MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015955	AGG	2	6	306156	306161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007082
5502	NC_015955	CGA	2	6	306163	306168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007082
5503	NC_015955	GTG	2	6	306190	306195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007082
5504	NC_015955	ACC	2	6	306197	306202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007082
5505	NC_015955	GCT	2	6	306277	306282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007082
5506	NC_015955	CCG	2	6	306291	306296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007082
5507	NC_015955	GTC	2	6	306314	306319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007082
5508	NC_015955	CA	3	6	306330	306335	50 %	0 %	0 %	50 %	345007082
5509	NC_015955	GAC	2	6	306341	306346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007082
5510	NC_015955	CGA	2	6	306379	306384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007082
5511	NC_015955	TGCACA	2	12	306433	306444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007082
5512	NC_015955	CCCG	2	8	306458	306465	0 %	0 %	25 %	75 %	345007082
5513	NC_015955	GC	3	6	306502	306507	0 %	0 %	50 %	50 %	345007082
5514	NC_015955	CGC	2	6	306616	306621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007082
5515	NC_015955	CGC	2	6	306640	306645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007082
5516	NC_015955	CCG	2	6	306646	306651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007082
5517	NC_015955	GCG	2	6	306750	306755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007082
5518	NC_015955	CGA	2	6	306886	306891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007082
5519	NC_015955	GAAT	2	8	306917	306924	50 %	25 %	25 %	0 %	345007082
5520	NC_015955	TTC	2	6	307116	307121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007083
5521	NC_015955	AAT	2	6	307154	307159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007083
5522	NC_015955	GCGA	2	8	307207	307214	25 %	0 %	50 %	25 %	345007083
5523	NC_015955	GGCG	2	8	307226	307233	0 %	0 %	75 %	25 %	345007083
5524	NC_015955	GAATC	2	10	307249	307258	40 %	20 %	20 %	20 %	345007083
5525	NC_015955	ATC	2	6	307288	307293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007083
5526	NC_015955	CGA	3	9	307400	307408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5527	NC_015955	CTG	3	9	307410	307418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5528	NC_015955	GGT	2	6	307484	307489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007083
5529	NC_015955	CGA	2	6	307589	307594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5530	NC_015955	GAC	2	6	307628	307633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5531	NC_015955	AGA	2	6	307663	307668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007083
5532	NC_015955	TGA	2	6	307693	307698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007083
5533	NC_015955	GAC	2	6	307725	307730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5534	NC_015955	AGCC	2	8	307834	307841	25 %	0 %	25 %	50 %	345007083
5535	NC_015955	GAG	3	9	307860	307868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007083
5536	NC_015955	TCG	3	9	307963	307971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5537	NC_015955	G	6	6	307971	307976	0 %	0 %	100 %	0 %	345007083
5538	NC_015955	GCC	2	6	307980	307985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007083
5539	NC_015955	GGA	2	6	307988	307993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007083
5540	NC_015955	ACG	2	6	308020	308025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5541	NC_015955	CCGAG	2	10	308087	308096	20 %	0 %	40 %	40 %	345007083
5542	NC_015955	CGA	2	6	308114	308119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5543	NC_015955	CGA	2	6	308183	308188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007083
5544	NC_015955	CGTGG	2	10	308198	308207	0 %	20 %	60 %	20 %	345007083
5545	NC_015955	GGT	2	6	308249	308254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007083
5546	NC_015955	GAG	2	6	308256	308261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007083
5547	NC_015955	CGC	2	6	308285	308290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007083
5548	NC_015955	GTCG	2	8	308330	308337	0 %	25 %	50 %	25 %	345007083
5549	NC_015955	GGT	2	6	308357	308362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007083
5550	NC_015955	GGT	2	6	308462	308467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007083
5551	NC_015955	CGC	2	6	308540	308545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007083
5552	NC_015955	GGT	2	6	308581	308586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007083
5553	NC_015955	AAG	2	6	308649	308654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007083
5554	NC_015955	GACCG	2	10	308664	308673	20 %	0 %	40 %	40 %	345007083
5555	NC_015955	GAC	2	6	308829	308834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007084
5556	NC_015955	CGG	2	6	308861	308866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007084
5557	NC_015955	TCG	2	6	308946	308951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007084
5558	NC_015955	CTCG	2	8	309029	309036	0 %	25 %	25 %	50 %	345007084
5559	NC_015955	CCG	2	6	309043	309048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007084
5560	NC_015955	GACC	2	8	309053	309060	25 %	0 %	25 %	50 %	345007084
5561	NC_015955	GTC	2	6	309069	309074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007084
5562	NC_015955	GAG	2	6	309084	309089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007084
5563	NC_015955	G	6	6	309134	309139	0 %	0 %	100 %	0 %	345007084
