MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 3316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015667	CCGTCG	2	12	92155	92166	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336251650
1502	NC_015667	ACG	2	6	92224	92229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1503	NC_015667	CGAC	2	8	92242	92249	25 %	0 %	25 %	50 %	336251650
1504	NC_015667	GTC	2	6	92250	92255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1505	NC_015667	GCC	2	6	92294	92299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251650
1506	NC_015667	CGGT	2	8	92319	92326	0 %	25 %	50 %	25 %	336251650
1507	NC_015667	CGT	2	6	92327	92332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1508	NC_015667	CGA	2	6	92333	92338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1509	NC_015667	CCGTCG	2	12	92362	92373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336251650
1510	NC_015667	CGT	2	6	92375	92380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1511	NC_015667	GCCG	2	8	92450	92457	0 %	0 %	50 %	50 %	336251650
1512	NC_015667	ACG	2	6	92458	92463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1513	NC_015667	CGA	2	6	92483	92488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1514	NC_015667	ACGA	2	8	92490	92497	50 %	0 %	25 %	25 %	336251650
1515	NC_015667	TGA	2	6	92513	92518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251650
1516	NC_015667	CGA	2	6	92519	92524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1517	NC_015667	GTC	2	6	92532	92537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1518	NC_015667	GCT	2	6	92555	92560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1519	NC_015667	CGA	2	6	92609	92614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1520	NC_015667	ACGA	2	8	92655	92662	50 %	0 %	25 %	25 %	336251650
1521	NC_015667	CGT	2	6	92684	92689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1522	NC_015667	CGC	2	6	92690	92695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251650
1523	NC_015667	CGAG	2	8	92719	92726	25 %	0 %	50 %	25 %	336251650
1524	NC_015667	GC	3	6	92746	92751	0 %	0 %	50 %	50 %	336251650
1525	NC_015667	GTC	2	6	92792	92797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1526	NC_015667	GAC	2	6	92813	92818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1527	NC_015667	TCGC	2	8	92829	92836	0 %	25 %	25 %	50 %	336251650
1528	NC_015667	ACG	2	6	92845	92850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1529	NC_015667	CGAG	2	8	92865	92872	25 %	0 %	50 %	25 %	336251650
1530	NC_015667	TCG	2	6	92947	92952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1531	NC_015667	GGC	2	6	92975	92980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251650
1532	NC_015667	TGG	2	6	92985	92990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251650
1533	NC_015667	CGG	2	6	92994	92999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251650
1534	NC_015667	ACTC	2	8	93171	93178	25 %	25 %	0 %	50 %	336251651
1535	NC_015667	CGT	2	6	93231	93236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251651
1536	NC_015667	CG	3	6	93254	93259	0 %	0 %	50 %	50 %	336251651
1537	NC_015667	GCT	2	6	93281	93286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251651
1538	NC_015667	CTC	2	6	93292	93297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251651
1539	NC_015667	TCG	2	6	93457	93462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251651
1540	NC_015667	CTC	2	6	93463	93468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251651
1541	NC_015667	CGC	2	6	93556	93561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251651
1542	NC_015667	GAG	2	6	93637	93642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251651
1543	NC_015667	CCT	2	6	93690	93695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251651
1544	NC_015667	CCATC	2	10	93787	93796	20 %	20 %	0 %	60 %	336251651
1545	NC_015667	GTA	2	6	93943	93948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251651
1546	NC_015667	TGC	2	6	93987	93992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251651
1547	NC_015667	ATCC	2	8	94127	94134	25 %	25 %	0 %	50 %	336251652
1548	NC_015667	ACGT	2	8	94188	94195	25 %	25 %	25 %	25 %	336251652
1549	NC_015667	GAC	2	6	94202	94207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251652
1550	NC_015667	TCG	2	6	94279	94284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251652
1551	NC_015667	ACG	2	6	94287	94292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251652
1552	NC_015667	CG	3	6	94301	94306	0 %	0 %	50 %	50 %	336251652
1553	NC_015667	CCGA	2	8	94503	94510	25 %	0 %	25 %	50 %	336251652
1554	NC_015667	AGTCG	2	10	94529	94538	20 %	20 %	40 %	20 %	336251652
1555	NC_015667	GACG	2	8	94577	94584	25 %	0 %	50 %	25 %	336251652
1556	NC_015667	TCGA	2	8	94591	94598	25 %	25 %	25 %	25 %	336251652
1557	NC_015667	AGC	2	6	94618	94623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251652
1558	NC_015667	TC	3	6	94624	94629	0 %	50 %	0 %	50 %	336251652
1559	NC_015667	GCT	2	6	94661	94666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251652
1560	NC_015667	CGC	2	6	94687	94692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251652
1561	NC_015667	CGAA	2	8	94701	94708	50 %	0 %	25 %	25 %	336251652
1562	NC_015667	GTCGAA	2	12	94713	94724	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336251652
1563	NC_015667	CCG	2	6	94748	94753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251652
1564	NC_015667	CG	3	6	94864	94869	0 %	0 %	50 %	50 %	336251653
1565	NC_015667	CGT	2	6	94910	94915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251653
1566	NC_015667	TCG	2	6	94918	94923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251653
1567	NC_015667	GGC	2	6	94948	94953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251653
1568	NC_015667	CGT	2	6	95000	95005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251653
1569	NC_015667	GCTC	2	8	95008	95015	0 %	25 %	25 %	50 %	336251653
1570	NC_015667	GC	3	6	95016	95021	0 %	0 %	50 %	50 %	336251653
1571	NC_015667	GTA	2	6	95076	95081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251653
1572	NC_015667	GCC	3	9	95082	95090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251653
1573	NC_015667	CGA	2	6	95123	95128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251653
1574	NC_015667	GTG	2	6	95137	95142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251653
1575	NC_015667	CGT	2	6	95153	95158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251653
1576	NC_015667	GCG	2	6	95195	95200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251653
