MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015943	C	6	6	1632	1637	0 %	0 %	0 %	100 %	344209487
2	NC_015943	G	6	6	17870	17875	0 %	0 %	100 %	0 %	344209501
3	NC_015943	G	6	6	18834	18839	0 %	0 %	100 %	0 %	344209502
4	NC_015943	C	6	6	31371	31376	0 %	0 %	0 %	100 %	344209518
5	NC_015943	C	6	6	31470	31475	0 %	0 %	0 %	100 %	344209518
6	NC_015943	G	6	6	36073	36078	0 %	0 %	100 %	0 %	344209524
7	NC_015943	A	6	6	53387	53392	100 %	0 %	0 %	0 %	344209547
8	NC_015943	A	6	6	55445	55450	100 %	0 %	0 %	0 %	344209550
9	NC_015943	T	6	6	60883	60888	0 %	100 %	0 %	0 %	344209552
10	NC_015943	T	7	7	69851	69857	0 %	100 %	0 %	0 %	344209562
11	NC_015943	T	6	6	75034	75039	0 %	100 %	0 %	0 %	344209567
12	NC_015943	C	6	6	78666	78671	0 %	0 %	0 %	100 %	344209569
13	NC_015943	C	6	6	86394	86399	0 %	0 %	0 %	100 %	344209578
14	NC_015943	G	6	6	93568	93573	0 %	0 %	100 %	0 %	344209586
15	NC_015943	G	6	6	102461	102466	0 %	0 %	100 %	0 %	344209601
16	NC_015943	C	6	6	121491	121496	0 %	0 %	0 %	100 %	344209629
17	NC_015943	T	6	6	124316	124321	0 %	100 %	0 %	0 %	344209632
18	NC_015943	T	6	6	137648	137653	0 %	100 %	0 %	0 %	344209644
19	NC_015943	T	6	6	138827	138832	0 %	100 %	0 %	0 %	344209646
20	NC_015943	T	6	6	139094	139099	0 %	100 %	0 %	0 %	344209646
21	NC_015943	T	6	6	139234	139239	0 %	100 %	0 %	0 %	344209646
22	NC_015943	T	6	6	143762	143767	0 %	100 %	0 %	0 %	344209649
23	NC_015943	T	6	6	145364	145369	0 %	100 %	0 %	0 %	344209649
24	NC_015943	T	7	7	145726	145732	0 %	100 %	0 %	0 %	344209650
25	NC_015943	A	6	6	157791	157796	100 %	0 %	0 %	0 %	344209661
26	NC_015943	A	6	6	162204	162209	100 %	0 %	0 %	0 %	344209664
27	NC_015943	A	6	6	167053	167058	100 %	0 %	0 %	0 %	344209667
28	NC_015943	A	6	6	168631	168636	100 %	0 %	0 %	0 %	344209668
29	NC_015943	G	6	6	168738	168743	0 %	0 %	100 %	0 %	344209668
30	NC_015943	C	6	6	179005	179010	0 %	0 %	0 %	100 %	344209679
31	NC_015943	T	6	6	179818	179823	0 %	100 %	0 %	0 %	344209679
32	NC_015943	A	6	6	183711	183716	100 %	0 %	0 %	0 %	344209683
33	NC_015943	A	6	6	185239	185244	100 %	0 %	0 %	0 %	344209684
34	NC_015943	T	6	6	187749	187754	0 %	100 %	0 %	0 %	344209685
35	NC_015943	A	6	6	188183	188188	100 %	0 %	0 %	0 %	344209685
36	NC_015943	G	6	6	199312	199317	0 %	0 %	100 %	0 %	344209700
37	NC_015943	C	6	6	203486	203491	0 %	0 %	0 %	100 %	344209705
38	NC_015943	T	6	6	206274	206279	0 %	100 %	0 %	0 %	344209707
39	NC_015943	A	6	6	208250	208255	100 %	0 %	0 %	0 %	344209708
40	NC_015943	C	6	6	211496	211501	0 %	0 %	0 %	100 %	344209712
41	NC_015943	T	6	6	215454	215459	0 %	100 %	0 %	0 %	344209715
42	NC_015943	T	7	7	215637	215643	0 %	100 %	0 %	0 %	344209715
