MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015955	CGA	2	6	51258	51263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1002	NC_015955	CGT	2	6	51273	51278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1003	NC_015955	CTA	2	6	51384	51389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006866
1004	NC_015955	CGA	2	6	51489	51494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1005	NC_015955	GAC	2	6	51499	51504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1006	NC_015955	CTC	2	6	51511	51516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006866
1007	NC_015955	CGC	2	6	51537	51542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006866
1008	NC_015955	GAG	2	6	51637	51642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006866
1009	NC_015955	CCT	2	6	51681	51686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006866
1010	NC_015955	ACG	2	6	51710	51715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1011	NC_015955	CCT	3	9	51741	51749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006866
1012	NC_015955	CGT	2	6	51777	51782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1013	NC_015955	CCG	2	6	51792	51797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006866
1014	NC_015955	CGCC	2	8	51804	51811	0 %	0 %	25 %	75 %	345006866
1015	NC_015955	TCGG	2	8	51879	51886	0 %	25 %	50 %	25 %	345006866
1016	NC_015955	CGA	2	6	51903	51908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1017	NC_015955	CGA	3	9	51929	51937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1018	NC_015955	CGT	2	6	52025	52030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1019	NC_015955	ACG	2	6	52063	52068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1020	NC_015955	CGG	2	6	52084	52089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006867
1021	NC_015955	CGC	2	6	52115	52120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006867
1022	NC_015955	GAG	2	6	52122	52127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006867
1023	NC_015955	TCG	2	6	52132	52137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1024	NC_015955	TG	3	6	52182	52187	0 %	50 %	50 %	0 %	345006867
1025	NC_015955	CAA	2	6	52262	52267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006867
1026	NC_015955	CTCA	2	8	52274	52281	25 %	25 %	0 %	50 %	345006867
1027	NC_015955	CT	3	6	52301	52306	0 %	50 %	0 %	50 %	345006867
1028	NC_015955	CAG	2	6	52308	52313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1029	NC_015955	GGC	2	6	52436	52441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006867
1030	NC_015955	ACA	2	6	52525	52530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006867
1031	NC_015955	CGGT	2	8	52543	52550	0 %	25 %	50 %	25 %	345006867
1032	NC_015955	AAG	2	6	52593	52598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006867
1033	NC_015955	AAG	2	6	52612	52617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006867
1034	NC_015955	CGA	2	6	52628	52633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1035	NC_015955	ACC	2	6	52650	52655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006867
1036	NC_015955	TCC	2	6	52756	52761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006867
1037	NC_015955	GAC	2	6	52785	52790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1038	NC_015955	ACG	2	6	52849	52854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1039	NC_015955	GAC	2	6	52860	52865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1040	NC_015955	AGT	2	6	52902	52907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006867
1041	NC_015955	GGA	2	6	53069	53074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006867
1042	NC_015955	GAA	2	6	53087	53092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006867
1043	NC_015955	CAG	2	6	53156	53161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1044	NC_015955	CGA	2	6	53165	53170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1045	NC_015955	ACG	2	6	53215	53220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1046	NC_015955	ACG	2	6	53302	53307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006867
1047	NC_015955	GAG	2	6	53397	53402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006867
1048	NC_015955	TCAT	2	8	53695	53702	25 %	50 %	0 %	25 %	345006868
1049	NC_015955	GGA	2	6	53714	53719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006868
1050	NC_015955	AGG	2	6	53747	53752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006868
1051	NC_015955	CAGT	2	8	53777	53784	25 %	25 %	25 %	25 %	345006868
1052	NC_015955	CGGG	2	8	53794	53801	0 %	0 %	75 %	25 %	345006868
1053	NC_015955	GA	3	6	53834	53839	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
1054	NC_015955	GGA	2	6	53901	53906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006868
1055	NC_015955	CAC	2	6	53953	53958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006868
1056	NC_015955	TGA	2	6	54000	54005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006868
1057	NC_015955	GAAG	2	8	54021	54028	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
1058	NC_015955	GA	3	6	54035	54040	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
1059	NC_015955	AGCGCT	2	12	54058	54069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1060	NC_015955	GGC	3	9	54082	54090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006868
1061	NC_015955	C	6	6	54111	54116	0 %	0 %	0 %	100 %	345006868
1062	NC_015955	AGAT	2	8	54129	54136	50 %	25 %	25 %	0 %	345006868
1063	NC_015955	AT	3	6	54141	54146	50 %	50 %	0 %	0 %	345006868
1064	NC_015955	TGA	2	6	54207	54212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006868
1065	NC_015955	TGACGA	2	12	54225	54236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345006868
1066	NC_015955	GAA	2	6	54237	54242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006868
