MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 38109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	TCGTA	2	10	43	52	20 %	40 %	20 %	20 %	345428591
2	NC_015964	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428591
3	NC_015964	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428591
4	NC_015964	CTG	2	6	333	338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428591
5	NC_015964	A	6	6	344	349	100 %	0 %	0 %	0 %	345428591
6	NC_015964	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428591
7	NC_015964	CTT	2	6	444	449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428591
8	NC_015964	TAC	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428591
9	NC_015964	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428591
10	NC_015964	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	345428591
11	NC_015964	GTG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428591
12	NC_015964	GTG	2	6	594	599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428591
13	NC_015964	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428591
14	NC_015964	AGT	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428591
15	NC_015964	TGATGC	2	12	895	906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345428591
16	NC_015964	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	345428591
17	NC_015964	CAG	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428592
18	NC_015964	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428592
19	NC_015964	CTTG	2	8	1403	1410	0 %	50 %	25 %	25 %	345428592
20	NC_015964	CAA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428592
21	NC_015964	ATTT	2	8	1546	1553	25 %	75 %	0 %	0 %	345428592
22	NC_015964	TGTT	2	8	1578	1585	0 %	75 %	25 %	0 %	345428592
23	NC_015964	A	6	6	1644	1649	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
24	NC_015964	GATG	2	8	1774	1781	25 %	25 %	50 %	0 %	345428592
25	NC_015964	ATC	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428592
26	NC_015964	TCA	2	6	1858	1863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428592
27	NC_015964	CTTT	2	8	1913	1920	0 %	75 %	0 %	25 %	345428592
28	NC_015964	T	6	6	1918	1923	0 %	100 %	0 %	0 %	345428592
29	NC_015964	GAGC	2	8	1943	1950	25 %	0 %	50 %	25 %	345428592
30	NC_015964	TG	3	6	2049	2054	0 %	50 %	50 %	0 %	345428592
31	NC_015964	A	6	6	2073	2078	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
32	NC_015964	GAT	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
33	NC_015964	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
34	NC_015964	TTC	2	6	2201	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428592
35	NC_015964	ATG	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
36	NC_015964	TGG	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428592
37	NC_015964	AACC	2	8	2310	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	345428592
38	NC_015964	TTC	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428592
39	NC_015964	CAT	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428592
40	NC_015964	GGC	2	6	2492	2497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428592
41	NC_015964	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
42	NC_015964	AGA	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428592
43	NC_015964	ATTT	2	8	2604	2611	25 %	75 %	0 %	0 %	345428592
44	NC_015964	ACCG	2	8	2615	2622	25 %	0 %	25 %	50 %	345428592
45	NC_015964	TGA	2	6	2634	2639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
46	NC_015964	AT	3	6	2671	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	345428592
47	NC_015964	ATT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428592
48	NC_015964	A	6	6	2735	2740	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
49	NC_015964	AGA	2	6	2779	2784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428592
50	NC_015964	A	6	6	2792	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
51	NC_015964	ATT	2	6	2846	2851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428592
52	NC_015964	GAA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428592
53	NC_015964	CT	3	6	2927	2932	0 %	50 %	0 %	50 %	345428592
54	NC_015964	ATT	2	6	3014	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428592
55	NC_015964	CAA	3	9	3034	3042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428592
56	NC_015964	A	6	6	3066	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
57	NC_015964	CTA	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428593
58	NC_015964	T	6	6	3187	3192	0 %	100 %	0 %	0 %	345428593
59	NC_015964	CAA	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428593
60	NC_015964	ACC	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428593
61	NC_015964	GGTT	2	8	3330	3337	0 %	50 %	50 %	0 %	345428593
62	NC_015964	TCT	2	6	3368	3373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428593
63	NC_015964	TAA	2	6	3382	3387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428593
64	NC_015964	TGC	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428593
65	NC_015964	T	6	6	3583	3588	0 %	100 %	0 %	0 %	345428593
66	NC_015964	AGT	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428593
67	NC_015964	ACC	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428593
68	NC_015964	TGG	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428593
69	NC_015964	TTA	2	6	3821	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428593
70	NC_015964	GCA	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428593
71	NC_015964	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428593
72	NC_015964	GAA	2	6	3946	3951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428593
73	NC_015964	GCA	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428593
74	NC_015964	TCA	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
75	NC_015964	TCT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
76	NC_015964	CCAA	2	8	4383	4390	50 %	0 %	0 %	50 %	345428594
77	NC_015964	AAT	2	6	4428	4433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
78	NC_015964	CTT	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
79	NC_015964	AGT	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428594
