MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015955	AGC	2	6	255988	255993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4502	NC_015955	CGA	2	6	256130	256135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4503	NC_015955	CTG	2	6	256171	256176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4504	NC_015955	GAG	2	6	256194	256199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4505	NC_015955	CTG	2	6	256203	256208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4506	NC_015955	CGA	2	6	256247	256252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4507	NC_015955	GAG	2	6	256260	256265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4508	NC_015955	CGA	3	9	256313	256321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4509	NC_015955	GAA	2	6	256329	256334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
4510	NC_015955	GGGT	2	8	256392	256399	0 %	25 %	75 %	0 %	345007041
4511	NC_015955	GTC	2	6	256422	256427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4512	NC_015955	GGA	2	6	256460	256465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4513	NC_015955	CGAC	2	8	256552	256559	25 %	0 %	25 %	50 %	345007041
4514	NC_015955	AGG	2	6	256564	256569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4515	NC_015955	CT	3	6	256588	256593	0 %	50 %	0 %	50 %	345007041
4516	NC_015955	CGG	2	6	256627	256632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007041
4517	NC_015955	ACC	2	6	256705	256710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007041
4518	NC_015955	CCTG	2	8	256734	256741	0 %	25 %	25 %	50 %	345007041
4519	NC_015955	CTG	2	6	256758	256763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4520	NC_015955	TGG	2	6	256791	256796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007041
4521	NC_015955	GAG	2	6	256929	256934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4522	NC_015955	GAG	2	6	257001	257006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4523	NC_015955	CTG	2	6	257049	257054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4524	NC_015955	CTG	2	6	257109	257114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4525	NC_015955	GAA	2	6	257133	257138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
4526	NC_015955	CATT	2	8	257205	257212	25 %	50 %	0 %	25 %	345007041
4527	NC_015955	TCC	2	6	257284	257289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007041
4528	NC_015955	CTG	2	6	257292	257297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4529	NC_015955	CTG	2	6	257301	257306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4530	NC_015955	CTACAA	2	12	257396	257407	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345007041
4531	NC_015955	GAA	2	6	257409	257414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
4532	NC_015955	CTT	2	6	257426	257431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007041
4533	NC_015955	AGA	2	6	257525	257530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
4534	NC_015955	CGG	2	6	257537	257542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007041
4535	NC_015955	AAG	2	6	257692	257697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
4536	NC_015955	AGG	2	6	257734	257739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4537	NC_015955	GA	3	6	257745	257750	50 %	0 %	50 %	0 %	345007041
4538	NC_015955	CGA	2	6	257855	257860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4539	NC_015955	GAT	2	6	257925	257930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
4540	NC_015955	G	6	6	257993	257998	0 %	0 %	100 %	0 %	345007041
4541	NC_015955	ATT	3	9	258100	258108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345007041
4542	NC_015955	CGA	2	6	258150	258155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4543	NC_015955	CTA	2	6	258199	258204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007041
4544	NC_015955	ACCT	2	8	258261	258268	25 %	25 %	0 %	50 %	345007041
4545	NC_015955	AAC	2	6	258281	258286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007041
4546	NC_015955	AGG	2	6	258373	258378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4547	NC_015955	GATTT	2	10	258406	258415	20 %	60 %	20 %	0 %	345007041
4548	NC_015955	GAT	2	6	258468	258473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
4549	NC_015955	CAA	2	6	258507	258512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007041
4550	NC_015955	CAT	2	6	258556	258561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007041
4551	NC_015955	TGA	2	6	258638	258643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
4552	NC_015955	TCC	2	6	258691	258696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007041
4553	NC_015955	ATCA	2	8	258755	258762	50 %	25 %	0 %	25 %	345007041
4554	NC_015955	TCC	2	6	258805	258810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007041
4555	NC_015955	CAGT	2	8	258826	258833	25 %	25 %	25 %	25 %	345007041
4556	NC_015955	TAT	2	6	258848	258853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345007041
4557	NC_015955	GAC	2	6	258879	258884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4558	NC_015955	CTC	2	6	258885	258890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007041
4559	NC_015955	CTCGC	2	10	258940	258949	0 %	20 %	20 %	60 %	345007041
4560	NC_015955	GGA	2	6	259022	259027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
4561	NC_015955	CAC	2	6	259082	259087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007041
4562	NC_015955	GCCT	2	8	259125	259132	0 %	25 %	25 %	50 %	345007041
4563	NC_015955	ATC	2	6	259141	259146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007041
4564	NC_015955	GTT	2	6	259160	259165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007041
4565	NC_015955	GCA	2	6	259227	259232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4566	NC_015955	CGG	2	6	259236	259241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007041
4567	NC_015955	GAT	2	6	259248	259253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
4568	NC_015955	GCAG	2	8	259271	259278	25 %	0 %	50 %	25 %	345007041
4569	NC_015955	GAA	2	6	259335	259340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
4570	NC_015955	CT	3	6	259364	259369	0 %	50 %	0 %	50 %	345007041
