MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015954	GAGCT	2	10	495	504	20 %	20 %	40 %	20 %	345004011
2	NC_015954	AACGG	2	10	1753	1762	40 %	0 %	40 %	20 %	345004012
3	NC_015954	CGACG	2	10	3315	3324	20 %	0 %	40 %	40 %	345004012
4	NC_015954	TGACC	2	10	4795	4804	20 %	20 %	20 %	40 %	345004014
5	NC_015954	TTCGA	2	10	4926	4935	20 %	40 %	20 %	20 %	345004014
6	NC_015954	CGTGT	2	10	5620	5629	0 %	40 %	40 %	20 %	345004014
7	NC_015954	AAATC	2	10	6009	6018	60 %	20 %	0 %	20 %	345004014
8	NC_015954	TCAAT	2	10	6027	6036	40 %	40 %	0 %	20 %	345004015
9	NC_015954	GCGCC	2	10	8465	8474	0 %	0 %	40 %	60 %	345004017
10	NC_015954	CTCCC	2	10	8547	8556	0 %	20 %	0 %	80 %	345004017
11	NC_015954	GGACT	2	10	13740	13749	20 %	20 %	40 %	20 %	345004021
12	NC_015954	GTGGA	2	10	20135	20144	20 %	20 %	60 %	0 %	345004026
13	NC_015954	TGGCC	2	10	20316	20325	0 %	20 %	40 %	40 %	345004026
14	NC_015954	GGCCG	2	10	22039	22048	0 %	0 %	60 %	40 %	345004027
15	NC_015954	GGAGC	2	10	27132	27141	20 %	0 %	60 %	20 %	345004034
16	NC_015954	CTGCT	2	10	27379	27388	0 %	40 %	20 %	40 %	345004035
17	NC_015954	CATCG	2	10	33345	33354	20 %	20 %	20 %	40 %	345004042
18	NC_015954	CTTCA	2	10	35349	35358	20 %	40 %	0 %	40 %	345004044
19	NC_015954	CGGCG	2	10	36323	36332	0 %	0 %	60 %	40 %	345004045
20	NC_015954	TCGCC	2	10	36679	36688	0 %	20 %	20 %	60 %	345004045
21	NC_015954	GTGCG	2	10	38226	38235	0 %	20 %	60 %	20 %	345004047
22	NC_015954	CGTTC	2	10	39962	39971	0 %	40 %	20 %	40 %	345004049
23	NC_015954	CACGG	2	10	40380	40389	20 %	0 %	40 %	40 %	345004049
24	NC_015954	GACCA	2	10	41386	41395	40 %	0 %	20 %	40 %	345004050
25	NC_015954	CCGAC	2	10	42208	42217	20 %	0 %	20 %	60 %	345004051
26	NC_015954	GTCGA	2	10	43683	43692	20 %	20 %	40 %	20 %	345004052
27	NC_015954	GTTCG	2	10	44679	44688	0 %	40 %	40 %	20 %	345004053
28	NC_015954	AGCGA	2	10	50511	50520	40 %	0 %	40 %	20 %	345004061
29	NC_015954	TCTGC	2	10	54388	54397	0 %	40 %	20 %	40 %	345004065
30	NC_015954	CGCGG	2	10	56495	56504	0 %	0 %	60 %	40 %	345004067
31	NC_015954	GGAGC	2	10	61067	61076	20 %	0 %	60 %	20 %	345004071
32	NC_015954	CGCGA	2	10	61149	61158	20 %	0 %	40 %	40 %	345004071
33	NC_015954	GGCTC	2	10	61177	61186	0 %	20 %	40 %	40 %	345004071
34	NC_015954	GTCCA	2	10	61756	61765	20 %	20 %	20 %	40 %	345004072
35	NC_015954	GACTG	2	10	62150	62159	20 %	20 %	40 %	20 %	345004072
36	NC_015954	GCCGC	2	10	62273	62282	0 %	0 %	40 %	60 %	345004072
37	NC_015954	CCGTC	2	10	62886	62895	0 %	20 %	20 %	60 %	345004072
38	NC_015954	GACCG	2	10	66076	66085	20 %	0 %	40 %	40 %	345004076
39	NC_015954	GGATT	2	10	68886	68895	20 %	40 %	40 %	0 %	345004081
40	NC_015954	GTGGG	2	10	69119	69128	0 %	20 %	80 %	0 %	345004081
