MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	GCGA	2	8	489	496	25 %	0 %	50 %	25 %	344209943
2	NC_015944	GATC	2	8	999	1006	25 %	25 %	25 %	25 %	344209943
3	NC_015944	TTCT	2	8	1787	1794	0 %	75 %	0 %	25 %	344209944
4	NC_015944	CCCG	2	8	3304	3311	0 %	0 %	25 %	75 %	344209946
5	NC_015944	GTAC	2	8	4588	4595	25 %	25 %	25 %	25 %	344209947
6	NC_015944	CTCA	2	8	5450	5457	25 %	25 %	0 %	50 %	344209947
7	NC_015944	AGGC	2	8	5626	5633	25 %	0 %	50 %	25 %	344209947
8	NC_015944	TGGC	2	8	5719	5726	0 %	25 %	50 %	25 %	344209947
9	NC_015944	TGGT	2	8	6091	6098	0 %	50 %	50 %	0 %	344209947
10	NC_015944	CGAC	2	8	6301	6308	25 %	0 %	25 %	50 %	344209948
11	NC_015944	CGCC	2	8	7457	7464	0 %	0 %	25 %	75 %	344209948
12	NC_015944	CGAG	2	8	7618	7625	25 %	0 %	50 %	25 %	344209948
13	NC_015944	ACCC	2	8	7759	7766	25 %	0 %	0 %	75 %	344209948
14	NC_015944	TTCG	2	8	8561	8568	0 %	50 %	25 %	25 %	344209948
15	NC_015944	CAGT	2	8	9677	9684	25 %	25 %	25 %	25 %	344209950
16	NC_015944	GTCG	2	8	9829	9836	0 %	25 %	50 %	25 %	344209950
17	NC_015944	CGAC	2	8	11183	11190	25 %	0 %	25 %	50 %	344209951
18	NC_015944	CGAC	2	8	12112	12119	25 %	0 %	25 %	50 %	344209952
19	NC_015944	GTCC	2	8	12682	12689	0 %	25 %	25 %	50 %	344209952
20	NC_015944	TGGG	2	8	12772	12779	0 %	25 %	75 %	0 %	344209952
21	NC_015944	CGCA	2	8	13545	13552	25 %	0 %	25 %	50 %	344209953
22	NC_015944	GGTG	2	8	13599	13606	0 %	25 %	75 %	0 %	344209953
23	NC_015944	TTGC	2	8	14014	14021	0 %	50 %	25 %	25 %	344209953
24	NC_015944	GCCC	2	8	14610	14617	0 %	0 %	25 %	75 %	344209954
25	NC_015944	CCGA	2	8	14993	15000	25 %	0 %	25 %	50 %	344209954
26	NC_015944	GGCA	2	8	15110	15117	25 %	0 %	50 %	25 %	344209954
27	NC_015944	TGGG	2	8	16228	16235	0 %	25 %	75 %	0 %	344209955
28	NC_015944	CTTC	2	8	16340	16347	0 %	50 %	0 %	50 %	344209955
29	NC_015944	ACGT	2	8	16404	16411	25 %	25 %	25 %	25 %	344209955
30	NC_015944	TTAG	2	8	16662	16669	25 %	50 %	25 %	0 %	344209955
31	NC_015944	ATGA	2	8	17732	17739	50 %	25 %	25 %	0 %	344209956
32	NC_015944	CGAA	2	8	18020	18027	50 %	0 %	25 %	25 %	344209956
33	NC_015944	GCTC	2	8	18445	18452	0 %	25 %	25 %	50 %	344209956
34	NC_015944	AAAC	2	8	18915	18922	75 %	0 %	0 %	25 %	344209957
35	NC_015944	CGAC	2	8	19093	19100	25 %	0 %	25 %	50 %	344209957
36	NC_015944	CGAC	2	8	19161	19168	25 %	0 %	25 %	50 %	344209958
37	NC_015944	CAAC	2	8	19293	19300	50 %	0 %	0 %	50 %	344209958
38	NC_015944	GCAA	2	8	19465	19472	50 %	0 %	25 %	25 %	344209958
39	NC_015944	GCCA	2	8	20403	20410	25 %	0 %	25 %	50 %	344209959
40	NC_015944	TCCG	2	8	22026	22033	0 %	25 %	25 %	50 %	344209960
41	NC_015944	TACG	2	8	22158	22165	25 %	25 %	25 %	25 %	344209960
42	NC_015944	CTTG	2	8	23119	23126	0 %	50 %	25 %	25 %	344209961
43	NC_015944	AGCT	2	8	23226	23233	25 %	25 %	25 %	25 %	344209961
44	NC_015944	GATG	2	8	23355	23362	25 %	25 %	50 %	0 %	344209962
45	NC_015944	CAAG	2	8	23436	23443	50 %	0 %	25 %	25 %	344209962
46	NC_015944	GCAA	2	8	23447	23454	50 %	0 %	25 %	25 %	344209962
47	NC_015944	CTTC	2	8	25863	25870	0 %	50 %	0 %	50 %	344209963
48	NC_015944	TCGC	2	8	26383	26390	0 %	25 %	25 %	50 %	344209963