80	NC_015964	TCT	2	6	4510	4515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
81	NC_015964	CCA	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428594
82	NC_015964	T	6	6	4584	4589	0 %	100 %	0 %	0 %	345428594
83	NC_015964	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
84	NC_015964	T	7	7	4687	4693	0 %	100 %	0 %	0 %	345428594
85	NC_015964	TAA	2	6	4695	4700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
86	NC_015964	AAACG	2	10	4702	4711	60 %	0 %	20 %	20 %	345428594
87	NC_015964	CACGCA	2	12	4715	4726	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345428594
88	NC_015964	TCA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
89	NC_015964	ACA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428594
90	NC_015964	TCA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
91	NC_015964	TCG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428594
92	NC_015964	AG	3	6	4899	4904	50 %	0 %	50 %	0 %	345428594
93	NC_015964	TAC	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
94	NC_015964	TTC	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
95	NC_015964	CCA	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428594
96	NC_015964	AAT	2	6	5104	5109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
97	NC_015964	A	6	6	5159	5164	100 %	0 %	0 %	0 %	345428594
98	NC_015964	TAA	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
99	NC_015964	TTA	2	6	5272	5277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428594
100	NC_015964	TAA	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
101	NC_015964	TTA	2	6	5344	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428594
102	NC_015964	GA	4	8	5385	5392	50 %	0 %	50 %	0 %	345428594
103	NC_015964	AAT	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
104	NC_015964	TAA	2	6	5450	5455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
105	NC_015964	CAA	2	6	5508	5513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428595
106	NC_015964	ATC	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428595
107	NC_015964	ATG	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428596
108	NC_015964	ATT	2	6	6523	6528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428596
109	NC_015964	TA	4	8	6580	6587	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
110	NC_015964	AATT	2	8	6657	6664	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
111	NC_015964	AAG	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428596
112	NC_015964	AT	3	6	6724	6729	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
113	NC_015964	A	6	6	6740	6745	100 %	0 %	0 %	0 %	345428596
114	NC_015964	ATA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428596
115	NC_015964	A	8	8	6864	6871	100 %	0 %	0 %	0 %	345428596
116	NC_015964	ATT	2	6	6912	6917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428596
117	NC_015964	A	7	7	6924	6930	100 %	0 %	0 %	0 %	345428596
118	NC_015964	AAT	2	6	6940	6945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428596
119	NC_015964	TGA	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428596
120	NC_015964	AAG	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428596
121	NC_015964	TGA	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428596
122	NC_015964	AT	3	6	7065	7070	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
123	NC_015964	A	6	6	7095	7100	100 %	0 %	0 %	0 %	345428596
124	NC_015964	AT	3	6	7108	7113	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
125	NC_015964	GAA	2	6	7118	7123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428596
126	NC_015964	AATT	2	8	7198	7205	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
127	NC_015964	AGAAAG	2	12	7255	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428596
128	NC_015964	ATT	3	9	7309	7317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428596
129	NC_015964	TTA	2	6	7332	7337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428596
130	NC_015964	CAT	2	6	7417	7422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428596
131	NC_015964	TCAT	2	8	7519	7526	25 %	50 %	0 %	25 %	345428596
132	NC_015964	GAATAG	2	12	7529	7540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345428596
133	NC_015964	CAT	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428597
134	NC_015964	CTC	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345428597
135	NC_015964	CCG	2	6	7660	7665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428597
136	NC_015964	AATT	2	8	7669	7676	50 %	50 %	0 %	0 %	345428597
137	NC_015964	GCA	2	6	7701	7706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428597
138	NC_015964	CA	3	6	7754	7759	50 %	0 %	0 %	50 %	345428597
139	NC_015964	AATG	2	8	7838	7845	50 %	25 %	25 %	0 %	345428597
140	NC_015964	TGA	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428597
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142	NC_015964	TGT	2	6	8107	8112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428597
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260	NC_015964	GGT	2	6	15210	15215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428602
261	NC_015964	GTA	2	6	15219	15224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428602
262	NC_015964	CTT	2	6	15245	15250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428602
263	NC_015964	GAT	2	6	15266	15271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428602
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265	NC_015964	A	7	7	15285	15291	100 %	0 %	0 %	0 %	345428602
266	NC_015964	A	6	6	15353	15358	100 %	0 %	0 %	0 %	345428603
267	NC_015964	T	6	6	15368	15373	0 %	100 %	0 %	0 %	345428603
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389	NC_015964	TAA	4	12	22603	22614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
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391	NC_015964	ACC	2	6	22690	22695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428611
392	NC_015964	AT	3	6	22721	22726	50 %	50 %	0 %	0 %	345428611
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394	NC_015964	AGA	2	6	22918	22923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428611
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