41	NC_015954	GAACT	2	10	70545	70554	40 %	20 %	20 %	20 %	345004082
42	NC_015954	CGAAG	2	10	70609	70618	40 %	0 %	40 %	20 %	345004082
43	NC_015954	CTCGT	2	10	73104	73113	0 %	40 %	20 %	40 %	345004084
44	NC_015954	CTCGA	2	10	73386	73395	20 %	20 %	20 %	40 %	345004084
45	NC_015954	CGCTG	2	10	74025	74034	0 %	20 %	40 %	40 %	345004085
46	NC_015954	GTCGC	2	10	76482	76491	0 %	20 %	40 %	40 %	345004089
47	NC_015954	GTTCG	2	10	82136	82145	0 %	40 %	40 %	20 %	345004095
48	NC_015954	GAACC	2	10	88012	88021	40 %	0 %	20 %	40 %	345004098
49	NC_015954	CCACT	2	10	89249	89258	20 %	20 %	0 %	60 %	345004099
50	NC_015954	GCGCC	2	10	89594	89603	0 %	0 %	40 %	60 %	345004100
51	NC_015954	GGCCG	2	10	89670	89679	0 %	0 %	60 %	40 %	345004100
52	NC_015954	GTTCG	2	10	89899	89908	0 %	40 %	40 %	20 %	345004100
53	NC_015954	GTTCG	2	10	89932	89941	0 %	40 %	40 %	20 %	345004100
54	NC_015954	GTTCG	2	10	89965	89974	0 %	40 %	40 %	20 %	345004100
55	NC_015954	CGGGG	2	10	90808	90817	0 %	0 %	80 %	20 %	345004101
56	NC_015954	GTCTT	2	10	91958	91967	0 %	60 %	20 %	20 %	345004102
57	NC_015954	GTTGG	2	10	92956	92965	0 %	40 %	60 %	0 %	345004103
58	NC_015954	CGCGG	2	10	95605	95614	0 %	0 %	60 %	40 %	345004106
59	NC_015954	GCGCG	2	10	98205	98214	0 %	0 %	60 %	40 %	345004110
60	NC_015954	GGCCC	2	10	104189	104198	0 %	0 %	40 %	60 %	345004116
61	NC_015954	ACGAG	2	10	106008	106017	40 %	0 %	40 %	20 %	345004118
62	NC_015954	CGTCC	2	10	107312	107321	0 %	20 %	20 %	60 %	345004119
63	NC_015954	CTGAG	2	10	109276	109285	20 %	20 %	40 %	20 %	345004119
64	NC_015954	TCGGC	2	10	115744	115753	0 %	20 %	40 %	40 %	345004127
65	NC_015954	CGCCT	2	10	116351	116360	0 %	20 %	20 %	60 %	345004128
66	NC_015954	GCCGA	2	10	120027	120036	20 %	0 %	40 %	40 %	345004130
67	NC_015954	CCTCG	2	10	120705	120714	0 %	20 %	20 %	60 %	345004131
68	NC_015954	TCGAC	2	10	126840	126849	20 %	20 %	20 %	40 %	345004140
69	NC_015954	CCGGG	2	10	127617	127626	0 %	0 %	60 %	40 %	345004140
70	NC_015954	ACACG	2	10	128443	128452	40 %	0 %	20 %	40 %	345004140
71	NC_015954	CTTGA	2	10	130659	130668	20 %	40 %	20 %	20 %	345004142
72	NC_015954	GCTGG	2	10	133982	133991	0 %	20 %	60 %	20 %	345004145
73	NC_015954	TCGAT	2	10	136235	136244	20 %	40 %	20 %	20 %	345004147
74	NC_015954	CGAAC	2	10	139756	139765	40 %	0 %	20 %	40 %	345004152
75	NC_015954	CGAAA	2	10	140038	140047	60 %	0 %	20 %	20 %	345004152
76	NC_015954	GAGGT	2	10	141891	141900	20 %	20 %	60 %	0 %	345004155
77	NC_015954	GCCGG	2	10	149293	149302	0 %	0 %	60 %	40 %	345004161
78	NC_015954	CCGAG	2	10	149540	149549	20 %	0 %	40 %	40 %	345004162
79	NC_015954	GCTCG	2	10	151892	151901	0 %	20 %	40 %	40 %	345004163
