MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	GC	3	6	654	659	0 %	0 %	50 %	50 %	344209943
2	NC_015944	CG	3	6	741	746	0 %	0 %	50 %	50 %	344209943
3	NC_015944	AG	3	6	826	831	50 %	0 %	50 %	0 %	344209943
4	NC_015944	CT	3	6	1116	1121	0 %	50 %	0 %	50 %	344209943
5	NC_015944	AG	3	6	2491	2496	50 %	0 %	50 %	0 %	344209945
6	NC_015944	CT	3	6	2915	2920	0 %	50 %	0 %	50 %	344209945
7	NC_015944	CA	3	6	6728	6733	50 %	0 %	0 %	50 %	344209948
8	NC_015944	CG	3	6	7982	7987	0 %	0 %	50 %	50 %	344209948
9	NC_015944	AC	3	6	9280	9285	50 %	0 %	0 %	50 %	344209949
10	NC_015944	CG	3	6	9791	9796	0 %	0 %	50 %	50 %	344209950
11	NC_015944	TC	3	6	11658	11663	0 %	50 %	0 %	50 %	344209951
12	NC_015944	TC	3	6	12937	12942	0 %	50 %	0 %	50 %	344209952
13	NC_015944	GA	3	6	13241	13246	50 %	0 %	50 %	0 %	344209953
14	NC_015944	AC	3	6	14112	14117	50 %	0 %	0 %	50 %	344209953
15	NC_015944	TG	3	6	16388	16393	0 %	50 %	50 %	0 %	344209955
16	NC_015944	TG	3	6	18514	18519	0 %	50 %	50 %	0 %	344209956
17	NC_015944	TC	3	6	18601	18606	0 %	50 %	0 %	50 %	344209956
18	NC_015944	AC	3	6	20359	20364	50 %	0 %	0 %	50 %	344209959
19	NC_015944	CT	3	6	21343	21348	0 %	50 %	0 %	50 %	344209960
20	NC_015944	AC	3	6	21425	21430	50 %	0 %	0 %	50 %	344209960
21	NC_015944	TA	3	6	21461	21466	50 %	50 %	0 %	0 %	344209960
22	NC_015944	CA	3	6	22698	22703	50 %	0 %	0 %	50 %	344209961
23	NC_015944	CT	3	6	22705	22710	0 %	50 %	0 %	50 %	344209961
24	NC_015944	TC	3	6	25884	25889	0 %	50 %	0 %	50 %	344209963
25	NC_015944	CT	3	6	26862	26867	0 %	50 %	0 %	50 %	344209964
26	NC_015944	AT	3	6	27002	27007	50 %	50 %	0 %	0 %	344209964
27	NC_015944	CG	3	6	27478	27483	0 %	0 %	50 %	50 %	344209964
28	NC_015944	TC	3	6	27548	27553	0 %	50 %	0 %	50 %	344209964
29	NC_015944	GC	3	6	28061	28066	0 %	0 %	50 %	50 %	344209964
30	NC_015944	AC	3	6	29309	29314	50 %	0 %	0 %	50 %	344209966
31	NC_015944	AG	3	6	29522	29527	50 %	0 %	50 %	0 %	344209966
32	NC_015944	AC	3	6	30059	30064	50 %	0 %	0 %	50 %	344209967
33	NC_015944	GA	3	6	30066	30071	50 %	0 %	50 %	0 %	344209967
34	NC_015944	GC	3	6	31963	31968	0 %	0 %	50 %	50 %	344209968
35	NC_015944	GT	3	6	32229	32234	0 %	50 %	50 %	0 %	344209968
36	NC_015944	GC	3	6	33141	33146	0 %	0 %	50 %	50 %	344209969
37	NC_015944	GA	3	6	33771	33776	50 %	0 %	50 %	0 %	344209969
38	NC_015944	GA	3	6	34354	34359	50 %	0 %	50 %	0 %	344209969
39	NC_015944	TG	3	6	34812	34817	0 %	50 %	50 %	0 %	344209970
40	NC_015944	CG	3	6	35571	35576	0 %	0 %	50 %	50 %	344209970
41	NC_015944	CT	3	6	35967	35972	0 %	50 %	0 %	50 %	344209971
42	NC_015944	CA	3	6	36103	36108	50 %	0 %	0 %	50 %	344209971
43	NC_015944	AG	3	6	36447	36452	50 %	0 %	50 %	0 %	344209971
44	NC_015944	AT	3	6	37829	37834	50 %	50 %	0 %	0 %	344209972
45	NC_015944	CT	3	6	38220	38225	0 %	50 %	0 %	50 %	344209973
46	NC_015944	CA	3	6	38998	39003	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
47	NC_015944	AC	3	6	39042	39047	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
48	NC_015944	GT	3	6	39831	39836	0 %	50 %	50 %	0 %	344209974