49	NC_015944	GACC	2	8	26854	26861	25 %	0 %	25 %	50 %	344209964
50	NC_015944	GGCA	2	8	27420	27427	25 %	0 %	50 %	25 %	344209964
51	NC_015944	CGCT	2	8	27554	27561	0 %	25 %	25 %	50 %	344209964
52	NC_015944	CGGT	2	8	28707	28714	0 %	25 %	50 %	25 %	344209965
53	NC_015944	TCGT	2	8	28774	28781	0 %	50 %	25 %	25 %	344209965
54	NC_015944	GTCG	2	8	29602	29609	0 %	25 %	50 %	25 %	344209966
55	NC_015944	GCTG	2	8	30300	30307	0 %	25 %	50 %	25 %	344209967
56	NC_015944	CGGA	2	8	30320	30327	25 %	0 %	50 %	25 %	344209967
57	NC_015944	TCGG	2	8	30527	30534	0 %	25 %	50 %	25 %	344209967
58	NC_015944	TCGA	2	8	30650	30657	25 %	25 %	25 %	25 %	344209967
59	NC_015944	GTCT	2	8	31170	31177	0 %	50 %	25 %	25 %	344209968
60	NC_015944	GACG	2	8	31237	31244	25 %	0 %	50 %	25 %	344209968
61	NC_015944	GCTG	2	8	31508	31515	0 %	25 %	50 %	25 %	344209968
62	NC_015944	TCAT	2	8	32542	32549	25 %	50 %	0 %	25 %	344209968
63	NC_015944	CGAG	2	8	33061	33068	25 %	0 %	50 %	25 %	344209969
64	NC_015944	CCCA	2	8	33404	33411	25 %	0 %	0 %	75 %	344209969
65	NC_015944	CGGT	2	8	33873	33880	0 %	25 %	50 %	25 %	344209969
66	NC_015944	TGAC	2	8	33885	33892	25 %	25 %	25 %	25 %	344209969
67	NC_015944	GCCG	2	8	33906	33913	0 %	0 %	50 %	50 %	344209969
68	NC_015944	TACG	2	8	33914	33921	25 %	25 %	25 %	25 %	344209969
69	NC_015944	GTTC	2	8	33942	33949	0 %	50 %	25 %	25 %	344209969
70	NC_015944	GTCG	2	8	34283	34290	0 %	25 %	50 %	25 %	344209969
71	NC_015944	GATC	2	8	36184	36191	25 %	25 %	25 %	25 %	344209971
72	NC_015944	GTGC	2	8	36244	36251	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
73	NC_015944	TCGC	2	8	36324	36331	0 %	25 %	25 %	50 %	344209971
74	NC_015944	TCGG	2	8	36404	36411	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
75	NC_015944	CGGT	2	8	36462	36469	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
76	NC_015944	TCGT	2	8	36992	36999	0 %	50 %	25 %	25 %	344209972
77	NC_015944	CGAC	2	8	37677	37684	25 %	0 %	25 %	50 %	344209972
78	NC_015944	GACA	2	8	37699	37706	50 %	0 %	25 %	25 %	344209972
79	NC_015944	ATCT	2	8	37786	37793	25 %	50 %	0 %	25 %	344209972
80	NC_015944	ACGG	2	8	38855	38862	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
81	NC_015944	GCGA	2	8	38876	38883	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
82	NC_015944	GCGA	2	8	38989	38996	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
83	NC_015944	GCTC	2	8	39078	39085	0 %	25 %	25 %	50 %	344209974
84	NC_015944	ACGA	2	8	39449	39456	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
85	NC_015944	ACGA	2	8	39878	39885	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
86	NC_015944	GCCG	2	8	39937	39944	0 %	0 %	50 %	50 %	344209974
87	NC_015944	ACGA	2	8	39950	39957	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
88	NC_015944	CGAC	2	8	40044	40051	25 %	0 %	25 %	50 %	344209974
89	NC_015944	GATC	2	8	40288	40295	25 %	25 %	25 %	25 %	344209974
90	NC_015944	CTGA	2	8	40352	40359	25 %	25 %	25 %	25 %	344209974
91	NC_015944	GGCA	2	8	40432	40439	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
92	NC_015944	GCCG	2	8	40499	40506	0 %	0 %	50 %	50 %	344209974