80	NC_015954	TGGAG	2	10	152914	152923	20 %	20 %	60 %	0 %	345004165
81	NC_015954	CGGTC	2	10	155352	155361	0 %	20 %	40 %	40 %	345004169
82	NC_015954	GAAGA	2	10	155939	155948	60 %	0 %	40 %	0 %	345004170
83	NC_015954	GTCGC	2	10	157287	157296	0 %	20 %	40 %	40 %	345004171
84	NC_015954	CCCAA	2	10	158322	158331	40 %	0 %	0 %	60 %	345004172
85	NC_015954	GCGAC	2	10	159213	159222	20 %	0 %	40 %	40 %	345004173
86	NC_015954	GCGCC	2	10	159816	159825	0 %	0 %	40 %	60 %	345004173
87	NC_015954	GTTCA	2	10	160604	160613	20 %	40 %	20 %	20 %	345004174
88	NC_015954	ACCGA	2	10	161678	161687	40 %	0 %	20 %	40 %	345004175
89	NC_015954	GCGGT	2	10	162659	162668	0 %	20 %	60 %	20 %	345004175
90	NC_015954	CCCAG	2	10	162858	162867	20 %	0 %	20 %	60 %	345004175
91	NC_015954	CTGAA	2	10	164480	164489	40 %	20 %	20 %	20 %	345004177
92	NC_015954	GGCCC	2	10	164854	164863	0 %	0 %	40 %	60 %	345004178
93	NC_015954	GGTCG	2	10	165935	165944	0 %	20 %	60 %	20 %	345004179
94	NC_015954	GGTCA	2	10	167275	167284	20 %	20 %	40 %	20 %	345004180
95	NC_015954	CCGTT	2	10	168368	168377	0 %	40 %	20 %	40 %	345004181
96	NC_015954	CCGAG	2	10	168460	168469	20 %	0 %	40 %	40 %	345004181
97	NC_015954	GCGTC	2	10	168932	168941	0 %	20 %	40 %	40 %	345004181
98	NC_015954	CGTTC	2	10	169160	169169	0 %	40 %	20 %	40 %	345004182
99	NC_015954	GAACG	2	10	170728	170737	40 %	0 %	40 %	20 %	345004184
100	NC_015954	CAGAA	2	10	173205	173214	60 %	0 %	20 %	20 %	345004186
101	NC_015954	CTTCG	2	10	173494	173503	0 %	40 %	20 %	40 %	345004186
102	NC_015954	GGTGT	2	10	173578	173587	0 %	40 %	60 %	0 %	345004186
103	NC_015954	AGTCC	2	10	176076	176085	20 %	20 %	20 %	40 %	345004189
104	NC_015954	CGGCG	2	10	176865	176874	0 %	0 %	60 %	40 %	345004189
105	NC_015954	ATCGT	2	10	180186	180195	20 %	40 %	20 %	20 %	345004190
106	NC_015954	ACTCC	2	10	181230	181239	20 %	20 %	0 %	60 %	345004191
107	NC_015954	GCCGG	2	10	181739	181748	0 %	0 %	60 %	40 %	345004191
108	NC_015954	CTCGA	2	10	183415	183424	20 %	20 %	20 %	40 %	345004193
109	NC_015954	TCACC	2	10	183566	183575	20 %	20 %	0 %	60 %	345004193
110	NC_015954	AGGGC	2	10	186378	186387	20 %	0 %	60 %	20 %	345004197
111	NC_015954	AGTCC	2	10	197382	197391	20 %	20 %	20 %	40 %	345004203
112	NC_015954	AATAT	2	10	200997	201006	60 %	40 %	0 %	0 %	345004206
113	NC_015954	GACTT	2	10	201063	201072	20 %	40 %	20 %	20 %	345004206
114	NC_015954	CGTTC	2	10	202924	202933	0 %	40 %	20 %	40 %	345004207
115	NC_015954	CCTGA	2	10	204175	204184	20 %	20 %	20 %	40 %	345004208
116	NC_015954	GGAAG	2	10	204267	204276	40 %	0 %	60 %	0 %	345004208
117	NC_015954	GCTGG	2	10	205940	205949	0 %	20 %	60 %	20 %	345004210
118	NC_015954	CGCCA	2	10	209872	209881	20 %	0 %	20 %	60 %	345004213
