MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 51972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015948	CGA	2	6	44	49	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
2	NC_015948	ACG	2	6	62	67	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
3	NC_015948	CGA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
4	NC_015948	CGA	2	6	135	140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
5	NC_015948	CGA	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
6	NC_015948	CGA	2	6	207	212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
7	NC_015948	AGG	2	6	245	250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210306
8	NC_015948	TCC	2	6	251	256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210306
9	NC_015948	CCT	2	6	260	265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210306
10	NC_015948	CGC	2	6	269	274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210306
11	NC_015948	GAG	2	6	292	297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210306
12	NC_015948	CAA	2	6	303	308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210306
13	NC_015948	CGA	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
14	NC_015948	GCG	2	6	338	343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210306
15	NC_015948	CGA	2	6	552	557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
16	NC_015948	CGA	2	6	639	644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
17	NC_015948	GTC	2	6	772	777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210306
18	NC_015948	CGA	2	6	786	791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
19	NC_015948	TCG	2	6	803	808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210306
20	NC_015948	GCG	2	6	815	820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210306
21	NC_015948	ACG	2	6	974	979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
22	NC_015948	TCC	2	6	998	1003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210306
23	NC_015948	CGC	2	6	1074	1079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210306
24	NC_015948	CCT	2	6	1113	1118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210306
25	NC_015948	CGT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210306
26	NC_015948	GTC	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210306
27	NC_015948	CAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210306
28	NC_015948	GAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210306
29	NC_015948	CGT	3	9	1425	1433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210306
30	NC_015948	CGA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210306
31	NC_015948	TCG	2	6	1695	1700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210307
32	NC_015948	CGA	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210307
33	NC_015948	TGA	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210307
34	NC_015948	GTC	2	6	1912	1917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210307
35	NC_015948	TCC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210307
36	NC_015948	GAT	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210307
37	NC_015948	GTC	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210307
38	NC_015948	GAC	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210307
39	NC_015948	CTC	2	6	2134	2139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210307
40	NC_015948	CGA	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210307
41	NC_015948	CGC	2	6	2220	2225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210307
42	NC_015948	CGA	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210307
43	NC_015948	CAT	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210307
44	NC_015948	CTC	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210308
45	NC_015948	TGT	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210308
46	NC_015948	TAA	2	6	2627	2632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210308
47	NC_015948	GCG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210308
48	NC_015948	TCG	2	6	2665	2670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210308
49	NC_015948	GAT	2	6	2754	2759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210308
50	NC_015948	GCT	2	6	2768	2773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210308
51	NC_015948	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210308
52	NC_015948	GCC	2	6	2872	2877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210308
53	NC_015948	GGC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210308
54	NC_015948	CGA	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210308
55	NC_015948	CAC	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210308
56	NC_015948	CGA	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210309
57	NC_015948	TCG	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210309
58	NC_015948	ACC	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210309
59	NC_015948	GCG	2	6	3749	3754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210309
60	NC_015948	TCG	2	6	3818	3823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210309
61	NC_015948	GGA	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210309
62	NC_015948	TGA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210309
63	NC_015948	CAG	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210309
64	NC_015948	CGA	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210309
65	NC_015948	CCG	2	6	4010	4015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210309
66	NC_015948	GGC	2	6	4029	4034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210309
67	NC_015948	GGA	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210309
68	NC_015948	CAT	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210309
69	NC_015948	GAT	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210309
70	NC_015948	ACG	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210309
71	NC_015948	CGA	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210309
72	NC_015948	CAT	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210309
73	NC_015948	ACG	2	6	4364	4369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210309
74	NC_015948	CGA	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210309
75	NC_015948	GAG	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210309
76	NC_015948	CGC	2	6	4535	4540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210309
77	NC_015948	GGA	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210309
78	NC_015948	CGT	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210309
79	NC_015948	AGA	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210309
80	NC_015948	ACC	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210309
81	NC_015948	TTA	2	6	5111	5116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210310
82	NC_015948	GAC	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
83	NC_015948	ACA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210310
