MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015955	TCA	2	6	109536	109541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006914
2002	NC_015955	TCG	2	6	109542	109547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006914
2003	NC_015955	CGA	2	6	109551	109556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006914
2004	NC_015955	TC	3	6	109615	109620	0 %	50 %	0 %	50 %	345006914
2005	NC_015955	GAC	2	6	109655	109660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006914
2006	NC_015955	TC	3	6	109721	109726	0 %	50 %	0 %	50 %	345006914
2007	NC_015955	ACG	2	6	109962	109967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006915
2008	NC_015955	CACGA	2	10	109976	109985	40 %	0 %	20 %	40 %	345006915
2009	NC_015955	AGA	2	6	109990	109995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006915
2010	NC_015955	CGGC	2	8	110219	110226	0 %	0 %	50 %	50 %	345006916
2011	NC_015955	CGA	2	6	110228	110233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2012	NC_015955	GCACG	2	10	110243	110252	20 %	0 %	40 %	40 %	345006916
2013	NC_015955	CCAG	2	8	110258	110265	25 %	0 %	25 %	50 %	345006916
2014	NC_015955	GAC	2	6	110280	110285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2015	NC_015955	CGG	2	6	110341	110346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006916
2016	NC_015955	CGGA	2	8	110396	110403	25 %	0 %	50 %	25 %	345006916
2017	NC_015955	GAC	2	6	110448	110453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2018	NC_015955	TCG	2	6	110563	110568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2019	NC_015955	CACG	2	8	110594	110601	25 %	0 %	25 %	50 %	345006916
2020	NC_015955	TGGC	2	8	110647	110654	0 %	25 %	50 %	25 %	345006916
2021	NC_015955	GAG	2	6	110718	110723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006916
2022	NC_015955	CGCT	2	8	110743	110750	0 %	25 %	25 %	50 %	345006916
2023	NC_015955	CGT	2	6	110789	110794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2024	NC_015955	TCG	2	6	110827	110832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2025	NC_015955	CGG	2	6	110860	110865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006916
2026	NC_015955	GATACG	2	12	110880	110891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345006916
2027	NC_015955	GC	3	6	110920	110925	0 %	0 %	50 %	50 %	345006916
2028	NC_015955	CGA	2	6	110969	110974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2029	NC_015955	CGA	2	6	110978	110983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006916
2030	NC_015955	GTC	2	6	111341	111346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006917
2031	NC_015955	TCG	2	6	111401	111406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006917
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2033	NC_015955	CGCC	2	8	111450	111457	0 %	0 %	25 %	75 %	345006917
2034	NC_015955	CGG	2	6	111459	111464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006917
2035	NC_015955	CAC	3	9	111521	111529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006917
2036	NC_015955	CAG	2	6	111533	111538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006917
2037	NC_015955	GTTGTC	2	12	111558	111569	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006917
2038	NC_015955	AGT	2	6	111622	111627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006917
2039	NC_015955	GTG	2	6	111643	111648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006917
2040	NC_015955	GCG	2	6	111669	111674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006917
2041	NC_015955	GTAC	2	8	111719	111726	25 %	25 %	25 %	25 %	345006917
2042	NC_015955	GAT	2	6	111848	111853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006917
2043	NC_015955	AGC	2	6	111885	111890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006917
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2045	NC_015955	ACT	2	6	111986	111991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006917
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2048	NC_015955	GTC	2	6	112124	112129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006917
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2055	NC_015955	TCG	2	6	112626	112631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006918
2056	NC_015955	GTC	2	6	112812	112817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006918
2057	NC_015955	GTC	3	9	112903	112911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006918
2058	NC_015955	GAT	2	6	112923	112928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006918
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2061	NC_015955	TCG	2	6	113057	113062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006918
2062	NC_015955	GAA	2	6	113063	113068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006918
2063	NC_015955	GA	3	6	113077	113082	50 %	0 %	50 %	0 %	345006918
2064	NC_015955	CA	3	6	113098	113103	50 %	0 %	0 %	50 %	345006918
2065	NC_015955	CGA	2	6	113173	113178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006918
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2069	NC_015955	GAG	2	6	113296	113301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006918
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2092	NC_015955	CGA	2	6	115425	115430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006922
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2102	NC_015955	TC	3	6	115919	115924	0 %	50 %	0 %	50 %	345006923
2103	NC_015955	G	6	6	116012	116017	0 %	0 %	100 %	0 %	345006923
