MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015955	CGTG	2	8	196299	196306	0 %	25 %	50 %	25 %	345006992
3502	NC_015955	CGC	2	6	196392	196397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006992
3503	NC_015955	ACG	2	6	196841	196846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006993
3504	NC_015955	ACAGT	2	10	196847	196856	40 %	20 %	20 %	20 %	345006993
3505	NC_015955	GAC	2	6	196897	196902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006993
3506	NC_015955	AAAC	2	8	196904	196911	75 %	0 %	0 %	25 %	345006993
3507	NC_015955	CGCGT	2	10	196958	196967	0 %	20 %	40 %	40 %	345006993
3508	NC_015955	ACGCT	2	10	197029	197038	20 %	20 %	20 %	40 %	345006993
3509	NC_015955	CG	3	6	197191	197196	0 %	0 %	50 %	50 %	345006993
3510	NC_015955	CAA	2	6	197238	197243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006993
3511	NC_015955	CG	3	6	197303	197308	0 %	0 %	50 %	50 %	345006993
3512	NC_015955	GT	3	6	197355	197360	0 %	50 %	50 %	0 %	345006993
3513	NC_015955	GGA	2	6	197361	197366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006993
3514	NC_015955	GCTCC	2	10	197412	197421	0 %	20 %	20 %	60 %	345006993
3515	NC_015955	ACAA	2	8	197647	197654	75 %	0 %	0 %	25 %	345006994
3516	NC_015955	CAG	2	6	197668	197673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006994
3517	NC_015955	GCACAG	2	12	197682	197693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006994
3518	NC_015955	GAC	2	6	197699	197704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006994
3519	NC_015955	CTCA	2	8	197806	197813	25 %	25 %	0 %	50 %	345006994
3520	NC_015955	TGA	2	6	197896	197901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006994
3521	NC_015955	GCG	2	6	197947	197952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006994
3522	NC_015955	AGT	2	6	197974	197979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006994
3523	NC_015955	CGA	2	6	197989	197994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006994
3524	NC_015955	TGAC	2	8	198125	198132	25 %	25 %	25 %	25 %	345006995
3525	NC_015955	GTA	2	6	198208	198213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006995
3526	NC_015955	TCG	2	6	198808	198813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006996
3527	NC_015955	GT	3	6	198844	198849	0 %	50 %	50 %	0 %	345006996
3528	NC_015955	TCG	2	6	198850	198855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006996
3529	NC_015955	TTCT	2	8	198875	198882	0 %	75 %	0 %	25 %	345006996
3530	NC_015955	GTC	2	6	198915	198920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006996
3531	NC_015955	CGT	2	6	198971	198976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006996
3532	NC_015955	GTT	2	6	199065	199070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006996
3533	NC_015955	CGT	2	6	199167	199172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006997
3534	NC_015955	GTA	2	6	199173	199178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006997
3535	NC_015955	TCC	2	6	199193	199198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006997
3536	NC_015955	ACGG	2	8	199211	199218	25 %	0 %	50 %	25 %	345006997
3537	NC_015955	GGCAT	2	10	199226	199235	20 %	20 %	40 %	20 %	345006997
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3539	NC_015955	GTT	2	6	199440	199445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006997
3540	NC_015955	GCC	2	6	199467	199472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006998
3541	NC_015955	A	6	6	199501	199506	100 %	0 %	0 %	0 %	345006998
3542	NC_015955	GAT	2	6	199617	199622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006998
3543	NC_015955	TCG	2	6	199673	199678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006998
3544	NC_015955	ACGGAG	2	12	199693	199704	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345006998
3545	NC_015955	AAG	2	6	199708	199713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006998
3546	NC_015955	G	6	6	199798	199803	0 %	0 %	100 %	0 %	345006998
3547	NC_015955	TGG	3	9	199909	199917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006998
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3549	NC_015955	CTCG	2	8	200000	200007	0 %	25 %	25 %	50 %	345006998
3550	NC_015955	GAAA	2	8	200058	200065	75 %	0 %	25 %	0 %	345006998
3551	NC_015955	TCG	2	6	200160	200165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006999
3552	NC_015955	GTA	2	6	200177	200182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006999
3553	NC_015955	CTG	2	6	200236	200241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006999
3554	NC_015955	CCG	2	6	200372	200377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006999
3555	NC_015955	TCT	2	6	200428	200433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006999
3556	NC_015955	CT	3	6	200441	200446	0 %	50 %	0 %	50 %	345006999
3557	NC_015955	CG	3	6	200451	200456	0 %	0 %	50 %	50 %	345006999
3558	NC_015955	CGC	2	6	200471	200476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006999
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3561	NC_015955	TCG	2	6	200529	200534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006999
3562	NC_015955	TGG	2	6	200634	200639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006999
3563	NC_015955	TCG	2	6	200649	200654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006999
3564	NC_015955	GAC	2	6	200690	200695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006999
3565	NC_015955	CGTCG	2	10	200696	200705	0 %	20 %	40 %	40 %	345006999
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3569	NC_015955	CGG	2	6	200794	200799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006999
3570	NC_015955	GTC	3	9	200840	200848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006999
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3572	NC_015955	CGG	2	6	200952	200957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006999
3573	NC_015955	TGG	2	6	200962	200967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006999
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3580	NC_015955	CGCGA	2	10	202160	202169	20 %	0 %	40 %	40 %	345007000
3581	NC_015955	AT	3	6	202298	202303	50 %	50 %	0 %	0 %	345007000
3582	NC_015955	TA	3	6	202429	202434	50 %	50 %	0 %	0 %	345007001
3583	NC_015955	GTC	2	6	202440	202445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007001
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3587	NC_015955	CCT	2	6	202625	202630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007001
3588	NC_015955	TC	3	6	202649	202654	0 %	50 %	0 %	50 %	345007001
3589	NC_015955	TC	4	8	202855	202862	0 %	50 %	0 %	50 %	345007002
3590	NC_015955	CGA	2	6	202908	202913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007002
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3592	NC_015955	CAC	2	6	202935	202940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007002
