MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015955	CTC	2	6	170242	170247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006965
3002	NC_015955	GAACG	2	10	170299	170308	40 %	0 %	40 %	20 %	345006965
3003	NC_015955	CTTCGA	2	12	170328	170339	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006965
3004	NC_015955	CGA	3	9	170337	170345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006965
3005	NC_015955	ATC	2	6	170350	170355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006965
3006	NC_015955	AAT	2	6	170378	170383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006965
3007	NC_015955	CTG	2	6	170393	170398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006966
3008	NC_015955	CTC	2	6	170489	170494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006966
3009	NC_015955	CAT	2	6	170512	170517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006966
3010	NC_015955	TGA	2	6	170562	170567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006966
3011	NC_015955	TCA	2	6	170580	170585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006966
3012	NC_015955	TCG	2	6	170815	170820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3013	NC_015955	CGTC	2	8	170843	170850	0 %	25 %	25 %	50 %	345006967
3014	NC_015955	TCG	2	6	170900	170905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3015	NC_015955	ACG	2	6	170986	170991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3016	NC_015955	CGAC	2	8	171047	171054	25 %	0 %	25 %	50 %	345006967
3017	NC_015955	CTG	2	6	171066	171071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3018	NC_015955	ATG	2	6	171094	171099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006967
3019	NC_015955	ACA	2	6	171119	171124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006967
3020	NC_015955	CTGA	2	8	171150	171157	25 %	25 %	25 %	25 %	345006967
3021	NC_015955	CCCGAA	2	12	171168	171179	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345006967
3022	NC_015955	CGG	2	6	171202	171207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006967
3023	NC_015955	CG	3	6	171223	171228	0 %	0 %	50 %	50 %	345006967
3024	NC_015955	CTC	2	6	171255	171260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006967
3025	NC_015955	A	6	6	171269	171274	100 %	0 %	0 %	0 %	345006967
3026	NC_015955	GATC	2	8	171281	171288	25 %	25 %	25 %	25 %	345006967
3027	NC_015955	CGT	2	6	171290	171295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3028	NC_015955	CG	3	6	171302	171307	0 %	0 %	50 %	50 %	345006967
3029	NC_015955	CGC	2	6	171309	171314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006967
3030	NC_015955	AGC	2	6	171340	171345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3031	NC_015955	CTG	2	6	171360	171365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3032	NC_015955	AACA	2	8	171450	171457	75 %	0 %	0 %	25 %	345006967
3033	NC_015955	TGA	2	6	171542	171547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006967
3034	NC_015955	GCG	2	6	171554	171559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006967
3035	NC_015955	TCG	2	6	171574	171579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3036	NC_015955	CGGGAT	2	12	171669	171680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345006967
3037	NC_015955	TCG	2	6	171688	171693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3038	NC_015955	TGA	2	6	171698	171703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006967
3039	NC_015955	CGT	2	6	171725	171730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3040	NC_015955	GT	3	6	171776	171781	0 %	50 %	50 %	0 %	345006967
3041	NC_015955	GCCG	2	8	171826	171833	0 %	0 %	50 %	50 %	345006967
3042	NC_015955	CAT	2	6	171834	171839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006967
3043	NC_015955	CTC	2	6	171840	171845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006967
3044	NC_015955	CGC	2	6	171909	171914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006967
3045	NC_015955	ATCG	2	8	171921	171928	25 %	25 %	25 %	25 %	345006967
3046	NC_015955	GCA	2	6	172016	172021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3047	NC_015955	CGG	2	6	172040	172045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006967
3048	NC_015955	TCG	2	6	172108	172113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3049	NC_015955	TCC	2	6	172156	172161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006967
3050	NC_015955	CGAG	2	8	172261	172268	25 %	0 %	50 %	25 %	345006967
3051	NC_015955	CGA	2	6	172307	172312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3052	NC_015955	GAACTC	2	12	172350	172361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345006967
3053	NC_015955	GTC	2	6	172368	172373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3054	NC_015955	CG	3	6	172424	172429	0 %	0 %	50 %	50 %	345006967
3055	NC_015955	CGG	2	6	172434	172439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006967
3056	NC_015955	GTC	2	6	172455	172460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006967
3057	NC_015955	TCT	2	6	172510	172515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006968
3058	NC_015955	CGA	2	6	172516	172521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006968
3059	NC_015955	GCGTCC	2	12	172533	172544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345006968
3060	NC_015955	GTA	2	6	172622	172627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006968
3061	NC_015955	CGT	2	6	172645	172650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006968
3062	NC_015955	GTC	2	6	172697	172702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006968
3063	NC_015955	GCC	2	6	172757	172762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006968
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3065	NC_015955	GAG	2	6	172817	172822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006968
3066	NC_015955	GAAC	2	8	172864	172871	50 %	0 %	25 %	25 %	345006968
3067	NC_015955	CGA	2	6	172924	172929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006968
3068	NC_015955	ACG	2	6	172944	172949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006968
3069	NC_015955	ACTCGT	2	12	173008	173019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006968
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3071	NC_015955	GTCG	2	8	173114	173121	0 %	25 %	50 %	25 %	345006968
3072	NC_015955	TTG	2	6	173156	173161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006968
