MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 33535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017161	CTTCT	2	10	49190	49199	0 %	60 %	0 %	40 %	384128132
1002	NC_017161	CTT	2	6	49224	49229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128132
1003	NC_017161	CCT	3	9	49290	49298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128132
1004	NC_017161	TGCTTG	2	12	49354	49365	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384128132
1005	NC_017161	TCT	2	6	49436	49441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128132
1006	NC_017161	GA	3	6	49457	49462	50 %	0 %	50 %	0 %	384128132
1007	NC_017161	A	6	6	49462	49467	100 %	0 %	0 %	0 %	384128132
1008	NC_017161	CTA	2	6	49470	49475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128132
1009	NC_017161	CCT	2	6	49539	49544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128133
1010	NC_017161	TGA	2	6	49564	49569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128133
1011	NC_017161	AAGGC	2	10	49737	49746	40 %	0 %	40 %	20 %	384128133
1012	NC_017161	CTT	2	6	49750	49755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128133
1013	NC_017161	CTTC	2	8	49876	49883	0 %	50 %	0 %	50 %	384128133
1014	NC_017161	T	6	6	49929	49934	0 %	100 %	0 %	0 %	384128133
1015	NC_017161	AGA	2	6	49945	49950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128133
1016	NC_017161	CCT	3	9	50023	50031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128133
1017	NC_017161	CT	3	6	50042	50047	0 %	50 %	0 %	50 %	384128133
1018	NC_017161	CTT	2	6	50064	50069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128133
1019	NC_017161	CTT	2	6	50411	50416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
1020	NC_017161	CCA	3	9	50530	50538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128134
1021	NC_017161	GGA	2	6	50559	50564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128134
1022	NC_017161	T	6	6	50593	50598	0 %	100 %	0 %	0 %	384128134
1023	NC_017161	AAG	2	6	50749	50754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128134
1024	NC_017161	TCC	2	6	50785	50790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1025	NC_017161	CTT	2	6	50833	50838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
1026	NC_017161	TCC	2	6	50883	50888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1027	NC_017161	GT	3	6	50897	50902	0 %	50 %	50 %	0 %	384128134
1028	NC_017161	GA	3	6	50975	50980	50 %	0 %	50 %	0 %	384128134
1029	NC_017161	GAT	2	6	51098	51103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128134
1030	NC_017161	CT	3	6	51131	51136	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1031	NC_017161	GAAG	2	8	51174	51181	50 %	0 %	50 %	0 %	384128134
1032	NC_017161	TGT	2	6	51205	51210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128134
1033	NC_017161	TCT	2	6	51231	51236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
1034	NC_017161	TC	3	6	51249	51254	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1035	NC_017161	TCC	2	6	51351	51356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1036	NC_017161	TC	3	6	51367	51372	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1037	NC_017161	TC	3	6	51441	51446	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1038	NC_017161	TG	3	6	51561	51566	0 %	50 %	50 %	0 %	384128134
1039	NC_017161	GGA	2	6	51578	51583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128134
1040	NC_017161	CTG	3	9	51633	51641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128134
1041	NC_017161	CCT	2	6	51663	51668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1042	NC_017161	CT	3	6	51762	51767	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1043	NC_017161	T	7	7	51770	51776	0 %	100 %	0 %	0 %	384128134
1044	NC_017161	TC	3	6	51840	51845	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1045	NC_017161	TAGT	2	8	51855	51862	25 %	50 %	25 %	0 %	384128134
1046	NC_017161	CCA	2	6	51868	51873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128134
1047	NC_017161	CTT	2	6	51885	51890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
1048	NC_017161	CTC	2	6	51961	51966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1049	NC_017161	AACT	2	8	52024	52031	50 %	25 %	0 %	25 %	384128134
1050	NC_017161	TCTT	2	8	52038	52045	0 %	75 %	0 %	25 %	384128134
1051	NC_017161	TCT	2	6	52052	52057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
1052	NC_017161	TCCAGC	2	12	52125	52136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384128134
1053	NC_017161	TCC	2	6	52188	52193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1054	NC_017161	ACA	2	6	52266	52271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128134
1055	NC_017161	CT	4	8	52280	52287	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1056	NC_017161	CCCA	2	8	52391	52398	25 %	0 %	0 %	75 %	384128134
1057	NC_017161	TAG	2	6	52429	52434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128134
1058	NC_017161	CT	3	6	52439	52444	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
1059	NC_017161	ACT	2	6	52467	52472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128134
1060	NC_017161	TCC	2	6	52542	52547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1061	NC_017161	GA	3	6	52549	52554	50 %	0 %	50 %	0 %	384128134
1062	NC_017161	CTT	2	6	52732	52737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128135
1063	NC_017161	ACC	2	6	52759	52764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128135
1064	NC_017161	CATA	2	8	52811	52818	50 %	25 %	0 %	25 %	384128135