1067	NC_015955	TGA	2	6	54383	54388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006868
1068	NC_015955	CCAT	2	8	54447	54454	25 %	25 %	0 %	50 %	345006868
1069	NC_015955	ACT	2	6	54455	54460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006868
1070	NC_015955	CGC	3	9	54489	54497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006868
1071	NC_015955	TCC	2	6	54578	54583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006868
1072	NC_015955	CCG	2	6	54669	54674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006868
1073	NC_015955	GTT	2	6	54675	54680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006868
1074	NC_015955	CAA	2	6	54690	54695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006868
1075	NC_015955	CAAGA	2	10	54709	54718	60 %	0 %	20 %	20 %	345006868
1076	NC_015955	GAC	2	6	54735	54740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
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1083	NC_015955	GAT	2	6	55048	55053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006868
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1085	NC_015955	CGA	2	6	55125	55130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
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1087	NC_015955	AAC	2	6	55154	55159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006868
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1091	NC_015955	CGG	2	6	55322	55327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006868
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1093	NC_015955	CCA	2	6	55386	55391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006868
1094	NC_015955	CAC	2	6	55484	55489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006868
1095	NC_015955	GCA	2	6	55512	55517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
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1098	NC_015955	ACG	2	6	55802	55807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1099	NC_015955	CAT	2	6	55829	55834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006868
1100	NC_015955	CCG	2	6	55860	55865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006868
1101	NC_015955	TCAG	2	8	55883	55890	25 %	25 %	25 %	25 %	345006868
1102	NC_015955	AGGAG	2	10	55929	55938	40 %	0 %	60 %	0 %	345006868
1103	NC_015955	ACG	2	6	55946	55951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1104	NC_015955	ATA	2	6	55955	55960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006868
1105	NC_015955	CT	3	6	56001	56006	0 %	50 %	0 %	50 %	345006868
1106	NC_015955	CGA	3	9	56007	56015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1107	NC_015955	CAG	2	6	56017	56022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1108	NC_015955	AG	3	6	56062	56067	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
1109	NC_015955	CAG	2	6	56197	56202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
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1111	NC_015955	GTG	2	6	56279	56284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006868
1112	NC_015955	GGA	2	6	56307	56312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006868
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1114	NC_015955	ACC	2	6	56373	56378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006868
1115	NC_015955	GAT	3	9	56401	56409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006868
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1117	NC_015955	CAGT	2	8	56628	56635	25 %	25 %	25 %	25 %	345006868
1118	NC_015955	CAGAC	2	10	56690	56699	40 %	0 %	20 %	40 %	345006868
1119	NC_015955	AGGA	2	8	56710	56717	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
1120	NC_015955	GGTC	2	8	56760	56767	0 %	25 %	50 %	25 %	345006868
1121	NC_015955	AGA	2	6	56778	56783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006868
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1125	NC_015955	GGCA	2	8	56983	56990	25 %	0 %	50 %	25 %	345006868
1126	NC_015955	GCA	2	6	57007	57012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1127	NC_015955	GAC	2	6	57040	57045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1128	NC_015955	TGA	2	6	57198	57203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006868
1129	NC_015955	GGAT	2	8	57205	57212	25 %	25 %	50 %	0 %	345006868
1130	NC_015955	CGA	2	6	57221	57226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1131	NC_015955	CGA	2	6	57276	57281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
1132	NC_015955	ATG	2	6	57310	57315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006868
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1238	NC_015955	GACT	2	8	63360	63367	25 %	25 %	25 %	25 %	345006878
1239	NC_015955	TCC	2	6	63403	63408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006878
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1243	NC_015955	CA	3	6	63539	63544	50 %	0 %	0 %	50 %	345006878
1244	NC_015955	AGCG	3	12	63600	63611	25 %	0 %	50 %	25 %	345006878
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1493	NC_015955	GGT	2	6	76900	76905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006895
1494	NC_015955	ACC	2	6	76922	76927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006895
1495	NC_015955	GTC	3	9	76955	76963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1496	NC_015955	GGACGA	2	12	76976	76987	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345006895
1497	NC_015955	CTG	2	6	77093	77098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1498	NC_015955	CGA	2	6	77120	77125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006895
1499	NC_015955	CGG	2	6	77128	77133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006895
1500	NC_015955	TCG	2	6	77149	77154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006895

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