MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 9351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	CGA	2	6	44	49	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006828
2	NC_015955	TCA	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
3	NC_015955	ATC	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
4	NC_015955	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006828
5	NC_015955	TGC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006828
6	NC_015955	TCA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
7	NC_015955	GTG	2	6	560	565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006828
8	NC_015955	TGA	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006828
9	NC_015955	CAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006828
10	NC_015955	TTC	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
11	NC_015955	GAA	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006829
12	NC_015955	AGC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006829
13	NC_015955	TTA	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006829
14	NC_015955	TAG	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006829
15	NC_015955	TGC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006829
16	NC_015955	ATA	2	6	1813	1818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
17	NC_015955	GAT	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006829
18	NC_015955	CTT	2	6	1853	1858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
19	NC_015955	TTG	2	6	1880	1885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006829
20	NC_015955	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
21	NC_015955	AAT	2	6	2052	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
22	NC_015955	TCT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
23	NC_015955	TTC	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006830
24	NC_015955	AAT	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006830
25	NC_015955	TCA	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006830
26	NC_015955	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006830
27	NC_015955	TAG	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006830
28	NC_015955	CTT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006830
29	NC_015955	ATG	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006831
30	NC_015955	TTC	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006831
31	NC_015955	CAG	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006831
32	NC_015955	CGA	3	9	3448	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
33	NC_015955	CGC	2	6	3547	3552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
34	NC_015955	CAG	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
35	NC_015955	CGC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
36	NC_015955	ACC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006832
37	NC_015955	CCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
38	NC_015955	GAC	3	9	3986	3994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
39	NC_015955	CCG	2	6	4035	4040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
40	NC_015955	CTG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006832
41	NC_015955	GCC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
42	NC_015955	GAT	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006832
43	NC_015955	GAC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
44	NC_015955	GTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006832
45	NC_015955	CGA	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
46	NC_015955	ACC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006832
47	NC_015955	TCT	2	6	4257	4262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006832
48	NC_015955	CGA	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
49	NC_015955	GAA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006832
50	NC_015955	GGA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006832
51	NC_015955	AGA	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006832
52	NC_015955	CGG	2	6	4457	4462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006832
53	NC_015955	CAG	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
54	NC_015955	TAC	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006832
55	NC_015955	CGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
56	NC_015955	TCT	2	6	4778	4783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006833
57	NC_015955	CAT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006833
58	NC_015955	GCG	2	6	4997	5002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006833
59	NC_015955	CAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006833
60	NC_015955	GTT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006833
61	NC_015955	GAG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006833
62	NC_015955	CAA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006833
63	NC_015955	CCG	2	6	5387	5392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006833
64	NC_015955	TTC	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006833
65	NC_015955	AAT	2	6	5494	5499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006833
66	NC_015955	CCA	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006834
67	NC_015955	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006834
68	NC_015955	CGA	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006834
69	NC_015955	TTG	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006835
70	NC_015955	TTA	2	6	6252	6257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006835
71	NC_015955	TAA	2	6	6346	6351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006835
72	NC_015955	CCA	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006835
73	NC_015955	CTC	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
74	NC_015955	CAA	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006835
75	NC_015955	CTC	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
76	NC_015955	ACA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006835
77	NC_015955	GAA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
78	NC_015955	AGA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
79	NC_015955	GCC	2	6	6852	6857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006835
80	NC_015955	TCC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
81	NC_015955	CTA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
82	NC_015955	TCG	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006835
83	NC_015955	GCG	2	6	7125	7130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006835
84	NC_015955	CAC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006835
85	NC_015955	ATA	2	6	7203	7208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006835
86	NC_015955	CAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
87	NC_015955	GCC	2	6	7316	7321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006835
88	NC_015955	TTC	2	6	7349	7354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006835
89	NC_015955	AGA	2	6	7411	7416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
90	NC_015955	GTA	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006835
91	NC_015955	ACG	2	6	7467	7472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006835
92	NC_015955	ACG	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006835
93	NC_015955	ACT	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
94	NC_015955	ACT	2	6	7747	7752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
95	NC_015955	GAT	2	6	8204	8209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006836
96	NC_015955	ACT	2	6	8279	8284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006836
97	NC_015955	TCA	2	6	8306	8311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006836
