MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 38109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015964	CCA	2	6	28588	28593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428619
502	NC_015964	GTTCTT	2	12	28611	28622	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	345428619
503	NC_015964	TAAAAT	2	12	28655	28666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428620
504	NC_015964	TCAA	2	8	28682	28689	50 %	25 %	0 %	25 %	345428620
505	NC_015964	TGC	2	6	28709	28714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428620
506	NC_015964	CTG	2	6	28716	28721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428620
507	NC_015964	AAGT	2	8	28726	28733	50 %	25 %	25 %	0 %	345428620
508	NC_015964	ATT	2	6	28750	28755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428620
509	NC_015964	T	6	6	28822	28827	0 %	100 %	0 %	0 %	345428620
510	NC_015964	ACC	2	6	28834	28839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428620
511	NC_015964	TGCAA	2	10	28842	28851	40 %	20 %	20 %	20 %	345428620
512	NC_015964	AAC	2	6	28933	28938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428620
513	NC_015964	CTT	2	6	28980	28985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428620
514	NC_015964	CTG	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428620
515	NC_015964	ACC	2	6	29044	29049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428620
516	NC_015964	CCA	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428620
517	NC_015964	TAT	2	6	29139	29144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428620
518	NC_015964	TCA	2	6	29240	29245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428620
519	NC_015964	AAT	2	6	29258	29263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428620
520	NC_015964	GC	3	6	29268	29273	0 %	0 %	50 %	50 %	345428620
521	NC_015964	T	6	6	29327	29332	0 %	100 %	0 %	0 %	345428620
522	NC_015964	TTCT	2	8	29341	29348	0 %	75 %	0 %	25 %	345428620
523	NC_015964	CTT	2	6	29349	29354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428620
524	NC_015964	AAT	2	6	29497	29502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428620
525	NC_015964	TGA	2	6	29555	29560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428620
526	NC_015964	GTT	2	6	29625	29630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428620
527	NC_015964	TTG	2	6	29633	29638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428620
528	NC_015964	GCA	2	6	29660	29665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428620
529	NC_015964	CA	3	6	29668	29673	50 %	0 %	0 %	50 %	345428620
530	NC_015964	TCA	2	6	29708	29713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428620
531	NC_015964	ACA	2	6	29744	29749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428620
532	NC_015964	AAT	2	6	29777	29782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428620
533	NC_015964	GCT	2	6	29827	29832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428620
534	NC_015964	TCAT	2	8	29894	29901	25 %	50 %	0 %	25 %	345428620
535	NC_015964	T	6	6	29921	29926	0 %	100 %	0 %	0 %	345428620
536	NC_015964	AAT	2	6	29944	29949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428621
537	NC_015964	T	6	6	29954	29959	0 %	100 %	0 %	0 %	345428621
538	NC_015964	TTG	2	6	29965	29970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428621
539	NC_015964	AAT	2	6	30007	30012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428621
540	NC_015964	CGT	2	6	30015	30020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428621
541	NC_015964	ATA	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428621
542	NC_015964	TTA	2	6	30071	30076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428621
543	NC_015964	CA	3	6	30127	30132	50 %	0 %	0 %	50 %	345428621
544	NC_015964	AAT	2	6	30136	30141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428621
545	NC_015964	TAA	2	6	30159	30164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428621
546	NC_015964	TCT	2	6	30167	30172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428621
547	NC_015964	GTT	2	6	30177	30182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428621
548	NC_015964	TCT	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428621
549	NC_015964	CGG	2	6	30318	30323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428621
550	NC_015964	AAC	2	6	30362	30367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428621
551	NC_015964	CG	3	6	30668	30673	0 %	0 %	50 %	50 %	345428621
552	NC_015964	CCA	2	6	30792	30797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428621
553	NC_015964	CGG	2	6	30837	30842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428621
554	NC_015964	GGTA	2	8	30850	30857	25 %	25 %	50 %	0 %	345428621
555	NC_015964	CAC	2	6	30972	30977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428621
556	NC_015964	ACG	2	6	31015	31020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428621
557	NC_015964	TAG	2	6	31026	31031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428621
558	NC_015964	CTG	2	6	31038	31043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428621
559	NC_015964	AATTTA	2	12	31079	31090	50 %	50 %	0 %	0 %	345428622
560	NC_015964	TGT	2	6	31306	31311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428622
561	NC_015964	TGT	2	6	31372	31377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428622
562	NC_015964	ATTT	2	8	31482	31489	25 %	75 %	0 %	0 %	345428622