3593	NC_015955	CGA	2	6	203013	203018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007002
3594	NC_015955	TC	4	8	203036	203043	0 %	50 %	0 %	50 %	345007002
3595	NC_015955	ACC	2	6	203072	203077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007002
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3598	NC_015955	CGG	2	6	203191	203196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007002
3599	NC_015955	TAC	2	6	203197	203202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007002
3600	NC_015955	GA	3	6	203208	203213	50 %	0 %	50 %	0 %	345007002
3601	NC_015955	CAC	2	6	203291	203296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007002
3602	NC_015955	CGC	2	6	203336	203341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007002
3603	NC_015955	GAC	2	6	203343	203348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007002
3604	NC_015955	CGTT	2	8	203375	203382	0 %	50 %	25 %	25 %	345007002
3605	NC_015955	GCG	2	6	203407	203412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007002
3606	NC_015955	TC	3	6	203500	203505	0 %	50 %	0 %	50 %	345007002
3607	NC_015955	CCA	2	6	203546	203551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007002
3608	NC_015955	ACA	2	6	203614	203619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007002
3609	NC_015955	CGA	2	6	203652	203657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007002
3610	NC_015955	GAC	2	6	203658	203663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007002
3611	NC_015955	CGACG	2	10	203727	203736	20 %	0 %	40 %	40 %	345007002
3612	NC_015955	CGAC	2	8	203768	203775	25 %	0 %	25 %	50 %	345007002
3613	NC_015955	GAG	2	6	203812	203817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007002
3614	NC_015955	ACC	3	9	203894	203902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007002
3615	NC_015955	GC	3	6	203936	203941	0 %	0 %	50 %	50 %	345007002
3616	NC_015955	TCG	2	6	203942	203947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007002
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3618	NC_015955	ATCG	2	8	203996	204003	25 %	25 %	25 %	25 %	345007002
3619	NC_015955	TC	3	6	204023	204028	0 %	50 %	0 %	50 %	345007002
3620	NC_015955	GAC	2	6	204187	204192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007002
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3622	NC_015955	GGGT	2	8	204250	204257	0 %	25 %	75 %	0 %	345007002
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3743	NC_015955	GAA	2	6	211659	211664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007009
3744	NC_015955	TGGA	2	8	211683	211690	25 %	25 %	50 %	0 %	345007009
3745	NC_015955	CGA	2	6	211712	211717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007009
3746	NC_015955	CGG	2	6	211767	211772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007009
3747	NC_015955	GATG	2	8	211799	211806	25 %	25 %	50 %	0 %	345007009
3748	NC_015955	GTT	2	6	211814	211819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007009
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3833	NC_015955	GAGC	2	8	220781	220788	25 %	0 %	50 %	25 %	345007015
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3852	NC_015955	ATC	2	6	222847	222852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007016
3853	NC_015955	GCGTTC	2	12	222925	222936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007016
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3859	NC_015955	GTTC	2	8	223095	223102	0 %	50 %	25 %	25 %	345007016
3860	NC_015955	TC	3	6	223113	223118	0 %	50 %	0 %	50 %	345007016
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3862	NC_015955	CTTG	2	8	223560	223567	0 %	50 %	25 %	25 %	345007016
3863	NC_015955	GTC	2	6	223570	223575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007016
3864	NC_015955	GAC	2	6	223585	223590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007016
3865	NC_015955	TCA	3	9	223691	223699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007016
3866	NC_015955	TC	3	6	223723	223728	0 %	50 %	0 %	50 %	345007016
3867	NC_015955	TCA	2	6	223790	223795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007016
3868	NC_015955	TCC	2	6	223982	223987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007016
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3870	NC_015955	TCACC	2	10	224001	224010	20 %	20 %	0 %	60 %	345007016
3871	NC_015955	CGG	2	6	224118	224123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007016
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3874	NC_015955	TCT	2	6	224204	224209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007016
3875	NC_015955	AAG	2	6	224221	224226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007016
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3877	NC_015955	CATC	2	8	224385	224392	25 %	25 %	0 %	50 %	345007016
3878	NC_015955	GCA	2	6	224400	224405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007016
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3880	NC_015955	GCC	2	6	224426	224431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007016
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3883	NC_015955	GCT	2	6	224601	224606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007016
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3885	NC_015955	GTT	2	6	224764	224769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007016
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3892	NC_015955	TCA	2	6	224985	224990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007016
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3969	NC_015955	CGGG	2	8	230679	230686	0 %	0 %	75 %	25 %	345007020
3970	NC_015955	GAT	2	6	230689	230694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007020
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3973	NC_015955	GTT	2	6	230791	230796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007020
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3977	NC_015955	CAGG	2	8	230962	230969	25 %	0 %	50 %	25 %	345007020
3978	NC_015955	TGA	2	6	231006	231011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007020
3979	NC_015955	GGC	2	6	231020	231025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007020
3980	NC_015955	AC	3	6	231029	231034	50 %	0 %	0 %	50 %	345007020
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3982	NC_015955	GTG	2	6	231136	231141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007020
3983	NC_015955	GGTTCG	2	12	231161	231172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345007020
3984	NC_015955	CCGG	2	8	231186	231193	0 %	0 %	50 %	50 %	345007020
3985	NC_015955	TGA	2	6	231198	231203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007020
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3987	NC_015955	GAC	2	6	231290	231295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007021
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