	10	159754	159763	0 %	20 %	60 %	20 %	384890539
104	NC_017357	GTTTT	2	10	160836	160845	0 %	80 %	20 %	0 %	384890540
105	NC_017357	ATTTT	2	10	161121	161130	20 %	80 %	0 %	0 %	384890541
106	NC_017357	ATTCA	2	10	162753	162762	40 %	40 %	0 %	20 %	384890543
107	NC_017357	CACTT	2	10	162957	162966	20 %	40 %	0 %	40 %	384890543
108	NC_017357	ATCTT	2	10	166152	166161	20 %	60 %	0 %	20 %	384890546
109	NC_017357	TTTAA	2	10	170819	170828	40 %	60 %	0 %	0 %	384890552
110	NC_017357	CCGCA	2	10	174007	174016	20 %	0 %	20 %	60 %	384890555
111	NC_017357	TGGGG	2	10	174716	174725	0 %	20 %	80 %	0 %	384890556
112	NC_017357	ATTTG	2	10	175493	175502	20 %	60 %	20 %	0 %	384890556
113	NC_017357	AATTG	2	10	175649	175658	40 %	40 %	20 %	0 %	384890557
114	NC_017357	AAATG	2	10	177242	177251	60 %	20 %	20 %	0 %	384890559
115	NC_017357	TGTAA	2	10	178032	178041	40 %	40 %	20 %	0 %	384890560
116	NC_017357	AAAAT	2	10	178812	178821	80 %	20 %	0 %	0 %	384890561
117	NC_017357	ATAAA	2	10	179528	179537	80 %	20 %	0 %	0 %	384890561
118	NC_017357	AAAAG	2	10	180683	180692	80 %	0 %	20 %	0 %	384890563
119	NC_017357	GCATT	2	10	185380	185389	20 %	40 %	20 %	20 %	384890568
120	NC_017357	AGAGG	2	10	186423	186432	40 %	0 %	60 %	0 %	384890569
121	NC_017357	TTCAA	2	10	188203	188212	40 %	40 %	0 %	20 %	384890571
122	NC_017357	TCATT	2	10	193804	193813	20 %	60 %	0 %	20 %	384890575
123	NC_017357	TCATG	2	10	194579	194588	20 %	40 %	20 %	20 %	384890576
124	NC_017357	CTATT	2	10	194689	194698	20 %	60 %	0 %	20 %	384890577
125	NC_017357	TTTTC	2	10	195750	195759	0 %	80 %	0 %	20 %	384890578
126	NC_017357	TATTT	2	10	199510	199519	20 %	80 %	0 %	0 %	384890583
127	NC_017357	TTTCA	2	10	200173	200182	20 %	60 %	0 %	20 %	384890584
128	NC_017357	CTTTT	2	10	201168	201177	0 %	80 %	0 %	20 %	384890585
129	NC_017357	TGGGG	2	10	207311	207320	0 %	20 %	80 %	0 %	384890590
130	NC_017357	GATCA	2	10	209217	209226	40 %	20 %	20 %	20 %	384890592
131	NC_017357	ATTCT	2	10	209744	209753	20 %	60 %	0 %	20 %	384890592
132	NC_017357	GCAAA	2	10	212701	212710	60 %	0 %	20 %	20 %	384890595
133	NC_017357	TGCTT	2	10	212740	212749	0 %	60 %	20 %	20 %	384890595
134	NC_017357	CTAAG	2	10	213081	213090	40 %	20 %	20 %	20 %	384890596
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