MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 14184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	GAT	3	9	112	120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888658
2	NC_017355	GTT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888658
3	NC_017355	TTC	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888658
4	NC_017355	ACA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888658
5	NC_017355	ACC	2	6	383	388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888658
6	NC_017355	AAT	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888659
7	NC_017355	TTA	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888659
8	NC_017355	TAA	2	6	640	645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888659
9	NC_017355	AAC	2	6	687	692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888659
10	NC_017355	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888659
11	NC_017355	TGA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888659
12	NC_017355	CTA	2	6	931	936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888660
13	NC_017355	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888660
14	NC_017355	CCG	4	12	1033	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888660
15	NC_017355	CCA	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888660
16	NC_017355	GCT	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384888660
17	NC_017355	CTA	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888660
18	NC_017355	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888660
19	NC_017355	GGC	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384888660
20	NC_017355	GTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888660
21	NC_017355	TAG	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888660
22	NC_017355	CTT	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888660
23	NC_017355	TTC	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888661
24	NC_017355	ATG	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888661
25	NC_017355	TCA	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888661
26	NC_017355	GTT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888661
27	NC_017355	CTT	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888661
28	NC_017355	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888661
29	NC_017355	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888661
30	NC_017355	AAT	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888661
31	NC_017355	TAG	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888661
32	NC_017355	AGG	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888661
33	NC_017355	GTG	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888662
34	NC_017355	AGA	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888662
35	NC_017355	GTG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888662
36	NC_017355	GCC	2	6	3123	3128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888662
37	NC_017355	GTT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888663
38	NC_017355	ATC	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888663
39	NC_017355	ATT	2	6	3897	3902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888663
40	NC_017355	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384888663
41	NC_017355	AAT	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888664
42	NC_017355	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888664
43	NC_017355	TGT	2	6	4738	4743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888664
44	NC_017355	ATT	2	6	5315	5320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888665
45	NC_017355	TGG	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888665
46	NC_017355	GTT	2	6	5615	5620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
47	NC_017355	TAA	2	6	5684	5689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888665
48	NC_017355	TTA	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888665
49	NC_017355	GTG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888665
50	NC_017355	GTT	2	6	5831	5836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
51	NC_017355	ATG	2	6	6031	6036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888665
52	NC_017355	AGT	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888665
53	NC_017355	AGA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888665
54	NC_017355	CTT	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888665
55	NC_017355	TAG	7	21	6436	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888665
56	NC_017355	TGT	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
57	NC_017355	GTT	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
58	NC_017355	TTG	2	6	6551	6556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
59	NC_017355	CAT	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888665
60	NC_017355	TTG	2	6	6692	6697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
61	NC_017355	CCG	2	6	6754	6759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888665
62	NC_017355	CAT	2	6	7374	7379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888666
63	NC_017355	GCC	2	6	7380	7385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888666
64	NC_017355	ACC	2	6	7398	7403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888666
65	NC_017355	TCT	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
66	NC_017355	AAT	2	6	7539	7544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888666
67	NC_017355	CTT	2	6	7547	7552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
68	NC_017355	CAT	2	6	7637	7642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888666
69	NC_017355	ATG	2	6	7690	7695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888666
70	NC_017355	TCA	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888666
71	NC_017355	CCA	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888666
72	NC_017355	CTT	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
73	NC_017355	TCA	2	6	7822	7827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888666
74	NC_017355	TTG	2	6	7943	7948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888666
75	NC_017355	CAT	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888666
76	NC_017355	TTC	2	6	8103	8108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
77	NC_017355	TAA	2	6	8111	8116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888666
78	NC_017355	CCG	2	6	8122	8127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888666
79	NC_017355	TCT	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
80	NC_017355	CAC	2	6	8223	8228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888666
81	NC_017355	GAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888666
82	NC_017355	TAG	2	6	8304	8309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888666
83	NC_017355	CTT	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
84	NC_017355	TCT	2	6	8587	8592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
85	NC_017355	TAA	2	6	8630	8635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888666
86	NC_017355	CGG	2	6	8759	8764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384888666
87	NC_017355	CTT	2	6	8786	8791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888666
88	NC_017355	ACA	2	6	9108	9113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888667
89	NC_017355	TCT	2	6	9142	9147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888667
90	NC_017355	CTT	2	6	9224	9229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888667
91	NC_017355	GAT	3	9	9312	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888667
92	NC_017355	TCT	2	6	9340	9345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888667
93	NC_017355	CTA	2	6	9356	9361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888667
94	NC_017355	TTG	2	6	9771	9776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888668
95	NC_017355	GAA	2	6	9787	9792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888668
96	NC_017355	TTA	2	6	9966	9971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888668
97	NC_017355	AGA	2	6	9981	9986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888668
98	NC_017355	ACC	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888668
99	NC_017355	AAG	2	6	10022	10027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888668
100	NC_017355	ATT	2	6	10055	10060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888668
101	NC_017355	CAT	2	6	10236	10241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888668
102	NC_017355	GTG	2	6	10270	10275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888668
103	NC_017355	ATG	2	6	10550	10555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888668
104	NC_017355	AGG	2	6	10615	10620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888668
105	NC_017355	AAC	2	6	10642	10647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888668
106	NC_017355	AGA	2	6	11028	11033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888668
107	NC_017355	TTG	2	6	11041	11046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888668
108	NC_017355	GAC	2	6	11128	11133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888668
109	NC_017355	TTA	3	9	11149	11157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888668
110	NC_017355	TTG	2	6	11206	11211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888668
111	NC_017355	TGT	2	6	11392	11397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888669
112	NC_017355	TGT	2	6	11560	11565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888669
113	NC_017355	AAG	2	6	11719	11724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888669
114	NC_017355	GTT	2	6	11834	11839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888669
115	NC_017355	TAA	2	6	12029	12034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888669
116	NC_017355	TGG	3	9	12130	12138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888669
117	NC_017355	GAA	3	9	12147	12155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888669
118	NC_017355	TGG	2	6	12229	12234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888669
119	NC_017355	AGA	2	6	12251	12256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888669
120	NC_017355	AGG	2	6	12476	12481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888670
121	NC_017355	TTA	2	6	12563	12568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888671
122	NC_017355	GAA	2	6	12580	12585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888671
123	NC_017355	GTT	2	6	12647	12652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888671
124	NC_017355	ATT	2	6	12670	12675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888671
125	NC_017355	AAT	2	6	12952	12957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888671
126	NC_017355	CAA	2	6	13051	13056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888671
127	NC_017355	CTA	2	6	13109	13114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888671
128	NC_017355	TTG	2	6	13196	13201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888671
129	NC_017355	AGA	2	6	13248	13253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888671
130	NC_017355	GAA	2	6	13766	13771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888673
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