98	NC_015955	TAC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006836
99	NC_015955	CAG	2	6	8489	8494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006836
100	NC_015955	AAG	2	6	8544	8549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006836
101	NC_015955	GAT	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006836
102	NC_015955	AAC	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006836
103	NC_015955	TGT	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006836
104	NC_015955	AGA	2	6	8875	8880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006836
105	NC_015955	TGA	2	6	9132	9137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006837
106	NC_015955	GAA	2	6	9184	9189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
107	NC_015955	TTG	2	6	9307	9312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006837
108	NC_015955	CAA	2	6	9368	9373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006837
109	NC_015955	GCT	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006837
110	NC_015955	CAA	2	6	9609	9614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006837
111	NC_015955	AAG	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
112	NC_015955	GAA	2	6	9694	9699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
113	NC_015955	TCA	2	6	9731	9736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006837
114	NC_015955	AAG	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
115	NC_015955	TGA	3	9	9957	9965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006837
116	NC_015955	AAG	2	6	9991	9996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
117	NC_015955	GTG	2	6	10055	10060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006837
118	NC_015955	AAT	2	6	10062	10067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006837
119	NC_015955	CTT	2	6	10072	10077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006837
120	NC_015955	ATT	2	6	10420	10425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006838
121	NC_015955	CCT	2	6	10514	10519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006838
122	NC_015955	TGC	2	6	10592	10597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006838
123	NC_015955	AGA	2	6	10655	10660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006838
124	NC_015955	TTC	2	6	10842	10847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006839
125	NC_015955	TGA	2	6	10850	10855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006839
126	NC_015955	AGG	2	6	10879	10884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006839
127	NC_015955	TCA	2	6	10918	10923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006839
128	NC_015955	ACT	2	6	11046	11051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006839
129	NC_015955	TGC	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006839
130	NC_015955	CGG	2	6	11200	11205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006839
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251	NC_015955	CTA	2	6	19510	19515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006842
252	NC_015955	GAC	2	6	19645	19650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006842
253	NC_015955	TCG	2	6	19716	19721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006842
254	NC_015955	GAC	2	6	19820	19825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006842
255	NC_015955	GTG	2	6	19968	19973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006842
256	NC_015955	GAT	2	6	20018	20023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006842
257	NC_015955	GGC	3	9	20045	20053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006842
258	NC_015955	GGT	2	6	20069	20074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006842
259	NC_015955	GGT	2	6	20096	20101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006842
260	NC_015955	AGA	2	6	20223	20228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006842
261	NC_015955	CAG	2	6	20257	20262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006842
262	NC_015955	GTC	3	9	20273	20281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006842
263	NC_015955	TAA	2	6	20544	20549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006842
264	NC_015955	TTG	2	6	20646	20651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006842
265	NC_015955	AAG	2	6	20667	20672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006842
266	NC_015955	GTA	3	9	20732	20740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006843
267	NC_015955	CGG	2	6	20745	20750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006843
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269	NC_015955	GGA	2	6	20994	20999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006843
270	NC_015955	ATG	2	6	21065	21070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006843
271	NC_015955	TAT	2	6	21250	21255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006843
272	NC_015955	ATT	2	6	21326	21331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006843
273	NC_015955	AGA	2	6	21379	21384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006844
274	NC_015955	TGG	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006844
275	NC_015955	CTG	3	9	21489	21497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006844
276	NC_015955	ACG	2	6	21543	21548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006844
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278	NC_015955	ATA	2	6	21729	21734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006844
279	NC_015955	GGT	2	6	21788	21793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006844
280	NC_015955	GAG	2	6	21962	21967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006844
281	NC_015955	TAC	2	6	21977	21982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006844
282	NC_015955	TGG	2	6	22079	22084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006844
283	NC_015955	GTT	2	6	22247	22252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006844
284	NC_015955	ATG	2	6	22263	22268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006844
285	NC_015955	ATT	2	6	22432	22437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006844
286	NC_015955	ATG	2	6	22706	22711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006844
287	NC_015955	ATT	2	6	22722	22727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006844
288	NC_015955	AAT	2	6	22751	22756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006844
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290	NC_015955	TCA	2	6	22873	22878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006844
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375	NC_015955	ATC	2	6	31267	31272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006848
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377	NC_015955	CAT	2	6	31321	31326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006848
378	NC_015955	GGA	2	6	31399	31404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006848
379	NC_015955	GAA	2	6	31602	31607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006849
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381	NC_015955	CAT	2	6	31664	31669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006849
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386	NC_015955	GCA	2	6	31937	31942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006850
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402	NC_015955	TCA	2	6	33639	33644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006851
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499	NC_015955	TCG	2	6	40130	40135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006859
500	NC_015955	GAT	2	6	40167	40172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006859

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