49	NC_015944	CA	3	6	39898	39903	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
50	NC_015944	CA	3	6	40135	40140	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
51	NC_015944	TC	3	6	41358	41363	0 %	50 %	0 %	50 %	344209974
52	NC_015944	GA	3	6	41584	41589	50 %	0 %	50 %	0 %	344209975
53	NC_015944	AG	3	6	41656	41661	50 %	0 %	50 %	0 %	344209975
54	NC_015944	CA	3	6	42366	42371	50 %	0 %	0 %	50 %	344209976
55	NC_015944	TC	3	6	43998	44003	0 %	50 %	0 %	50 %	344209977
56	NC_015944	GC	3	6	44346	44351	0 %	0 %	50 %	50 %	344209977
57	NC_015944	GC	3	6	44946	44951	0 %	0 %	50 %	50 %	344209977
58	NC_015944	TC	3	6	45528	45533	0 %	50 %	0 %	50 %	344209977
59	NC_015944	GC	3	6	47627	47632	0 %	0 %	50 %	50 %	344209978
60	NC_015944	AT	3	6	48496	48501	50 %	50 %	0 %	0 %	344209978
61	NC_015944	CA	3	6	49447	49452	50 %	0 %	0 %	50 %	344209979
62	NC_015944	TA	3	6	49505	49510	50 %	50 %	0 %	0 %	344209979
63	NC_015944	TA	3	6	49966	49971	50 %	50 %	0 %	0 %	344209979
64	NC_015944	AG	3	6	52016	52021	50 %	0 %	50 %	0 %	344209980
65	NC_015944	GC	3	6	53022	53027	0 %	0 %	50 %	50 %	344209981
66	NC_015944	CT	3	6	53760	53765	0 %	50 %	0 %	50 %	344209981
67	NC_015944	CA	3	6	53897	53902	50 %	0 %	0 %	50 %	344209981
68	NC_015944	TC	3	6	54110	54115	0 %	50 %	0 %	50 %	344209982
69	NC_015944	CG	3	6	54171	54176	0 %	0 %	50 %	50 %	344209982
70	NC_015944	GC	3	6	54822	54827	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
71	NC_015944	GT	3	6	55399	55404	0 %	50 %	50 %	0 %	344209983
72	NC_015944	GC	3	6	55521	55526	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
73	NC_015944	CG	3	6	55947	55952	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
74	NC_015944	TC	3	6	56418	56423	0 %	50 %	0 %	50 %	344209983
75	NC_015944	CG	4	8	56951	56958	0 %	0 %	50 %	50 %	344209984
76	NC_015944	CT	3	6	57120	57125	0 %	50 %	0 %	50 %	344209984
77	NC_015944	CT	3	6	59291	59296	0 %	50 %	0 %	50 %	344209985
78	NC_015944	CG	3	6	59609	59614	0 %	0 %	50 %	50 %	344209986
79	NC_015944	GC	3	6	60027	60032	0 %	0 %	50 %	50 %	344209986
80	NC_015944	GC	3	6	60493	60498	0 %	0 %	50 %	50 %	344209987
81	NC_015944	GT	3	6	61623	61628	0 %	50 %	50 %	0 %	344209989
82	NC_015944	CT	3	6	61880	61885	0 %	50 %	0 %	50 %	344209990
83	NC_015944	GT	3	6	62245	62250	0 %	50 %	50 %	0 %	344209990
84	NC_015944	GT	3	6	62880	62885	0 %	50 %	50 %	0 %	344209991
85	NC_015944	CG	3	6	63259	63264	0 %	0 %	50 %	50 %	344209992
86	NC_015944	AG	3	6	64260	64265	50 %	0 %	50 %	0 %	344209993
87	NC_015944	GC	3	6	64302	64307	0 %	0 %	50 %	50 %	344209993
88	NC_015944	GC	3	6	64367	64372	0 %	0 %	50 %	50 %	344209993
89	NC_015944	CG	3	6	65115	65120	0 %	0 %	50 %	50 %	344209994
90	NC_015944	CA	4	8	65450	65457	50 %	0 %	0 %	50 %	344209995
91	NC_015944	GA	3	6	65937	65942	50 %	0 %	50 %	0 %	344209995
92	NC_015944	CG	3	6	66033	66038	0 %	0 %	50 %	50 %	344209995
93	NC_015944	AC	3	6	66126	66131	50 %	0 %	0 %	50 %	344209995
94	NC_015944	GC	3	6	66729	66734	0 %	0 %	50 %	50 %	344209995
95	NC_015944	GT	3	6	68770	68775	0 %	50 %	50 %	0 %	344209996
