MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 2467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015667	CGC	2	6	223	228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251561
2	NC_015667	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251561
3	NC_015667	CAG	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251561
4	NC_015667	TCT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251562
5	NC_015667	TTC	2	6	604	609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251562
6	NC_015667	CAC	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251562
7	NC_015667	AGA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251562
8	NC_015667	GTC	2	6	745	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251562
9	NC_015667	TCG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251562
10	NC_015667	GAT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251562
11	NC_015667	ACC	2	6	869	874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251563
12	NC_015667	TCG	2	6	929	934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251563
13	NC_015667	CGC	2	6	944	949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251563
14	NC_015667	GGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251563
15	NC_015667	AGG	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251563
16	NC_015667	CCG	2	6	1067	1072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251563
17	NC_015667	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251563
18	NC_015667	CCG	2	6	1114	1119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251563
19	NC_015667	CGG	2	6	1167	1172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251563
20	NC_015667	GAT	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251563
21	NC_015667	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251563
22	NC_015667	GAA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251563
23	NC_015667	TAC	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251563
24	NC_015667	ACG	3	9	2026	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251563
25	NC_015667	CGA	2	6	2253	2258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251563
26	NC_015667	AGA	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251563
27	NC_015667	CAA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251563
28	NC_015667	CAG	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251564
29	NC_015667	GTT	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251564
30	NC_015667	AAC	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251564
31	NC_015667	GTC	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251564
32	NC_015667	CAA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251564
33	NC_015667	GAA	2	6	3011	3016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251564
34	NC_015667	AGG	2	6	3061	3066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251564
35	NC_015667	CTC	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251564
36	NC_015667	CAA	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251564
37	NC_015667	GGT	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251564
38	NC_015667	AGC	2	6	3250	3255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251564
39	NC_015667	CCT	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251564
40	NC_015667	GAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251564
41	NC_015667	ACT	2	6	3400	3405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251564
42	NC_015667	AGA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251564
43	NC_015667	GTT	2	6	3476	3481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251565
44	NC_015667	AAC	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251565
45	NC_015667	GGA	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251565
46	NC_015667	ACT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251565
47	NC_015667	TCA	3	9	3798	3806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251565
48	NC_015667	TTC	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251565
49	NC_015667	CAG	3	9	4137	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251565
50	NC_015667	CTT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251565
51	NC_015667	GCT	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251565
52	NC_015667	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251565
53	NC_015667	GGC	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251565
54	NC_015667	CGA	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251565
55	NC_015667	CGG	2	6	4487	4492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251565
56	NC_015667	CTA	2	6	4513	4518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251565
57	NC_015667	CAT	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251566
58	NC_015667	CGG	2	6	4705	4710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251566
59	NC_015667	ATC	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251566
60	NC_015667	AGA	2	6	4825	4830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251566
61	NC_015667	AGT	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251566
62	NC_015667	GGC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251566
63	NC_015667	CGA	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
64	NC_015667	CAA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251566
65	NC_015667	ACG	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
66	NC_015667	CTC	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251566
67	NC_015667	GAG	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251566
68	NC_015667	CAG	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
69	NC_015667	CGC	2	6	5289	5294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251566
70	NC_015667	CGA	2	6	5317	5322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
71	NC_015667	TCG	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251566
72	NC_015667	ACG	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
73	NC_015667	GGT	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251566
74	NC_015667	TGA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251566
75	NC_015667	AAC	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251566
76	NC_015667	GGA	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251566
77	NC_015667	TCC	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251567
78	NC_015667	AGC	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
79	NC_015667	GGA	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251567
80	NC_015667	CGA	2	6	5876	5881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
81	NC_015667	ACG	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
82	NC_015667	GAA	2	6	6074	6079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251567
83	NC_015667	CGA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
84	NC_015667	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251567
85	NC_015667	CGA	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
86	NC_015667	CCG	2	6	6379	6384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251567
87	NC_015667	CGG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251567
88	NC_015667	CGC	2	6	6457	6462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251567
89	NC_015667	CGA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
90	NC_015667	GAG	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251567
91	NC_015667	GGC	2	6	6486	6491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251567
92	NC_015667	GGT	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251567
93	NC_015667	CAT	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251567
94	NC_015667	AAC	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251567
95	NC_015667	CGG	2	6	6728	6733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251567
96	NC_015667	CGA	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
97	NC_015667	CTT	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251567
98	NC_015667	GAC	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
99	NC_015667	GAT	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251567
100	NC_015667	CGA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
101	NC_015667	ATG	2	6	6990	6995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251567
102	NC_015667	CGA	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
103	NC_015667	AAG	2	6	7068	7073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251567
104	NC_015667	CAG	2	6	7194	7199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
105	NC_015667	CAG	2	6	7214	7219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
106	NC_015667	GCT	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251567
107	NC_015667	AGG	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251567
108	NC_015667	CGA	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
109	NC_015667	CAT	2	6	7316	7321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251567
110	NC_015667	CAC	2	6	7365	7370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251567
111	NC_015667	CCA	2	6	7373	7378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251567
112	NC_015667	CGA	2	6	7412	7417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
113	NC_015667	TCG	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251567
114	NC_015667	CTC	2	6	7688	7693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251567
115	NC_015667	GGA	2	6	7841	7846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251567
116	NC_015667	TTC	2	6	8053	8058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251568
117	NC_015667	CAC	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251568
118	NC_015667	TCG	2	6	8195	8200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251568
119	NC_015667	ACC	2	6	8255	8260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251568
120	NC_015667	CAG	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251568
121	NC_015667	CGG	2	6	8313	8318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251568
122	NC_015667	GGA	2	6	8400	8405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251568
123	NC_015667	ACC	2	6	8415	8420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251568
124	NC_015667	CGA	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251568
125	NC_015667	GAT	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251568
126	NC_015667	CGC	2	6	8486	8491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251568
127	NC_015667	GGA	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251568
128	NC_015667	TCG	2	6	8584	8589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251568
129	NC_015667	GTC	2	6	8665	8670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251568
130	NC_015667	TCG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251568
131	NC_015667	TTC	2	6	8743	8748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251568
132	NC_015667	GTC	2	6	8755	8760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251568
133	NC_015667	GAG	2	6	8779	8784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251568
134	NC_015667	CGA	2	6	8907	8912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251568
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161	NC_015667	GAC	2	6	9877	9882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251568
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163	NC_015667	CGA	2	6	10032	10037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251568
164	NC_015667	CCT	2	6	10098	10103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251568
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251	NC_015667	GGA	2	6	16963	16968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251574
252	NC_015667	CGC	2	6	16980	16985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251574
253	NC_015667	GAT	2	6	16996	17001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251574
254	NC_015667	CGT	2	6	17020	17025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251574
255	NC_015667	GAG	2	6	17045	17050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251574
256	NC_015667	CGA	2	6	17065	17070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251574
257	NC_015667	CGA	2	6	17080	17085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251574
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274	NC_015667	CGA	2	6	18586	18591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251576
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285	NC_015667	GAC	2	6	19345	19350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251577
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376	NC_015667	CAT	2	6	27120	27125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251586
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380	NC_015667	GCA	2	6	27282	27287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251586
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497	NC_015667	GCT	2	6	38332	38337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251595
498	NC_015667	AAT	2	6	38385	38390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336251595
499	NC_015667	CAT	2	6	38426	38431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251595
500	NC_015667	TGC	2	6	38460	38465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251595

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