MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 38109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015964	ACT	2	6	51931	51936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428640
1002	NC_015964	GAA	3	9	51946	51954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428640
1003	NC_015964	AGA	2	6	51969	51974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428640
1004	NC_015964	GTT	3	9	51979	51987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428640
1005	NC_015964	TGT	2	6	52000	52005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428640
1006	NC_015964	GAAA	2	8	52050	52057	75 %	0 %	25 %	0 %	345428640
1007	NC_015964	AGT	2	6	52063	52068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428640
1008	NC_015964	ATT	2	6	52099	52104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428640
1009	NC_015964	T	6	6	52103	52108	0 %	100 %	0 %	0 %	345428641
1010	NC_015964	TTA	3	9	52116	52124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428641
1011	NC_015964	CGG	2	6	52133	52138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428641
1012	NC_015964	TTAA	2	8	52314	52321	50 %	50 %	0 %	0 %	345428641
1013	NC_015964	TACGAT	2	12	52494	52505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345428642
1014	NC_015964	T	6	6	52525	52530	0 %	100 %	0 %	0 %	345428642
1015	NC_015964	ATT	2	6	52564	52569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428642
1016	NC_015964	TGCG	2	8	52572	52579	0 %	25 %	50 %	25 %	345428642
1017	NC_015964	TGCT	2	8	52599	52606	0 %	50 %	25 %	25 %	345428642
1018	NC_015964	GTT	2	6	52614	52619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428642
1019	NC_015964	GA	3	6	52665	52670	50 %	0 %	50 %	0 %	345428642
1020	NC_015964	ACG	3	9	52729	52737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428643
1021	NC_015964	GTG	2	6	53268	53273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428644
1022	NC_015964	TCA	2	6	53333	53338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428644
1023	NC_015964	AAG	2	6	53386	53391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428644
1024	NC_015964	ATC	2	6	53443	53448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428644
1025	NC_015964	ATTT	2	8	53521	53528	25 %	75 %	0 %	0 %	345428644
1026	NC_015964	TTG	2	6	53536	53541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428644
1027	NC_015964	AACC	2	8	53602	53609	50 %	0 %	0 %	50 %	345428644
1028	NC_015964	TTA	2	6	53658	53663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428644
1029	NC_015964	ATA	2	6	53764	53769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428644
1030	NC_015964	A	6	6	53784	53789	100 %	0 %	0 %	0 %	345428644
1031	NC_015964	ATT	2	6	53810	53815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428644
1032	NC_015964	GAT	2	6	53820	53825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428644
1033	NC_015964	TTC	2	6	53832	53837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428644
1034	NC_015964	AGAAAA	2	12	53840	53851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	345428644
1035	NC_015964	A	6	6	53848	53853	100 %	0 %	0 %	0 %	345428644
1036	NC_015964	AAG	2	6	53857	53862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428644
1037	NC_015964	TTC	2	6	53865	53870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428644
1038	NC_015964	AAT	2	6	53880	53885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428644
1039	NC_015964	ATT	2	6	53907	53912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428644
1040	NC_015964	A	6	6	53944	53949	100 %	0 %	0 %	0 %	345428644
1041	NC_015964	GAA	2	6	53952	53957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428644
1042	NC_015964	ACC	2	6	54002	54007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428644
1043	NC_015964	A	6	6	54039	54044	100 %	0 %	0 %	0 %	345428644
1044	NC_015964	GAA	2	6	54048	54053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428644
1045	NC_015964	CAT	2	6	54054	54059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428644
1046	NC_015964	AGA	2	6	54071	54076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428644
1047	NC_015964	GGT	2	6	54168	54173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428644
1048	NC_015964	ATTGAT	2	12	54177	54188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345428644
1049	NC_015964	CAG	2	6	54467	54472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428644
1050	NC_015964	AAG	2	6	54478	54483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428644
1051	NC_015964	ATG	2	6	54526	54531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428645
1052	NC_015964	CTA	2	6	54556	54561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428645
1053	NC_015964	TTA	2	6	54628	54633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428645
1054	NC_015964	TCT	2	6	54706	54711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428645
1055	NC_015964	A	6	6	54745	54750	100 %	0 %	0 %	0 %	345428645
1056	NC_015964	GAA	2	6	54805	54810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428645
1057	NC_015964	ACT	2	6	54853	54858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428645
1058	NC_015964	GAA	2	6	54868	54873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428645
1059	NC_015964	TACG	2	8	55028	55035	25 %	25 %	25 %	25 %	345428645
1060	NC_015964	TTA	2	6	55144	55149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428645
1061	NC_015964	AAT	2	6	55189	55194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428645
1062	NC_015964	CGT	2	6	55261	55266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428645
1063	NC_015964	TCGTA	2	10	55287	55296	20 %	40 %	20 %	20 %	345428645
1064	NC_015964	GCGT	2	8	55367	55374	0 %	25 %	50 %	25 %	345428645
1065	NC_015964	AGA	2	6	55434	55439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428645
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1072	NC_015964	TTA	2	6	55749	55754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428646
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1074	NC_015964	CAT	2	6	55811	55816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428646
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1098	NC_015964	AACG	2	8	57158	57165	50 %	0 %	25 %	25 %	345428647
1099	NC_015964	AAT	2	6	57195	57200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428647
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1104	NC_015964	A	6	6	57457	57462	100 %	0 %	0 %	0 %	345428647
1105	NC_015964	AT	3	6	57490	57495	50 %	50 %	0 %	0 %	345428647
1106	NC_015964	T	6	6	57513	57518	0 %	100 %	0 %	0 %	345428647
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1109	NC_015964	AT	3	6	57841	57846	50 %	50 %	0 %	0 %	345428647
1110	NC_015964	ACC	2	6	57859	57864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428647
1111	NC_015964	TTAA	2	8	57907	57914	50 %	50 %	0 %	0 %	345428647
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1247	NC_015964	AAT	2	6	65496	65501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428656
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1251	NC_015964	GCC	2	6	65830	65835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428656
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