43	NC_015943	T	6	6	220348	220353	0 %	100 %	0 %	0 %	344209720
44	NC_015943	A	6	6	226074	226079	100 %	0 %	0 %	0 %	344209723
45	NC_015943	G	6	6	228819	228824	0 %	0 %	100 %	0 %	344209725
46	NC_015943	T	7	7	241795	241801	0 %	100 %	0 %	0 %	344209738
47	NC_015943	T	6	6	247430	247435	0 %	100 %	0 %	0 %	344209742
48	NC_015943	C	6	6	254899	254904	0 %	0 %	0 %	100 %	344209746
49	NC_015943	A	6	6	260570	260575	100 %	0 %	0 %	0 %	344209753
50	NC_015943	G	6	6	261010	261015	0 %	0 %	100 %	0 %	344209753
51	NC_015943	G	6	6	261083	261088	0 %	0 %	100 %	0 %	344209754
52	NC_015943	A	6	6	264582	264587	100 %	0 %	0 %	0 %	344209757
53	NC_015943	C	6	6	288711	288716	0 %	0 %	0 %	100 %	344209778
54	NC_015943	T	6	6	288727	288732	0 %	100 %	0 %	0 %	344209778
55	NC_015943	C	7	7	289296	289302	0 %	0 %	0 %	100 %	344209779
56	NC_015943	A	6	6	291738	291743	100 %	0 %	0 %	0 %	344209781
57	NC_015943	T	6	6	300157	300162	0 %	100 %	0 %	0 %	344209791
58	NC_015943	C	6	6	304728	304733	0 %	0 %	0 %	100 %	344209794
59	NC_015943	G	6	6	310530	310535	0 %	0 %	100 %	0 %	344209799
60	NC_015943	C	6	6	310665	310670	0 %	0 %	0 %	100 %	344209799
61	NC_015943	C	6	6	341960	341965	0 %	0 %	0 %	100 %	344209824
62	NC_015943	C	6	6	350005	350010	0 %	0 %	0 %	100 %	344209831
63	NC_015943	C	6	6	352368	352373	0 %	0 %	0 %	100 %	344209833
64	NC_015943	T	6	6	361012	361017	0 %	100 %	0 %	0 %	344209843
65	NC_015943	T	7	7	383360	383366	0 %	100 %	0 %	0 %	344209861
66	NC_015943	C	6	6	386217	386222	0 %	0 %	0 %	100 %	344209863
67	NC_015943	G	6	6	389726	389731	0 %	0 %	100 %	0 %	344209865
68	NC_015943	C	6	6	396543	396548	0 %	0 %	0 %	100 %	344209871
69	NC_015943	A	6	6	398313	398318	100 %	0 %	0 %	0 %	344209873
70	NC_015943	C	6	6	400104	400109	0 %	0 %	0 %	100 %	344209875
71	NC_015943	G	6	6	401179	401184	0 %	0 %	100 %	0 %	344209876
72	NC_015943	C	6	6	403642	403647	0 %	0 %	0 %	100 %	344209877
73	NC_015943	C	6	6	406486	406491	0 %	0 %	0 %	100 %	344209878
74	NC_015943	C	6	6	407128	407133	0 %	0 %	0 %	100 %	344209878
75	NC_015943	G	6	6	408641	408646	0 %	0 %	100 %	0 %	344209878
76	NC_015943	T	6	6	410884	410889	0 %	100 %	0 %	0 %	344209879
77	NC_015943	G	6	6	433017	433022	0 %	0 %	100 %	0 %	344209894
78	NC_015943	G	6	6	448022	448027	0 %	0 %	100 %	0 %	344209907
79	NC_015943	C	6	6	450014	450019	0 %	0 %	0 %	100 %	344209908
80	NC_015943	C	6	6	458821	458826	0 %	0 %	0 %	100 %	344209915
81	NC_015943	T	6	6	461684	461689	0 %	100 %	0 %	0 %	344209917
82	NC_015943	C	6	6	469990	469995	0 %	0 %	0 %	100 %	344209923
83	NC_015943	T	7	7	470791	470797	0 %	100 %	0 %	0 %	344209924
84	NC_015943	T	6	6	483923	483928	0 %	100 %	0 %	0 %	344209938

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.