119	NC_015954	CCGAA	2	10	210079	210088	40 %	0 %	20 %	40 %	345004213
120	NC_015954	CCGGG	2	10	212338	212347	0 %	0 %	60 %	40 %	345004216
121	NC_015954	ACCCC	2	10	212386	212395	20 %	0 %	0 %	80 %	345004216
122	NC_015954	AGCAT	2	10	213225	213234	40 %	20 %	20 %	20 %	345004216
123	NC_015954	GCCGC	2	10	216517	216526	0 %	0 %	40 %	60 %	345004222
124	NC_015954	TGGAT	2	10	217166	217175	20 %	40 %	40 %	0 %	345004223
125	NC_015954	GTCGG	2	10	219902	219911	0 %	20 %	60 %	20 %	345004224
126	NC_015954	CCGTC	2	10	221643	221652	0 %	20 %	20 %	60 %	345004225
127	NC_015954	CGGGG	2	10	222026	222035	0 %	0 %	80 %	20 %	345004225
128	NC_015954	CGGTC	2	10	223234	223243	0 %	20 %	40 %	40 %	345004226
129	NC_015954	CGGCG	2	10	224491	224500	0 %	0 %	60 %	40 %	345004226
130	NC_015954	AACGA	2	10	227289	227298	60 %	0 %	20 %	20 %	345004230
131	NC_015954	CCAGC	2	10	227339	227348	20 %	0 %	20 %	60 %	345004230
132	NC_015954	CGTCG	2	10	228517	228526	0 %	20 %	40 %	40 %	345004231
133	NC_015954	GACCC	2	10	229600	229609	20 %	0 %	20 %	60 %	345004232
134	NC_015954	GGCGT	2	10	231507	231516	0 %	20 %	60 %	20 %	345004234
135	NC_015954	CGTCA	2	10	232608	232617	20 %	20 %	20 %	40 %	345004235
136	NC_015954	CTCCC	2	10	233399	233408	0 %	20 %	0 %	80 %	345004236
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142	NC_015954	GACGT	2	10	245391	245400	20 %	20 %	40 %	20 %	345004243
143	NC_015954	CAGCC	2	10	245672	245681	20 %	0 %	20 %	60 %	345004243
144	NC_015954	GCGCC	2	10	246253	246262	0 %	0 %	40 %	60 %	345004244
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146	NC_015954	GACCT	2	10	246937	246946	20 %	20 %	20 %	40 %	345004245
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149	NC_015954	GCCGA	2	10	257083	257092	20 %	0 %	40 %	40 %	345004255
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155	NC_015954	GCGGT	2	10	276553	276562	0 %	20 %	60 %	20 %	345004277
156	NC_015954	ACCCG	2	10	276779	276788	20 %	0 %	20 %	60 %	345004277
157	NC_015954	TACCC	2	10	280388	280397	20 %	20 %	0 %	60 %	345004281
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163	NC_015954	TCGGT	2	10	288579	288588	0 %	40 %	40 %	20 %	345004289
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167	NC_015954	GGCGC	2	10	302593	302602	0 %	0 %	60 %	40 %	345004305
168	NC_015954	CGGCG	2	10	303115	303124	0 %	0 %	60 %	40 %	345004305
169	NC_015954	ACCTC	2	10	303541	303550	20 %	20 %	0 %	60 %	345004306
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173	NC_015954	GGAGA	2	10	310326	310335	40 %	0 %	60 %	0 %	345004313
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177	NC_015954	TGACC	2	10	317336	317345	20 %	20 %	20 %	40 %	345004319