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3077	NC_015955	ACG	2	6	173368	173373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006969
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3090	NC_015955	GTA	2	6	173754	173759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006969
3091	NC_015955	ACG	2	6	173795	173800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006969
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3102	NC_015955	TCC	2	6	173989	173994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006969
3103	NC_015955	CAC	2	6	174028	174033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006969
3104	NC_015955	CCG	2	6	174095	174100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006969
3105	NC_015955	AC	3	6	174110	174115	50 %	0 %	0 %	50 %	345006969
3106	NC_015955	TCA	2	6	174250	174255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006969
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3108	NC_015955	CGA	2	6	174323	174328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006969
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3110	NC_015955	GCT	2	6	174380	174385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006969
3111	NC_015955	TCG	2	6	174438	174443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006970
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3114	NC_015955	CAC	2	6	174506	174511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006970
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3117	NC_015955	TCT	2	6	174667	174672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006970
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3119	NC_015955	TCGG	2	8	174756	174763	0 %	25 %	50 %	25 %	345006970
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3228	NC_015955	ATG	2	6	180021	180026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006972
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3231	NC_015955	TTGTC	2	10	180124	180133	0 %	60 %	20 %	20 %	345006972
3232	NC_015955	GTT	2	6	180213	180218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006972
3233	NC_015955	CGA	2	6	180505	180510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006972
3234	NC_015955	AAC	2	6	180514	180519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006972
3235	NC_015955	TGA	2	6	180539	180544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006972
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3237	NC_015955	T	7	7	180578	180584	0 %	100 %	0 %	0 %	345006972
3238	NC_015955	TGA	2	6	180668	180673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006972
3239	NC_015955	CCG	2	6	180735	180740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006972
3240	NC_015955	CGC	2	6	180771	180776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006972
3241	NC_015955	GCC	2	6	180822	180827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006972
3242	NC_015955	AAC	2	6	180834	180839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006972
3243	NC_015955	AGC	2	6	180916	180921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006972
3244	NC_015955	ATC	2	6	180945	180950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006972
3245	NC_015955	ATC	2	6	180982	180987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006972
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3252	NC_015955	GACC	2	8	181449	181456	25 %	0 %	25 %	50 %	345006973
3253	NC_015955	CGAT	2	8	181482	181489	25 %	25 %	25 %	25 %	345006973
3254	NC_015955	TCG	2	6	181553	181558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006973
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3267	NC_015955	GATCG	2	10	182261	182270	20 %	20 %	40 %	20 %	345006973
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3301	NC_015955	TTTCG	2	10	184517	184526	0 %	60 %	20 %	20 %	345006974
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3333	NC_015955	GAC	3	9	186391	186399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006976
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3337	NC_015955	CAAT	2	8	186510	186517	50 %	25 %	0 %	25 %	345006976
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3348	NC_015955	GCA	2	6	187096	187101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006978
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3353	NC_015955	CAA	2	6	187333	187338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006978
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3359	NC_015955	ACGAT	2	10	187631	187640	40 %	20 %	20 %	20 %	345006979
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3479	NC_015955	AGGT	2	8	194979	194986	25 %	25 %	50 %	0 %	345006991
3480	NC_015955	GTG	2	6	194990	194995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006991
3481	NC_015955	TCG	2	6	195527	195532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006992
3482	NC_015955	CGT	2	6	195538	195543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006992
3483	NC_015955	GAG	2	6	195559	195564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006992
3484	NC_015955	TCC	2	6	195572	195577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006992
3485	NC_015955	TGG	2	6	195588	195593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006992
3486	NC_015955	GC	3	6	195642	195647	0 %	0 %	50 %	50 %	345006992
3487	NC_015955	CGC	3	9	195675	195683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006992
3488	NC_015955	TCC	2	6	195707	195712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006992
3489	NC_015955	CGT	2	6	195732	195737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006992
3490	NC_015955	GAC	2	6	195760	195765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006992
3491	NC_015955	CGA	2	6	195825	195830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006992
3492	NC_015955	GTC	3	9	195880	195888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006992
3493	NC_015955	GTG	2	6	195952	195957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006992
3494	NC_015955	GTC	2	6	196003	196008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006992
3495	NC_015955	CGG	2	6	196143	196148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006992
3496	NC_015955	TCA	2	6	196149	196154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006992
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3499	NC_015955	CGA	2	6	196233	196238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006992
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