96	NC_015944	GA	3	6	69423	69428	50 %	0 %	50 %	0 %	344209996
97	NC_015944	CG	3	6	72541	72546	0 %	0 %	50 %	50 %	344210001
98	NC_015944	GC	3	6	72661	72666	0 %	0 %	50 %	50 %	344210001
99	NC_015944	CG	3	6	72961	72966	0 %	0 %	50 %	50 %	344210002
100	NC_015944	GC	3	6	73587	73592	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
101	NC_015944	CG	3	6	73655	73660	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
102	NC_015944	GC	3	6	73668	73673	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
103	NC_015944	CG	3	6	74453	74458	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
104	NC_015944	AC	3	6	75069	75074	50 %	0 %	0 %	50 %	344210005
105	NC_015944	GC	3	6	75687	75692	0 %	0 %	50 %	50 %	344210006
106	NC_015944	TA	3	6	77301	77306	50 %	50 %	0 %	0 %	344210007
107	NC_015944	CG	3	6	77981	77986	0 %	0 %	50 %	50 %	344210009
108	NC_015944	CG	3	6	79201	79206	0 %	0 %	50 %	50 %	344210011
109	NC_015944	TG	3	6	79982	79987	0 %	50 %	50 %	0 %	344210011
110	NC_015944	CT	3	6	81627	81632	0 %	50 %	0 %	50 %	344210014
111	NC_015944	TG	3	6	82369	82374	0 %	50 %	50 %	0 %	344210015
112	NC_015944	CA	3	6	82560	82565	50 %	0 %	0 %	50 %	344210015
113	NC_015944	TC	3	6	83111	83116	0 %	50 %	0 %	50 %	344210016
114	NC_015944	GA	3	6	83811	83816	50 %	0 %	50 %	0 %	344210017
115	NC_015944	TG	3	6	84968	84973	0 %	50 %	50 %	0 %	344210018
116	NC_015944	TC	3	6	85019	85024	0 %	50 %	0 %	50 %	344210019
117	NC_015944	AC	3	6	86336	86341	50 %	0 %	0 %	50 %	344210020
118	NC_015944	GC	3	6	86863	86868	0 %	0 %	50 %	50 %	344210020
119	NC_015944	TG	3	6	86877	86882	0 %	50 %	50 %	0 %	344210020
120	NC_015944	CG	3	6	88578	88583	0 %	0 %	50 %	50 %	344210022
121	NC_015944	GC	3	6	89262	89267	0 %	0 %	50 %	50 %	344210022
122	NC_015944	GC	3	6	89954	89959	0 %	0 %	50 %	50 %	344210023
123	NC_015944	GC	3	6	90067	90072	0 %	0 %	50 %	50 %	344210023
124	NC_015944	GC	3	6	91034	91039	0 %	0 %	50 %	50 %	344210024
125	NC_015944	GC	3	6	91156	91161	0 %	0 %	50 %	50 %	344210024
126	NC_015944	AG	3	6	91880	91885	50 %	0 %	50 %	0 %	344210025
127	NC_015944	AT	3	6	92288	92293	50 %	50 %	0 %	0 %	344210025
128	NC_015944	GC	3	6	92526	92531	0 %	0 %	50 %	50 %	344210026
129	NC_015944	AT	3	6	97815	97820	50 %	50 %	0 %	0 %	344210032
130	NC_015944	TC	3	6	98488	98493	0 %	50 %	0 %	50 %	344210033
131	NC_015944	TA	3	6	99604	99609	50 %	50 %	0 %	0 %	344210033
132	NC_015944	GA	3	6	99874	99879	50 %	0 %	50 %	0 %	344210034
133	NC_015944	TC	3	6	100027	100032	0 %	50 %	0 %	50 %	344210034
134	NC_015944	CA	3	6	100077	100082	50 %	0 %	0 %	50 %	344210034
135	NC_015944	AG	3	6	100097	100102	50 %	0 %	50 %	0 %	344210034
136	NC_015944	CG	3	6	100116	100121	0 %	0 %	50 %	50 %	344210034
137	NC_015944	TG	3	6	103471	103476	0 %	50 %	50 %	0 %	344210039
138	NC_015944	GC	3	6	103892	103897	0 %	0 %	50 %	50 %	344210040
139	NC_015944	GC	3	6	105523	105528	0 %	0 %	50 %	50 %	344210041
140	NC_015944	CT	3	6	107084	107089	0 %	50 %	0 %	50 %	344210043
141	NC_015944	TG	3	6	107304	107309	0 %	50 %	50 %	0 %	344210043
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