MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 33535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017161	GGA	2	6	226773	226778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128314
4502	NC_017161	A	6	6	226946	226951	100 %	0 %	0 %	0 %	384128314
4503	NC_017161	CT	3	6	227100	227105	0 %	50 %	0 %	50 %	384128314
4504	NC_017161	ACA	2	6	227121	227126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128314
4505	NC_017161	CAA	2	6	227138	227143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128314
4506	NC_017161	TAC	2	6	227176	227181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128314
4507	NC_017161	ACAG	2	8	227232	227239	50 %	0 %	25 %	25 %	384128314
4508	NC_017161	GTG	2	6	227308	227313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128314
4509	NC_017161	GGAA	2	8	227314	227321	50 %	0 %	50 %	0 %	384128314
4510	NC_017161	TGACCT	2	12	227365	227376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384128314
4511	NC_017161	CTT	2	6	227472	227477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128314
4512	NC_017161	A	6	6	227489	227494	100 %	0 %	0 %	0 %	384128314
4513	NC_017161	ACC	2	6	227543	227548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128314
4514	NC_017161	CAA	2	6	227554	227559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128314
4515	NC_017161	AAAC	2	8	227561	227568	75 %	0 %	0 %	25 %	384128314
4516	NC_017161	TA	3	6	227593	227598	50 %	50 %	0 %	0 %	384128314
4517	NC_017161	CTTTA	2	10	227627	227636	20 %	60 %	0 %	20 %	384128314
4518	NC_017161	AG	3	6	227666	227671	50 %	0 %	50 %	0 %	384128314
4519	NC_017161	CAG	2	6	227686	227691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128314
4520	NC_017161	ATC	2	6	227693	227698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128314
4521	NC_017161	GAA	2	6	227736	227741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128314
4522	NC_017161	TCC	2	6	227783	227788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128314
4523	NC_017161	TTG	2	6	227829	227834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128314
4524	NC_017161	GACT	2	8	227872	227879	25 %	25 %	25 %	25 %	384128314
4525	NC_017161	ACA	2	6	227925	227930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128314
4526	NC_017161	ATA	2	6	227952	227957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128314
4527	NC_017161	TTA	2	6	228020	228025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128314
4528	NC_017161	GGAG	2	8	228037	228044	25 %	0 %	75 %	0 %	384128314
4529	NC_017161	ACT	2	6	228125	228130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128314
4530	NC_017161	TGT	2	6	228142	228147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128314
4531	NC_017161	AAG	2	6	228169	228174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128314
4532	NC_017161	T	6	6	228199	228204	0 %	100 %	0 %	0 %	384128314
4533	NC_017161	A	6	6	228283	228288	100 %	0 %	0 %	0 %	384128314
4534	NC_017161	T	6	6	228326	228331	0 %	100 %	0 %	0 %	384128314
4535	NC_017161	GACC	2	8	228343	228350	25 %	0 %	25 %	50 %	384128314
4536	NC_017161	ATAA	2	8	228422	228429	75 %	25 %	0 %	0 %	384128314
4537	NC_017161	GATTA	2	10	228450	228459	40 %	40 %	20 %	0 %	384128314
4538	NC_017161	GA	3	6	228493	228498	50 %	0 %	50 %	0 %	384128314
4539	NC_017161	ACG	2	6	228504	228509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128314
4540	NC_017161	TA	3	6	228524	228529	50 %	50 %	0 %	0 %	384128314
4541	NC_017161	CTTT	2	8	228597	228604	0 %	75 %	0 %	25 %	384128315
4542	NC_017161	CTT	2	6	228610	228615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128315
4543	NC_017161	CTC	2	6	228621	228626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128315
4544	NC_017161	ATCT	2	8	228720	228727	25 %	50 %	0 %	25 %	384128315
4545	NC_017161	CCA	2	6	228755	228760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128315
4546	NC_017161	TCTG	2	8	228761	228768	0 %	50 %	25 %	25 %	384128315
4547	NC_017161	CT	3	6	228781	228786	0 %	50 %	0 %	50 %	384128315
4548	NC_017161	AAG	2	6	228837	228842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128315
4549	NC_017161	CTT	2	6	228866	228871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128315
4550	NC_017161	GA	3	6	228882	228887	50 %	0 %	50 %	0 %	384128315
4551	NC_017161	TATC	2	8	229034	229041	25 %	50 %	0 %	25 %	384128315
4552	NC_017161	T	6	6	229075	229080	0 %	100 %	0 %	0 %	384128315
4553	NC_017161	TCCA	2	8	229128	229135	25 %	25 %	0 %	50 %	384128315
4554	NC_017161	GGAG	2	8	229221	229228	25 %	0 %	75 %	0 %	384128315
4555	NC_017161	AAG	2	6	229695	229700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128316
4556	NC_017161	AG	3	6	229699	229704	50 %	0 %	50 %	0 %	384128316
4557	NC_017161	AAGGG	2	10	229715	229724	40 %	0 %	60 %	0 %	384128316
4558	NC_017161	AAG	2	6	229733	229738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128316
4559	NC_017161	CTC	2	6	229751	229756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4560	NC_017161	T	6	6	229785	229790	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4561	NC_017161	TAT	2	6	230003	230008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128316
4562	NC_017161	CCT	2	6	230009	230014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4563	NC_017161	AAG	2	6	230054	230059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128316
4564	NC_017161	CTT	2	6	230141	230146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128316
4565	NC_017161	TA	3	6	230157	230162	50 %	50 %	0 %	0 %	384128316
4566	NC_017161	T	6	6	230172	230177	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4567	NC_017161	TGG	2	6	230243	230248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128316