563	NC_015964	CAG	2	6	31515	31520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428622
564	NC_015964	ATT	2	6	31525	31530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428622
565	NC_015964	TGT	2	6	31531	31536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428622
566	NC_015964	TTACTG	2	12	31584	31595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	345428622
567	NC_015964	CTG	2	6	31626	31631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428622
568	NC_015964	T	6	6	31632	31637	0 %	100 %	0 %	0 %	345428622
569	NC_015964	TTC	2	6	31672	31677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428622
570	NC_015964	CCA	3	9	31699	31707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428622
571	NC_015964	AAT	2	6	31738	31743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428622
572	NC_015964	CG	3	6	31801	31806	0 %	0 %	50 %	50 %	345428622
573	NC_015964	T	7	7	31931	31937	0 %	100 %	0 %	0 %	345428622
574	NC_015964	ATT	2	6	31948	31953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428622
575	NC_015964	AG	3	6	32056	32061	50 %	0 %	50 %	0 %	345428622
576	NC_015964	T	6	6	32067	32072	0 %	100 %	0 %	0 %	345428622
577	NC_015964	CGA	2	6	32082	32087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428622
578	NC_015964	ATT	2	6	32172	32177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428623
579	NC_015964	TTG	2	6	32236	32241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428623
580	NC_015964	GTTT	2	8	32252	32259	0 %	75 %	25 %	0 %	345428623
581	NC_015964	TGA	2	6	32303	32308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428623
582	NC_015964	TAA	2	6	32309	32314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428623
583	NC_015964	A	6	6	32378	32383	100 %	0 %	0 %	0 %	345428623
584	NC_015964	GTT	2	6	32392	32397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428623
585	NC_015964	GCTT	2	8	32444	32451	0 %	50 %	25 %	25 %	345428623
586	NC_015964	ATA	2	6	32509	32514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428623
587	NC_015964	TCA	2	6	32519	32524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428623
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589	NC_015964	CG	3	6	32601	32606	0 %	0 %	50 %	50 %	345428623
590	NC_015964	GCT	2	6	32612	32617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428623
591	NC_015964	TGT	2	6	32618	32623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428623
592	NC_015964	TTA	2	6	32624	32629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428623
593	NC_015964	A	6	6	32661	32666	100 %	0 %	0 %	0 %	345428623
594	NC_015964	AGC	2	6	32881	32886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428624
595	NC_015964	ATC	2	6	32893	32898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428624
596	NC_015964	T	6	6	32946	32951	0 %	100 %	0 %	0 %	345428624
597	NC_015964	T	6	6	33041	33046	0 %	100 %	0 %	0 %	345428624
598	NC_015964	CAT	2	6	33081	33086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428624
599	NC_015964	TAA	2	6	33097	33102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428624
600	NC_015964	T	6	6	33190	33195	0 %	100 %	0 %	0 %	345428624
601	NC_015964	TCA	2	6	33212	33217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428624
602	NC_015964	GTGAA	2	10	33238	33247	40 %	20 %	40 %	0 %	345428624
603	NC_015964	CGT	2	6	33323	33328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428624
604	NC_015964	ATC	2	6	33349	33354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428624
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606	NC_015964	ACCCAT	2	12	33406	33417	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345428624
607	NC_015964	CAC	2	6	33421	33426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428624
608	NC_015964	TGCTG	2	10	33533	33542	0 %	40 %	40 %	20 %	345428624
609	NC_015964	GAA	2	6	33581	33586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428624
610	NC_015964	CG	3	6	33598	33603	0 %	0 %	50 %	50 %	345428624
611	NC_015964	TTG	2	6	33634	33639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428624
612	NC_015964	GTT	2	6	33684	33689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428624
613	NC_015964	T	6	6	33745	33750	0 %	100 %	0 %	0 %	345428624
614	NC_015964	A	6	6	33847	33852	100 %	0 %	0 %	0 %	345428624
615	NC_015964	CTG	2	6	33862	33867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428624
616	NC_015964	T	6	6	33893	33898	0 %	100 %	0 %	0 %	345428624
617	NC_015964	GTT	2	6	33921	33926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428624
618	NC_015964	A	7	7	34240	34246	100 %	0 %	0 %	0 %	345428625
619	NC_015964	TTCT	2	8	34248	34255	0 %	75 %	0 %	25 %	345428625
620	NC_015964	AAT	2	6	34406	34411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428625
621	NC_015964	GAC	2	6	34442	34447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428625
622	NC_015964	GATTAC	2	12	34448	34459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345428625
623	NC_015964	CA	3	6	34468	34473	50 %	0 %	0 %	50 %	345428625
624	NC_015964	ATT	2	6	34513	34518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428625
625	NC_015964	TGC	2	6	34549	34554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428625
626	NC_015964	A	6	6	34602	34607	100 %	0 %	0 %	0 %	345428625
627	NC_015964	TGAA	2	8	34608	34615	50 %	25 %	25 %	0 %	345428625
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629	NC_015964	TTCA	2	8	34769	34776	25 %	50 %	0 %	25 %	345428625
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