MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015948	TGA	2	6	126860	126865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210439
3002	NC_015948	CGA	2	6	126867	126872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3003	NC_015948	CCGG	2	8	126999	127006	0 %	0 %	50 %	50 %	344210439
3004	NC_015948	GAC	2	6	127065	127070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3005	NC_015948	CGA	2	6	127089	127094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3006	NC_015948	GACG	2	8	127107	127114	25 %	0 %	50 %	25 %	344210439
3007	NC_015948	TCT	2	6	127163	127168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210439
3008	NC_015948	ACC	2	6	127200	127205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210439
3009	NC_015948	TCG	3	9	127277	127285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3010	NC_015948	GAC	2	6	127291	127296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3011	NC_015948	GC	3	6	127350	127355	0 %	0 %	50 %	50 %	344210439
3012	NC_015948	GGA	2	6	127464	127469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210439
3013	NC_015948	GC	3	6	127521	127526	0 %	0 %	50 %	50 %	344210439
3014	NC_015948	GTC	2	6	127549	127554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3015	NC_015948	GAA	2	6	127591	127596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210439
3016	NC_015948	CCT	2	6	127626	127631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210439
3017	NC_015948	GCCGG	2	10	127634	127643	0 %	0 %	60 %	40 %	344210439
3018	NC_015948	GGA	2	6	127683	127688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210439
3019	NC_015948	GAG	2	6	127693	127698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210439
3020	NC_015948	CCG	2	6	127731	127736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210439
3021	NC_015948	CGC	2	6	127782	127787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210439
3022	NC_015948	ACG	2	6	127790	127795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3023	NC_015948	ACG	2	6	127817	127822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3024	NC_015948	CAGA	2	8	127834	127841	50 %	0 %	25 %	25 %	344210439
3025	NC_015948	ATC	2	6	127867	127872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210439
3026	NC_015948	CAT	2	6	127893	127898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210439
3027	NC_015948	CGGT	2	8	127929	127936	0 %	25 %	50 %	25 %	344210439
3028	NC_015948	ACG	2	6	127958	127963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210439
3029	NC_015948	AGTC	2	8	128031	128038	25 %	25 %	25 %	25 %	344210440
3030	NC_015948	TCT	2	6	128041	128046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210440
3031	NC_015948	CGT	2	6	128051	128056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210440
3032	NC_015948	CGC	2	6	128152	128157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210440
3033	NC_015948	CGG	2	6	128170	128175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210440
3034	NC_015948	TCC	2	6	128253	128258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210440
3035	NC_015948	GTC	2	6	128282	128287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210440
3036	NC_015948	CG	3	6	128306	128311	0 %	0 %	50 %	50 %	344210440
3037	NC_015948	CCG	2	6	128341	128346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210440
3038	NC_015948	GGT	2	6	128377	128382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210440
3039	NC_015948	GGC	2	6	128390	128395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210440
3040	NC_015948	GAA	2	6	128420	128425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210440
3041	NC_015948	TCG	2	6	128445	128450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210440
3042	NC_015948	CGA	2	6	128461	128466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210440
3043	NC_015948	GTC	2	6	128495	128500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210440
3044	NC_015948	GT	3	6	128552	128557	0 %	50 %	50 %	0 %	344210440
3045	NC_015948	CCG	2	6	128568	128573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210440
3046	NC_015948	GTA	2	6	128617	128622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210440
3047	NC_015948	CGT	2	6	128653	128658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210440
3048	NC_015948	GTCA	2	8	128678	128685	25 %	25 %	25 %	25 %	344210440
3049	NC_015948	CAG	2	6	128687	128692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210440
3050	NC_015948	TGA	2	6	128842	128847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210441
3051	NC_015948	CAG	2	6	128861	128866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210441
3052	NC_015948	GAC	3	9	129094	129102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210442
3053	NC_015948	GTC	2	6	129109	129114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210442
3054	NC_015948	TCG	2	6	129158	129163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210442
3055	NC_015948	CGCT	2	8	129170	129177	0 %	25 %	25 %	50 %	344210442
3056	NC_015948	TC	3	6	129178	129183	0 %	50 %	0 %	50 %	344210442
3057	NC_015948	CGC	2	6	129186	129191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210442
3058	NC_015948	CGA	2	6	129234	129239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210442
3059	NC_015948	TTC	2	6	129271	129276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210442
3060	NC_015948	CGA	2	6	129296	129301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210442
3061	NC_015948	CGT	2	6	129336	129341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210442
3062	NC_015948	GTC	2	6	129417	129422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3063	NC_015948	CGCC	2	8	129434	129441	0 %	0 %	25 %	75 %	344210443
3064	NC_015948	CCG	2	6	129463	129468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210443
3065	NC_015948	CGA	2	6	129515	129520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3066	NC_015948	AGTCCG	2	12	129541	129552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3067	NC_015948	CGA	2	6	129575	129580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3068	NC_015948	ACG	2	6	129599	129604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3069	NC_015948	GCC	2	6	129645	129650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210443
3070	NC_015948	CGA	2	6	129734	129739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3071	NC_015948	GCC	2	6	129766	129771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210443
3072	NC_015948	CGA	2	6	129800	129805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3073	NC_015948	GGGC	2	8	129808	129815	0 %	0 %	75 %	25 %	344210443
3074	NC_015948	CCG	2	6	129833	129838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210443
3075	NC_015948	CGA	2	6	129839	129844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
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3079	NC_015948	CCG	2	6	130144	130149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210443
3080	NC_015948	GAC	2	6	130161	130166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3081	NC_015948	CCG	2	6	130202	130207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210443
