MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015955	CGT	2	6	138375	138380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006942
2502	NC_015955	CGG	2	6	138414	138419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006942
2503	NC_015955	GAG	2	6	138434	138439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006942
2504	NC_015955	GGCA	2	8	138486	138493	25 %	0 %	50 %	25 %	345006942
2505	NC_015955	TCCA	2	8	138548	138555	25 %	25 %	0 %	50 %	345006942
2506	NC_015955	T	6	6	138565	138570	0 %	100 %	0 %	0 %	345006942
2507	NC_015955	AG	3	6	138583	138588	50 %	0 %	50 %	0 %	345006942
2508	NC_015955	AAG	2	6	138665	138670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006942
2509	NC_015955	TAC	2	6	138706	138711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006942
2510	NC_015955	CAGT	2	8	138755	138762	25 %	25 %	25 %	25 %	345006942
2511	NC_015955	CGCCAT	2	12	138786	138797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345006942
2512	NC_015955	ACC	2	6	138800	138805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006942
2513	NC_015955	GGA	2	6	138831	138836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006942
2514	NC_015955	TTC	2	6	138842	138847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006942
2515	NC_015955	TGA	2	6	138972	138977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006942
2516	NC_015955	AGC	2	6	138999	139004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006942
2517	NC_015955	GAA	2	6	139018	139023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006942
2518	NC_015955	CAA	3	9	139036	139044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006942
2519	NC_015955	GAA	2	6	139149	139154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006942
2520	NC_015955	GA	3	6	139322	139327	50 %	0 %	50 %	0 %	345006942
2521	NC_015955	TCA	2	6	139417	139422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006942
2522	NC_015955	GT	3	6	139430	139435	0 %	50 %	50 %	0 %	345006942
2523	NC_015955	TTC	2	6	139494	139499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006942
2524	NC_015955	ATC	2	6	139570	139575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006943
2525	NC_015955	ATG	2	6	139583	139588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006943
2526	NC_015955	TCA	2	6	139595	139600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006943
2527	NC_015955	CCA	2	6	139811	139816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006943
2528	NC_015955	TCC	2	6	139856	139861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006943
2529	NC_015955	T	6	6	139882	139887	0 %	100 %	0 %	0 %	345006943
2530	NC_015955	TGC	2	6	140032	140037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006943
2531	NC_015955	ACG	2	6	140116	140121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006943
2532	NC_015955	ATC	2	6	140140	140145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006943
2533	NC_015955	CTC	2	6	140161	140166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006943
2534	NC_015955	T	6	6	140358	140363	0 %	100 %	0 %	0 %	345006943
2535	NC_015955	ACC	2	6	140377	140382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006943
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2538	NC_015955	TCG	2	6	140540	140545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006943
2539	NC_015955	CA	3	6	140584	140589	50 %	0 %	0 %	50 %	345006943
2540	NC_015955	ACC	2	6	140591	140596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006943
2541	NC_015955	TC	3	6	141006	141011	0 %	50 %	0 %	50 %	345006944
2542	NC_015955	TGT	2	6	141074	141079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006944
2543	NC_015955	CTT	2	6	141103	141108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006944
2544	NC_015955	GCA	2	6	141152	141157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006944
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2546	NC_015955	CGT	2	6	141297	141302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006944
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2549	NC_015955	GTC	2	6	141441	141446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006944
2550	NC_015955	CCT	2	6	141453	141458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006944
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2553	NC_015955	GCT	2	6	141584	141589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006945
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2555	NC_015955	TCT	2	6	141706	141711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006945
2556	NC_015955	GGA	2	6	141713	141718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006945
2557	NC_015955	GTT	2	6	141759	141764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006945
2558	NC_015955	ATC	2	6	141798	141803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006945
2559	NC_015955	GACT	2	8	141849	141856	25 %	25 %	25 %	25 %	345006945
2560	NC_015955	TCA	2	6	141919	141924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006945
2561	NC_015955	TCG	2	6	141943	141948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006945
2562	NC_015955	CCGTC	2	10	141971	141980	0 %	20 %	20 %	60 %	345006945
2563	NC_015955	CAA	2	6	141992	141997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006945
2564	NC_015955	CGCT	2	8	142000	142007	0 %	25 %	25 %	50 %	345006945
2565	NC_015955	AGC	2	6	142135	142140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006945
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2567	NC_015955	TCG	2	6	142225	142230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006945
2568	NC_015955	CGGAA	2	10	142255	142264	40 %	0 %	40 %	20 %	345006945
2569	NC_015955	TCT	2	6	142346	142351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006945
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2573	NC_015955	TCG	2	6	142644	142649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006945
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2578	NC_015955	TCG	2	6	144799	144804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006946
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2585	NC_015955	GCT	2	6	145262	145267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006946
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2587	NC_015955	GTAC	2	8	145426	145433	25 %	25 %	25 %	25 %	345006946
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2592	NC_015955	GCT	2	6	145613	145618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006946
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2594	NC_015955	GGCG	2	8	145695	145702	0 %	0 %	75 %	25 %	345006946
2595	NC_015955	TGG	3	9	145710	145718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006946
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2600	NC_015955	ATCC	2	8	146925	146932	25 %	25 %	0 %	50 %	345006947
2601	NC_015955	CAT	2	6	146938	146943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006947
2602	NC_015955	CGC	2	6	147080	147085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006947
2603	NC_015955	TTC	2	6	147127	147132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006947
2604	NC_015955	TGAG	2	8	147162	147169	25 %	25 %	50 %	0 %	345006947
2605	NC_015955	ATC	2	6	147197	147202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006947
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2607	NC_015955	CGT	2	6	147388	147393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006947