1577	NC_015667	GTGC	2	8	95219	95226	0 %	25 %	50 %	25 %	336251653
1578	NC_015667	CGA	2	6	95591	95596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251654
1579	NC_015667	CCA	2	6	95598	95603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251654
1580	NC_015667	CGA	2	6	95616	95621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251654
1581	NC_015667	GTC	2	6	95667	95672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251654
1582	NC_015667	CCGT	2	8	95727	95734	0 %	25 %	25 %	50 %	336251654
1583	NC_015667	GGC	2	6	95749	95754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251654
1584	NC_015667	TCG	2	6	95761	95766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251654
1585	NC_015667	GA	3	6	95782	95787	50 %	0 %	50 %	0 %	336251654
1586	NC_015667	TCGA	2	8	95811	95818	25 %	25 %	25 %	25 %	336251654
1587	NC_015667	GGA	2	6	95822	95827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251654
1588	NC_015667	GAT	2	6	95834	95839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251654
1589	NC_015667	ACG	2	6	95842	95847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251654
1590	NC_015667	ACG	2	6	95884	95889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251654
1591	NC_015667	CGTC	2	8	95918	95925	0 %	25 %	25 %	50 %	336251654
1592	NC_015667	ACG	2	6	95932	95937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251654
1593	NC_015667	GAA	2	6	95979	95984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251654
1594	NC_015667	CG	3	6	96276	96281	0 %	0 %	50 %	50 %	336251655
1595	NC_015667	CGA	2	6	96389	96394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251655
1596	NC_015667	TCG	2	6	96490	96495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251655
1597	NC_015667	CGA	2	6	96561	96566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251655
1598	NC_015667	GTC	2	6	96594	96599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251655
1599	NC_015667	CGG	2	6	96605	96610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251655
1600	NC_015667	GCG	2	6	96640	96645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251655
1601	NC_015667	GCTG	2	8	96828	96835	0 %	25 %	50 %	25 %	336251656
1602	NC_015667	CGT	2	6	96891	96896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1603	NC_015667	CGA	2	6	96930	96935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1604	NC_015667	GAA	2	6	96973	96978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251656
1605	NC_015667	ACG	2	6	97015	97020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1606	NC_015667	TCG	2	6	97088	97093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1607	NC_015667	CTC	2	6	97129	97134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251656
1608	NC_015667	GGC	2	6	97135	97140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251656
1609	NC_015667	CTC	2	6	97153	97158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251656
1610	NC_015667	TCG	2	6	97181	97186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1611	NC_015667	ACT	2	6	97217	97222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251656
1612	NC_015667	GACG	2	8	97239	97246	25 %	0 %	50 %	25 %	336251656
1613	NC_015667	CGT	2	6	97326	97331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251656
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1616	NC_015667	ACG	2	6	97465	97470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251656
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1618	NC_015667	GAC	2	6	97482	97487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1619	NC_015667	GTCG	2	8	97488	97495	0 %	25 %	50 %	25 %	336251656
1620	NC_015667	GCT	2	6	97504	97509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1621	NC_015667	CGA	2	6	97527	97532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251656
1622	NC_015667	TCG	2	6	97547	97552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251656
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1624	NC_015667	TCG	2	6	97609	97614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251656
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1746	NC_015667	TACG	2	8	103921	103928	25 %	25 %	25 %	25 %	336251665
1747	NC_015667	TGGC	2	8	103942	103949	0 %	25 %	50 %	25 %	336251665
1748	NC_015667	CGT	2	6	103954	103959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251665
1749	NC_015667	GTC	3	9	104006	104014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251665
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1753	NC_015667	CGA	2	6	104478	104483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251666
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1765	NC_015667	TCG	2	6	104876	104881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251666
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1773	NC_015667	CGA	2	6	105177	105182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251666
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1984	NC_015667	TGA	2	6	116127	116132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251677
1985	NC_015667	CGT	2	6	116145	116150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251677
1986	NC_015667	GTT	2	6	116530	116535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251678
1987	NC_015667	GTC	2	6	116548	116553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251678
1988	NC_015667	ACGA	2	8	116593	116600	50 %	0 %	25 %	25 %	336251678
1989	NC_015667	CTC	2	6	116614	116619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251678
1990	NC_015667	CGG	2	6	116622	116627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251678
1991	NC_015667	GCG	2	6	116652	116657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251678
1992	NC_015667	CGG	2	6	116752	116757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251678
1993	NC_015667	CGT	2	6	116844	116849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251678
1994	NC_015667	CTC	2	6	116851	116856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251678
1995	NC_015667	TCG	2	6	116861	116866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251678
1996	NC_015667	ATCC	2	8	116867	116874	25 %	25 %	0 %	50 %	336251678
1997	NC_015667	TCT	2	6	116927	116932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251678
1998	NC_015667	GCT	2	6	116969	116974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251678
1999	NC_015667	AACG	2	8	117004	117011	50 %	0 %	25 %	25 %	336251678
2000	NC_015667	GAGC	2	8	117478	117485	25 %	0 %	50 %	25 %	336251679

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