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2120	NC_015955	AGG	2	6	117034	117039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006925
2121	NC_015955	TAG	2	6	117061	117066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006925
2122	NC_015955	GA	3	6	117082	117087	50 %	0 %	50 %	0 %	345006925
2123	NC_015955	CGGT	2	8	117169	117176	0 %	25 %	50 %	25 %	345006925
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2225	NC_015955	TCGA	2	8	124035	124042	25 %	25 %	25 %	25 %	345006931
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2233	NC_015955	GAT	2	6	124281	124286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006931
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2235	NC_015955	A	6	6	124370	124375	100 %	0 %	0 %	0 %	345006931
2236	NC_015955	AAG	2	6	124383	124388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006931
2237	NC_015955	ATAGA	2	10	124423	124432	60 %	20 %	20 %	0 %	345006931
2238	NC_015955	GA	3	6	124431	124436	50 %	0 %	50 %	0 %	345006931
2239	NC_015955	CTCACA	2	12	124500	124511	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345006931
2240	NC_015955	AACG	2	8	124525	124532	50 %	0 %	25 %	25 %	345006931
2241	NC_015955	GAA	2	6	124679	124684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006931
2242	NC_015955	GTTGA	2	10	124686	124695	20 %	40 %	40 %	0 %	345006931
2243	NC_015955	CCA	2	6	124856	124861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006931
2244	NC_015955	GAA	2	6	124917	124922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006931
2245	NC_015955	CGA	2	6	125058	125063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006931
2246	NC_015955	AGC	2	6	125096	125101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006931
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2248	NC_015955	A	6	6	125186	125191	100 %	0 %	0 %	0 %	345006931
2249	NC_015955	AAG	2	6	125218	125223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006931
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2251	NC_015955	ACT	2	6	125272	125277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006931
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2254	NC_015955	TGA	2	6	125404	125409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006931
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2258	NC_015955	TGA	2	6	125489	125494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006931
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2264	NC_015955	GAAACA	2	12	125673	125684	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	345006931
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2270	NC_015955	GAC	2	6	125853	125858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006931
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2357	NC_015955	CGT	2	6	129948	129953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006936
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2359	NC_015955	CGG	2	6	130062	130067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006936
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2361	NC_015955	CATTCT	2	12	130197	130208	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345006936
2362	NC_015955	GAA	2	6	130227	130232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006936
2363	NC_015955	CAGTC	2	10	130272	130281	20 %	20 %	20 %	40 %	345006936
2364	NC_015955	GAT	2	6	130322	130327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006936
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2366	NC_015955	CTT	2	6	130386	130391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006936
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2370	NC_015955	CATT	2	8	130640	130647	25 %	50 %	0 %	25 %	345006936
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2467	NC_015955	GAG	2	6	136410	136415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006940
2468	NC_015955	AGT	2	6	136419	136424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006940
2469	NC_015955	AGT	2	6	136444	136449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006940
2470	NC_015955	CA	3	6	136628	136633	50 %	0 %	0 %	50 %	345006941
2471	NC_015955	TGC	2	6	136802	136807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006941
2472	NC_015955	GATG	2	8	136826	136833	25 %	25 %	50 %	0 %	345006941
2473	NC_015955	GAT	2	6	136886	136891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006941
2474	NC_015955	TCCTCA	2	12	136930	136941	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345006941
2475	NC_015955	ACG	3	9	137014	137022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006941
2476	NC_015955	CAT	2	6	137051	137056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006941
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2478	NC_015955	TTC	2	6	137208	137213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006941
2479	NC_015955	GAAC	2	8	137234	137241	50 %	0 %	25 %	25 %	345006941
2480	NC_015955	CGT	2	6	137258	137263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006941
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2482	NC_015955	TGA	2	6	137380	137385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006941
2483	NC_015955	CGGAC	2	10	137422	137431	20 %	0 %	40 %	40 %	345006941
2484	NC_015955	AC	3	6	137437	137442	50 %	0 %	0 %	50 %	345006941
2485	NC_015955	AGG	2	6	137557	137562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006941
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