84	NC_015948	CGC	2	6	5277	5282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210310
85	NC_015948	GGC	2	6	5364	5369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210310
86	NC_015948	GGC	2	6	5377	5382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210310
87	NC_015948	CGT	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210310
88	NC_015948	CGT	2	6	5471	5476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210310
89	NC_015948	CGG	2	6	5484	5489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210310
90	NC_015948	TCG	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210310
91	NC_015948	ACG	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
92	NC_015948	CGA	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
93	NC_015948	CTT	2	6	5688	5693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210310
94	NC_015948	ACA	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210310
95	NC_015948	ACG	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
96	NC_015948	ACC	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210310
97	NC_015948	CGG	2	6	5802	5807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210310
98	NC_015948	TCG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210310
99	NC_015948	GGA	2	6	5838	5843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210310
100	NC_015948	CGA	2	6	5916	5921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
101	NC_015948	CGC	2	6	5937	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210310
102	NC_015948	CAG	2	6	5974	5979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
103	NC_015948	ACC	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210310
104	NC_015948	CGG	2	6	6162	6167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210310
105	NC_015948	CGG	2	6	6171	6176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210310
106	NC_015948	ACG	2	6	6206	6211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
107	NC_015948	CTG	2	6	6250	6255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210310
108	NC_015948	TCA	2	6	6281	6286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210310
109	NC_015948	ACC	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210310
110	NC_015948	CAG	2	6	6310	6315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210310
111	NC_015948	GAG	2	6	6325	6330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210310
112	NC_015948	GCC	3	9	6334	6342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210310
113	NC_015948	TGA	2	6	6351	6356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210310
114	NC_015948	CAG	2	6	6751	6756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210311
115	NC_015948	ACG	2	6	6795	6800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210311
116	NC_015948	CGA	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210311
117	NC_015948	CGC	2	6	7062	7067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210311
118	NC_015948	CCG	2	6	7076	7081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210311
119	NC_015948	GAT	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210311
120	NC_015948	TCG	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210311
121	NC_015948	GAG	2	6	7198	7203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210311
122	NC_015948	GTT	2	6	7243	7248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210311
123	NC_015948	CAG	2	6	7303	7308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210311
124	NC_015948	CAG	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210312
125	NC_015948	CGA	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210312
126	NC_015948	GGC	2	6	7610	7615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210312
127	NC_015948	CGA	2	6	7669	7674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210312
128	NC_015948	AAC	2	6	7707	7712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210312
129	NC_015948	GAA	2	6	7736	7741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210312
130	NC_015948	CTT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210312
131	NC_015948	GCT	2	6	7926	7931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210312
132	NC_015948	ACG	2	6	7965	7970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210312
133	NC_015948	CAG	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210312
134	NC_015948	ATC	2	6	8031	8036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210312
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138	NC_015948	GGC	2	6	8491	8496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210313
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145	NC_015948	CGG	2	6	8865	8870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210313
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150	NC_015948	CGA	2	6	9093	9098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210313
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243	NC_015948	TCG	2	6	13285	13290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210317
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247	NC_015948	CAT	2	6	13538	13543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210317
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249	NC_015948	CTC	2	6	13797	13802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210318
250	NC_015948	GCT	2	6	13803	13808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210318
251	NC_015948	TCT	2	6	13822	13827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210318
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253	NC_015948	AAG	2	6	13867	13872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210318
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376	NC_015948	CCG	2	6	19729	19734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210325
377	NC_015948	GAG	2	6	20466	20471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210326
378	NC_015948	CGA	2	6	20513	20518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210326
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380	NC_015948	GTC	3	9	20667	20675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210326
381	NC_015948	CTC	2	6	20697	20702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210326
382	NC_015948	TAT	2	6	20705	20710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210326
383	NC_015948	CGT	2	6	20729	20734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210326
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389	NC_015948	CGC	2	6	20900	20905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210326
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401	NC_015948	GGT	2	6	21341	21346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210327
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499	NC_015948	ACG	2	6	26974	26979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210333
500	NC_015948	CGG	2	6	26983	26988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210333

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