MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	C	6	6	11586	11591	0 %	0 %	0 %	100 %	344209951
2	NC_015944	T	6	6	17190	17195	0 %	100 %	0 %	0 %	344209956
3	NC_015944	T	6	6	25916	25921	0 %	100 %	0 %	0 %	344209963
4	NC_015944	G	6	6	29620	29625	0 %	0 %	100 %	0 %	344209966
5	NC_015944	C	6	6	32426	32431	0 %	0 %	0 %	100 %	344209968
6	NC_015944	C	7	7	33538	33544	0 %	0 %	0 %	100 %	344209969
7	NC_015944	C	6	6	45031	45036	0 %	0 %	0 %	100 %	344209977
8	NC_015944	A	6	6	46258	46263	100 %	0 %	0 %	0 %	344209977
9	NC_015944	T	6	6	51861	51866	0 %	100 %	0 %	0 %	344209980
10	NC_015944	G	6	6	59043	59048	0 %	0 %	100 %	0 %	344209985
11	NC_015944	A	6	6	61644	61649	100 %	0 %	0 %	0 %	344209989
12	NC_015944	G	6	6	64971	64976	0 %	0 %	100 %	0 %	344209994
13	NC_015944	C	6	6	75223	75228	0 %	0 %	0 %	100 %	344210005
14	NC_015944	G	6	6	90185	90190	0 %	0 %	100 %	0 %	344210023
15	NC_015944	G	6	6	111999	112004	0 %	0 %	100 %	0 %	344210048
16	NC_015944	G	6	6	114646	114651	0 %	0 %	100 %	0 %	344210050
17	NC_015944	T	7	7	115593	115599	0 %	100 %	0 %	0 %	344210051
18	NC_015944	T	6	6	144126	144131	0 %	100 %	0 %	0 %	344210078
19	NC_015944	G	6	6	157950	157955	0 %	0 %	100 %	0 %	344210090
20	NC_015944	C	6	6	163898	163903	0 %	0 %	0 %	100 %	344210094
21	NC_015944	C	6	6	165653	165658	0 %	0 %	0 %	100 %	344210095
22	NC_015944	G	6	6	168580	168585	0 %	0 %	100 %	0 %	344210097
23	NC_015944	T	6	6	174187	174192	0 %	100 %	0 %	0 %	344210102
24	NC_015944	T	6	6	177550	177555	0 %	100 %	0 %	0 %	344210104
25	NC_015944	A	6	6	178056	178061	100 %	0 %	0 %	0 %	344210104
26	NC_015944	C	6	6	178730	178735	0 %	0 %	0 %	100 %	344210105
27	NC_015944	T	6	6	181711	181716	0 %	100 %	0 %	0 %	344210107
28	NC_015944	T	6	6	184068	184073	0 %	100 %	0 %	0 %	344210108
29	NC_015944	A	7	7	187961	187967	100 %	0 %	0 %	0 %	344210111
30	NC_015944	G	6	6	189977	189982	0 %	0 %	100 %	0 %	344210112
31	NC_015944	A	6	6	195484	195489	100 %	0 %	0 %	0 %	344210119
32	NC_015944	G	6	6	195492	195497	0 %	0 %	100 %	0 %	344210119
33	NC_015944	G	6	6	214215	214220	0 %	0 %	100 %	0 %	344210133
34	NC_015944	C	6	6	216675	216680	0 %	0 %	0 %	100 %	344210136
35	NC_015944	C	6	6	219120	219125	0 %	0 %	0 %	100 %	344210137
36	NC_015944	C	6	6	234596	234601	0 %	0 %	0 %	100 %	344210151
37	NC_015944	G	7	7	236950	236956	0 %	0 %	100 %	0 %	344210153
38	NC_015944	C	6	6	244051	244056	0 %	0 %	0 %	100 %	344210160
39	NC_015944	C	6	6	246018	246023	0 %	0 %	0 %	100 %	344210162
40	NC_015944	G	6	6	249048	249053	0 %	0 %	100 %	0 %	344210165
41	NC_015944	C	6	6	262453	262458	0 %	0 %	0 %	100 %	344210176
42	NC_015944	C	6	6	265788	265793	0 %	0 %	0 %	100 %	344210178
43	NC_015944	C	6	6	270027	270032	0 %	0 %	0 %	100 %	344210182
44	NC_015944	T	7	7	281468	281474	0 %	100 %	0 %	0 %	344210194
45	NC_015944	C	7	7	288077	288083	0 %	0 %	0 %	100 %	344210202
46	NC_015944	A	6	6	293296	293301	100 %	0 %	0 %	0 %	344210209
47	NC_015944	G	6	6	295233	295238	0 %	0 %	100 %	0 %	344210211
48	NC_015944	G	6	6	302149	302154	0 %	0 %	100 %	0 %	344210215
49	NC_015944	C	6	6	309119	309124	0 %	0 %	0 %	100 %	344210221
50	NC_015944	C	6	6	311900	311905	0 %	0 %	0 %	100 %	344210223
51	NC_015944	G	6	6	326914	326919	0 %	0 %	100 %	0 %	344210238
52	NC_015944	C	6	6	329595	329600	0 %	0 %	0 %	100 %	344210240
53	NC_015944	C	6	6	336389	336394	0 %	0 %	0 %	100 %	344210245
54	NC_015944	G	6	6	336589	336594	0 %	0 %	100 %	0 %	344210245
55	NC_015944	G	6	6	346906	346911	0 %	0 %	100 %	0 %	344210255
56	NC_015944	C	6	6	354126	354131	0 %	0 %	0 %	100 %	344210264
57	NC_015944	A	7	7	359455	359461	100 %	0 %	0 %	0 %	344210268
58	NC_015944	T	6	6	360022	360027	0 %	100 %	0 %	0 %	344210268
59	NC_015944	C	6	6	361828	361833	0 %	0 %	0 %	100 %	344210268
60	NC_015944	G	7	7	366308	366314	0 %	0 %	100 %	0 %	344210274
61	NC_015944	A	6	6	366416	366421	100 %	0 %	0 %	0 %	344210274
62	NC_015944	G	6	6	366919	366924	0 %	0 %	100 %	0 %	344210275
63	NC_015944	A	6	6	368706	368711	100 %	0 %	0 %	0 %	344210277
64	NC_015944	T	6	6	370568	370573	0 %	100 %	0 %	0 %	344210278
65	NC_015944	A	6	6	378051	378056	100 %	0 %	0 %	0 %	344210283
66	NC_015944	C	6	6	385223	385228	0 %	0 %	0 %	100 %	344210288
67	NC_015944	C	6	6	390836	390841	0 %	0 %	0 %	100 %	344210292
68	NC_015944	G	6	6	398133	398138	0 %	0 %	100 %	0 %	344210297

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.