MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 7750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015944	GGC	2	6	33317	33322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209969
502	NC_015944	CCG	2	6	33333	33338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209969
503	NC_015944	TCG	2	6	33348	33353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
504	NC_015944	TCG	2	6	33387	33392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
505	NC_015944	CCCA	2	8	33404	33411	25 %	0 %	0 %	75 %	344209969
506	NC_015944	CGG	2	6	33511	33516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209969
507	NC_015944	C	7	7	33538	33544	0 %	0 %	0 %	100 %	344209969
508	NC_015944	CGC	2	6	33568	33573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209969
509	NC_015944	TGA	2	6	33625	33630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209969
510	NC_015944	TCG	2	6	33723	33728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
511	NC_015944	GCC	2	6	33729	33734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209969
512	NC_015944	ACG	2	6	33750	33755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209969
513	NC_015944	CGG	2	6	33757	33762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209969
514	NC_015944	GA	3	6	33771	33776	50 %	0 %	50 %	0 %	344209969
515	NC_015944	CGT	2	6	33779	33784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
516	NC_015944	GCC	2	6	33821	33826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209969
517	NC_015944	CGGT	2	8	33873	33880	0 %	25 %	50 %	25 %	344209969
518	NC_015944	TGAC	2	8	33885	33892	25 %	25 %	25 %	25 %	344209969
519	NC_015944	GCCG	2	8	33906	33913	0 %	0 %	50 %	50 %	344209969
520	NC_015944	TACG	2	8	33914	33921	25 %	25 %	25 %	25 %	344209969
521	NC_015944	CGT	2	6	33932	33937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
522	NC_015944	GTTC	2	8	33942	33949	0 %	50 %	25 %	25 %	344209969
523	NC_015944	GCG	2	6	34107	34112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209969
524	NC_015944	TCG	2	6	34131	34136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
525	NC_015944	GGT	2	6	34157	34162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209969
526	NC_015944	GGC	2	6	34252	34257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209969
527	NC_015944	GTCG	2	8	34283	34290	0 %	25 %	50 %	25 %	344209969
528	NC_015944	GAG	2	6	34322	34327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209969
529	NC_015944	GA	3	6	34354	34359	50 %	0 %	50 %	0 %	344209969
530	NC_015944	CCG	2	6	34526	34531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209969
531	NC_015944	AGC	2	6	34563	34568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
532	NC_015944	ACG	2	6	34587	34592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
533	NC_015944	GAG	2	6	34649	34654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209970
534	NC_015944	CGA	2	6	34690	34695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
535	NC_015944	ACC	2	6	34716	34721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209970
536	NC_015944	GAT	2	6	34733	34738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209970
537	NC_015944	GCC	2	6	34751	34756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209970
538	NC_015944	TG	3	6	34812	34817	0 %	50 %	50 %	0 %	344209970
539	NC_015944	GTC	2	6	34881	34886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209970
540	NC_015944	CGG	2	6	34900	34905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209970
541	NC_015944	GAA	2	6	34922	34927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209970
542	NC_015944	TAATCG	2	12	35029	35040	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344209970
543	NC_015944	CGC	2	6	35047	35052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209970
544	NC_015944	CGA	2	6	35056	35061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
545	NC_015944	TCG	2	6	35097	35102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209970
546	NC_015944	CGA	2	6	35155	35160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
547	NC_015944	TGA	2	6	35182	35187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209970
548	NC_015944	CGA	2	6	35356	35361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
549	NC_015944	ACG	2	6	35370	35375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
550	NC_015944	GTCGA	2	10	35385	35394	20 %	20 %	40 %	20 %	344209970
551	NC_015944	CCG	2	6	35424	35429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209970
552	NC_015944	GGC	2	6	35450	35455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209970
553	NC_015944	CGA	2	6	35503	35508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209970
554	NC_015944	CG	3	6	35571	35576	0 %	0 %	50 %	50 %	344209970
555	NC_015944	CT	3	6	35967	35972	0 %	50 %	0 %	50 %	344209971
556	NC_015944	ATC	2	6	36024	36029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209971
557	NC_015944	AAC	2	6	36056	36061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209971
558	NC_015944	CA	3	6	36103	36108	50 %	0 %	0 %	50 %	344209971
559	NC_015944	GATC	2	8	36184	36191	25 %	25 %	25 %	25 %	344209971
560	NC_015944	GTGC	2	8	36244	36251	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
561	NC_015944	GTA	2	6	36299	36304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209971
562	NC_015944	GGT	2	6	36313	36318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209971
563	NC_015944	TCGC	2	8	36324	36331	0 %	25 %	25 %	50 %	344209971
564	NC_015944	CGC	2	6	36350	36355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209971