4568	NC_017161	AAG	2	6	230258	230263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128316
4569	NC_017161	A	7	7	230336	230342	100 %	0 %	0 %	0 %	384128316
4570	NC_017161	ATC	2	6	230405	230410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128316
4571	NC_017161	GTAT	2	8	230412	230419	25 %	50 %	25 %	0 %	384128316
4572	NC_017161	GT	3	6	230428	230433	0 %	50 %	50 %	0 %	384128316
4573	NC_017161	TCCTT	2	10	230455	230464	0 %	60 %	0 %	40 %	384128316
4574	NC_017161	CCA	2	6	230467	230472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128316
4575	NC_017161	A	6	6	230510	230515	100 %	0 %	0 %	0 %	384128316
4576	NC_017161	CCT	2	6	230549	230554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4577	NC_017161	TGT	2	6	230579	230584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128316
4578	NC_017161	ATGC	2	8	230600	230607	25 %	25 %	25 %	25 %	384128316
4579	NC_017161	T	6	6	230672	230677	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4580	NC_017161	CT	3	6	230713	230718	0 %	50 %	0 %	50 %	384128316
4581	NC_017161	TCTTCC	2	12	230730	230741	0 %	50 %	0 %	50 %	384128316
4582	NC_017161	TG	3	6	230754	230759	0 %	50 %	50 %	0 %	384128316
4583	NC_017161	TCC	2	6	230808	230813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4584	NC_017161	CA	3	6	230830	230835	50 %	0 %	0 %	50 %	384128316
4585	NC_017161	GTCCTT	2	12	230906	230917	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384128316
4586	NC_017161	TTC	2	6	230920	230925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128316
4587	NC_017161	TCA	2	6	230940	230945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128316
4588	NC_017161	CTG	2	6	231017	231022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128316
4589	NC_017161	AAG	2	6	231035	231040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128316
4590	NC_017161	AG	5	10	231053	231062	50 %	0 %	50 %	0 %	384128316
4591	NC_017161	CTTT	2	8	231115	231122	0 %	75 %	0 %	25 %	384128316
4592	NC_017161	T	6	6	231154	231159	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4593	NC_017161	CAA	2	6	231232	231237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128316
4594	NC_017161	GTC	2	6	231248	231253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128316
4595	NC_017161	CTTT	2	8	231353	231360	0 %	75 %	0 %	25 %	384128316
4596	NC_017161	CT	3	6	231462	231467	0 %	50 %	0 %	50 %	384128316
4597	NC_017161	CCT	2	6	231484	231489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4598	NC_017161	T	6	6	231495	231500	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4599	NC_017161	CTT	2	6	231523	231528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128317
4600	NC_017161	CAC	2	6	231715	231720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128317
4601	NC_017161	CCCT	2	8	231749	231756	0 %	25 %	0 %	75 %	384128317
4602	NC_017161	CAA	2	6	231783	231788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128317
4603	NC_017161	CAT	2	6	231870	231875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128317
4604	NC_017161	ATGT	2	8	231940	231947	25 %	50 %	25 %	0 %	384128317
4605	NC_017161	TTC	2	6	231989	231994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128317
4606	NC_017161	CTTA	2	8	232062	232069	25 %	50 %	0 %	25 %	384128318
4607	NC_017161	TGG	2	6	232088	232093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128318
4608	NC_017161	CTT	2	6	232123	232128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128318
4609	NC_017161	TCA	2	6	232141	232146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128318
4610	NC_017161	AGTGT	2	10	232201	232210	20 %	40 %	40 %	0 %	384128318
4611	NC_017161	TAT	2	6	232211	232216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128318
4612	NC_017161	TC	3	6	232226	232231	0 %	50 %	0 %	50 %	384128318
4613	NC_017161	AGG	2	6	232267	232272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128318
4614	NC_017161	CTG	2	6	232289	232294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128318
4615	NC_017161	TGT	2	6	232298	232303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128318
4616	NC_017161	ATG	2	6	232318	232323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128318
4617	NC_017161	T	6	6	232328	232333	0 %	100 %	0 %	0 %	384128318
4618	NC_017161	GTA	2	6	232341	232346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128318
4619	NC_017161	AGG	2	6	232348	232353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128318
4620	NC_017161	TC	3	6	232355	232360	0 %	50 %	0 %	50 %	384128318
4621	NC_017161	TATTC	2	10	232399	232408	20 %	60 %	0 %	20 %	384128318
4622	NC_017161	ACC	2	6	232416	232421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128318
4623	NC_017161	CTT	2	6	232524	232529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128318
4624	NC_017161	ATG	2	6	232561	232566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128318
4625	NC_017161	CCT	2	6	232607	232612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128319
4626	NC_017161	GATAA	2	10	232620	232629	60 %	20 %	20 %	0 %	384128319
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4740	NC_017161	GGAAA	2	10	238402	238411	60 %	0 %	40 %	0 %	384128325
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4745	NC_017161	GA	3	6	238729	238734	50 %	0 %	50 %	0 %	384128325
4746	NC_017161	AGGG	2	8	238736	238743	25 %	0 %	75 %	0 %	384128325
4747	NC_017161	ACA	2	6	238769	238774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128325
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4999	NC_017161	TAC	2	6	259132	259137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128341
5000	NC_017161	TAA	2	6	259187	259192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128341

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