1065	NC_017161	AG	3	6	52833	52838	50 %	0 %	50 %	0 %	384128135
1066	NC_017161	CCT	2	6	52920	52925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128135
1067	NC_017161	AT	3	6	52927	52932	50 %	50 %	0 %	0 %	384128135
1068	NC_017161	GGA	2	6	52989	52994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128135
1069	NC_017161	AGG	2	6	53053	53058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128135
1070	NC_017161	CCA	2	6	53114	53119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128135
1071	NC_017161	CAT	2	6	53250	53255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128135
1072	NC_017161	GTG	2	6	53272	53277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128135
1073	NC_017161	TGA	2	6	53406	53411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128135
1074	NC_017161	TGA	2	6	53427	53432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128135
1075	NC_017161	AAG	2	6	53490	53495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128135
1076	NC_017161	CAG	2	6	53604	53609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128135
1077	NC_017161	TGA	2	6	53644	53649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128136
1078	NC_017161	AAG	2	6	53663	53668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128136
1079	NC_017161	CCA	2	6	53821	53826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128136
1080	NC_017161	ATG	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128136
1081	NC_017161	CTC	2	6	53892	53897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128136
1082	NC_017161	CCT	2	6	53960	53965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128136
1083	NC_017161	TAT	2	6	53975	53980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128136
1084	NC_017161	ATA	2	6	53997	54002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128136
1085	NC_017161	TCA	2	6	54063	54068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128136
1086	NC_017161	AG	4	8	54117	54124	50 %	0 %	50 %	0 %	384128136
1087	NC_017161	T	6	6	54162	54167	0 %	100 %	0 %	0 %	384128136
1088	NC_017161	CCT	2	6	54201	54206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128136
1089	NC_017161	ATA	2	6	54225	54230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128136
1090	NC_017161	TCA	2	6	54271	54276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128136
1091	NC_017161	ATTA	2	8	54314	54321	50 %	50 %	0 %	0 %	384128136
1092	NC_017161	CT	3	6	54345	54350	0 %	50 %	0 %	50 %	384128136
1093	NC_017161	CAT	2	6	54368	54373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128136
1094	NC_017161	GA	3	6	54453	54458	50 %	0 %	50 %	0 %	384128137
1095	NC_017161	TAG	2	6	54459	54464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128137
1096	NC_017161	CCA	2	6	54465	54470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128137
1097	NC_017161	CTA	2	6	54481	54486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128137
1098	NC_017161	TGG	2	6	54501	54506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128137
1099	NC_017161	TCA	2	6	54553	54558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128137
1100	NC_017161	TGA	2	6	54609	54614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128137
1101	NC_017161	A	6	6	54649	54654	100 %	0 %	0 %	0 %	384128137
1102	NC_017161	GGT	2	6	54670	54675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128137
1103	NC_017161	TG	3	6	54730	54735	0 %	50 %	50 %	0 %	384128137
1104	NC_017161	TAC	2	6	54815	54820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128137
1105	NC_017161	CAGT	2	8	54832	54839	25 %	25 %	25 %	25 %	384128137
1106	NC_017161	CA	4	8	54916	54923	50 %	0 %	0 %	50 %	384128137
1107	NC_017161	GGA	3	9	54988	54996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128137
1108	NC_017161	AG	4	8	55038	55045	50 %	0 %	50 %	0 %	384128137
1109	NC_017161	GACAG	2	10	55074	55083	40 %	0 %	40 %	20 %	384128137
1110	NC_017161	CTC	2	6	55138	55143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128137
1111	NC_017161	TGA	2	6	55165	55170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128137
1112	NC_017161	AG	3	6	55208	55213	50 %	0 %	50 %	0 %	384128137
1113	NC_017161	AGG	2	6	55232	55237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128138
1114	NC_017161	T	6	6	55324	55329	0 %	100 %	0 %	0 %	384128138
1115	NC_017161	ATA	2	6	55558	55563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128138
1116	NC_017161	GGA	2	6	55578	55583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128138
1117	NC_017161	TCT	2	6	55584	55589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128138
1118	NC_017161	A	7	7	55590	55596	100 %	0 %	0 %	0 %	384128138
1119	NC_017161	GGT	2	6	55615	55620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128138
1120	NC_017161	CTT	2	6	55636	55641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128138
1121	NC_017161	CAC	2	6	55653	55658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128138
1122	NC_017161	AG	3	6	55725	55730	50 %	0 %	50 %	0 %	384128138
1123	NC_017161	GTG	2	6	55768	55773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128138
1124	NC_017161	TCT	2	6	55948	55953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128139
1125	NC_017161	CTT	2	6	55962	55967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128139
1126	NC_017161	GT	3	6	55980	55985	0 %	50 %	50 %	0 %	384128139
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1128	NC_017161	CTT	2	6	56117	56122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128139
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