4571	NC_015955	GAA	2	6	259404	259409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
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4573	NC_015955	CGA	2	6	259466	259471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007041
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4577	NC_015955	TGA	2	6	259844	259849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
4578	NC_015955	TCG	2	6	259863	259868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4579	NC_015955	GACTG	2	10	259881	259890	20 %	20 %	40 %	20 %	345007041
4580	NC_015955	TCG	2	6	259996	260001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
4581	NC_015955	TGA	2	6	260016	260021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
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4583	NC_015955	GAAC	2	8	260063	260070	50 %	0 %	25 %	25 %	345007042
4584	NC_015955	TGG	2	6	260109	260114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007042
4585	NC_015955	TGA	2	6	260125	260130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007042
4586	NC_015955	TC	3	6	260164	260169	0 %	50 %	0 %	50 %	345007042
4587	NC_015955	AGAA	2	8	260262	260269	75 %	0 %	25 %	0 %	345007042
4588	NC_015955	CTG	2	6	260277	260282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007042
4589	NC_015955	GA	3	6	260284	260289	50 %	0 %	50 %	0 %	345007042
4590	NC_015955	TAC	2	6	260307	260312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007042
4591	NC_015955	CAG	2	6	260337	260342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007042
4592	NC_015955	TTG	2	6	260361	260366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007042
4593	NC_015955	GCT	2	6	260402	260407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007042
4594	NC_015955	GGA	2	6	260443	260448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007042
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4596	NC_015955	AAT	2	6	260550	260555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007042
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4600	NC_015955	TGG	2	6	260644	260649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007043
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4602	NC_015955	TCG	2	6	260675	260680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007043
4603	NC_015955	AACCG	2	10	260761	260770	40 %	0 %	20 %	40 %	345007043
4604	NC_015955	GTAC	2	8	260775	260782	25 %	25 %	25 %	25 %	345007043
4605	NC_015955	CA	3	6	260789	260794	50 %	0 %	0 %	50 %	345007043
4606	NC_015955	CGA	2	6	260796	260801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
4607	NC_015955	CGG	2	6	260832	260837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007043
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4609	NC_015955	CGC	2	6	260865	260870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007043
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4613	NC_015955	GACGCC	2	12	261040	261051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007043
4614	NC_015955	GGC	2	6	261097	261102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007043
4615	NC_015955	ACG	2	6	261149	261154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
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4620	NC_015955	TCG	2	6	261323	261328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007043
4621	NC_015955	CCAG	2	8	261366	261373	25 %	0 %	25 %	50 %	345007043
4622	NC_015955	CGAA	2	8	261432	261439	50 %	0 %	25 %	25 %	345007043
4623	NC_015955	ACG	2	6	261488	261493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
4624	NC_015955	TCC	2	6	261494	261499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007043
4625	NC_015955	ACG	2	6	261506	261511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
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4642	NC_015955	CAT	2	6	262464	262469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007043
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4644	NC_015955	CGA	2	6	262557	262562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
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4650	NC_015955	TTC	2	6	262853	262858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007044
4651	NC_015955	TCA	2	6	262880	262885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007044
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4654	NC_015955	GCTCCA	2	12	263082	263093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007044
4655	NC_015955	CTCG	2	8	263133	263140	0 %	25 %	25 %	50 %	345007044
4656	NC_015955	AGCG	2	8	263198	263205	25 %	0 %	50 %	25 %	345007044
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4659	NC_015955	TCG	2	6	263300	263305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007044
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4733	NC_015955	ACT	2	6	266923	266928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007045
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4739	NC_015955	GAT	2	6	267327	267332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007045
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4742	NC_015955	GTCG	2	8	267415	267422	0 %	25 %	50 %	25 %	345007045
4743	NC_015955	CGG	2	6	267472	267477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007046
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4851	NC_015955	ACGC	2	8	272951	272958	25 %	0 %	25 %	50 %	345007052
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4853	NC_015955	CGGC	2	8	273021	273028	0 %	0 %	50 %	50 %	345007052
4854	NC_015955	GCG	2	6	273038	273043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007052
4855	NC_015955	CAG	2	6	273049	273054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007052
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4857	NC_015955	GCAACG	2	12	273146	273157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007052
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4859	NC_015955	ACT	2	6	273286	273291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007052
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4861	NC_015955	ACGAC	2	10	273314	273323	40 %	0 %	20 %	40 %	345007053
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