178	NC_015954	TCTGC	2	10	317357	317366	0 %	40 %	20 %	40 %	345004319
179	NC_015954	TTCAG	2	10	318013	318022	20 %	40 %	20 %	20 %	345004320
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199	NC_015954	CAGTC	2	10	360696	360705	20 %	20 %	20 %	40 %	345004359
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233	NC_015954	GACCC	2	10	410576	410585	20 %	0 %	20 %	60 %	345004401
234	NC_015954	TCGCG	2	10	418740	418749	0 %	20 %	40 %	40 %	345004410
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236	NC_015954	GGGAT	2	10	420976	420985	20 %	20 %	60 %	0 %	345004414
237	NC_015954	TCCCC	2	10	421466	421475	0 %	20 %	0 %	80 %	345004414
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241	NC_015954	CGCGA	2	10	429953	429962	20 %	0 %	40 %	40 %	345004423
242	NC_015954	TCGTC	2	10	430036	430045	0 %	40 %	20 %	40 %	345004423
243	NC_015954	CCGTC	2	10	430693	430702	0 %	20 %	20 %	60 %	345004423
244	NC_015954	CGGCT	2	10	431442	431451	0 %	20 %	40 %	40 %	345004424
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246	NC_015954	TCGCG	2	10	435867	435876	0 %	20 %	40 %	40 %	345004428
247	NC_015954	CCCGA	2	10	438675	438684	20 %	0 %	20 %	60 %	345004432
248	NC_015954	TACCC	2	10	441779	441788	20 %	20 %	0 %	60 %	345004436
249	NC_015954	GGCGT	2	10	442784	442793	0 %	20 %	60 %	20 %	345004437
250	NC_015954	CCACG	2	10	445822	445831	20 %	0 %	20 %	60 %	345004440
251	NC_015954	GCGCC	2	10	448291	448300	0 %	0 %	40 %	60 %	345004443
252	NC_015954	AACCG	2	10	450465	450474	40 %	0 %	20 %	40 %	345004445
253	NC_015954	TCGTG	2	10	450871	450880	0 %	40 %	40 %	20 %	345004446
254	NC_015954	ACGTG	2	10	454406	454415	20 %	20 %	40 %	20 %	345004449
255	NC_015954	CGCAA	2	10	454473	454482	40 %	0 %	20 %	40 %	345004449
256	NC_015954	GGCTG	2	10	454668	454677	0 %	20 %	60 %	20 %	345004449
257	NC_015954	CGGCG	2	10	456084	456093	0 %	0 %	60 %	40 %	345004451
258	NC_015954	GCTCC	2	10	456872	456881	0 %	20 %	20 %	60 %	345004453
259	NC_015954	GAGCA	2	10	459734	459743	40 %	0 %	40 %	20 %	345004455
260	NC_015954	CCAGC	2	10	459828	459837	20 %	0 %	20 %	60 %	345004455
261	NC_015954	ACGAG	2	10	463996	464005	40 %	0 %	40 %	20 %	345004459
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263	NC_015954	GCCAG	2	10	467555	467564	20 %	0 %	40 %	40 %	345004462
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489	NC_015954	CCGGT	2	10	908002	908011	0 %	20 %	40 %	40 %	345004892
490	NC_015954	CTGCG	2	10	908262	908271	0 %	20 %	40 %	40 %	345004892
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500	NC_015954	TGACC	2	10	935470	935479	20 %	20 %	20 %	40 %	345004914

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