2608	NC_015955	CAC	2	6	147472	147477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006947
2609	NC_015955	ACG	2	6	147482	147487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006947
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2614	NC_015955	GAC	2	6	147793	147798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006948
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2620	NC_015955	CTT	2	6	148093	148098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006948
2621	NC_015955	ACGG	2	8	148115	148122	25 %	0 %	50 %	25 %	345006948
2622	NC_015955	TTCC	2	8	148174	148181	0 %	50 %	0 %	50 %	345006948
2623	NC_015955	CGA	2	6	148182	148187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006948
2624	NC_015955	GAA	2	6	148198	148203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006948
2625	NC_015955	CGG	2	6	148227	148232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006948
2626	NC_015955	TAC	2	6	148240	148245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006948
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2628	NC_015955	TCC	2	6	148340	148345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006948
2629	NC_015955	GAACT	2	10	148346	148355	40 %	20 %	20 %	20 %	345006948
2630	NC_015955	GAC	2	6	148407	148412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006948
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2634	NC_015955	TGG	2	6	148753	148758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006948
2635	NC_015955	CGT	2	6	148779	148784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006948
2636	NC_015955	TGC	2	6	148878	148883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006948
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2639	NC_015955	TGA	2	6	148986	148991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006948
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2641	NC_015955	CCCT	2	8	149745	149752	0 %	25 %	0 %	75 %	345006949
2642	NC_015955	ATC	2	6	149769	149774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006949
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2646	NC_015955	TCG	2	6	149920	149925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006949
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2651	NC_015955	GTC	2	6	150182	150187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006949
2652	NC_015955	AGG	2	6	150570	150575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006950
2653	NC_015955	CTG	2	6	150605	150610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006950
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2673	NC_015955	CGGA	2	8	151763	151770	25 %	0 %	50 %	25 %	345006951
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2734	NC_015955	GAC	3	9	154570	154578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006953
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2738	NC_015955	C	6	6	154643	154648	0 %	0 %	0 %	100 %	345006953
2739	NC_015955	CA	3	6	154683	154688	50 %	0 %	0 %	50 %	345006953
2740	NC_015955	CGA	2	6	154722	154727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006953
2741	NC_015955	ATC	2	6	154804	154809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006953
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2744	NC_015955	CGA	2	6	154929	154934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006953
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2843	NC_015955	TAGAT	2	10	159912	159921	40 %	40 %	20 %	0 %	345006958
2844	NC_015955	ATC	2	6	160067	160072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006959
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2846	NC_015955	GAGT	2	8	160302	160309	25 %	25 %	50 %	0 %	345006959
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2853	NC_015955	GACGC	2	10	161470	161479	20 %	0 %	40 %	40 %	345006961
2854	NC_015955	GAG	2	6	161480	161485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006961
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2857	NC_015955	TGCG	2	8	161678	161685	0 %	25 %	50 %	25 %	345006961
2858	NC_015955	CAT	2	6	161699	161704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006961
2859	NC_015955	CGTACT	2	12	161746	161757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006961
2860	NC_015955	TCCA	2	8	161873	161880	25 %	25 %	0 %	50 %	345006961
2861	NC_015955	TCT	2	6	161926	161931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006961
2862	NC_015955	TCG	2	6	161955	161960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006961
2863	NC_015955	CGC	2	6	161961	161966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006961
2864	NC_015955	TCG	2	6	162027	162032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006961
2865	NC_015955	CGAA	2	8	162039	162046	50 %	0 %	25 %	25 %	345006961
2866	NC_015955	TCTG	2	8	162101	162108	0 %	50 %	25 %	25 %	345006961
2867	NC_015955	CGA	2	6	162187	162192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006961
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2883	NC_015955	TCG	2	6	163444	163449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006962
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2891	NC_015955	GCTTC	2	10	163751	163760	0 %	40 %	20 %	40 %	345006962
2892	NC_015955	GAG	2	6	163854	163859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006962
2893	NC_015955	TGA	2	6	163910	163915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006962
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2968	NC_015955	TCG	2	6	167899	167904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006963
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2973	NC_015955	CA	3	6	168239	168244	50 %	0 %	0 %	50 %	345006963
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2981	NC_015955	TCC	2	6	168820	168825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006963
2982	NC_015955	TCT	2	6	168952	168957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006963
2983	NC_015955	TCG	2	6	168991	168996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006963
2984	NC_015955	CGC	2	6	169438	169443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006964
2985	NC_015955	TCG	2	6	169566	169571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006964
2986	NC_015955	ACG	2	6	169572	169577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006964
2987	NC_015955	CGA	2	6	169579	169584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006964
2988	NC_015955	GGA	2	6	169592	169597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006964
2989	NC_015955	AAG	2	6	169605	169610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006964
2990	NC_015955	ACG	2	6	169678	169683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006964
2991	NC_015955	TGG	2	6	169760	169765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006964
2992	NC_015955	GAAC	2	8	169855	169862	50 %	0 %	25 %	25 %	345006965
2993	NC_015955	CGA	2	6	169878	169883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006965
2994	NC_015955	AGA	2	6	169923	169928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006965
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2999	NC_015955	GGC	2	6	170167	170172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006965
3000	NC_015955	ACT	2	6	170186	170191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006965

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