565	NC_015944	TCGG	2	8	36404	36411	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
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568	NC_015944	CGGT	2	8	36462	36469	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
569	NC_015944	GCT	2	6	36594	36599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209972
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571	NC_015944	CGG	2	6	36639	36644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209972
572	NC_015944	CTC	2	6	36667	36672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209972
573	NC_015944	CGA	2	6	36681	36686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209972
574	NC_015944	CGA	2	6	36702	36707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209972
575	NC_015944	CGC	2	6	36795	36800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209972
576	NC_015944	CGT	2	6	36852	36857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209972
577	NC_015944	CGG	2	6	36903	36908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209972
578	NC_015944	TCG	2	6	36929	36934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209972
579	NC_015944	TCGT	2	8	36992	36999	0 %	50 %	25 %	25 %	344209972
580	NC_015944	TCC	2	6	37004	37009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209972
581	NC_015944	CGA	2	6	37026	37031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209972
582	NC_015944	ACG	2	6	37077	37082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209972
583	NC_015944	CGA	2	6	37119	37124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209972
584	NC_015944	CGC	2	6	37153	37158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209972
585	NC_015944	CGA	2	6	37245	37250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209972
586	NC_015944	TGA	2	6	37314	37319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209972
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588	NC_015944	AAT	2	6	37485	37490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209972
589	NC_015944	GCC	2	6	37510	37515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209972
590	NC_015944	CGC	2	6	37521	37526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209972
591	NC_015944	CGAC	2	8	37677	37684	25 %	0 %	25 %	50 %	344209972
592	NC_015944	CGT	2	6	37686	37691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209972
593	NC_015944	GACA	2	8	37699	37706	50 %	0 %	25 %	25 %	344209972
594	NC_015944	TGC	3	9	37777	37785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209972
595	NC_015944	ATCT	2	8	37786	37793	25 %	50 %	0 %	25 %	344209972
596	NC_015944	AT	3	6	37829	37834	50 %	50 %	0 %	0 %	344209972
597	NC_015944	GTTCC	2	10	38058	38067	0 %	40 %	20 %	40 %	344209973
598	NC_015944	ACG	2	6	38113	38118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209973
599	NC_015944	ACGGA	2	10	38171	38180	40 %	0 %	40 %	20 %	344209973
600	NC_015944	CT	3	6	38220	38225	0 %	50 %	0 %	50 %	344209973
601	NC_015944	CAT	2	6	38251	38256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209973
602	NC_015944	TCCAC	2	10	38605	38614	20 %	20 %	0 %	60 %	344209974
603	NC_015944	TCG	3	9	38628	38636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209974
604	NC_015944	CGA	2	6	38779	38784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209974
605	NC_015944	GTC	2	6	38840	38845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209974
606	NC_015944	ACGG	2	8	38855	38862	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
607	NC_015944	GCGA	2	8	38876	38883	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
608	NC_015944	GCGA	2	8	38989	38996	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
609	NC_015944	CA	3	6	38998	39003	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
610	NC_015944	AC	3	6	39042	39047	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
611	NC_015944	GCTC	2	8	39078	39085	0 %	25 %	25 %	50 %	344209974
612	NC_015944	GACGG	2	10	39100	39109	20 %	0 %	60 %	20 %	344209974
613	NC_015944	GAT	2	6	39112	39117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209974
614	NC_015944	CGA	2	6	39118	39123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209974
615	NC_015944	GTG	2	6	39166	39171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209974
616	NC_015944	CCACGG	2	12	39264	39275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344209974
617	NC_015944	TTCGG	2	10	39292	39301	0 %	40 %	40 %	20 %	344209974
618	NC_015944	ACGA	2	8	39449	39456	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
619	NC_015944	CGA	3	9	39511	39519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209974
620	NC_015944	CTC	2	6	39548	39553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209974
621	NC_015944	GCT	2	6	39649	39654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209974
622	NC_015944	CTG	2	6	39692	39697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209974
623	NC_015944	CAC	2	6	39806	39811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209974
624	NC_015944	TCG	2	6	39813	39818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209974
625	NC_015944	GT	3	6	39831	39836	0 %	50 %	50 %	0 %	344209974
626	NC_015944	ACG	2	6	39867	39872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209974
627	NC_015944	ACGA	2	8	39878	39885	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
628	NC_015944	CA	3	6	39898	39903	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
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631	NC_015944	ACG	2	6	39987	39992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209974
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