3082	NC_015948	CGC	2	6	130236	130241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210443
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3084	NC_015948	GC	3	6	130367	130372	0 %	0 %	50 %	50 %	344210443
3085	NC_015948	GCG	2	6	130375	130380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210443
3086	NC_015948	TCG	2	6	130459	130464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3087	NC_015948	AGA	2	6	130480	130485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210443
3088	NC_015948	CAG	2	6	130498	130503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3089	NC_015948	CG	3	6	130566	130571	0 %	0 %	50 %	50 %	344210443
3090	NC_015948	GAC	2	6	130602	130607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3091	NC_015948	GGA	2	6	130620	130625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210443
3092	NC_015948	CGA	2	6	130649	130654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3093	NC_015948	AGT	2	6	130655	130660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210443
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3096	NC_015948	CGGCG	2	10	130770	130779	0 %	0 %	60 %	40 %	344210443
3097	NC_015948	TC	3	6	130802	130807	0 %	50 %	0 %	50 %	344210443
3098	NC_015948	CGA	2	6	130811	130816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210443
3099	NC_015948	AGA	2	6	130852	130857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210443
3100	NC_015948	ACC	2	6	130869	130874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210443
3101	NC_015948	GAC	2	6	131055	131060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210444
3102	NC_015948	CGG	2	6	131094	131099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210444
3103	NC_015948	GCT	2	6	131111	131116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210444
3104	NC_015948	CGG	2	6	131141	131146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210444
3105	NC_015948	CTCGC	2	10	131160	131169	0 %	20 %	20 %	60 %	344210444
3106	NC_015948	GCA	2	6	131296	131301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210444
3107	NC_015948	CGA	2	6	131309	131314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210444
3108	NC_015948	CGT	2	6	131372	131377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210444
3109	NC_015948	AAT	2	6	131399	131404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210444
3110	NC_015948	CGT	4	12	131424	131435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210445
3111	NC_015948	CGT	2	6	131493	131498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210445
3112	NC_015948	TCC	2	6	131522	131527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210445
3113	NC_015948	TCG	2	6	131570	131575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210445
3114	NC_015948	AC	3	6	131600	131605	50 %	0 %	0 %	50 %	344210445
3115	NC_015948	GTCGTA	2	12	131626	131637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210445
3116	NC_015948	ACC	2	6	131809	131814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210446
3117	NC_015948	CGA	2	6	131819	131824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210446
3118	NC_015948	GAG	2	6	131832	131837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210446
3119	NC_015948	CTC	2	6	131951	131956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210446
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3121	NC_015948	GAG	2	6	132030	132035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210446
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3123	NC_015948	TCG	3	9	132115	132123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210446
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3223	NC_015948	CGCGA	2	10	135773	135782	20 %	0 %	40 %	40 %	344210449
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3230	NC_015948	CTG	2	6	136044	136049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210449
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3233	NC_015948	AAC	2	6	136209	136214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210449
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3235	NC_015948	ACCGG	2	10	136466	136475	20 %	0 %	40 %	40 %	344210450
3236	NC_015948	GCC	2	6	136485	136490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210450
3237	NC_015948	CGC	2	6	136521	136526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210450
3238	NC_015948	ACGG	2	8	136569	136576	25 %	0 %	50 %	25 %	344210450
3239	NC_015948	GCGACA	2	12	136604	136615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210450
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3241	NC_015948	GGCC	2	8	136701	136708	0 %	0 %	50 %	50 %	344210450
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3354	NC_015948	GGCG	2	8	141163	141170	0 %	0 %	75 %	25 %	344210456
3355	NC_015948	TCG	2	6	141270	141275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210456
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3477	NC_015948	ACG	2	6	146236	146241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210461
3478	NC_015948	AGA	2	6	146255	146260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210461
3479	NC_015948	GCT	2	6	146261	146266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210461
3480	NC_015948	CTGA	2	8	146290	146297	25 %	25 %	25 %	25 %	344210461
3481	NC_015948	CGG	2	6	146298	146303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210462
3482	NC_015948	GGC	2	6	146338	146343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210462
3483	NC_015948	GACC	2	8	146370	146377	25 %	0 %	25 %	50 %	344210462
3484	NC_015948	GAACG	2	10	146410	146419	40 %	0 %	40 %	20 %	344210462
3485	NC_015948	GGA	2	6	146430	146435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210462
3486	NC_015948	GC	3	6	146503	146508	0 %	0 %	50 %	50 %	344210462
3487	NC_015948	CCA	2	6	146536	146541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210462
3488	NC_015948	ACC	2	6	146594	146599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210462
3489	NC_015948	CGG	2	6	146605	146610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210462
3490	NC_015948	GGTG	2	8	146673	146680	0 %	25 %	75 %	0 %	344210462
3491	NC_015948	GGAC	2	8	146700	146707	25 %	0 %	50 %	25 %	344210462
3492	NC_015948	CAG	2	6	146734	146739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210462
3493	NC_015948	CG	3	6	146740	146745	0 %	0 %	50 %	50 %	344210462
3494	NC_015948	CGG	2	6	146768	146773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210462
3495	NC_015948	TGG	2	6	146811	146816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210462
3496	NC_015948	CGA	2	6	146817	146822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210462
3497	NC_015948	ACG	2	6	146825	146830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210462
3498	NC_015948	GCG	2	6	146846	146851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210462
3499	NC_015948	GTA	2	6	146863	146868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210462
3500	NC_015948	CGA	2	6	146880	146885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210462

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