93	NC_015944	GGGC	2	8	41985	41992	0 %	0 %	75 %	25 %	344209976
94	NC_015944	GTCG	2	8	42848	42855	0 %	25 %	50 %	25 %	344209976
95	NC_015944	GCGG	2	8	42897	42904	0 %	0 %	75 %	25 %	344209976
96	NC_015944	CGGA	2	8	42919	42926	25 %	0 %	50 %	25 %	344209976
97	NC_015944	ACGG	2	8	43142	43149	25 %	0 %	50 %	25 %	344209977
98	NC_015944	CCGG	2	8	43385	43392	0 %	0 %	50 %	50 %	344209977
99	NC_015944	GAAC	2	8	43849	43856	50 %	0 %	25 %	25 %	344209977
100	NC_015944	TTGG	2	8	44042	44049	0 %	50 %	50 %	0 %	344209977
101	NC_015944	TCCG	2	8	44474	44481	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
102	NC_015944	CGCT	2	8	44849	44856	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
103	NC_015944	GGGT	2	8	45519	45526	0 %	25 %	75 %	0 %	344209977
104	NC_015944	CGAA	2	8	45553	45560	50 %	0 %	25 %	25 %	344209977
105	NC_015944	GTGC	2	8	45643	45650	0 %	25 %	50 %	25 %	344209977
106	NC_015944	CGCC	2	8	46672	46679	0 %	0 %	25 %	75 %	344209977
107	NC_015944	CTCG	2	8	46688	46695	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
108	NC_015944	TCGC	2	8	46700	46707	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
109	NC_015944	CAAG	2	8	46834	46841	50 %	0 %	25 %	25 %	344209977
110	NC_015944	CCGT	2	8	47443	47450	0 %	25 %	25 %	50 %	344209978
111	NC_015944	CGTT	2	8	48057	48064	0 %	50 %	25 %	25 %	344209978
112	NC_015944	CGAT	2	8	48907	48914	25 %	25 %	25 %	25 %	344209978
113	NC_015944	GGCT	2	8	49031	49038	0 %	25 %	50 %	25 %	344209978
114	NC_015944	TGGG	2	8	49135	49142	0 %	25 %	75 %	0 %	344209978
115	NC_015944	ACCC	2	8	49622	49629	25 %	0 %	0 %	75 %	344209979
116	NC_015944	AGTG	2	8	49952	49959	25 %	25 %	50 %	0 %	344209979
117	NC_015944	GAAC	2	8	50047	50054	50 %	0 %	25 %	25 %	344209979
118	NC_015944	CGAG	2	8	52592	52599	25 %	0 %	50 %	25 %	344209980
119	NC_015944	CTCC	2	8	52635	52642	0 %	25 %	0 %	75 %	344209980
120	NC_015944	CGCT	2	8	54677	54684	0 %	25 %	25 %	50 %	344209983
121	NC_015944	GAGT	2	8	54792	54799	25 %	25 %	50 %	0 %	344209983
122	NC_015944	GTTC	2	8	55428	55435	0 %	50 %	25 %	25 %	344209983
123	NC_015944	GGAC	2	8	55901	55908	25 %	0 %	50 %	25 %	344209983
124	NC_015944	GCAG	2	8	56052	56059	25 %	0 %	50 %	25 %	344209983
125	NC_015944	GCTC	2	8	56112	56119	0 %	25 %	25 %	50 %	344209983
126	NC_015944	TCGT	2	8	56216	56223	0 %	50 %	25 %	25 %	344209983
127	NC_015944	GCCC	2	8	56857	56864	0 %	0 %	25 %	75 %	344209984
128	NC_015944	TCAG	2	8	57005	57012	25 %	25 %	25 %	25 %	344209984
129	NC_015944	CCGG	2	8	57093	57100	0 %	0 %	50 %	50 %	344209984
130	NC_015944	TCGT	2	8	57300	57307	0 %	50 %	25 %	25 %	344209984
131	NC_015944	CAAG	2	8	57315	57322	50 %	0 %	25 %	25 %	344209984
132	NC_015944	CCGG	2	8	57734	57741	0 %	0 %	50 %	50 %	344209984
133	NC_015944	CGAC	2	8	58836	58843	25 %	0 %	25 %	50 %	344209985
134	NC_015944	GGCC	2	8	59015	59022	0 %	0 %	50 %	50 %	344209985
135	NC_015944	ACCC	2	8	59089	59096	25 %	0 %	0 %	75 %	344209985
136	NC_015944	GGAC	2	8	60284	60291	25 %	0 %	50 %	25 %	344209987
137	NC_015944	CGGT	2	8	60434	60441	0 %	25 %	50 %	25 %	344209987
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