5564	NC_015955	CGA	2	6	309155	309160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007084
5565	NC_015955	CCACG	2	10	309194	309203	20 %	0 %	20 %	60 %	345007084
5566	NC_015955	CGA	2	6	309253	309258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007084
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5569	NC_015955	GGC	2	6	309356	309361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007084
5570	NC_015955	TCA	2	6	309364	309369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007084
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5573	NC_015955	CGG	2	6	309674	309679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007085
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5575	NC_015955	AACTA	2	10	309753	309762	60 %	20 %	0 %	20 %	345007085
5576	NC_015955	CCTG	2	8	309807	309814	0 %	25 %	25 %	50 %	345007085
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5582	NC_015955	GGC	2	6	309954	309959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007085
5583	NC_015955	TCG	2	6	309997	310002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007085
5584	NC_015955	TCG	2	6	310013	310018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007085
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5588	NC_015955	GTCGA	2	10	310165	310174	20 %	20 %	40 %	20 %	345007085
5589	NC_015955	GCC	2	6	310177	310182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007085
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5591	NC_015955	CGT	2	6	310220	310225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007085
5592	NC_015955	CT	3	6	310252	310257	0 %	50 %	0 %	50 %	345007085
5593	NC_015955	CCA	2	6	310316	310321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007085
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5599	NC_015955	CAG	2	6	310999	311004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007086
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5603	NC_015955	ACG	2	6	311158	311163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007086
5604	NC_015955	TGT	2	6	311182	311187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007086
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5609	NC_015955	ATGGAG	2	12	311382	311393	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345007086
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5615	NC_015955	CGA	2	6	311636	311641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007086
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5617	NC_015955	TGC	2	6	311734	311739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007087
5618	NC_015955	CTCG	2	8	311752	311759	0 %	25 %	25 %	50 %	345007087
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5620	NC_015955	ACCG	2	8	311798	311805	25 %	0 %	25 %	50 %	345007087
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5733	NC_015955	ACGG	2	8	316775	316782	25 %	0 %	50 %	25 %	345007091
5734	NC_015955	ACG	2	6	316796	316801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007091
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5738	NC_015955	CTC	2	6	317062	317067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007091
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5740	NC_015955	GTT	2	6	317212	317217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007091
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5742	NC_015955	GTC	2	6	317269	317274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007091
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5861	NC_015955	ACT	2	6	322262	322267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007095
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5980	NC_015955	CGC	2	6	327127	327132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007100
5981	NC_015955	GTC	2	6	327149	327154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007100
5982	NC_015955	CAT	2	6	327191	327196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007100
5983	NC_015955	CGA	2	6	327199	327204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007100
5984	NC_015955	TCC	2	6	327219	327224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007100
5985	NC_015955	TCG	2	6	327240	327245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007100
5986	NC_015955	CTCG	2	8	327302	327309	0 %	25 %	25 %	50 %	345007100
5987	NC_015955	ATC	2	6	327321	327326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007100
5988	NC_015955	TCG	2	6	327426	327431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007100
5989	NC_015955	CGA	2	6	327484	327489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007100
5990	NC_015955	GA	3	6	327516	327521	50 %	0 %	50 %	0 %	345007100
5991	NC_015955	TG	3	6	327557	327562	0 %	50 %	50 %	0 %	345007100
5992	NC_015955	GTC	2	6	327570	327575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007100
5993	NC_015955	ACC	2	6	327600	327605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007100
5994	NC_015955	GTG	2	6	327780	327785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007101
5995	NC_015955	TCC	2	6	327852	327857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007101
5996	NC_015955	CTG	2	6	327881	327886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
5997	NC_015955	CCGG	2	8	327915	327922	0 %	0 %	50 %	50 %	345007101
5998	NC_015955	GCT	2	6	327937	327942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
5999	NC_015955	CGA	2	6	327945	327950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6000	NC_015955	CGA	2	6	327955	327960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007101

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